MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus sp. CL1 chromosome

Total Repeats: 36405

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_018015	TCC	2	6	547928	547933	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960760
10002	NC_018015	TGA	2	6	548055	548060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960760
10003	NC_018015	CTC	2	6	548065	548070	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960760
10004	NC_018015	TCC	2	6	548078	548083	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960760
10005	NC_018015	CTC	2	6	548119	548124	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960760
10006	NC_018015	CCT	2	6	548136	548141	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960760
10007	NC_018015	GTA	2	6	548170	548175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960760
10008	NC_018015	GTC	2	6	548377	548382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960760
10009	NC_018015	GA	4	8	548398	548405	50 %	0 %	50 %	0 %	390960760
10010	NC_018015	GTG	2	6	548420	548425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960760
10011	NC_018015	ATC	2	6	548432	548437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960760
10012	NC_018015	TCG	2	6	548459	548464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960760
10013	NC_018015	TCA	2	6	548498	548503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960760
10014	NC_018015	TCC	2	6	548535	548540	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960760
10015	NC_018015	CGA	2	6	548574	548579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960760
10016	NC_018015	TCC	2	6	548594	548599	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960760
10017	NC_018015	CTT	2	6	548676	548681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960761
10018	NC_018015	CGT	2	6	548701	548706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960761
10019	NC_018015	GGC	2	6	548771	548776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960761
10020	NC_018015	GCTCTT	2	12	548795	548806	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	390960761
10021	NC_018015	TCC	2	6	548810	548815	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960761
10022	NC_018015	CGA	2	6	548842	548847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960761
10023	NC_018015	CCT	2	6	548863	548868	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960761
10024	NC_018015	GGC	2	6	548882	548887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960761
10025	NC_018015	GAC	2	6	548930	548935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960761
10026	NC_018015	ACC	2	6	548939	548944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960761
10027	NC_018015	CTG	2	6	548952	548957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960761
10028	NC_018015	GTT	2	6	548999	549004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390960761
10029	NC_018015	CTT	3	9	549041	549049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960761
10030	NC_018015	CTG	2	6	549059	549064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960761
10031	NC_018015	CTC	2	6	549065	549070	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960761
10032	NC_018015	CAC	2	6	549081	549086	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960762
10033	NC_018015	TC	3	6	549112	549117	0 %	50 %	0 %	50 %	390960762
10034	NC_018015	TCC	3	9	549167	549175	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960762
10035	NC_018015	GCCTG	2	10	549249	549258	0 %	20 %	40 %	40 %	390960762
10036	NC_018015	CTT	2	6	549280	549285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960762
10037	NC_018015	GA	3	6	549335	549340	50 %	0 %	50 %	0 %	390960762
10038	NC_018015	GCT	2	6	549399	549404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960762
10039	NC_018015	GCG	2	6	549434	549439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960762
10040	NC_018015	CTT	2	6	549499	549504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960762
10041	NC_018015	CTT	2	6	549520	549525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960762
10042	NC_018015	CT	3	6	549534	549539	0 %	50 %	0 %	50 %	390960762
10043	NC_018015	CTT	2	6	549586	549591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960762
10044	NC_018015	CTT	2	6	549629	549634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960763
10045	NC_018015	CCT	2	6	549635	549640	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960763
10046	NC_018015	TGA	2	6	549790	549795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960763
10047	NC_018015	CAGG	2	8	549843	549850	25 %	0 %	50 %	25 %	390960763
10048	NC_018015	TCT	2	6	549880	549885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960763
10049	NC_018015	TCT	2	6	549889	549894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960763
10050	NC_018015	TCG	2	6	549903	549908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960763
10051	NC_018015	GCT	2	6	550012	550017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960763
10052	NC_018015	CTC	2	6	551169	551174	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960764
10053	NC_018015	CGC	2	6	551185	551190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960764
10054	NC_018015	TGG	2	6	551197	551202	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960764
10055	NC_018015	CGA	2	6	551245	551250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960764
10056	NC_018015	CTT	2	6	551258	551263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960764
10057	NC_018015	CCG	2	6	551320	551325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960764
10058	NC_018015	CTC	2	6	551405	551410	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960764
10059	NC_018015	TCC	2	6	551418	551423	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960764
10060	NC_018015	GTA	2	6	551435	551440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960764
10061	NC_018015	TCC	2	6	551475	551480	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960764
