MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus sp. CL1 chromosome

Total Repeats: 36405

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_018015	TCG	2	6	842246	842251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961048
15502	NC_018015	TCCT	2	8	842279	842286	0 %	50 %	0 %	50 %	390961048
15503	NC_018015	GAG	2	6	842305	842310	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961048
15504	NC_018015	GGA	2	6	842313	842318	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961048
15505	NC_018015	TCC	2	6	842495	842500	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961048
15506	NC_018015	TCT	2	6	842505	842510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961048
15507	NC_018015	CGA	2	6	842568	842573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961048
15508	NC_018015	GAGC	2	8	842587	842594	25 %	0 %	50 %	25 %	390961048
15509	NC_018015	CGT	2	6	842601	842606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961048
15510	NC_018015	GAG	2	6	842671	842676	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961048
15511	NC_018015	TAC	2	6	843015	843020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961049
15512	NC_018015	TAG	2	6	843127	843132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961049
15513	NC_018015	TTC	2	6	843144	843149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961049
15514	NC_018015	ACCT	2	8	843165	843172	25 %	25 %	0 %	50 %	390961049
15515	NC_018015	TTC	2	6	843199	843204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961049
15516	NC_018015	CGA	2	6	843284	843289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961049
15517	NC_018015	TAC	2	6	843300	843305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961049
15518	NC_018015	CGG	2	6	843524	843529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390961049
15519	NC_018015	ACG	2	6	843631	843636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961049
15520	NC_018015	ACT	2	6	843643	843648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961049
15521	NC_018015	CCA	2	6	843746	843751	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390961049
15522	NC_018015	CTT	2	6	843758	843763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961049
15523	NC_018015	CTT	2	6	843770	843775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961049
15524	NC_018015	ATG	2	6	844011	844016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961049
15525	NC_018015	CCG	2	6	844071	844076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390961049
15526	NC_018015	TCG	2	6	844123	844128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961049
15527	NC_018015	GAC	2	6	844140	844145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961049
15528	NC_018015	GGCTCT	2	12	844150	844161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961049
15529	NC_018015	TTC	2	6	844215	844220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961049
15530	NC_018015	ACG	2	6	844354	844359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961049
15531	NC_018015	AAG	2	6	844361	844366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961049
15532	NC_018015	GC	3	6	844375	844380	0 %	0 %	50 %	50 %	390961049
15533	NC_018015	TGA	2	6	844390	844395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961049
15534	NC_018015	CGA	2	6	844427	844432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961049
15535	NC_018015	GAC	2	6	844526	844531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961049
15536	NC_018015	GCA	2	6	844558	844563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961049
15537	NC_018015	AAT	2	6	844613	844618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390961049
15538	NC_018015	AG	3	6	844640	844645	50 %	0 %	50 %	0 %	390961049
15539	NC_018015	A	6	6	844670	844675	100 %	0 %	0 %	0 %	390961049
15540	NC_018015	GTTT	2	8	844919	844926	0 %	75 %	25 %	0 %	390961050
15541	NC_018015	CGT	2	6	844959	844964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961050
15542	NC_018015	CAC	2	6	845004	845009	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390961050
15543	NC_018015	CAG	2	6	845010	845015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961050
15544	NC_018015	CGAG	2	8	845018	845025	25 %	0 %	50 %	25 %	390961050
15545	NC_018015	ACC	2	6	845026	845031	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390961050
15546	NC_018015	CGAG	2	8	845036	845043	25 %	0 %	50 %	25 %	390961050
15547	NC_018015	ACC	2	6	845074	845079	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390961050
15548	NC_018015	GGT	2	6	845106	845111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390961050
15549	NC_018015	GAG	2	6	845164	845169	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961050
15550	NC_018015	GCC	2	6	845239	845244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390961050
15551	NC_018015	GAC	2	6	845332	845337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961050
15552	NC_018015	CGC	2	6	845424	845429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390961050
15553	NC_018015	ACA	2	6	845450	845455	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390961050
15554	NC_018015	GAGC	2	8	845466	845473	25 %	0 %	50 %	25 %	390961050
15555	NC_018015	CGA	2	6	845487	845492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961050
15556	NC_018015	GGA	2	6	845508	845513	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961050
15557	NC_018015	GAG	2	6	845530	845535	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961050
15558	NC_018015	CGG	2	6	845595	845600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390961050
15559	NC_018015	CTA	2	6	845601	845606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961050
15560	NC_018015	CGA	2	6	845610	845615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961050
15561	NC_018015	TTC	3	9	845668	845676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961050
