MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus sp. CL1 chromosome

Total Repeats: 36405

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_018015	GAGCT	2	10	814778	814787	20 %	20 %	40 %	20 %	390961027
15002	NC_018015	CAC	2	6	814832	814837	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390961027
15003	NC_018015	GGA	2	6	814858	814863	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961027
15004	NC_018015	CTC	2	6	814877	814882	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961027
15005	NC_018015	TCG	2	6	814926	814931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961027
15006	NC_018015	TCA	2	6	814989	814994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961027
15007	NC_018015	TGG	2	6	815153	815158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390961028
15008	NC_018015	CGCT	2	8	815181	815188	0 %	25 %	25 %	50 %	390961028
15009	NC_018015	GAGGG	2	10	815236	815245	20 %	0 %	80 %	0 %	390961028
15010	NC_018015	AGGTCA	2	12	815289	815300	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	390961028
15011	NC_018015	GAG	2	6	815327	815332	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961028
15012	NC_018015	AAG	2	6	815384	815389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961028
15013	NC_018015	TGA	2	6	815401	815406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961028
15014	NC_018015	GAA	2	6	815452	815457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961028
15015	NC_018015	AGG	2	6	815469	815474	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961028
15016	NC_018015	GCCT	2	8	815483	815490	0 %	25 %	25 %	50 %	390961028
15017	NC_018015	GAG	2	6	815567	815572	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961028
15018	NC_018015	A	8	8	815745	815752	100 %	0 %	0 %	0 %	390961029
15019	NC_018015	TTG	2	6	815769	815774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390961029
15020	NC_018015	TAGTT	2	10	815786	815795	20 %	60 %	20 %	0 %	390961029
15021	NC_018015	CTA	2	6	815821	815826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961029
15022	NC_018015	TA	3	6	815882	815887	50 %	50 %	0 %	0 %	390961029
15023	NC_018015	ATG	2	6	815899	815904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961029
15024	NC_018015	AGC	2	6	815988	815993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961029
15025	NC_018015	GAT	3	9	816039	816047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961029
15026	NC_018015	TGG	2	6	816095	816100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390961029
15027	NC_018015	AT	3	6	816128	816133	50 %	50 %	0 %	0 %	390961029
15028	NC_018015	CAA	2	6	816200	816205	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390961029
15029	NC_018015	TAC	2	6	816216	816221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961029
15030	NC_018015	GATAAA	2	12	816252	816263	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	390961029
15031	NC_018015	GA	3	6	816316	816321	50 %	0 %	50 %	0 %	390961029
15032	NC_018015	TA	3	6	816337	816342	50 %	50 %	0 %	0 %	390961029
15033	NC_018015	ATT	2	6	816367	816372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390961029
15034	NC_018015	TCA	2	6	816463	816468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961029
15035	NC_018015	GTC	3	9	816534	816542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961029
15036	NC_018015	CTG	2	6	816601	816606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961029
15037	NC_018015	GAG	2	6	816607	816612	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961029
15038	NC_018015	TGTA	2	8	816736	816743	25 %	50 %	25 %	0 %	390961029
15039	NC_018015	C	6	6	816769	816774	0 %	0 %	0 %	100 %	390961029
15040	NC_018015	AGA	2	6	816788	816793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961029
15041	NC_018015	AACAGT	2	12	816794	816805	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	390961029
15042	NC_018015	GAA	2	6	816807	816812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961029
15043	NC_018015	TA	3	6	816864	816869	50 %	50 %	0 %	0 %	390961029
15044	NC_018015	ATG	2	6	817105	817110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961029
15045	NC_018015	ATAGAA	2	12	817149	817160	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	390961029
15046	NC_018015	TA	3	6	817189	817194	50 %	50 %	0 %	0 %	390961029
15047	NC_018015	A	6	6	817203	817208	100 %	0 %	0 %	0 %	390961029
15048	NC_018015	CATA	2	8	817273	817280	50 %	25 %	0 %	25 %	390961029
15049	NC_018015	AAC	2	6	817285	817290	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390961029
15050	NC_018015	TGG	2	6	817304	817309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390961029
15051	NC_018015	AGA	2	6	817310	817315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961029
15052	NC_018015	TAT	2	6	817356	817361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390961029
15053	NC_018015	GAG	2	6	817390	817395	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961029
15054	NC_018015	CAT	2	6	817483	817488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961029
15055	NC_018015	TTG	2	6	817639	817644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390961029
15056	NC_018015	ATT	2	6	817720	817725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390961029
15057	NC_018015	AGA	2	6	817820	817825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961029
15058	NC_018015	ATA	2	6	817861	817866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390961029
