MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus sp. CL1 chromosome

Total Repeats: 36405

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17501	NC_018015	GACTTC	2	12	949760	949771	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	390961141
17502	NC_018015	AAT	2	6	949843	949848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390961141
17503	NC_018015	GGCA	2	8	949917	949924	25 %	0 %	50 %	25 %	390961141
17504	NC_018015	GAT	2	6	949972	949977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961141
17505	NC_018015	GAA	2	6	950014	950019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961141
17506	NC_018015	GGT	2	6	950037	950042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390961141
17507	NC_018015	GAA	2	6	950056	950061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961141
17508	NC_018015	GAG	3	9	950138	950146	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961141
17509	NC_018015	GGGGT	2	10	950158	950167	0 %	20 %	80 %	0 %	390961141
17510	NC_018015	ATG	2	6	950201	950206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961141
17511	NC_018015	GAGG	2	8	950251	950258	25 %	0 %	75 %	0 %	390961141
17512	NC_018015	TGA	3	9	950323	950331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961142
17513	NC_018015	GGCGCA	2	12	950391	950402	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	390961142
17514	NC_018015	A	6	6	950440	950445	100 %	0 %	0 %	0 %	390961142
17515	NC_018015	AGGA	2	8	950465	950472	50 %	0 %	50 %	0 %	390961142
17516	NC_018015	GAG	2	6	950552	950557	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961142
17517	NC_018015	GGA	3	9	950623	950631	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961142
17518	NC_018015	TCG	2	6	950711	950716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961142
17519	NC_018015	AGG	2	6	950765	950770	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961142
17520	NC_018015	TTC	2	6	950801	950806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961142
17521	NC_018015	GAA	2	6	950840	950845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961142
17522	NC_018015	GAT	2	6	950900	950905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961142
17523	NC_018015	AG	3	6	950974	950979	50 %	0 %	50 %	0 %	390961142
17524	NC_018015	ACG	2	6	951039	951044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961142
17525	NC_018015	CTA	2	6	951205	951210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961142
17526	NC_018015	GAC	2	6	951287	951292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961142
17527	NC_018015	CAA	2	6	951295	951300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390961142
17528	NC_018015	CTCAA	2	10	951350	951359	40 %	20 %	0 %	40 %	390961142
17529	NC_018015	TGG	2	6	951398	951403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390961142
17530	NC_018015	GA	3	6	951409	951414	50 %	0 %	50 %	0 %	390961142
17531	NC_018015	TCG	2	6	951426	951431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961142
17532	NC_018015	GGAA	2	8	951477	951484	50 %	0 %	50 %	0 %	390961142
17533	NC_018015	AGGAG	2	10	951491	951500	40 %	0 %	60 %	0 %	390961142
17534	NC_018015	GAG	2	6	951524	951529	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961142
17535	NC_018015	AAG	2	6	951556	951561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961142
17536	NC_018015	GAT	2	6	951571	951576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961142
17537	NC_018015	AGG	2	6	951597	951602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961142
17538	NC_018015	G	7	7	951647	951653	0 %	0 %	100 %	0 %	390961142
17539	NC_018015	TCT	2	6	951712	951717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961143
17540	NC_018015	CCT	2	6	951731	951736	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961143
17541	NC_018015	CCT	2	6	951752	951757	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961143
17542	NC_018015	CG	3	6	951864	951869	0 %	0 %	50 %	50 %	390961143
17543	NC_018015	GCT	2	6	952047	952052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961143
17544	NC_018015	TGG	2	6	952069	952074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390961143
17545	NC_018015	ACC	2	6	952162	952167	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390961143
17546	NC_018015	GGA	2	6	952211	952216	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961143
17547	NC_018015	TCA	2	6	952220	952225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961143
17548	NC_018015	CCA	2	6	952283	952288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390961143
17549	NC_018015	GAG	2	6	952339	952344	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961143
17550	NC_018015	GAC	2	6	952377	952382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961143
17551	NC_018015	GAA	2	6	952463	952468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961143
17552	NC_018015	TCC	2	6	952507	952512	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961143
17553	NC_018015	GAG	2	6	952925	952930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961144
17554	NC_018015	AAG	2	6	952931	952936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961144
17555	NC_018015	ACC	2	6	952940	952945	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390961144
17556	NC_018015	TCC	2	6	953034	953039	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961144
