MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus sp. CL1 chromosome

Total Repeats: 36405

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_018015	GAG	2	6	704873	704878	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960938
13002	NC_018015	GAT	2	6	704941	704946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960938
13003	NC_018015	ACA	2	6	704958	704963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390960938
13004	NC_018015	CTT	2	6	705006	705011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960938
13005	NC_018015	AGGG	2	8	705014	705021	25 %	0 %	75 %	0 %	390960938
13006	NC_018015	CCA	2	6	705024	705029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960938
13007	NC_018015	AAT	2	6	705034	705039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390960938
13008	NC_018015	TAC	3	9	705131	705139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960938
13009	NC_018015	CAG	2	6	705145	705150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960938
13010	NC_018015	CCA	2	6	705216	705221	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960938
13011	NC_018015	GAC	2	6	705233	705238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960938
13012	NC_018015	CGA	2	6	705289	705294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960938
13013	NC_018015	CGATAA	2	12	705408	705419	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	390960938
13014	NC_018015	TGA	2	6	705443	705448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960938
13015	NC_018015	CAT	2	6	705462	705467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960939
13016	NC_018015	CTC	3	9	705505	705513	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960939
13017	NC_018015	TCC	2	6	705532	705537	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960939
13018	NC_018015	GA	3	6	705559	705564	50 %	0 %	50 %	0 %	390960939
13019	NC_018015	GA	3	6	705574	705579	50 %	0 %	50 %	0 %	390960939
13020	NC_018015	TCGTA	2	10	705590	705599	20 %	40 %	20 %	20 %	390960939
13021	NC_018015	GAA	2	6	705804	705809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960939
13022	NC_018015	C	6	6	705872	705877	0 %	0 %	0 %	100 %	390960939
13023	NC_018015	TCA	2	6	705923	705928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960939
13024	NC_018015	C	6	6	705950	705955	0 %	0 %	0 %	100 %	390960939
13025	NC_018015	TTAT	2	8	706025	706032	25 %	75 %	0 %	0 %	390960939
13026	NC_018015	ACGGCA	2	12	706196	706207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960939
13027	NC_018015	TCT	2	6	706265	706270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960939
13028	NC_018015	ACG	2	6	706595	706600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960939
13029	NC_018015	CTGGAT	2	12	706659	706670	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	390960939
13030	NC_018015	CTAC	2	8	706685	706692	25 %	25 %	0 %	50 %	390960939
13031	NC_018015	CGA	2	6	706707	706712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960939
13032	NC_018015	CGGG	2	8	706820	706827	0 %	0 %	75 %	25 %	390960939
13033	NC_018015	GTG	2	6	706852	706857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960939
13034	NC_018015	CCG	2	6	706862	706867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960939
13035	NC_018015	TCC	2	6	706883	706888	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960939
13036	NC_018015	TCA	2	6	706919	706924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960939
13037	NC_018015	TCC	2	6	707093	707098	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960939
13038	NC_018015	ACG	3	9	707183	707191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960939
13039	NC_018015	ACA	2	6	707243	707248	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390960939
13040	NC_018015	CTT	2	6	707289	707294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960939
13041	NC_018015	ACATA	2	10	707441	707450	60 %	20 %	0 %	20 %	390960939
13042	NC_018015	CGG	2	6	707557	707562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960939
13043	NC_018015	AAC	2	6	707582	707587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390960939
13044	NC_018015	GAT	2	6	707596	707601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960939
13045	NC_018015	TGG	2	6	707662	707667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960939
13046	NC_018015	TGG	2	6	707677	707682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960939
13047	NC_018015	ACG	2	6	707690	707695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960939
13048	NC_018015	CGA	2	6	707700	707705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960939
13049	NC_018015	GACTAC	2	12	707725	707736	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	390960939
13050	NC_018015	ACA	2	6	707762	707767	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390960939
13051	NC_018015	GA	3	6	707793	707798	50 %	0 %	50 %	0 %	390960939
13052	NC_018015	CAA	2	6	707805	707810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390960939
13053	NC_018015	CGAAGA	2	12	707874	707885	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	390960939
13054	NC_018015	GAC	2	6	707929	707934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960939
13055	NC_018015	GAC	2	6	707992	707997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960939
13056	NC_018015	CCA	2	6	708005	708010	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960939
13057	NC_018015	CGG	2	6	708021	708026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960939
13058	NC_018015	G	6	6	708053	708058	0 %	0 %	100 %	0 %	390960939
