MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus sp. CL1 chromosome

Total Repeats: 36405

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19002	NC_018015	CGT	2	6	1023734	1023739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961222
19003	NC_018015	GAG	2	6	1023777	1023782	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961223
19004	NC_018015	TTGAAG	2	12	1023889	1023900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961223
19005	NC_018015	GGCC	2	8	1023920	1023927	0 %	0 %	50 %	50 %	390961223
19006	NC_018015	GA	3	6	1023963	1023968	50 %	0 %	50 %	0 %	390961223
19007	NC_018015	AG	3	6	1023972	1023977	50 %	0 %	50 %	0 %	390961223
19008	NC_018015	GGT	2	6	1024016	1024021	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390961223
19009	NC_018015	ATC	2	6	1024029	1024034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961223
19010	NC_018015	C	6	6	1024129	1024134	0 %	0 %	0 %	100 %	390961223
19011	NC_018015	ACA	2	6	1024180	1024185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390961223
19012	NC_018015	CTA	2	6	1024202	1024207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961223
19013	NC_018015	CGG	2	6	1024229	1024234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390961223
19014	NC_018015	TCG	2	6	1024258	1024263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961223
19015	NC_018015	GAA	2	6	1024277	1024282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961223
19016	NC_018015	AG	3	6	1024322	1024327	50 %	0 %	50 %	0 %	390961223
19017	NC_018015	GAG	2	6	1024335	1024340	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961223
19018	NC_018015	ACC	2	6	1024351	1024356	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390961223
19019	NC_018015	ACC	2	6	1024378	1024383	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390961223
19020	NC_018015	CGA	2	6	1024391	1024396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961223
19021	NC_018015	GAA	2	6	1024440	1024445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961223
19022	NC_018015	ACCA	2	8	1024491	1024498	50 %	0 %	0 %	50 %	390961223
19023	NC_018015	GAA	2	6	1024550	1024555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961223
19024	NC_018015	TCG	2	6	1024612	1024617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961223
19025	NC_018015	AAG	2	6	1024635	1024640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961223
19026	NC_018015	GGA	2	6	1024643	1024648	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961223
19027	NC_018015	GGA	2	6	1024691	1024696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961223
19028	NC_018015	CTA	2	6	1024724	1024729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961223
19029	NC_018015	AAG	2	6	1024770	1024775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961223
19030	NC_018015	CAAC	2	8	1024822	1024829	50 %	0 %	0 %	50 %	390961223
19031	NC_018015	CGA	2	6	1024897	1024902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961223
19032	NC_018015	CGA	2	6	1024913	1024918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961223
19033	NC_018015	CCA	2	6	1024984	1024989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390961223
19034	NC_018015	GTG	2	6	1025028	1025033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390961223
19035	NC_018015	GAC	2	6	1025040	1025045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961223
19036	NC_018015	GAG	2	6	1025079	1025084	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961223
19037	NC_018015	TCG	2	6	1025125	1025130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961223
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19039	NC_018015	CCTG	2	8	1025147	1025154	0 %	25 %	25 %	50 %	390961223
19040	NC_018015	TGG	2	6	1025172	1025177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390961223
19041	NC_018015	CG	3	6	1025245	1025250	0 %	0 %	50 %	50 %	390961223
19042	NC_018015	GAG	2	6	1025259	1025264	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961223
19043	NC_018015	GCG	2	6	1025265	1025270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390961223
19044	NC_018015	CTC	2	6	1025307	1025312	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961223
19045	NC_018015	GAG	2	6	1025343	1025348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961223
19046	NC_018015	TAC	2	6	1025391	1025396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961223
19047	NC_018015	GGA	2	6	1025423	1025428	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961223
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19049	NC_018015	CAT	2	6	1025696	1025701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961223
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19052	NC_018015	CG	3	6	1025845	1025850	0 %	0 %	50 %	50 %	390961223
19053	NC_018015	GCC	2	6	1025862	1025867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390961223
19054	NC_018015	AGGA	2	8	1025869	1025876	50 %	0 %	50 %	0 %	390961223
19055	NC_018015	CTT	2	6	1025900	1025905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961223
19056	NC_018015	GAG	2	6	1026077	1026082	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961223
19057	NC_018015	CCGCG	2	10	1026107	1026116	0 %	0 %	40 %	60 %	390961223
19058	NC_018015	CTG	2	6	1026210	1026215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961223
19059	NC_018015	ACG	2	6	1026226	1026231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961223
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19065	NC_018015	CA	3	6	1026559	1026564	50 %	0 %	0 %	50 %	390961223
19066	NC_018015	ATC	2	6	1026576	1026581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961223
19067	NC_018015	CGA	2	6	1026665	1026670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961223
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19069	NC_018015	TAC	2	6	1026717	1026722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961223
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19072	NC_018015	CG	3	6	1026784	1026789	0 %	0 %	50 %	50 %	390961223
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19084	NC_018015	GA	3	6	1027377	1027382	50 %	0 %	50 %	0 %	390961223
19085	NC_018015	CCG	2	6	1027405	1027410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390961223
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19090	NC_018015	AAAAC	2	10	1027566	1027575	80 %	0 %	0 %	20 %	390961223
19091	NC_018015	AGGA	2	8	1027602	1027609	50 %	0 %	50 %	0 %	390961223
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19109	NC_018015	TCA	2	6	1028955	1028960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961225
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19111	NC_018015	AAG	2	6	1029026	1029031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961225
19112	NC_018015	GAG	2	6	1029152	1029157	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961225
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19116	NC_018015	GAA	2	6	1029296	1029301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961225
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19118	NC_018015	TCC	2	6	1029369	1029374	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961225
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19223	NC_018015	TCCA	2	8	1034898	1034905	25 %	25 %	0 %	50 %	390961231
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19227	NC_018015	TCGT	2	8	1035115	1035122	0 %	50 %	25 %	25 %	390961231
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19231	NC_018015	GA	3	6	1035223	1035228	50 %	0 %	50 %	0 %	390961231
19232	NC_018015	TCA	2	6	1035256	1035261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961231
19233	NC_018015	CT	3	6	1035280	1035285	0 %	50 %	0 %	50 %	390961231
19234	NC_018015	TAA	2	6	1035311	1035316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390961231
19235	NC_018015	TAA	2	6	1035490	1035495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390961232
19236	NC_018015	GAA	2	6	1035501	1035506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961232
19237	NC_018015	CTA	2	6	1035602	1035607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961232
19238	NC_018015	CTC	2	6	1035643	1035648	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961232
19239	NC_018015	CTA	2	6	1035660	1035665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961232
19240	NC_018015	GAA	2	6	1035689	1035694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961232
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19245	NC_018015	CCT	2	6	1035905	1035910	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961232
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