MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus sp. CL1 chromosome

Total Repeats: 36405

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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9002	NC_018015	TGG	2	6	492023	492028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960702
9003	NC_018015	CGA	2	6	493075	493080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960703
9004	NC_018015	TGT	2	6	493132	493137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390960703
9005	NC_018015	ACG	2	6	493215	493220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960703
9006	NC_018015	TTGC	2	8	493233	493240	0 %	50 %	25 %	25 %	390960703
9007	NC_018015	CGG	2	6	493252	493257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960703
9008	NC_018015	TCC	2	6	493278	493283	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960703
9009	NC_018015	CG	3	6	493289	493294	0 %	0 %	50 %	50 %	390960703
9010	NC_018015	CGC	2	6	493298	493303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960703
9011	NC_018015	CT	3	6	493330	493335	0 %	50 %	0 %	50 %	390960703
9012	NC_018015	CGA	2	6	493348	493353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960703
9013	NC_018015	CGA	2	6	493366	493371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960703
9014	NC_018015	GAT	2	6	493400	493405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960703
9015	NC_018015	TGA	2	6	493438	493443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960703
9016	NC_018015	TCG	2	6	493503	493508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960703
9017	NC_018015	GCCTG	2	10	493546	493555	0 %	20 %	40 %	40 %	390960703
9018	NC_018015	AGG	2	6	493558	493563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960703
9019	NC_018015	GGT	2	6	493634	493639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960703
9020	NC_018015	GTC	2	6	493667	493672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960703
9021	NC_018015	CCT	2	6	493690	493695	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960703
9022	NC_018015	TCC	2	6	493716	493721	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960703
9023	NC_018015	ATC	2	6	493724	493729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960704
9024	NC_018015	G	6	6	493814	493819	0 %	0 %	100 %	0 %	390960704
9025	NC_018015	ATC	2	6	493828	493833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960704
9026	NC_018015	GC	3	6	493903	493908	0 %	0 %	50 %	50 %	390960704
9027	NC_018015	G	6	6	493923	493928	0 %	0 %	100 %	0 %	390960704
9028	NC_018015	CAGC	2	8	493989	493996	25 %	0 %	25 %	50 %	390960704
9029	NC_018015	AGC	2	6	494010	494015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960704
9030	NC_018015	TTA	2	6	494027	494032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390960704
9031	NC_018015	GTGA	2	8	494062	494069	25 %	25 %	50 %	0 %	390960704
9032	NC_018015	CCT	2	6	494163	494168	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960705
9033	NC_018015	GTA	2	6	494187	494192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960705
9034	NC_018015	CCT	2	6	494196	494201	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960705
9035	NC_018015	CCT	2	6	494205	494210	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960705
9036	NC_018015	CAG	2	6	494331	494336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960705
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9038	NC_018015	AGT	2	6	494390	494395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960705
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9040	NC_018015	AGT	2	6	494450	494455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960705
9041	NC_018015	CAGC	2	8	494462	494469	25 %	0 %	25 %	50 %	390960705
9042	NC_018015	GAG	2	6	494472	494477	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960705
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9044	NC_018015	TTCC	2	8	494516	494523	0 %	50 %	0 %	50 %	390960705
9045	NC_018015	TCC	2	6	494557	494562	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960705
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9049	NC_018015	TCGGC	2	10	494657	494666	0 %	20 %	40 %	40 %	390960705
9050	NC_018015	TCGC	2	8	494689	494696	0 %	25 %	25 %	50 %	390960705
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9052	NC_018015	ACG	2	6	495049	495054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960705
9053	NC_018015	AGGC	2	8	495056	495063	25 %	0 %	50 %	25 %	390960705
9054	NC_018015	GAGG	2	8	495090	495097	25 %	0 %	75 %	0 %	390960705
9055	NC_018015	TTGC	2	8	495112	495119	0 %	50 %	25 %	25 %	390960705
9056	NC_018015	AGGC	2	8	495144	495151	25 %	0 %	50 %	25 %	390960705
9057	NC_018015	TCTCG	2	10	495204	495213	0 %	40 %	20 %	40 %	390960705
9058	NC_018015	TGA	2	6	495218	495223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960705
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9060	NC_018015	TAC	2	6	495291	495296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960705
9061	NC_018015	TCGTAG	2	12	495376	495387	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	390960705
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9063	NC_018015	GAGG	2	8	495429	495436	25 %	0 %	75 %	0 %	390960705
9064	NC_018015	GTT	2	6	495509	495514	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390960706
9065	NC_018015	GC	3	6	495519	495524	0 %	0 %	50 %	50 %	390960706
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9069	NC_018015	CGA	2	6	495730	495735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960706
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9104	NC_018015	C	6	6	497581	497586	0 %	0 %	0 %	100 %	390960707
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9106	NC_018015	ATTCC	2	10	497636	497645	20 %	40 %	0 %	40 %	390960707
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9122	NC_018015	ATA	2	6	498534	498539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390960708
9123	NC_018015	CGA	2	6	498545	498550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960708
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9125	NC_018015	GA	3	6	498607	498612	50 %	0 %	50 %	0 %	390960708
9126	NC_018015	CAC	2	6	498632	498637	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960708
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9220	NC_018015	CGAGG	2	10	503429	503438	20 %	0 %	60 %	20 %	390960712
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9228	NC_018015	GCT	2	6	503862	503867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960712
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9233	NC_018015	CCT	2	6	504082	504087	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960713
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9237	NC_018015	CTCCC	2	10	504241	504250	0 %	20 %	0 %	80 %	390960713
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9239	NC_018015	TCC	2	6	504485	504490	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960714
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9485	NC_018015	AG	3	6	516406	516411	50 %	0 %	50 %	0 %	390960726
9486	NC_018015	GC	3	6	516415	516420	0 %	0 %	50 %	50 %	390960726
9487	NC_018015	AAG	2	6	516452	516457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960726
9488	NC_018015	CGC	2	6	516486	516491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960726
9489	NC_018015	CTA	2	6	516550	516555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960726
9490	NC_018015	GA	3	6	516583	516588	50 %	0 %	50 %	0 %	390960726
9491	NC_018015	TTC	2	6	516626	516631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960726
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9493	NC_018015	GAG	2	6	516659	516664	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960726
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