MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus sp. CL1 chromosome

Total Repeats: 36405

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_018015	AGCT	2	8	53019	53026	25 %	25 %	25 %	25 %	390960233
1002	NC_018015	ACT	2	6	53199	53204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960233
1003	NC_018015	GTA	3	9	53261	53269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960233
1004	NC_018015	CAC	2	6	53304	53309	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960233
1005	NC_018015	TGA	2	6	53324	53329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960233
1006	NC_018015	TC	3	6	53393	53398	0 %	50 %	0 %	50 %	390960233
1007	NC_018015	GTC	2	6	53498	53503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960234
1008	NC_018015	GTC	2	6	53515	53520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960234
1009	NC_018015	TTCCA	2	10	53549	53558	20 %	40 %	0 %	40 %	390960234
1010	NC_018015	CGA	2	6	53590	53595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960234
1011	NC_018015	TTC	2	6	53697	53702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960234
1012	NC_018015	TAG	2	6	53967	53972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960235
1013	NC_018015	TGGG	2	8	54167	54174	0 %	25 %	75 %	0 %	390960235
1014	NC_018015	GAG	3	9	54215	54223	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960235
1015	NC_018015	AG	3	6	54265	54270	50 %	0 %	50 %	0 %	390960235
1016	NC_018015	GAG	2	6	54319	54324	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960235
1017	NC_018015	GAC	2	6	54347	54352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960235
1018	NC_018015	ACT	2	6	54363	54368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960235
1019	NC_018015	GAAA	2	8	54387	54394	75 %	0 %	25 %	0 %	390960235
1020	NC_018015	CTC	2	6	54395	54400	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960235
1021	NC_018015	GAT	3	9	54475	54483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960235
1022	NC_018015	GGA	2	6	54487	54492	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960235
1023	NC_018015	CCG	2	6	54558	54563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960235
1024	NC_018015	TCC	2	6	54591	54596	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960235
1025	NC_018015	CTA	2	6	54610	54615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960235
1026	NC_018015	GCTG	2	8	54650	54657	0 %	25 %	50 %	25 %	390960235
1027	NC_018015	GCC	2	6	54674	54679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960235
1028	NC_018015	GC	3	6	54703	54708	0 %	0 %	50 %	50 %	390960235
1029	NC_018015	GGCA	2	8	54718	54725	25 %	0 %	50 %	25 %	390960235
1030	NC_018015	CGG	2	6	54766	54771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960235
1031	NC_018015	CGGCGC	2	12	54814	54825	0 %	0 %	50 %	50 %	390960235
1032	NC_018015	GAG	2	6	54871	54876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960235
1033	NC_018015	ACC	2	6	55006	55011	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960236
1034	NC_018015	CTT	3	9	55047	55055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960236
1035	NC_018015	CCG	2	6	55057	55062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960236
1036	NC_018015	GGT	2	6	55078	55083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960236
1037	NC_018015	CTT	2	6	55179	55184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960236
1038	NC_018015	CTT	2	6	55308	55313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960236
1039	NC_018015	AAG	2	6	55330	55335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960236
1040	NC_018015	TAC	2	6	55342	55347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960236
1041	NC_018015	AGG	2	6	55427	55432	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960236
1042	NC_018015	GAA	2	6	55599	55604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960236
1043	NC_018015	CCT	2	6	55611	55616	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960236
1044	NC_018015	CGGC	2	8	55661	55668	0 %	0 %	50 %	50 %	390960236
1045	NC_018015	CGG	2	6	55695	55700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960236
1046	NC_018015	AGG	2	6	55756	55761	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960236
1047	NC_018015	GGAAA	2	10	55832	55841	60 %	0 %	40 %	0 %	390960237
1048	NC_018015	AAG	3	9	55892	55900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960237
1049	NC_018015	GAC	2	6	55916	55921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960237
1050	NC_018015	AGG	2	6	55964	55969	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960237
1051	NC_018015	AAG	2	6	56042	56047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960237
1052	NC_018015	AGG	3	9	56121	56129	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960237
1053	NC_018015	ACG	2	6	56151	56156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960237
1054	NC_018015	GAT	2	6	56161	56166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960237
1055	NC_018015	GAG	2	6	56177	56182	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960237
1056	NC_018015	CGA	2	6	56257	56262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960237
1057	NC_018015	CGG	2	6	56310	56315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960237
1058	NC_018015	GTGA	2	8	56316	56323	25 %	25 %	50 %	0 %	390960237
1059	NC_018015	TCA	2	6	56392	56397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960238
1060	NC_018015	ACG	2	6	56464	56469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960238
1061	NC_018015	GAC	2	6	56495	56500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960238
1062	NC_018015	CTC	2	6	56514	56519	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960238
1063	NC_018015	GGA	2	6	56601	56606	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960238
1064	NC_018015	TAC	2	6	56640	56645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960238
1065	NC_018015	TCA	2	6	56683	56688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960238
1066	NC_018015	GTC	2	6	56694	56699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960238
1067	NC_018015	CTG	2	6	56722	56727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960238
1068	NC_018015	ATG	2	6	56766	56771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960238
1069	NC_018015	TCG	2	6	56794	56799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960238
1070	NC_018015	GGA	2	6	56852	56857	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960238
1071	NC_018015	CGAC	2	8	56911	56918	25 %	0 %	25 %	50 %	390960238
1072	NC_018015	CGG	2	6	57001	57006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960238
1073	NC_018015	TGG	2	6	57046	57051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960238
1074	NC_018015	CAG	2	6	57069	57074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960238
1075	NC_018015	CAA	2	6	57150	57155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390960238
1076	NC_018015	GC	3	6	57204	57209	0 %	0 %	50 %	50 %	390960238
