MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus sp. CL1 chromosome

Total Repeats: 36405

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16002	NC_018015	GCG	2	6	867947	867952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390961069
16003	NC_018015	GAG	2	6	867953	867958	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961069
16004	NC_018015	GAC	2	6	867968	867973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961069
16005	NC_018015	CTA	2	6	868006	868011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961069
16006	NC_018015	ACC	2	6	868062	868067	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390961069
16007	NC_018015	AT	3	6	868125	868130	50 %	50 %	0 %	0 %	390961069
16008	NC_018015	C	6	6	868168	868173	0 %	0 %	0 %	100 %	390961069
16009	NC_018015	TCC	2	6	868272	868277	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961069
16010	NC_018015	TGG	2	6	868311	868316	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390961069
16011	NC_018015	CGA	2	6	868333	868338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961069
16012	NC_018015	GAA	2	6	868339	868344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961069
16013	NC_018015	G	6	6	869680	869685	0 %	0 %	100 %	0 %	390961070
16014	NC_018015	CGG	2	6	869689	869694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390961070
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16016	NC_018015	CGT	2	6	869741	869746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961070
16017	NC_018015	CTTT	2	8	869749	869756	0 %	75 %	0 %	25 %	390961070
16018	NC_018015	TCC	2	6	869759	869764	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961070
16019	NC_018015	GTA	2	6	869773	869778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961070
16020	NC_018015	CAC	2	6	869812	869817	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390961070
16021	NC_018015	TGG	2	6	869856	869861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390961070
16022	NC_018015	GAC	2	6	869900	869905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961070
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16025	NC_018015	TA	3	6	870110	870115	50 %	50 %	0 %	0 %	390961070
16026	NC_018015	CAA	2	6	870159	870164	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390961070
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16030	NC_018015	TC	3	6	870436	870441	0 %	50 %	0 %	50 %	390961070
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16033	NC_018015	GGA	2	6	870605	870610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961070
16034	NC_018015	GA	3	6	870709	870714	50 %	0 %	50 %	0 %	390961070
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16040	NC_018015	AGGA	2	8	871219	871226	50 %	0 %	50 %	0 %	390961070
16041	NC_018015	TCA	2	6	871272	871277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961070
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16043	NC_018015	AGG	2	6	871333	871338	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961071
16044	NC_018015	CGA	2	6	871361	871366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961071
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16047	NC_018015	GGT	2	6	871619	871624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390961072
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16049	NC_018015	GGA	2	6	871633	871638	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961072
16050	NC_018015	AGG	2	6	871656	871661	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961072
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16052	NC_018015	GAG	2	6	871805	871810	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961072
16053	NC_018015	TCC	3	9	871905	871913	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961072
16054	NC_018015	CAG	2	6	871916	871921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961072
16055	NC_018015	TCC	2	6	871989	871994	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961072
16056	NC_018015	GGC	2	6	872357	872362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390961073
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16058	NC_018015	AGG	2	6	872562	872567	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961073
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16060	NC_018015	GGC	2	6	872651	872656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390961073
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16064	NC_018015	ACG	2	6	872793	872798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961073
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16067	NC_018015	TCG	2	6	872964	872969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961073
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16069	NC_018015	GA	4	8	872983	872990	50 %	0 %	50 %	0 %	390961073
16070	NC_018015	GCACT	2	10	872993	873002	20 %	20 %	20 %	40 %	390961073
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16103	NC_018015	GAG	2	6	874660	874665	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961075
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16115	NC_018015	GCCG	2	8	875559	875566	0 %	0 %	50 %	50 %	390961076
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16239	NC_018015	GCT	3	9	880667	880675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961081
16240	NC_018015	TGC	2	6	880687	880692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961081
16241	NC_018015	CGT	2	6	880696	880701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961081
16242	NC_018015	CGA	2	6	880717	880722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961081
16243	NC_018015	GTC	2	6	880790	880795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961081
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16245	NC_018015	GGTA	2	8	880867	880874	25 %	25 %	50 %	0 %	390961081
16246	NC_018015	GCG	2	6	880875	880880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390961081
16247	NC_018015	GTA	2	6	880901	880906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961081
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16249	NC_018015	GTA	2	6	880955	880960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961081
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16339	NC_018015	TTCG	2	8	886344	886351	0 %	50 %	25 %	25 %	390961085
16340	NC_018015	CAG	2	6	886359	886364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961085
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16350	NC_018015	TGG	2	6	886657	886662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390961085
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16475	NC_018015	TCC	3	9	892805	892813	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961091
16476	NC_018015	TTG	2	6	892868	892873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390961091
16477	NC_018015	AGT	2	6	892896	892901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961091
16478	NC_018015	GCC	2	6	892936	892941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390961091
16479	NC_018015	TCC	2	6	892956	892961	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961091
16480	NC_018015	TGA	2	6	892998	893003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961091
16481	NC_018015	ACCT	2	8	893005	893012	25 %	25 %	0 %	50 %	390961091
16482	NC_018015	GGC	2	6	893084	893089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390961091
16483	NC_018015	TTCC	2	8	893119	893126	0 %	50 %	0 %	50 %	390961091
16484	NC_018015	TAC	2	6	893182	893187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961091
16485	NC_018015	CTC	2	6	893198	893203	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961091
16486	NC_018015	TTG	2	6	893258	893263	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390961091
16487	NC_018015	CGT	2	6	893298	893303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961091
16488	NC_018015	GAG	2	6	893380	893385	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961091
16489	NC_018015	GGC	2	6	893415	893420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390961091
16490	NC_018015	CCT	3	9	893445	893453	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961091
16491	NC_018015	C	6	6	893503	893508	0 %	0 %	0 %	100 %	390961091
16492	NC_018015	GCC	3	9	893521	893529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390961091
16493	NC_018015	CTGTC	2	10	893544	893553	0 %	40 %	20 %	40 %	390961091
16494	NC_018015	GAG	2	6	893554	893559	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961091
16495	NC_018015	CCCTCT	2	12	893568	893579	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961091
16496	NC_018015	GAA	2	6	893757	893762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961092
16497	NC_018015	TCG	2	6	893779	893784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961092
16498	NC_018015	GCT	2	6	893789	893794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961092
16499	NC_018015	TGA	2	6	893795	893800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961092
16500	NC_018015	ATG	2	6	893830	893835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961092

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