MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus sp. CL1 chromosome

Total Repeats: 36405

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10502	NC_018015	ATA	2	6	573130	573135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390960799
10503	NC_018015	CGG	2	6	573195	573200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960799
10504	NC_018015	CGT	2	6	573249	573254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960799
10505	NC_018015	GGA	2	6	573315	573320	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960799
10506	NC_018015	CGA	2	6	573324	573329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960799
10507	NC_018015	CGT	2	6	573351	573356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960799
10508	NC_018015	GTC	2	6	573424	573429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960799
10509	NC_018015	GCT	2	6	573444	573449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960799
10510	NC_018015	TCG	2	6	573452	573457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960799
10511	NC_018015	CCG	2	6	573550	573555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960799
10512	NC_018015	TGC	2	6	573567	573572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960799
10513	NC_018015	AAG	2	6	573646	573651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960799
10514	NC_018015	AAG	2	6	573664	573669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960799
10515	NC_018015	CCG	2	6	573685	573690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960799
10516	NC_018015	CGT	2	6	573714	573719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960799
10517	NC_018015	TTG	2	6	573728	573733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390960799
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10519	NC_018015	GGC	2	6	573742	573747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960799
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10530	NC_018015	GTA	2	6	574404	574409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960800
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10532	NC_018015	CTC	2	6	574476	574481	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960800
10533	NC_018015	GAG	2	6	574506	574511	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960800
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10540	NC_018015	GTC	2	6	575023	575028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960801
10541	NC_018015	GTC	2	6	575062	575067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960801
10542	NC_018015	GCTG	2	8	575184	575191	0 %	25 %	50 %	25 %	390960801
10543	NC_018015	CCA	2	6	575205	575210	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960801
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10551	NC_018015	GCC	2	6	575827	575832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960802
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10602	NC_018015	TCC	3	9	577919	577927	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960803
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10604	NC_018015	CCCT	2	8	578117	578124	0 %	25 %	0 %	75 %	390960804
10605	NC_018015	CGTT	2	8	578157	578164	0 %	50 %	25 %	25 %	390960804
10606	NC_018015	CCGG	2	8	578192	578199	0 %	0 %	50 %	50 %	390960804
10607	NC_018015	GCCT	2	8	578235	578242	0 %	25 %	25 %	50 %	390960804
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10611	NC_018015	CAG	2	6	578407	578412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960804
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10619	NC_018015	CGGGC	2	10	578842	578851	0 %	0 %	60 %	40 %	390960804
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10979	NC_018015	GAA	2	6	598384	598389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960819
10980	NC_018015	TCC	2	6	598480	598485	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960819
10981	NC_018015	ACC	2	6	598566	598571	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960819
10982	NC_018015	GTC	2	6	598628	598633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960819
10983	NC_018015	GAA	2	6	598675	598680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960819
10984	NC_018015	ATC	2	6	598733	598738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960819
10985	NC_018015	GGA	2	6	598947	598952	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960820
10986	NC_018015	GAA	3	9	598977	598985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960820
10987	NC_018015	GCG	2	6	599000	599005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960820
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10991	NC_018015	TCA	2	6	599165	599170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960820
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10998	NC_018015	GC	3	6	599604	599609	0 %	0 %	50 %	50 %	390960820
10999	NC_018015	GAG	2	6	599641	599646	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960820
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