MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus sp. CL1 chromosome

Total Repeats: 36405

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_018015	CGGC	2	8	677813	677820	0 %	0 %	50 %	50 %	390960908
12502	NC_018015	CCT	2	6	677858	677863	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960908
12503	NC_018015	GA	3	6	677878	677883	50 %	0 %	50 %	0 %	390960908
12504	NC_018015	CGA	2	6	677924	677929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960908
12505	NC_018015	CGT	2	6	678216	678221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960909
12506	NC_018015	ACG	2	6	678269	678274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960909
12507	NC_018015	CCT	3	9	678279	678287	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960909
12508	NC_018015	CTC	2	6	678364	678369	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960909
12509	NC_018015	GAA	2	6	678514	678519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960909
12510	NC_018015	ATC	2	6	678533	678538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960909
12511	NC_018015	GAA	2	6	678595	678600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960909
12512	NC_018015	CGG	2	6	678675	678680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960909
12513	NC_018015	CCTTC	2	10	678691	678700	0 %	40 %	0 %	60 %	390960909
12514	NC_018015	GTC	2	6	678770	678775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960909
12515	NC_018015	ACGG	2	8	678880	678887	25 %	0 %	50 %	25 %	390960909
12516	NC_018015	CTC	2	6	678901	678906	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960909
12517	NC_018015	AGT	2	6	678915	678920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960909
12518	NC_018015	GAG	2	6	678934	678939	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960909
12519	NC_018015	GGA	2	6	679545	679550	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960910
12520	NC_018015	GAG	2	6	679619	679624	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960910
12521	NC_018015	CCT	2	6	679660	679665	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960910
12522	NC_018015	AAG	2	6	679715	679720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960910
12523	NC_018015	CTC	2	6	679721	679726	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960910
12524	NC_018015	CTT	2	6	679732	679737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960910
12525	NC_018015	ACG	2	6	679782	679787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960910
12526	NC_018015	AGG	2	6	679797	679802	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960910
12527	NC_018015	GGT	2	6	679828	679833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960910
12528	NC_018015	TCGC	2	8	679977	679984	0 %	25 %	25 %	50 %	390960910
12529	NC_018015	GAGG	2	8	680041	680048	25 %	0 %	75 %	0 %	390960910
12530	NC_018015	AGT	2	6	680136	680141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960910
12531	NC_018015	GAA	2	6	680291	680296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960911
12532	NC_018015	CTT	2	6	680319	680324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960911
12533	NC_018015	GAA	2	6	680330	680335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960911
12534	NC_018015	AGCG	2	8	680379	680386	25 %	0 %	50 %	25 %	390960911
12535	NC_018015	GCTG	2	8	680455	680462	0 %	25 %	50 %	25 %	390960911
12536	NC_018015	CTACAC	2	12	680465	680476	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	390960911
12537	NC_018015	CT	3	6	680586	680591	0 %	50 %	0 %	50 %	390960912
12538	NC_018015	CCT	2	6	680624	680629	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960912
12539	NC_018015	TCT	2	6	680637	680642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960912
12540	NC_018015	CTC	2	6	680657	680662	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960912
12541	NC_018015	CTC	2	6	680684	680689	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960912
12542	NC_018015	GAGC	2	8	680728	680735	25 %	0 %	50 %	25 %	390960912
12543	NC_018015	CTC	2	6	680765	680770	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960912
12544	NC_018015	TC	4	8	680784	680791	0 %	50 %	0 %	50 %	390960912
12545	NC_018015	CCAG	2	8	680833	680840	25 %	0 %	25 %	50 %	390960912
12546	NC_018015	CCA	2	6	680902	680907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960912
12547	NC_018015	CTT	2	6	681002	681007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960912
12548	NC_018015	GAA	2	6	681149	681154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960912
12549	NC_018015	CGT	2	6	681163	681168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960912
12550	NC_018015	GTA	2	6	681263	681268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960912
12551	NC_018015	GAG	2	6	681272	681277	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960912
12552	NC_018015	CCA	2	6	681355	681360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960912
12553	NC_018015	TGA	2	6	681370	681375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960912
12554	NC_018015	TAG	2	6	681381	681386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960912
12555	NC_018015	GTA	2	6	681428	681433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960912
12556	NC_018015	CGAAGC	2	12	681454	681465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960912
