MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus sp. CL1 chromosome

Total Repeats: 36405

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_018015	CTA	2	6	26184	26189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960206
502	NC_018015	TTCG	2	8	26391	26398	0 %	50 %	25 %	25 %	390960206
503	NC_018015	TCC	2	6	26459	26464	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960206
504	NC_018015	TCC	2	6	26501	26506	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960206
505	NC_018015	GAT	2	6	26621	26626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960207
506	NC_018015	GGT	2	6	26627	26632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960207
507	NC_018015	ACT	2	6	26668	26673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960207
508	NC_018015	CAC	2	6	26708	26713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960207
509	NC_018015	CTC	2	6	26862	26867	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960207
510	NC_018015	TCC	2	6	26896	26901	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960207
511	NC_018015	CTT	2	6	26972	26977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960207
512	NC_018015	TCC	2	6	26980	26985	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960207
513	NC_018015	ACG	2	6	27013	27018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960207
514	NC_018015	CTC	2	6	27024	27029	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960207
515	NC_018015	ACT	2	6	27055	27060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960207
516	NC_018015	ACT	2	6	27070	27075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960207
517	NC_018015	AC	3	6	27212	27217	50 %	0 %	0 %	50 %	390960207
518	NC_018015	CCT	2	6	27230	27235	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960207
519	NC_018015	TTC	2	6	27539	27544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960208
520	NC_018015	GAG	2	6	27557	27562	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960208
521	NC_018015	GGAA	2	8	27580	27587	50 %	0 %	50 %	0 %	390960208
522	NC_018015	TGA	2	6	27679	27684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960208
523	NC_018015	GTG	2	6	27719	27724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960208
524	NC_018015	GAG	2	6	27803	27808	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960208
525	NC_018015	CAGG	2	8	27898	27905	25 %	0 %	50 %	25 %	390960208
526	NC_018015	GGT	2	6	27922	27927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960208
527	NC_018015	GGGAA	2	10	27959	27968	40 %	0 %	60 %	0 %	390960208
528	NC_018015	CCT	2	6	27971	27976	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960208
529	NC_018015	GAC	2	6	28038	28043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960209
530	NC_018015	GC	3	6	28108	28113	0 %	0 %	50 %	50 %	390960209
531	NC_018015	GGA	2	6	28115	28120	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960209
532	NC_018015	GAG	2	6	28181	28186	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960209
533	NC_018015	GAC	2	6	28200	28205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960209
534	NC_018015	GAA	2	6	28229	28234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960209
535	NC_018015	GAG	2	6	28251	28256	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960209
536	NC_018015	GTG	2	6	28263	28268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960209
537	NC_018015	TC	3	6	28334	28339	0 %	50 %	0 %	50 %	390960209
538	NC_018015	GGA	2	6	28388	28393	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960209
539	NC_018015	GAT	2	6	28424	28429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960209
540	NC_018015	GA	3	6	28443	28448	50 %	0 %	50 %	0 %	390960209
541	NC_018015	CTC	2	6	28461	28466	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960209
542	NC_018015	CTC	2	6	28527	28532	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960209
543	NC_018015	GGA	2	6	28589	28594	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960209
544	NC_018015	GT	3	6	28649	28654	0 %	50 %	50 %	0 %	390960209
545	NC_018015	CTCG	2	8	28661	28668	0 %	25 %	25 %	50 %	390960209
546	NC_018015	CAGG	2	8	28685	28692	25 %	0 %	50 %	25 %	390960209
547	NC_018015	CTT	2	6	28743	28748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960209
548	NC_018015	TGT	2	6	28771	28776	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390960209
549	NC_018015	CCTA	2	8	28786	28793	25 %	25 %	0 %	50 %	390960209
550	NC_018015	GAGAG	2	10	28817	28826	40 %	0 %	60 %	0 %	390960209
551	NC_018015	GCC	2	6	28833	28838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960209
552	NC_018015	TGG	2	6	28860	28865	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960209
553	NC_018015	GA	3	6	28923	28928	50 %	0 %	50 %	0 %	390960209
554	NC_018015	CGG	2	6	28980	28985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960209
555	NC_018015	GCTG	2	8	28988	28995	0 %	25 %	50 %	25 %	390960209
556	NC_018015	GA	3	6	29007	29012	50 %	0 %	50 %	0 %	390960209
557	NC_018015	GAG	2	6	29040	29045	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960209
558	NC_018015	CT	3	6	29067	29072	0 %	50 %	0 %	50 %	390960210
559	NC_018015	CCA	2	6	29073	29078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960210
560	NC_018015	CG	3	6	29084	29089	0 %	0 %	50 %	50 %	390960210
561	NC_018015	CCCG	2	8	29091	29098	0 %	0 %	25 %	75 %	390960210