10062	NC_018015	CTC	2	6	551493	551498	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960764
10063	NC_018015	TCC	2	6	551500	551505	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960764
10064	NC_018015	TGG	2	6	551550	551555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960764
10065	NC_018015	GTA	2	6	551636	551641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960764
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10067	NC_018015	GGC	2	6	551685	551690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960764
10068	NC_018015	TC	3	6	551701	551706	0 %	50 %	0 %	50 %	390960764
10069	NC_018015	TCC	2	6	551739	551744	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960764
10070	NC_018015	CGGC	2	8	551788	551795	0 %	0 %	50 %	50 %	390960764
10071	NC_018015	ACC	2	6	551808	551813	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960764
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10073	NC_018015	CCG	2	6	551871	551876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960764
10074	NC_018015	GGCC	2	8	551878	551885	0 %	0 %	50 %	50 %	390960764
10075	NC_018015	ACC	2	6	551919	551924	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960764
10076	NC_018015	TCG	2	6	551932	551937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960764
10077	NC_018015	CGG	2	6	552002	552007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960764
10078	NC_018015	CAG	2	6	552070	552075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960764
10079	NC_018015	GTAA	2	8	552182	552189	50 %	25 %	25 %	0 %	390960765
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10084	NC_018015	GTT	2	6	552632	552637	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390960765
10085	NC_018015	CAA	2	6	552721	552726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390960765
10086	NC_018015	CT	3	6	552756	552761	0 %	50 %	0 %	50 %	390960765
10087	NC_018015	CAA	2	6	552808	552813	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390960765
10088	NC_018015	CCA	2	6	552820	552825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960765
10089	NC_018015	GCCT	2	8	552829	552836	0 %	25 %	25 %	50 %	390960765
10090	NC_018015	GGC	2	6	552974	552979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960766
10091	NC_018015	TCG	3	9	552990	552998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960766
10092	NC_018015	TCT	2	6	553018	553023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960766
10093	NC_018015	TCC	2	6	553054	553059	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960766
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10099	NC_018015	CCT	2	6	553204	553209	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960767
10100	NC_018015	TTG	2	6	553215	553220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390960767
10101	NC_018015	GGT	2	6	553261	553266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960767
10102	NC_018015	GGC	2	6	553271	553276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960767
10103	NC_018015	GTC	2	6	553346	553351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960767
10104	NC_018015	CCT	2	6	553423	553428	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960767
10105	NC_018015	CTC	2	6	553446	553451	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960767
10106	NC_018015	GC	3	6	553464	553469	0 %	0 %	50 %	50 %	390960767
10107	NC_018015	CTTC	2	8	553507	553514	0 %	50 %	0 %	50 %	390960767
10108	NC_018015	GGC	2	6	553531	553536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960767
10109	NC_018015	ACG	2	6	553545	553550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960767
10110	NC_018015	CTG	2	6	553622	553627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960767
10111	NC_018015	CTC	2	6	553631	553636	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960767
10112	NC_018015	AG	3	6	553726	553731	50 %	0 %	50 %	0 %	390960767
10113	NC_018015	GTC	2	6	553734	553739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960767
10114	NC_018015	CCTGA	2	10	553825	553834	20 %	20 %	20 %	40 %	390960768
10115	NC_018015	CG	3	6	553935	553940	0 %	0 %	50 %	50 %	390960768
10116	NC_018015	TCC	3	9	554043	554051	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960768
10117	NC_018015	TGACCT	2	12	554053	554064	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	390960768
10118	NC_018015	ATC	2	6	554162	554167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960769
10119	NC_018015	GCTC	2	8	554199	554206	0 %	25 %	25 %	50 %	390960769
10120	NC_018015	GAA	2	6	554251	554256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960769
10121	NC_018015	AGCC	2	8	554303	554310	25 %	0 %	25 %	50 %	390960769
10122	NC_018015	GAA	2	6	554311	554316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960769
10123	NC_018015	AGG	2	6	554339	554344	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960769
10124	NC_018015	CTG	2	6	554407	554412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960769
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10233	NC_018015	CCTCA	2	10	559496	559505	20 %	20 %	0 %	60 %	390960777
10234	NC_018015	CCTC	2	8	559553	559560	0 %	25 %	0 %	75 %	390960777
10235	NC_018015	GCCT	2	8	559594	559601	0 %	25 %	25 %	50 %	390960777
10236	NC_018015	GGTCG	2	10	559602	559611	0 %	20 %	60 %	20 %	390960777
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10241	NC_018015	CCT	2	6	560013	560018	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960778
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10350	NC_018015	TCA	2	6	565744	565749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960790
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10352	NC_018015	TTC	2	6	565764	565769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960791
10353	NC_018015	GACC	2	8	565782	565789	25 %	0 %	25 %	50 %	390960791
10354	NC_018015	TTCC	2	8	565790	565797	0 %	50 %	0 %	50 %	390960791
10355	NC_018015	GC	3	6	565805	565810	0 %	0 %	50 %	50 %	390960791
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