MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus sp. CL1 chromosome

Total Repeats: 36405

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17001	NC_018015	GCCGTG	2	12	921762	921773	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	390961120
17002	NC_018015	GAA	2	6	921780	921785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961120
17003	NC_018015	TCG	2	6	921808	921813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961120
17004	NC_018015	AGA	2	6	921908	921913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961120
17005	NC_018015	TCC	2	6	921952	921957	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961120
17006	NC_018015	CTC	2	6	922093	922098	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961121
17007	NC_018015	CAT	2	6	922165	922170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961121
17008	NC_018015	CTC	3	9	922261	922269	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961121
17009	NC_018015	GAGC	2	8	922279	922286	25 %	0 %	50 %	25 %	390961121
17010	NC_018015	TCC	2	6	922304	922309	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961121
17011	NC_018015	ATC	2	6	922337	922342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961121
17012	NC_018015	CCA	2	6	922566	922571	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390961122
17013	NC_018015	GA	3	6	922592	922597	50 %	0 %	50 %	0 %	390961122
17014	NC_018015	GCCT	2	8	922688	922695	0 %	25 %	25 %	50 %	390961122
17015	NC_018015	CTGC	2	8	922774	922781	0 %	25 %	25 %	50 %	390961122
17016	NC_018015	GAA	2	6	922802	922807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961122
17017	NC_018015	CTG	2	6	922823	922828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961122
17018	NC_018015	GAC	2	6	922832	922837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961122
17019	NC_018015	TGA	2	6	922905	922910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961122
17020	NC_018015	TGG	2	6	922962	922967	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390961122
17021	NC_018015	GAA	2	6	922974	922979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961122
17022	NC_018015	ACA	2	6	923022	923027	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390961122
17023	NC_018015	GCC	2	6	923030	923035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390961122
17024	NC_018015	TGG	2	6	923106	923111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390961122
17025	NC_018015	GGT	2	6	923125	923130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390961122
17026	NC_018015	CTGGA	2	10	923165	923174	20 %	20 %	40 %	20 %	390961122
17027	NC_018015	GGT	2	6	923260	923265	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390961122
17028	NC_018015	CGG	3	9	923622	923630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390961123
17029	NC_018015	CCA	2	6	923646	923651	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390961123
17030	NC_018015	GTTCA	2	10	923720	923729	20 %	40 %	20 %	20 %	390961123
17031	NC_018015	ACC	2	6	923744	923749	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390961123
17032	NC_018015	AG	3	6	923756	923761	50 %	0 %	50 %	0 %	390961123
17033	NC_018015	TGC	2	6	923794	923799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961123
17034	NC_018015	GGA	2	6	923830	923835	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961123
17035	NC_018015	TAC	2	6	923861	923866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961123
17036	NC_018015	GAA	2	6	924044	924049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961123
17037	NC_018015	AAATGG	2	12	924113	924124	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	390961123
17038	NC_018015	TAA	2	6	924165	924170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390961123
17039	NC_018015	CGA	2	6	924184	924189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961123
17040	NC_018015	GCA	2	6	924245	924250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961123
17041	NC_018015	CAA	2	6	924298	924303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390961123
17042	NC_018015	TGG	2	6	924380	924385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390961123
17043	NC_018015	AGT	2	6	924400	924405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961123
17044	NC_018015	ACA	2	6	924429	924434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390961123
17045	NC_018015	CTA	2	6	924448	924453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961123
17046	NC_018015	CTG	2	6	924503	924508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961123
17047	NC_018015	AGT	2	6	924617	924622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961123
17048	NC_018015	ATA	2	6	924671	924676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390961123
17049	NC_018015	GGA	2	6	924695	924700	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961123
17050	NC_018015	A	6	6	924716	924721	100 %	0 %	0 %	0 %	390961123
17051	NC_018015	AGG	2	6	924801	924806	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961123
17052	NC_018015	AAC	2	6	924860	924865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390961123
17053	NC_018015	GGAAC	2	10	924974	924983	40 %	0 %	40 %	20 %	390961123
17054	NC_018015	TCA	2	6	925113	925118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961123
17055	NC_018015	AGC	2	6	925142	925147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961123
17056	NC_018015	GAT	2	6	925157	925162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961123
17057	NC_018015	GAG	2	6	925196	925201	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961123
17058	NC_018015	CTC	2	6	925204	925209	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961123
17059	NC_018015	C	6	6	925266	925271	0 %	0 %	0 %	100 %	390961123
17060	NC_018015	TAAAA	2	10	925309	925318	80 %	20 %	0 %	0 %	390961123
17061	NC_018015	TTA	2	6	925354	925359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390961123
17062	NC_018015	CATA	2	8	925377	925384	50 %	25 %	0 %	25 %	390961123
17063	NC_018015	CAT	2	6	925396	925401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961123
17064	NC_018015	CT	3	6	925429	925434	0 %	50 %	0 %	50 %	390961123
17065	NC_018015	CGA	2	6	925450	925455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961123
17066	NC_018015	TAC	2	6	925535	925540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961123
17067	NC_018015	CACC	2	8	925675	925682	25 %	0 %	0 %	75 %	390961123
17068	NC_018015	ATA	2	6	925712	925717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390961123
17069	NC_018015	CAC	2	6	925774	925779	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390961123
17070	NC_018015	TAC	2	6	925861	925866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961123
17071	NC_018015	GGA	2	6	925952	925957	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961123
17072	NC_018015	GGA	2	6	926003	926008	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961123
17073	NC_018015	GGGA	2	8	926226	926233	25 %	0 %	75 %	0 %	390961123
17074	NC_018015	TGAAG	2	10	926260	926269	40 %	20 %	40 %	0 %	390961123
