MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus sp. CL1 chromosome

Total Repeats: 36405

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_018015	CAC	2	6	625451	625456	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960855
11502	NC_018015	GAC	2	6	625457	625462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960855
11503	NC_018015	ACG	2	6	625497	625502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960855
11504	NC_018015	TTC	2	6	625521	625526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960855
11505	NC_018015	GGA	2	6	625541	625546	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960855
11506	NC_018015	ACT	2	6	625607	625612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960855
11507	NC_018015	CCTT	2	8	625710	625717	0 %	50 %	0 %	50 %	390960856
11508	NC_018015	TCC	2	6	625764	625769	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960856
11509	NC_018015	TCC	2	6	625774	625779	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960856
11510	NC_018015	TGAA	2	8	625791	625798	50 %	25 %	25 %	0 %	390960856
11511	NC_018015	CAT	2	6	625834	625839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960856
11512	NC_018015	CTT	2	6	626001	626006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960857
11513	NC_018015	ACC	2	6	626014	626019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960857
11514	NC_018015	CTC	2	6	626031	626036	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960857
11515	NC_018015	CCT	2	6	626042	626047	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960857
11516	NC_018015	GAA	2	6	626061	626066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960857
11517	NC_018015	GCC	3	9	626091	626099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960857
11518	NC_018015	CCT	2	6	626123	626128	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960857
11519	NC_018015	GCC	2	6	626167	626172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960857
11520	NC_018015	TCCG	2	8	626175	626182	0 %	25 %	25 %	50 %	390960857
11521	NC_018015	GAC	2	6	626361	626366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960857
11522	NC_018015	TGA	2	6	626438	626443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960857
11523	NC_018015	GAG	3	9	626472	626480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960857
11524	NC_018015	TAT	2	6	626490	626495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390960857
11525	NC_018015	TCT	2	6	626552	626557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960857
11526	NC_018015	TCC	2	6	626563	626568	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960857
11527	NC_018015	TCG	2	6	626569	626574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960857
11528	NC_018015	CTT	2	6	626586	626591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960857
11529	NC_018015	GC	3	6	626697	626702	0 %	0 %	50 %	50 %	390960857
11530	NC_018015	GTA	2	6	626736	626741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960857
11531	NC_018015	CG	3	6	626819	626824	0 %	0 %	50 %	50 %	390960857
11532	NC_018015	GTG	2	6	626829	626834	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960857
11533	NC_018015	CTCG	2	8	626892	626899	0 %	25 %	25 %	50 %	390960857
11534	NC_018015	CCG	2	6	626902	626907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960857
11535	NC_018015	AGCGGG	2	12	626926	626937	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	390960857
11536	NC_018015	CCT	2	6	627021	627026	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960857
11537	NC_018015	GTG	2	6	627132	627137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960857
11538	NC_018015	CAG	2	6	627141	627146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960857
11539	NC_018015	GGC	2	6	627186	627191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960857
11540	NC_018015	GC	3	6	627262	627267	0 %	0 %	50 %	50 %	390960857
11541	NC_018015	CTC	3	9	627276	627284	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960857
11542	NC_018015	CTT	2	6	627291	627296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960857
11543	NC_018015	TAT	2	6	627381	627386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390960857
11544	NC_018015	CCCGT	2	10	627463	627472	0 %	20 %	20 %	60 %	390960857
11545	NC_018015	TGA	2	6	627572	627577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960857
11546	NC_018015	TCCT	2	8	627592	627599	0 %	50 %	0 %	50 %	390960857
11547	NC_018015	CAC	2	6	627600	627605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960857
11548	NC_018015	CCT	2	6	627608	627613	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960857
11549	NC_018015	TCC	2	6	627691	627696	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960857
11550	NC_018015	GCC	2	6	627714	627719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960857
11551	NC_018015	GAG	2	6	627720	627725	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960857
11552	NC_018015	CGAA	2	8	627766	627773	50 %	0 %	25 %	25 %	390960857
11553	NC_018015	GAC	2	6	627864	627869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960857
11554	NC_018015	GGT	2	6	627903	627908	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960857
11555	NC_018015	CT	3	6	628203	628208	0 %	50 %	0 %	50 %	390960857
11556	NC_018015	ACC	2	6	628210	628215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960857
11557	NC_018015	AGG	2	6	628326	628331	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960858
11558	NC_018015	TTA	2	6	628336	628341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390960858
