MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus sp. CL1 chromosome

Total Repeats: 36405

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12001	NC_018015	CTT	3	9	652107	652115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960876
12002	NC_018015	GCT	2	6	652164	652169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960876
12003	NC_018015	CTC	2	6	652288	652293	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960876
12004	NC_018015	CTT	2	6	652323	652328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960876
12005	NC_018015	TGG	2	6	652331	652336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960876
12006	NC_018015	CTT	2	6	652338	652343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960876
12007	NC_018015	CTC	2	6	652429	652434	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960876
12008	NC_018015	ACG	2	6	652450	652455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960876
12009	NC_018015	AGG	2	6	652517	652522	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960876
12010	NC_018015	GAA	2	6	652526	652531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960876
12011	NC_018015	TAC	2	6	652648	652653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960876
12012	NC_018015	CA	3	6	652690	652695	50 %	0 %	0 %	50 %	390960876
12013	NC_018015	CGGA	2	8	652751	652758	25 %	0 %	50 %	25 %	390960876
12014	NC_018015	TCA	2	6	652772	652777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960876
12015	NC_018015	AGG	2	6	652807	652812	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960876
12016	NC_018015	TGGG	2	8	652874	652881	0 %	25 %	75 %	0 %	390960876
12017	NC_018015	TGAA	2	8	653004	653011	50 %	25 %	25 %	0 %	390960877
12018	NC_018015	TCAC	2	8	653046	653053	25 %	25 %	0 %	50 %	390960877
12019	NC_018015	G	6	6	653093	653098	0 %	0 %	100 %	0 %	390960877
12020	NC_018015	GAA	2	6	653117	653122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960877
12021	NC_018015	TCC	2	6	653154	653159	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960877
12022	NC_018015	GAG	2	6	653183	653188	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960877
12023	NC_018015	CTT	2	6	653234	653239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960877
12024	NC_018015	CGG	2	6	653258	653263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960877
12025	NC_018015	CAT	2	6	653273	653278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960877
12026	NC_018015	TTC	3	9	653345	653353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960877
12027	NC_018015	CTG	2	6	654331	654336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960878
12028	NC_018015	GCC	2	6	654358	654363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960878
12029	NC_018015	GTC	2	6	654496	654501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960878
12030	NC_018015	CAGC	2	8	654546	654553	25 %	0 %	25 %	50 %	390960878
12031	NC_018015	CGCT	2	8	654605	654612	0 %	25 %	25 %	50 %	390960878
12032	NC_018015	AGAGC	2	10	654636	654645	40 %	0 %	40 %	20 %	390960878
12033	NC_018015	GTC	2	6	654649	654654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960878
12034	NC_018015	CTC	2	6	654742	654747	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960878
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12036	NC_018015	CAT	2	6	654801	654806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960878
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12039	NC_018015	A	6	6	654878	654883	100 %	0 %	0 %	0 %	390960878
12040	NC_018015	GAA	2	6	654892	654897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960878
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12042	NC_018015	GAT	2	6	654926	654931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960878
12043	NC_018015	GA	3	6	655116	655121	50 %	0 %	50 %	0 %	390960879
12044	NC_018015	GA	3	6	655155	655160	50 %	0 %	50 %	0 %	390960879
12045	NC_018015	CGC	2	6	655176	655181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960879
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12048	NC_018015	CCG	2	6	655561	655566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960879
12049	NC_018015	GAG	2	6	655570	655575	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960879
12050	NC_018015	AGG	2	6	655597	655602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960879
12051	NC_018015	GCG	2	6	655622	655627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960879
12052	NC_018015	ACG	2	6	655682	655687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960879
12053	NC_018015	ATA	2	6	655783	655788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390960879
12054	NC_018015	GAC	2	6	655801	655806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960879
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12056	NC_018015	CGA	2	6	655839	655844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960879
12057	NC_018015	GGA	2	6	655872	655877	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960879
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12059	NC_018015	TCG	2	6	655901	655906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960879
12060	NC_018015	GGC	2	6	655909	655914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960879
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12062	NC_018015	GAG	2	6	655948	655953	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960879
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12065	NC_018015	GGGA	2	8	655972	655979	25 %	0 %	75 %	0 %	390960879
12066	NC_018015	CGT	2	6	655998	656003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960879
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12073	NC_018015	GAC	2	6	656198	656203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960880
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12106	NC_018015	TCT	2	6	657511	657516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960882
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12476	NC_018015	AAT	2	6	676376	676381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390960906
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