12557	NC_018015	GTC	2	6	681473	681478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960912
12558	NC_018015	GAG	2	6	681575	681580	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960912
12559	NC_018015	GAA	2	6	681619	681624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960912
12560	NC_018015	GCC	2	6	681628	681633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960912
12561	NC_018015	CCG	2	6	681730	681735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960912
12562	NC_018015	GTC	2	6	681755	681760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960912
12563	NC_018015	CTC	2	6	681793	681798	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960912
12564	NC_018015	CCT	2	6	681848	681853	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960912
12565	NC_018015	TCC	3	9	681912	681920	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960912
12566	NC_018015	ACC	2	6	681933	681938	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960912
12567	NC_018015	CCG	2	6	681954	681959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960912
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12569	NC_018015	GATCTC	2	12	682016	682027	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	390960912
12570	NC_018015	CGT	2	6	682084	682089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960912
12571	NC_018015	GAG	2	6	682349	682354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960913
12572	NC_018015	GAA	2	6	682364	682369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960913
12573	NC_018015	AAC	2	6	682448	682453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390960913
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12575	NC_018015	CCCAG	2	10	682600	682609	20 %	0 %	20 %	60 %	390960913
12576	NC_018015	ACG	2	6	682644	682649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960913
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12579	NC_018015	CCTC	2	8	682888	682895	0 %	25 %	0 %	75 %	390960913
12580	NC_018015	GGC	2	6	682954	682959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960913
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12586	NC_018015	CAGC	2	8	683224	683231	25 %	0 %	25 %	50 %	390960913
12587	NC_018015	ATC	2	6	683264	683269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960913
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12590	NC_018015	GAT	2	6	683366	683371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960913
12591	NC_018015	GAT	2	6	684478	684483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960914
12592	NC_018015	CAG	2	6	684485	684490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960914
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12597	NC_018015	AGGG	2	8	684747	684754	25 %	0 %	75 %	0 %	390960915
12598	NC_018015	GTA	2	6	684756	684761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960915
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12602	NC_018015	TGA	2	6	685216	685221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960916
12603	NC_018015	CGG	2	6	685225	685230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960916
12604	NC_018015	CGT	2	6	685295	685300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960916
12605	NC_018015	GAC	2	6	685305	685310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960916
12606	NC_018015	G	6	6	685362	685367	0 %	0 %	100 %	0 %	390960916
12607	NC_018015	AAC	2	6	685392	685397	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390960916
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12611	NC_018015	TCATC	2	10	685564	685573	20 %	40 %	0 %	40 %	390960916
12612	NC_018015	GA	3	6	685606	685611	50 %	0 %	50 %	0 %	390960916
12613	NC_018015	CAA	2	6	685631	685636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390960916
12614	NC_018015	GGC	2	6	685721	685726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960916
12615	NC_018015	ACG	2	6	685747	685752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960916
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12619	NC_018015	CGA	2	6	685939	685944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960917
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12732	NC_018015	GCCA	2	8	691551	691558	25 %	0 %	25 %	50 %	390960923
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12975	NC_018015	ACA	2	6	703514	703519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390960938
12976	NC_018015	ATA	2	6	703616	703621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390960938
12977	NC_018015	CAA	2	6	703636	703641	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390960938
12978	NC_018015	GAT	3	9	703666	703674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960938
12979	NC_018015	CTC	2	6	703717	703722	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960938
12980	NC_018015	ATA	2	6	703754	703759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390960938
12981	NC_018015	GAG	2	6	703831	703836	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960938
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12984	NC_018015	ACTC	2	8	704187	704194	25 %	25 %	0 %	50 %	390960938
12985	NC_018015	GAT	2	6	704201	704206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960938
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