11559	NC_018015	GCC	2	6	628376	628381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960858
11560	NC_018015	GTT	2	6	628421	628426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390960858
11561	NC_018015	CTC	2	6	628448	628453	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960858
11562	NC_018015	CAT	2	6	628469	628474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960858
11563	NC_018015	TCA	2	6	628504	628509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960858
11564	NC_018015	GA	3	6	628557	628562	50 %	0 %	50 %	0 %	390960858
11565	NC_018015	ATC	2	6	628638	628643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960858
11566	NC_018015	AGG	2	6	628647	628652	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960858
11567	NC_018015	CTG	2	6	628676	628681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960858
11568	NC_018015	GC	3	6	628783	628788	0 %	0 %	50 %	50 %	390960858
11569	NC_018015	GAA	2	6	628837	628842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960858
11570	NC_018015	GGAC	2	8	628861	628868	25 %	0 %	50 %	25 %	390960858
11571	NC_018015	GGA	2	6	628951	628956	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960858
11572	NC_018015	GCCGA	2	10	628980	628989	20 %	0 %	40 %	40 %	390960858
11573	NC_018015	GGA	2	6	629003	629008	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960858
11574	NC_018015	CTCAC	2	10	629040	629049	20 %	20 %	0 %	60 %	390960858
11575	NC_018015	GAG	2	6	629054	629059	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960858
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11577	NC_018015	CCAGG	2	10	629333	629342	20 %	0 %	40 %	40 %	390960858
11578	NC_018015	ACGAA	2	10	629356	629365	60 %	0 %	20 %	20 %	390960858
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11588	NC_018015	CTG	2	6	629969	629974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960859
11589	NC_018015	AG	3	6	630081	630086	50 %	0 %	50 %	0 %	390960859
11590	NC_018015	CGG	2	6	630099	630104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960859
11591	NC_018015	CGTCCC	2	12	630138	630149	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	390960859
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11593	NC_018015	GTT	2	6	630202	630207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390960859
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11599	NC_018015	CGG	2	6	630324	630329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960859
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11601	NC_018015	GAC	2	6	630403	630408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960859
11602	NC_018015	C	6	6	630457	630462	0 %	0 %	0 %	100 %	390960859
11603	NC_018015	CGT	2	6	630547	630552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960859
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11606	NC_018015	TTG	2	6	630648	630653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390960859
11607	NC_018015	ACC	2	6	630689	630694	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960859
11608	NC_018015	TCG	2	6	630710	630715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960859
11609	NC_018015	TCGG	2	8	630743	630750	0 %	25 %	50 %	25 %	390960859
11610	NC_018015	GTG	2	6	630836	630841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960859
11611	NC_018015	G	6	6	630906	630911	0 %	0 %	100 %	0 %	390960859
11612	NC_018015	TGG	3	9	630927	630935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960859
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11617	NC_018015	TAA	2	6	631659	631664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390960860
11618	NC_018015	CGA	2	6	631690	631695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960860
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11620	NC_018015	CGT	2	6	631777	631782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960860
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11979	NC_018015	CCT	2	6	650975	650980	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960875
11980	NC_018015	ACGT	2	8	651006	651013	25 %	25 %	25 %	25 %	390960875
11981	NC_018015	CAACA	2	10	651026	651035	60 %	0 %	0 %	40 %	390960875
11982	NC_018015	AAC	2	6	651072	651077	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390960875
11983	NC_018015	ACA	2	6	651111	651116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390960875
11984	NC_018015	G	6	6	651121	651126	0 %	0 %	100 %	0 %	390960875
11985	NC_018015	GAA	2	6	651192	651197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960875
11986	NC_018015	A	6	6	651210	651215	100 %	0 %	0 %	0 %	390960875
11987	NC_018015	GGT	2	6	651350	651355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960875
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11990	NC_018015	ACT	2	6	651569	651574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960876
11991	NC_018015	GGCAC	2	10	651587	651596	20 %	0 %	40 %	40 %	390960876
11992	NC_018015	AAG	2	6	651695	651700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960876
11993	NC_018015	GCTC	2	8	651707	651714	0 %	25 %	25 %	50 %	390960876
11994	NC_018015	CT	3	6	651728	651733	0 %	50 %	0 %	50 %	390960876
11995	NC_018015	AAG	2	6	651772	651777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960876
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11998	NC_018015	CCG	2	6	652028	652033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960876
11999	NC_018015	ACG	2	6	652040	652045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960876
12000	NC_018015	CCG	2	6	652076	652081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960876

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