MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus sp. CL1 chromosome

Total Repeats: 36405

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19501	NC_018015	ATC	2	6	1051108	1051113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961242
19502	NC_018015	TGA	2	6	1051163	1051168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961242
19503	NC_018015	ATA	2	6	1051210	1051215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390961242
19504	NC_018015	A	6	6	1051240	1051245	100 %	0 %	0 %	0 %	390961242
19505	NC_018015	CTT	2	6	1051294	1051299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961242
19506	NC_018015	A	6	6	1051329	1051334	100 %	0 %	0 %	0 %	390961242
19507	NC_018015	A	6	6	1051368	1051373	100 %	0 %	0 %	0 %	390961242
19508	NC_018015	GGA	2	6	1051455	1051460	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961242
19509	NC_018015	G	6	6	1051627	1051632	0 %	0 %	100 %	0 %	390961243
19510	NC_018015	TC	3	6	1051635	1051640	0 %	50 %	0 %	50 %	390961243
19511	NC_018015	AGC	2	6	1051672	1051677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961243
19512	NC_018015	TACAAC	2	12	1051709	1051720	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	390961243
19513	NC_018015	ACC	2	6	1051745	1051750	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390961243
19514	NC_018015	AGA	2	6	1051759	1051764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961243
19515	NC_018015	AAG	2	6	1051910	1051915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961243
19516	NC_018015	A	6	6	1051921	1051926	100 %	0 %	0 %	0 %	390961243
19517	NC_018015	GAT	2	6	1052035	1052040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961243
19518	NC_018015	TGA	2	6	1052077	1052082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961243
19519	NC_018015	GCC	2	6	1052147	1052152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390961243
19520	NC_018015	AAG	2	6	1052173	1052178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961243
19521	NC_018015	TTG	2	6	1052190	1052195	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390961243
19522	NC_018015	CCA	2	6	1052200	1052205	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390961243
19523	NC_018015	CA	3	6	1052248	1052253	50 %	0 %	0 %	50 %	390961243
19524	NC_018015	TGAT	2	8	1052286	1052293	25 %	50 %	25 %	0 %	390961243
19525	NC_018015	ATCC	2	8	1052417	1052424	25 %	25 %	0 %	50 %	390961243
19526	NC_018015	A	7	7	1052453	1052459	100 %	0 %	0 %	0 %	390961243
19527	NC_018015	GGA	2	6	1052539	1052544	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961243
19528	NC_018015	TGA	2	6	1052599	1052604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961243
19529	NC_018015	A	6	6	1052624	1052629	100 %	0 %	0 %	0 %	390961243
19530	NC_018015	ATAC	2	8	1052689	1052696	50 %	25 %	0 %	25 %	390961243
19531	NC_018015	AG	3	6	1052726	1052731	50 %	0 %	50 %	0 %	390961243
19532	NC_018015	AAT	2	6	1052848	1052853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390961243
19533	NC_018015	G	6	6	1052871	1052876	0 %	0 %	100 %	0 %	390961243
19534	NC_018015	A	6	6	1052879	1052884	100 %	0 %	0 %	0 %	390961243
19535	NC_018015	T	6	6	1052923	1052928	0 %	100 %	0 %	0 %	390961244
19536	NC_018015	TAT	2	6	1052950	1052955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390961244
19537	NC_018015	ACGG	2	8	1052960	1052967	25 %	0 %	50 %	25 %	390961244
19538	NC_018015	TAT	2	6	1053092	1053097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390961244
19539	NC_018015	GA	3	6	1053118	1053123	50 %	0 %	50 %	0 %	390961244
19540	NC_018015	CCG	2	6	1053272	1053277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390961244
19541	NC_018015	GGT	2	6	1053312	1053317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390961244
19542	NC_018015	TGT	2	6	1053327	1053332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390961244
19543	NC_018015	GAAG	2	8	1053373	1053380	50 %	0 %	50 %	0 %	390961244
19544	NC_018015	AG	3	6	1053436	1053441	50 %	0 %	50 %	0 %	390961244
19545	NC_018015	AAT	2	6	1053453	1053458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390961244
19546	NC_018015	TGC	2	6	1053465	1053470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961244
19547	NC_018015	A	6	6	1053487	1053492	100 %	0 %	0 %	0 %	390961244
19548	NC_018015	TTA	2	6	1053538	1053543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390961244
19549	NC_018015	TGA	2	6	1053544	1053549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961244
19550	NC_018015	TGC	2	6	1054017	1054022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961245