1077	NC_018015	GTA	2	6	57473	57478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960239
1078	NC_018015	CTC	2	6	57617	57622	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960239
1079	NC_018015	TTC	2	6	57648	57653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960239
1080	NC_018015	CGT	2	6	57718	57723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960239
1081	NC_018015	AGG	2	6	57750	57755	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960239
1082	NC_018015	TCC	2	6	57768	57773	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960239
1083	NC_018015	CCA	2	6	57817	57822	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960239
1084	NC_018015	CTC	2	6	57828	57833	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960239
1085	NC_018015	CCTCG	2	10	57918	57927	0 %	20 %	20 %	60 %	390960240
1086	NC_018015	ATCC	2	8	57939	57946	25 %	25 %	0 %	50 %	390960240
1087	NC_018015	ATCC	2	8	57963	57970	25 %	25 %	0 %	50 %	390960240
1088	NC_018015	CTC	2	6	58142	58147	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960241
1089	NC_018015	CGC	2	6	58169	58174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960241
1090	NC_018015	CTG	2	6	58202	58207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960241
1091	NC_018015	CTC	2	6	58271	58276	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960241
1092	NC_018015	CGA	2	6	58542	58547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960242
1093	NC_018015	AGG	2	6	58565	58570	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960242
1094	NC_018015	AGA	2	6	58604	58609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960242
1095	NC_018015	CAG	2	6	58615	58620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960242
1096	NC_018015	AGGGCC	2	12	58703	58714	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	390960242
1097	NC_018015	GAC	2	6	58777	58782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960242
1098	NC_018015	CGA	2	6	58839	58844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960242
1099	NC_018015	CTG	2	6	58858	58863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960242
1100	NC_018015	AT	3	6	58917	58922	50 %	50 %	0 %	0 %	390960242
1101	NC_018015	ATG	2	6	58939	58944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960242
1102	NC_018015	CAG	2	6	58961	58966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960242
1103	NC_018015	ACG	2	6	58996	59001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960242
1104	NC_018015	GGT	2	6	59047	59052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960242
1105	NC_018015	GGTT	2	8	59116	59123	0 %	50 %	50 %	0 %	390960242
1106	NC_018015	CAG	2	6	59131	59136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960242
1107	NC_018015	ACCG	2	8	59229	59236	25 %	0 %	25 %	50 %	390960242
1108	NC_018015	GAC	2	6	59317	59322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960242
1109	NC_018015	CAGT	2	8	59379	59386	25 %	25 %	25 %	25 %	390960242
1110	NC_018015	CGG	2	6	59411	59416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960242
1111	NC_018015	AT	3	6	59444	59449	50 %	50 %	0 %	0 %	390960242
1112	NC_018015	CCG	2	6	59483	59488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960242
1113	NC_018015	A	6	6	59603	59608	100 %	0 %	0 %	0 %	390960242
1114	NC_018015	TGC	2	6	59616	59621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960242
1115	NC_018015	AAGC	2	8	59681	59688	50 %	0 %	25 %	25 %	390960242
1116	NC_018015	TGC	2	6	59700	59705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960242
1117	NC_018015	CTA	2	6	59730	59735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960242
1118	NC_018015	AAC	2	6	59763	59768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390960242
1119	NC_018015	ACA	2	6	59792	59797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390960242
1120	NC_018015	CAA	2	6	59826	59831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390960242
1121	NC_018015	GAT	2	6	59856	59861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960243
1122	NC_018015	CAA	2	6	59925	59930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390960243
1123	NC_018015	A	6	6	59936	59941	100 %	0 %	0 %	0 %	390960243
1124	NC_018015	GGC	2	6	59954	59959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960243
1125	NC_018015	AT	3	6	59970	59975	50 %	50 %	0 %	0 %	390960243
1126	NC_018015	GA	5	10	60019	60028	50 %	0 %	50 %	0 %	390960243
1127	NC_018015	CT	5	10	60095	60104	0 %	50 %	0 %	50 %	390960243
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1130	NC_018015	GATG	2	8	60427	60434	25 %	25 %	50 %	0 %	390960244
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1133	NC_018015	CAC	2	6	60565	60570	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960244
1134	NC_018015	ATC	2	6	60575	60580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960244
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1137	NC_018015	ACATAA	2	12	60636	60647	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	390960244
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1155	NC_018015	TTC	2	6	61235	61240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960244
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1157	NC_018015	GAG	2	6	61382	61387	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960244
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1160	NC_018015	GAG	2	6	61513	61518	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960244
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1164	NC_018015	TGG	2	6	61596	61601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960244
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1234	NC_018015	GGCCG	2	10	64748	64757	0 %	0 %	60 %	40 %	390960249
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1247	NC_018015	CGT	2	6	65215	65220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960249
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1250	NC_018015	CTTCT	2	10	65291	65300	0 %	60 %	0 %	40 %	390960249
1251	NC_018015	GTC	2	6	65345	65350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960249
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1255	NC_018015	GGA	2	6	65632	65637	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960249
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1365	NC_018015	GGCCC	2	10	72400	72409	0 %	0 %	40 %	60 %	390960254
1366	NC_018015	AG	3	6	72531	72536	50 %	0 %	50 %	0 %	390960254
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1371	NC_018015	ATA	2	6	72937	72942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390960254
1372	NC_018015	GC	3	6	72969	72974	0 %	0 %	50 %	50 %	390960254
1373	NC_018015	GCT	2	6	73065	73070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960254
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1499	NC_018015	CGT	2	6	79855	79860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960261
1500	NC_018015	CG	3	6	79881	79886	0 %	0 %	50 %	50 %	390960261

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