MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus sp. CL1 chromosome

Total Repeats: 36405

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1502	NC_018015	AAC	2	6	79967	79972	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390960261
1503	NC_018015	CCA	2	6	80044	80049	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960261
1504	NC_018015	AGA	2	6	80127	80132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960261
1505	NC_018015	TCC	2	6	80187	80192	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960262
1506	NC_018015	CGA	2	6	80203	80208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960262
1507	NC_018015	CTTCA	2	10	80246	80255	20 %	40 %	0 %	40 %	390960262
1508	NC_018015	CAG	2	6	80402	80407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960262
1509	NC_018015	AGAA	2	8	80641	80648	75 %	0 %	25 %	0 %	390960263
1510	NC_018015	CTC	3	9	80662	80670	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960263
1511	NC_018015	CCG	2	6	80677	80682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960263
1512	NC_018015	CGA	2	6	80739	80744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960263
1513	NC_018015	GAG	2	6	80745	80750	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960263
1514	NC_018015	AGG	2	6	80810	80815	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960263
1515	NC_018015	GTG	2	6	80863	80868	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960263
1516	NC_018015	CTA	2	6	80895	80900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960263
1517	NC_018015	GAG	2	6	80908	80913	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960263
1518	NC_018015	TCCC	2	8	80939	80946	0 %	25 %	0 %	75 %	390960263
1519	NC_018015	GGA	2	6	80988	80993	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960263
1520	NC_018015	AGCGG	2	10	81015	81024	20 %	0 %	60 %	20 %	390960263
1521	NC_018015	GGA	2	6	81035	81040	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960263
1522	NC_018015	CAC	2	6	81120	81125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960264
1523	NC_018015	CGG	2	6	81129	81134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960264
1524	NC_018015	CGC	2	6	81140	81145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960264
1525	NC_018015	CTCGTC	2	12	81237	81248	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	390960264
1526	NC_018015	GAG	2	6	81249	81254	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960264
1527	NC_018015	TCCG	2	8	81264	81271	0 %	25 %	25 %	50 %	390960264
1528	NC_018015	TCG	2	6	81376	81381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960264
1529	NC_018015	CGT	2	6	81395	81400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960264
1530	NC_018015	ACC	2	6	81511	81516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960264
1531	NC_018015	CGA	2	6	81530	81535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960264
1532	NC_018015	CAT	2	6	81536	81541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960264
1533	NC_018015	TCG	2	6	81782	81787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960265
1534	NC_018015	TCG	2	6	81821	81826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960265
1535	NC_018015	CGT	2	6	81867	81872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960265
1536	NC_018015	CTT	2	6	81940	81945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960265
1537	NC_018015	TCT	2	6	82050	82055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960265
1538	NC_018015	GTC	2	6	82093	82098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960265
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1540	NC_018015	CTT	2	6	82165	82170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960265
1541	NC_018015	CTC	2	6	82171	82176	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960265
1542	NC_018015	ATT	2	6	82187	82192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390960265
1543	NC_018015	CTT	2	6	82216	82221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960265
1544	NC_018015	TCG	2	6	82283	82288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960265
1545	NC_018015	TGCT	2	8	82331	82338	0 %	50 %	25 %	25 %	390960265
1546	NC_018015	AC	3	6	82370	82375	50 %	0 %	0 %	50 %	390960265
1547	NC_018015	CG	3	6	82422	82427	0 %	0 %	50 %	50 %	390960265
1548	NC_018015	AGT	2	6	82428	82433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960265
1549	NC_018015	CTC	2	6	82441	82446	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960265
1550	NC_018015	GCT	2	6	82452	82457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960265
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1552	NC_018015	TGACCA	2	12	82509	82520	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	390960265
1553	NC_018015	GTA	2	6	82522	82527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960265
1554	NC_018015	GAA	2	6	82531	82536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960265
1555	NC_018015	CCT	2	6	82566	82571	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960265
1556	NC_018015	CGG	2	6	82572	82577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960265
1557	NC_018015	AAT	2	6	82585	82590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390960265
1558	NC_018015	GAA	2	6	82684	82689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960265
1559	NC_018015	CGC	3	9	82938	82946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960265
1560	NC_018015	CGT	2	6	82962	82967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960265
1561	NC_018015	CCT	2	6	83028	83033	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960265
1562	NC_018015	CGA	2	6	83034	83039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960265
1563	NC_018015	GGT	2	6	83040	83045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960265
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1566	NC_018015	CCCT	2	8	83168	83175	0 %	25 %	0 %	75 %	390960265
1567	NC_018015	TCG	2	6	83217	83222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960265
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1569	NC_018015	CCT	2	6	83296	83301	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960265
1570	NC_018015	GAA	2	6	83313	83318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960265
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1586	NC_018015	GA	3	6	83895	83900	50 %	0 %	50 %	0 %	390960266
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1596	NC_018015	CGA	2	6	84140	84145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960266
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1995	NC_018015	TCC	2	6	106545	106550	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960286
1996	NC_018015	GGGGAG	2	12	106551	106562	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	390960286
1997	NC_018015	AG	3	6	106642	106647	50 %	0 %	50 %	0 %	390960286
1998	NC_018015	CTC	2	6	106774	106779	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960287
1999	NC_018015	GCGT	2	8	106990	106997	0 %	25 %	50 %	25 %	390960287
2000	NC_018015	CCT	2	6	107106	107111	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960287

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