17075	NC_018015	CGT	2	6	926280	926285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961123
17076	NC_018015	CAT	2	6	926340	926345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961123
17077	NC_018015	CA	3	6	926352	926357	50 %	0 %	0 %	50 %	390961123
17078	NC_018015	AGG	2	6	926382	926387	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961123
17079	NC_018015	A	7	7	926401	926407	100 %	0 %	0 %	0 %	390961123
17080	NC_018015	GAT	2	6	926495	926500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961123
17081	NC_018015	TAT	2	6	926513	926518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390961123
17082	NC_018015	AGA	2	6	926629	926634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961123
17083	NC_018015	GCA	2	6	926726	926731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961123
17084	NC_018015	GGA	2	6	926789	926794	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961123
17085	NC_018015	TCC	2	6	926805	926810	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961123
17086	NC_018015	AAC	2	6	926873	926878	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390961123
17087	NC_018015	AGG	2	6	926884	926889	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961123
17088	NC_018015	GA	3	6	926900	926905	50 %	0 %	50 %	0 %	390961124
17089	NC_018015	TC	3	6	926939	926944	0 %	50 %	0 %	50 %	390961124
17090	NC_018015	CTGT	2	8	927099	927106	0 %	50 %	25 %	25 %	390961124
17091	NC_018015	GGC	2	6	927107	927112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390961124
17092	NC_018015	GGAAT	2	10	927123	927132	40 %	20 %	40 %	0 %	390961124
17093	NC_018015	TGAA	2	8	927214	927221	50 %	25 %	25 %	0 %	390961124
17094	NC_018015	GGA	2	6	927227	927232	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961124
17095	NC_018015	TAA	2	6	927268	927273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390961124
17096	NC_018015	GGT	2	6	927301	927306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390961124
17097	NC_018015	AGC	2	6	927341	927346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961124
17098	NC_018015	TTTCC	2	10	927489	927498	0 %	60 %	0 %	40 %	390961125
17099	NC_018015	ATT	2	6	927561	927566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390961125
17100	NC_018015	TAC	2	6	927667	927672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961125
17101	NC_018015	CAG	2	6	927714	927719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961125
17102	NC_018015	AACT	2	8	927735	927742	50 %	25 %	0 %	25 %	390961125
17103	NC_018015	TCC	2	6	927773	927778	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961125
17104	NC_018015	TTC	2	6	927868	927873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961125
17105	NC_018015	CGC	2	6	928267	928272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390961126
17106	NC_018015	CTT	2	6	928313	928318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961126
17107	NC_018015	CGA	2	6	928321	928326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961126
17108	NC_018015	CTTC	2	8	928379	928386	0 %	50 %	0 %	50 %	390961126
17109	NC_018015	GAC	2	6	928433	928438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961126
17110	NC_018015	GTA	2	6	928691	928696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961126
17111	NC_018015	CAA	2	6	928765	928770	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390961126
17112	NC_018015	TCG	2	6	928842	928847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961126
17113	NC_018015	GAA	2	6	928873	928878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961126
17114	NC_018015	TCA	2	6	928893	928898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961126
17115	NC_018015	TCC	2	6	928932	928937	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961126
17116	NC_018015	CTT	2	6	928952	928957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961126
17117	NC_018015	TCA	2	6	928969	928974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961126
17118	NC_018015	GTC	2	6	928982	928987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961126
17119	NC_018015	TCC	2	6	929052	929057	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961126
17120	NC_018015	CGA	2	6	929080	929085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961126
17121	NC_018015	TTC	2	6	929180	929185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961126
17122	NC_018015	GTA	2	6	929207	929212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961126
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17124	NC_018015	GTC	2	6	929312	929317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961126
17125	NC_018015	GCT	2	6	929329	929334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961126
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17130	NC_018015	CCT	2	6	929450	929455	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961126
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17134	NC_018015	TGA	2	6	929713	929718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961127
17135	NC_018015	GGT	2	6	929819	929824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390961127
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17139	NC_018015	TCC	2	6	930102	930107	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961127
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17145	NC_018015	TCGT	2	8	930392	930399	0 %	50 %	25 %	25 %	390961128
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17148	NC_018015	CGA	2	6	930528	930533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961128
17149	NC_018015	CGA	2	6	930540	930545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961128
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17221	NC_018015	GTA	2	6	933853	933858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961131
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17228	NC_018015	AGT	2	6	934308	934313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961131
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17232	NC_018015	TGC	2	6	934619	934624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961131
17233	NC_018015	CTG	2	6	934634	934639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961131
17234	NC_018015	TCCAG	2	10	934677	934686	20 %	20 %	20 %	40 %	390961131
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17473	NC_018015	CCTTCT	2	12	948185	948196	0 %	50 %	0 %	50 %	390961140
17474	NC_018015	CCG	2	6	948239	948244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390961140
17475	NC_018015	GCG	2	6	948293	948298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390961140
17476	NC_018015	TCG	2	6	948331	948336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961140
17477	NC_018015	CGA	2	6	948360	948365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961140
17478	NC_018015	GCG	2	6	948410	948415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390961140
17479	NC_018015	GGT	2	6	948512	948517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390961140
17480	NC_018015	TCT	2	6	948545	948550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961140
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