15059	NC_018015	GAC	2	6	817887	817892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961029
15060	NC_018015	AT	3	6	817957	817962	50 %	50 %	0 %	0 %	390961029
15061	NC_018015	TGA	2	6	817964	817969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961029
15062	NC_018015	ATG	2	6	817987	817992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961029
15063	NC_018015	CGGA	2	8	817999	818006	25 %	0 %	50 %	25 %	390961029
15064	NC_018015	TAG	2	6	818009	818014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961029
15065	NC_018015	GATA	2	8	818030	818037	50 %	25 %	25 %	0 %	390961029
15066	NC_018015	AAG	2	6	818089	818094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961029
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15068	NC_018015	GAA	2	6	818144	818149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961029
15069	NC_018015	TGG	2	6	818204	818209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390961029
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15071	NC_018015	ATG	2	6	818431	818436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961029
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15074	NC_018015	ATGG	2	8	818485	818492	25 %	25 %	50 %	0 %	390961029
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15079	NC_018015	CTA	2	6	818762	818767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961029
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15090	NC_018015	GGCAGT	2	12	819554	819565	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	390961029
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15093	NC_018015	AGA	2	6	819686	819691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961029
15094	NC_018015	GAC	2	6	819723	819728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961029
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15097	NC_018015	ACA	2	6	819850	819855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390961029
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15101	NC_018015	GAT	2	6	820020	820025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961029
15102	NC_018015	CATA	3	12	820090	820101	50 %	25 %	0 %	25 %	390961029
15103	NC_018015	TGA	2	6	820154	820159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961029
15104	NC_018015	CCA	2	6	820221	820226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390961029
15105	NC_018015	CAA	2	6	820241	820246	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390961029
15106	NC_018015	GCGA	2	8	820305	820312	25 %	0 %	50 %	25 %	390961029
15107	NC_018015	AAG	2	6	820426	820431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961029
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15111	NC_018015	ACAA	2	8	820818	820825	75 %	0 %	0 %	25 %	390961029
15112	NC_018015	AGA	2	6	820826	820831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961029
15113	NC_018015	CA	3	6	820850	820855	50 %	0 %	0 %	50 %	390961029
15114	NC_018015	CA	4	8	820943	820950	50 %	0 %	0 %	50 %	390961029
15115	NC_018015	CT	3	6	820986	820991	0 %	50 %	0 %	50 %	390961029
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15120	NC_018015	TCC	2	6	821152	821157	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961029
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15477	NC_018015	CTC	2	6	841078	841083	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961047
15478	NC_018015	CTG	2	6	841097	841102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961047
15479	NC_018015	GTC	2	6	841106	841111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961047
15480	NC_018015	TA	3	6	841123	841128	50 %	50 %	0 %	0 %	390961047
15481	NC_018015	GGC	2	6	841129	841134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390961047
15482	NC_018015	AGT	2	6	841194	841199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961047
15483	NC_018015	TTG	2	6	841217	841222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390961047
15484	NC_018015	TTC	2	6	841262	841267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961047
15485	NC_018015	TCA	2	6	841344	841349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961047
15486	NC_018015	CGCT	2	8	841356	841363	0 %	25 %	25 %	50 %	390961047
15487	NC_018015	GAG	2	6	841387	841392	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961047
15488	NC_018015	CT	4	8	841465	841472	0 %	50 %	0 %	50 %	390961047
15489	NC_018015	CCTC	2	8	841491	841498	0 %	25 %	0 %	75 %	390961047
15490	NC_018015	ATT	2	6	841508	841513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390961047
15491	NC_018015	C	6	6	841628	841633	0 %	0 %	0 %	100 %	390961047
15492	NC_018015	GAG	2	6	841942	841947	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961048
15493	NC_018015	TGA	2	6	841950	841955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961048
15494	NC_018015	CTG	2	6	841992	841997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961048
15495	NC_018015	TGA	2	6	842013	842018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961048
15496	NC_018015	TGT	2	6	842025	842030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390961048
15497	NC_018015	CTC	2	6	842111	842116	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961048
15498	NC_018015	GAA	2	6	842137	842142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961048
15499	NC_018015	CTC	2	6	842201	842206	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961048
15500	NC_018015	TGT	2	6	842217	842222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390961048

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