15562	NC_018015	CAG	2	6	845722	845727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961050
15563	NC_018015	AGGGC	2	10	845741	845750	20 %	0 %	60 %	20 %	390961050
15564	NC_018015	GAT	2	6	845754	845759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961050
15565	NC_018015	GTT	2	6	845815	845820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390961050
15566	NC_018015	GCC	2	6	845826	845831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390961050
15567	NC_018015	CGC	2	6	845919	845924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390961050
15568	NC_018015	CAC	2	6	845946	845951	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390961050
15569	NC_018015	GCTC	2	8	845973	845980	0 %	25 %	25 %	50 %	390961050
15570	NC_018015	AGG	2	6	846008	846013	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961050
15571	NC_018015	CAG	2	6	846199	846204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961050
15572	NC_018015	ACA	2	6	846215	846220	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390961050
15573	NC_018015	GAA	2	6	846273	846278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961051
15574	NC_018015	ACC	2	6	846283	846288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390961051
15575	NC_018015	TTC	2	6	846331	846336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961051
15576	NC_018015	ATA	2	6	846349	846354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390961051
15577	NC_018015	GCC	2	6	846420	846425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390961051
15578	NC_018015	TCG	2	6	846434	846439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961051
15579	NC_018015	ACG	2	6	846467	846472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961051
15580	NC_018015	TCG	2	6	846509	846514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961051
15581	NC_018015	ACA	2	6	846566	846571	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390961051
15582	NC_018015	CCT	2	6	846606	846611	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961051
15583	NC_018015	CTC	2	6	846634	846639	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961051
15584	NC_018015	TGGC	2	8	846784	846791	0 %	25 %	50 %	25 %	390961051
15585	NC_018015	CCG	2	6	846818	846823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390961051
15586	NC_018015	TGG	2	6	846848	846853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390961051
15587	NC_018015	GGC	2	6	846855	846860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390961051
15588	NC_018015	ATA	2	6	846862	846867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390961051
15589	NC_018015	ACT	2	6	846878	846883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961051
15590	NC_018015	CGA	2	6	846938	846943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961051
15591	NC_018015	GCG	2	6	846955	846960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390961051
15592	NC_018015	GAGC	2	8	847052	847059	25 %	0 %	50 %	25 %	390961051
15593	NC_018015	GGC	3	9	847074	847082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390961051
15594	NC_018015	ACGTCA	2	12	847124	847135	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	390961051
15595	NC_018015	AGG	2	6	847151	847156	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961051
15596	NC_018015	GAT	2	6	847166	847171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961051
15597	NC_018015	TCACCC	2	12	847204	847215	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	390961052
15598	NC_018015	TCA	2	6	847237	847242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961052
15599	NC_018015	CTA	2	6	847256	847261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961052
15600	NC_018015	TGG	2	6	847447	847452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390961052
15601	NC_018015	CGT	2	6	847706	847711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961052
15602	NC_018015	TTC	2	6	847770	847775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961052
15603	NC_018015	ATA	2	6	847797	847802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390961052
15604	NC_018015	CTG	2	6	847818	847823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961052
15605	NC_018015	TTC	2	6	847872	847877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961052
15606	NC_018015	GGA	2	6	847926	847931	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961052
15607	NC_018015	GTC	2	6	847968	847973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961052
15608	NC_018015	CGC	2	6	848018	848023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390961052
15609	NC_018015	CTC	2	6	848049	848054	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961052
15610	NC_018015	GGC	2	6	848093	848098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390961052
15611	NC_018015	TGG	2	6	848101	848106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390961052
15612	NC_018015	GGC	2	6	848196	848201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390961052
15613	NC_018015	CCT	3	9	848270	848278	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961052
15614	NC_018015	GGC	2	6	848280	848285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390961052
15615	NC_018015	CGG	3	9	848317	848325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390961052
15616	NC_018015	GGA	2	6	848400	848405	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961052
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15618	NC_018015	CCGAA	2	10	848509	848518	40 %	0 %	20 %	40 %	390961053
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15622	NC_018015	CTA	2	6	848639	848644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961053
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15737	NC_018015	CG	3	6	853891	853896	0 %	0 %	50 %	50 %	390961055
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