19551	NC_018015	GA	3	6	1054063	1054068	50 %	0 %	50 %	0 %	390961245
19552	NC_018015	GAA	2	6	1054109	1054114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961245
19553	NC_018015	GAAA	2	8	1054192	1054199	75 %	0 %	25 %	0 %	390961245
19554	NC_018015	CTG	2	6	1054229	1054234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961245
19555	NC_018015	AGA	2	6	1054250	1054255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961245
19556	NC_018015	GAC	2	6	1054283	1054288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961245
19557	NC_018015	AC	3	6	1054301	1054306	50 %	0 %	0 %	50 %	390961245
19558	NC_018015	TCC	2	6	1054319	1054324	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961245
19559	NC_018015	AGG	2	6	1054335	1054340	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961245
19560	NC_018015	CTG	2	6	1054346	1054351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961245
19561	NC_018015	AG	3	6	1054385	1054390	50 %	0 %	50 %	0 %	390961245
19562	NC_018015	GAA	2	6	1054513	1054518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961245
19563	NC_018015	GAG	2	6	1054627	1054632	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961245
19564	NC_018015	GAATG	2	10	1054642	1054651	40 %	20 %	40 %	0 %	390961245
19565	NC_018015	ATG	2	6	1054707	1054712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961245
19566	NC_018015	TAC	2	6	1054760	1054765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961245
19567	NC_018015	AG	3	6	1054766	1054771	50 %	0 %	50 %	0 %	390961245
19568	NC_018015	TAC	2	6	1054775	1054780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961245
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19570	NC_018015	CCTTGG	2	12	1055370	1055381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961246
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19572	NC_018015	CTT	2	6	1055428	1055433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961246
19573	NC_018015	GGC	2	6	1055570	1055575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390961246
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19577	NC_018015	GC	3	6	1055669	1055674	0 %	0 %	50 %	50 %	390961246
19578	NC_018015	GCC	2	6	1055681	1055686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390961246
19579	NC_018015	GAG	2	6	1055725	1055730	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961246
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19585	NC_018015	TCC	2	6	1056195	1056200	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961247
19586	NC_018015	CG	4	8	1056201	1056208	0 %	0 %	50 %	50 %	390961247
19587	NC_018015	GAA	2	6	1056338	1056343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961247
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19592	NC_018015	CT	3	6	1056697	1056702	0 %	50 %	0 %	50 %	390961248
19593	NC_018015	TCA	2	6	1056718	1056723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961248
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19599	NC_018015	CGA	2	6	1057034	1057039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961248
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19601	NC_018015	CGA	2	6	1057175	1057180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961248
19602	NC_018015	TA	3	6	1057218	1057223	50 %	50 %	0 %	0 %	390961248
19603	NC_018015	GAT	2	6	1057295	1057300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961248
19604	NC_018015	GTTCA	2	10	1057323	1057332	20 %	40 %	20 %	20 %	390961248
19605	NC_018015	CAT	2	6	1057409	1057414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961248
19606	NC_018015	AGA	2	6	1057432	1057437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961248
19607	NC_018015	GTG	2	6	1057449	1057454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390961248
19608	NC_018015	TGA	2	6	1057541	1057546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961248
19609	NC_018015	GGT	2	6	1057560	1057565	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390961248
19610	NC_018015	TCA	2	6	1057594	1057599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961248
19611	NC_018015	TGG	2	6	1057663	1057668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390961248
19612	NC_018015	AAG	2	6	1057686	1057691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961248
19613	NC_018015	GGA	3	9	1057763	1057771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961248
19614	NC_018015	GTGA	2	8	1057780	1057787	25 %	25 %	50 %	0 %	390961248
19615	NC_018015	CTT	3	9	1057793	1057801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961249
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