13059	NC_018015	GC	3	6	708160	708165	0 %	0 %	50 %	50 %	390960939
13060	NC_018015	TCC	2	6	708169	708174	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960939
13061	NC_018015	ACT	2	6	708305	708310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960939
13062	NC_018015	CCT	2	6	708335	708340	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960939
13063	NC_018015	CTT	2	6	708459	708464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960939
13064	NC_018015	CGA	2	6	708483	708488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960939
13065	NC_018015	ACT	2	6	708500	708505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960939
13066	NC_018015	TAC	2	6	708559	708564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960939
13067	NC_018015	AGA	2	6	708641	708646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960939
13068	NC_018015	GGA	2	6	708651	708656	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960939
13069	NC_018015	ACT	3	9	708689	708697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960939
13070	NC_018015	CAGGG	2	10	708719	708728	20 %	0 %	60 %	20 %	390960939
13071	NC_018015	GAC	2	6	708763	708768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960939
13072	NC_018015	TTC	2	6	708805	708810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960939
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13076	NC_018015	CTC	3	9	709094	709102	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960940
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13088	NC_018015	GAA	2	6	709623	709628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960940
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13090	NC_018015	GAG	2	6	710157	710162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960941
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13095	NC_018015	TCG	2	6	710374	710379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960941
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13099	NC_018015	CCG	2	6	710554	710559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960941
13100	NC_018015	CAC	2	6	710582	710587	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960942
13101	NC_018015	TCA	2	6	710616	710621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960942
13102	NC_018015	TCGT	2	8	710676	710683	0 %	50 %	25 %	25 %	390960942
13103	NC_018015	GCGG	2	8	710705	710712	0 %	0 %	75 %	25 %	390960942
13104	NC_018015	ACG	2	6	710802	710807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960942
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13106	NC_018015	CCT	2	6	710920	710925	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960942
13107	NC_018015	TGA	2	6	710935	710940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960942
13108	NC_018015	CT	3	6	710943	710948	0 %	50 %	0 %	50 %	390960942
13109	NC_018015	GAC	2	6	711011	711016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960942
13110	NC_018015	TCC	3	9	711026	711034	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960943
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13113	NC_018015	TCCC	2	8	711154	711161	0 %	25 %	0 %	75 %	390960943
13114	NC_018015	ACC	2	6	711206	711211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960943
13115	NC_018015	GAT	2	6	711214	711219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960943
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13238	NC_018015	CTC	2	6	717355	717360	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960949
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13476	NC_018015	CGC	2	6	731214	731219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960961
13477	NC_018015	GT	3	6	731474	731479	0 %	50 %	50 %	0 %	390960962
13478	NC_018015	TGT	2	6	731632	731637	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390960962
13479	NC_018015	ACG	2	6	731646	731651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960962
13480	NC_018015	GGC	2	6	731666	731671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960962
13481	NC_018015	CGA	2	6	731707	731712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960962
13482	NC_018015	GGCCCT	2	12	731729	731740	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	390960962
13483	NC_018015	CCT	2	6	731749	731754	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960962
13484	NC_018015	GGT	2	6	731773	731778	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960962
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13486	NC_018015	GAG	2	6	731993	731998	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960962
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13490	NC_018015	ATC	2	6	732255	732260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960962
13491	NC_018015	AG	3	6	732287	732292	50 %	0 %	50 %	0 %	390960963
13492	NC_018015	T	6	6	732307	732312	0 %	100 %	0 %	0 %	390960963
13493	NC_018015	ATG	2	6	732325	732330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960963
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13495	NC_018015	CAG	2	6	732390	732395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960963
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13497	NC_018015	AGT	2	6	732518	732523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960963
13498	NC_018015	AGCGA	2	10	732596	732605	40 %	0 %	40 %	20 %	390960963
13499	NC_018015	CCT	2	6	732662	732667	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960963
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