562	NC_018015	ATC	2	6	29108	29113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960210
563	NC_018015	GGT	2	6	29136	29141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960210
564	NC_018015	CTT	2	6	29168	29173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960210
565	NC_018015	CT	3	6	29205	29210	0 %	50 %	0 %	50 %	390960210
566	NC_018015	CCT	2	6	29223	29228	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960210
567	NC_018015	CTC	2	6	29233	29238	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960210
568	NC_018015	CCT	2	6	29239	29244	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960210
569	NC_018015	AAGCC	2	10	29264	29273	40 %	0 %	20 %	40 %	390960210
570	NC_018015	CCA	2	6	29286	29291	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960210
571	NC_018015	CTC	2	6	29363	29368	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960210
572	NC_018015	TC	3	6	29585	29590	0 %	50 %	0 %	50 %	390960210
573	NC_018015	GAG	2	6	29723	29728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960210
574	NC_018015	CCCGT	2	10	29738	29747	0 %	20 %	20 %	60 %	390960210
575	NC_018015	GAA	2	6	29782	29787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960210
576	NC_018015	GCC	2	6	29827	29832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960210
577	NC_018015	GTC	2	6	29992	29997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960210
578	NC_018015	TCC	2	6	30053	30058	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960210
579	NC_018015	C	6	6	30085	30090	0 %	0 %	0 %	100 %	390960210
580	NC_018015	CCG	2	6	30293	30298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960210
581	NC_018015	TCC	2	6	30370	30375	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960211
582	NC_018015	CCG	2	6	30390	30395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960211
583	NC_018015	CTC	2	6	30494	30499	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960211
584	NC_018015	GAA	2	6	30725	30730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960211
585	NC_018015	TCG	2	6	30763	30768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960211
586	NC_018015	TCG	2	6	30834	30839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960211
587	NC_018015	TCC	2	6	30855	30860	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960211
588	NC_018015	GAC	2	6	30863	30868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960211
589	NC_018015	CGC	2	6	30889	30894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960211
590	NC_018015	CCG	3	9	30903	30911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960211
591	NC_018015	CTT	2	6	30920	30925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960211
592	NC_018015	GTA	2	6	30962	30967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960211
593	NC_018015	ATCTCC	2	12	31068	31079	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	390960211
594	NC_018015	TCA	2	6	31081	31086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960211
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597	NC_018015	GA	3	6	31427	31432	50 %	0 %	50 %	0 %	390960212
598	NC_018015	CTC	2	6	31436	31441	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960212
599	NC_018015	CTT	2	6	31558	31563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960212
600	NC_018015	ACC	2	6	31592	31597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960212
601	NC_018015	TC	3	6	31620	31625	0 %	50 %	0 %	50 %	390960212
602	NC_018015	GAAC	2	8	31636	31643	50 %	0 %	25 %	25 %	390960212
603	NC_018015	CCCT	2	8	31668	31675	0 %	25 %	0 %	75 %	390960212
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607	NC_018015	ATG	2	6	32112	32117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960212
608	NC_018015	T	6	6	32134	32139	0 %	100 %	0 %	0 %	390960212
609	NC_018015	GT	3	6	32227	32232	0 %	50 %	50 %	0 %	390960212
610	NC_018015	GTC	2	6	32385	32390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960212
611	NC_018015	AGT	2	6	32395	32400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960212
612	NC_018015	CTC	2	6	32411	32416	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960212
613	NC_018015	GAG	2	6	32432	32437	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960212
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616	NC_018015	AG	3	6	32574	32579	50 %	0 %	50 %	0 %	390960212
617	NC_018015	GTA	2	6	32669	32674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960212
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620	NC_018015	GAG	2	6	32945	32950	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960213
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623	NC_018015	AGG	2	6	33023	33028	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960213
624	NC_018015	AC	3	6	33043	33048	50 %	0 %	0 %	50 %	390960213
625	NC_018015	TCG	2	6	33150	33155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960213
626	NC_018015	CGG	2	6	33229	33234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960213
627	NC_018015	AAGG	2	8	33250	33257	50 %	0 %	50 %	0 %	390960213
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629	NC_018015	GAG	2	6	33314	33319	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960213
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881	NC_018015	GTGA	2	8	46010	46017	25 %	25 %	50 %	0 %	390960226
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