MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus sp. CL1 chromosome

Total Repeats: 36405

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9501	NC_018015	GCAG	2	8	517032	517039	25 %	0 %	50 %	25 %	390960726
9502	NC_018015	GAG	2	6	517088	517093	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960726
9503	NC_018015	CAA	2	6	517135	517140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390960726
9504	NC_018015	GAC	2	6	517153	517158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960726
9505	NC_018015	GAG	2	6	517169	517174	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960726
9506	NC_018015	CCG	2	6	517188	517193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960726
9507	NC_018015	GAG	2	6	517240	517245	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960726
9508	NC_018015	AGGGA	2	10	517251	517260	40 %	0 %	60 %	0 %	390960726
9509	NC_018015	CGA	2	6	517261	517266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960726
9510	NC_018015	GAG	2	6	517343	517348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960726
9511	NC_018015	CGG	2	6	517363	517368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960726
9512	NC_018015	GTG	2	6	517414	517419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960726
9513	NC_018015	GAG	3	9	517439	517447	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960726
9514	NC_018015	CGA	2	6	517465	517470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960726
9515	NC_018015	GTC	2	6	517562	517567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960726
9516	NC_018015	TGA	2	6	517605	517610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960726
9517	NC_018015	AAGC	2	8	517645	517652	50 %	0 %	25 %	25 %	390960726
9518	NC_018015	ATC	2	6	517763	517768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960726
9519	NC_018015	GAG	2	6	517775	517780	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960726
9520	NC_018015	AGA	2	6	517794	517799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960726
9521	NC_018015	CGG	2	6	517821	517826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960726
9522	NC_018015	TGTT	2	8	517827	517834	0 %	75 %	25 %	0 %	390960726
9523	NC_018015	TTCC	2	8	517943	517950	0 %	50 %	0 %	50 %	390960727
9524	NC_018015	T	6	6	517998	518003	0 %	100 %	0 %	0 %	390960727
9525	NC_018015	CAC	2	6	518004	518009	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960727
9526	NC_018015	AAAC	2	8	518048	518055	75 %	0 %	0 %	25 %	390960727
9527	NC_018015	CTT	3	9	518178	518186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960727
9528	NC_018015	GAT	2	6	518226	518231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960727
9529	NC_018015	CGT	2	6	518259	518264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960727
9530	NC_018015	ATC	2	6	518376	518381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960727
9531	NC_018015	TCG	2	6	518413	518418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960727
9532	NC_018015	CCT	2	6	518447	518452	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960727
9533	NC_018015	CCG	2	6	518501	518506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960727
9534	NC_018015	GTA	2	6	518523	518528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960727
9535	NC_018015	TCA	2	6	518782	518787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960727
9536	NC_018015	GAAG	2	8	518827	518834	50 %	0 %	50 %	0 %	390960727
9537	NC_018015	ATG	2	6	518968	518973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960727
9538	NC_018015	CAG	2	6	519087	519092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960727
9539	NC_018015	AGT	2	6	520256	520261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960728
9540	NC_018015	CTTC	2	8	520265	520272	0 %	50 %	0 %	50 %	390960728
9541	NC_018015	AGG	2	6	520328	520333	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960728
9542	NC_018015	TGA	2	6	520350	520355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960728
9543	NC_018015	CAT	2	6	520366	520371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960728
9544	NC_018015	CAC	2	6	520423	520428	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960728
9545	NC_018015	CTG	2	6	520465	520470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960728
9546	NC_018015	GAT	2	6	520525	520530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960728
9547	NC_018015	CGAGGA	2	12	520572	520583	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	390960728
9548	NC_018015	CTG	2	6	520657	520662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960728
9549	NC_018015	CAT	2	6	520678	520683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960728
9550	NC_018015	GGA	3	9	520785	520793	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960728
9551	NC_018015	CGA	2	6	520803	520808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960728
9552	NC_018015	CAT	2	6	520891	520896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960728
9553	NC_018015	CTG	2	6	520951	520956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960728
9554	NC_018015	GAA	2	6	521002	521007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960728
9555	NC_018015	TCCT	2	8	521084	521091	0 %	50 %	0 %	50 %	390960728
9556	NC_018015	GCC	2	6	521114	521119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960728
9557	NC_018015	CAC	2	6	521122	521127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960728
9558	NC_018015	GAG	2	6	521143	521148	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960728
9559	NC_018015	CGG	2	6	521155	521160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960728
9560	NC_018015	CGA	2	6	521217	521222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960728
9561	NC_018015	CGC	2	6	521299	521304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960728
9562	NC_018015	GAA	2	6	521323	521328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960728
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9567	NC_018015	CGC	2	6	521403	521408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960728
9568	NC_018015	CGAAGG	2	12	521418	521429	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	390960728
9569	NC_018015	TA	3	6	521458	521463	50 %	50 %	0 %	0 %	390960728
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9579	NC_018015	TCG	2	6	521748	521753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960728
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9589	NC_018015	ACG	2	6	522437	522442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960729
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9594	NC_018015	CTTC	2	8	522566	522573	0 %	50 %	0 %	50 %	390960730
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9599	NC_018015	GAA	2	6	522756	522761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960730
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9602	NC_018015	CTC	2	6	522915	522920	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960730
9603	NC_018015	AG	3	6	522965	522970	50 %	0 %	50 %	0 %	390960730
9604	NC_018015	ATC	2	6	522988	522993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960730
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9608	NC_018015	CCAG	2	8	523168	523175	25 %	0 %	25 %	50 %	390960730
9609	NC_018015	GTCCAT	2	12	523233	523244	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	390960730
9610	NC_018015	AGT	2	6	523265	523270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960730
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9616	NC_018015	AAG	2	6	523690	523695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960731
9617	NC_018015	AC	3	6	523704	523709	50 %	0 %	0 %	50 %	390960731
9618	NC_018015	CCT	3	9	523777	523785	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960731
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