17557	NC_018015	AGG	2	6	953064	953069	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961144
17558	NC_018015	AGG	3	9	953073	953081	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961144
17559	NC_018015	GAG	3	9	953090	953098	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961144
17560	NC_018015	GA	3	6	953220	953225	50 %	0 %	50 %	0 %	390961145
17561	NC_018015	GAGC	2	8	953243	953250	25 %	0 %	50 %	25 %	390961145
17562	NC_018015	CGA	2	6	953351	953356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961145
17563	NC_018015	TGA	2	6	953372	953377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961145
17564	NC_018015	CGA	2	6	953390	953395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961145
17565	NC_018015	GA	3	6	953433	953438	50 %	0 %	50 %	0 %	390961145
17566	NC_018015	CGA	2	6	953444	953449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961145
17567	NC_018015	CTC	2	6	953463	953468	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961145
17568	NC_018015	TAC	2	6	953469	953474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961145
17569	NC_018015	GAC	2	6	953475	953480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961145
17570	NC_018015	GAG	2	6	953505	953510	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961145
17571	NC_018015	GACG	2	8	953555	953562	25 %	0 %	50 %	25 %	390961145
17572	NC_018015	ACC	2	6	953569	953574	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390961145
17573	NC_018015	CTC	2	6	953631	953636	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961145
17574	NC_018015	GCTGG	2	10	953705	953714	0 %	20 %	60 %	20 %	390961145
17575	NC_018015	GGC	2	6	953777	953782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390961145
17576	NC_018015	GGAA	2	8	953823	953830	50 %	0 %	50 %	0 %	390961145
17577	NC_018015	GAA	3	9	953828	953836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961145
17578	NC_018015	ATA	2	6	953859	953864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390961145
17579	NC_018015	ACT	2	6	953890	953895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961145
17580	NC_018015	GAGG	2	8	953954	953961	25 %	0 %	75 %	0 %	390961145
17581	NC_018015	CAC	2	6	953967	953972	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390961145
17582	NC_018015	GAA	2	6	953984	953989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961145
17583	NC_018015	TCG	2	6	954010	954015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961145
17584	NC_018015	ACT	2	6	954040	954045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961145
17585	NC_018015	TCA	2	6	954109	954114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961145
17586	NC_018015	AAG	2	6	954132	954137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961145
17587	NC_018015	GCG	2	6	954139	954144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390961145
17588	NC_018015	GAG	2	6	954177	954182	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961145
17589	NC_018015	GAT	2	6	954218	954223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961145
17590	NC_018015	CCG	2	6	954240	954245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390961145
17591	NC_018015	ATG	2	6	954252	954257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961145
17592	NC_018015	GTC	2	6	954276	954281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961145
17593	NC_018015	TGGAA	2	10	954356	954365	40 %	20 %	40 %	0 %	390961146
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17599	NC_018015	ACGG	2	8	954587	954594	25 %	0 %	50 %	25 %	390961147
17600	NC_018015	GCC	2	6	954605	954610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390961147
17601	NC_018015	CGA	2	6	954679	954684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961147
17602	NC_018015	ACC	2	6	954786	954791	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390961147
17603	NC_018015	TCG	2	6	954873	954878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961147
17604	NC_018015	GA	3	6	954939	954944	50 %	0 %	50 %	0 %	390961147
17605	NC_018015	AGGG	2	8	954983	954990	25 %	0 %	75 %	0 %	390961147
17606	NC_018015	TCG	2	6	955017	955022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961147
17607	NC_018015	GGA	2	6	955066	955071	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961147
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17609	NC_018015	CAT	2	6	955231	955236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961147
17610	NC_018015	GGT	2	6	955285	955290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390961147
17611	NC_018015	CGG	2	6	955408	955413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390961147
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17613	NC_018015	TGAGG	2	10	955488	955497	20 %	20 %	60 %	0 %	390961147
17614	NC_018015	GAAAG	2	10	955510	955519	60 %	0 %	40 %	0 %	390961148
17615	NC_018015	AGG	2	6	955523	955528	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961148
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17617	NC_018015	CCGCC	2	10	955571	955580	0 %	0 %	20 %	80 %	390961148
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17619	NC_018015	CGA	2	6	955605	955610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961148
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