MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus sp. CL1 chromosome

Total Repeats: 36405

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_018015	GCC	2	6	378355	378360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960583
7002	NC_018015	TCC	2	6	378399	378404	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960583
7003	NC_018015	GC	3	6	378437	378442	0 %	0 %	50 %	50 %	390960583
7004	NC_018015	TCG	2	6	378488	378493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960583
7005	NC_018015	AGG	2	6	378860	378865	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960583
7006	NC_018015	CCCT	2	8	378884	378891	0 %	25 %	0 %	75 %	390960583
7007	NC_018015	GAG	2	6	378901	378906	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960583
7008	NC_018015	CTTCC	2	10	378909	378918	0 %	40 %	0 %	60 %	390960583
7009	NC_018015	CTT	2	6	378940	378945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960583
7010	NC_018015	CAG	2	6	378975	378980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960583
7011	NC_018015	GTGG	2	8	378991	378998	0 %	25 %	75 %	0 %	390960583
7012	NC_018015	TCG	2	6	379005	379010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960583
7013	NC_018015	TCC	2	6	379052	379057	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960583
7014	NC_018015	GAC	2	6	379114	379119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960583
7015	NC_018015	AGG	2	6	379145	379150	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960583
7016	NC_018015	GAG	2	6	379168	379173	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960583
7017	NC_018015	GTC	2	6	379234	379239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960583
7018	NC_018015	GAG	2	6	379267	379272	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960583
7019	NC_018015	GAG	2	6	379348	379353	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960583
7020	NC_018015	TCC	2	6	379394	379399	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960583
7021	NC_018015	TCCCGT	2	12	379431	379442	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	390960583
7022	NC_018015	GCC	2	6	379549	379554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960583
7023	NC_018015	TGG	2	6	379632	379637	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960583
7024	NC_018015	GTC	2	6	379708	379713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960583
7025	NC_018015	CT	3	6	379726	379731	0 %	50 %	0 %	50 %	390960583
7026	NC_018015	CAC	2	6	379784	379789	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960583
7027	NC_018015	TC	3	6	379804	379809	0 %	50 %	0 %	50 %	390960583
7028	NC_018015	CCA	2	6	379840	379845	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960583
7029	NC_018015	TTCCT	2	10	380094	380103	0 %	60 %	0 %	40 %	390960584
7030	NC_018015	CTC	2	6	380123	380128	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960584
7031	NC_018015	TCT	2	6	380158	380163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960584
7032	NC_018015	CTG	2	6	380229	380234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960584
7033	NC_018015	TTG	2	6	380241	380246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390960584
7034	NC_018015	TCCA	2	8	380340	380347	25 %	25 %	0 %	50 %	390960584
7035	NC_018015	TCG	2	6	380397	380402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960584
7036	NC_018015	GGA	2	6	380404	380409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960584
7037	NC_018015	AGT	2	6	380410	380415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960584
7038	NC_018015	CTC	2	6	380439	380444	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960584
7039	NC_018015	CCT	2	6	380539	380544	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960584
7040	NC_018015	TCCC	2	8	380649	380656	0 %	25 %	0 %	75 %	390960584
7041	NC_018015	C	6	6	380654	380659	0 %	0 %	0 %	100 %	390960584
7042	NC_018015	C	6	6	380670	380675	0 %	0 %	0 %	100 %	390960584
7043	NC_018015	TCTT	2	8	380790	380797	0 %	75 %	0 %	25 %	390960584
7044	NC_018015	CCA	2	6	380804	380809	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960584
7045	NC_018015	TCG	2	6	380832	380837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960584
7046	NC_018015	GTC	2	6	380942	380947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960584
7047	NC_018015	GGA	2	6	381022	381027	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960584
7048	NC_018015	TCG	2	6	381039	381044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960584
7049	NC_018015	AGCC	2	8	381171	381178	25 %	0 %	25 %	50 %	390960584
7050	NC_018015	TCC	2	6	381239	381244	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960584
7051	NC_018015	TCG	2	6	381273	381278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960584
7052	NC_018015	TCC	2	6	381295	381300	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960584
7053	NC_018015	TCG	2	6	381330	381335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960584
7054	NC_018015	GAA	2	6	381362	381367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960584
7055	NC_018015	CTC	2	6	381395	381400	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960584
7056	NC_018015	GAA	2	6	381503	381508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960584
7057	NC_018015	GGAAT	2	10	381595	381604	40 %	20 %	40 %	0 %	390960584
7058	NC_018015	GAG	2	6	381623	381628	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960584
7059	NC_018015	GTA	2	6	381659	381664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960584
7060	NC_018015	GTA	2	6	381716	381721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960584
7061	NC_018015	TCC	2	6	381750	381755	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960584
7062	NC_018015	GCTCG	2	10	381782	381791	0 %	20 %	40 %	40 %	390960584
7063	NC_018015	TGA	2	6	382047	382052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960585
7064	NC_018015	CGG	2	6	382069	382074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960585
7065	NC_018015	GAT	2	6	382120	382125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960585
7066	NC_018015	CTT	2	6	382129	382134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960585
7067	NC_018015	TCC	2	6	382158	382163	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960585
7068	NC_018015	GAGT	2	8	382249	382256	25 %	25 %	50 %	0 %	390960585
7069	NC_018015	G	6	6	382257	382262	0 %	0 %	100 %	0 %	390960585
7070	NC_018015	ACT	2	6	382272	382277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960585
7071	NC_018015	CCA	2	6	382314	382319	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960585
7072	NC_018015	GGT	2	6	382324	382329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960585
7073	NC_018015	CTT	2	6	382348	382353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960585
7074	NC_018015	CGT	2	6	382354	382359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960585
7075	NC_018015	CT	3	6	382395	382400	0 %	50 %	0 %	50 %	390960585
7076	NC_018015	AAG	2	6	382418	382423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960585
7077	NC_018015	AAC	2	6	382487	382492	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390960585
7078	NC_018015	GAA	2	6	382497	382502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960585
7079	NC_018015	GGA	2	6	382531	382536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960585
7080	NC_018015	ACG	2	6	382698	382703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960585
7081	NC_018015	GAT	2	6	382880	382885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960585
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7083	NC_018015	GTT	2	6	383006	383011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390960585
7084	NC_018015	ACA	2	6	383037	383042	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390960585
7085	NC_018015	ATA	2	6	383117	383122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390960585
7086	NC_018015	TGA	2	6	383137	383142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960586
7087	NC_018015	TAC	2	6	383154	383159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960586
7088	NC_018015	GAG	2	6	383178	383183	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960586
7089	NC_018015	CTT	2	6	383190	383195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960586
7090	NC_018015	ATA	2	6	383229	383234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390960586
7091	NC_018015	TGG	2	6	383281	383286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960586
7092	NC_018015	CGA	2	6	383308	383313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960586
7093	NC_018015	CTA	3	9	383390	383398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960586
7094	NC_018015	CGG	2	6	383399	383404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960586
7095	NC_018015	CGA	2	6	383435	383440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960586
7096	NC_018015	TAC	2	6	383508	383513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960586
7097	NC_018015	GAT	2	6	383526	383531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960586
7098	NC_018015	TTG	2	6	383584	383589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390960586
7099	NC_018015	CTT	2	6	383615	383620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960586
7100	NC_018015	ATG	2	6	383670	383675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960586
7101	NC_018015	AGG	2	6	383701	383706	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960586
7102	NC_018015	GAG	2	6	383793	383798	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960586
7103	NC_018015	GCT	2	6	383822	383827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960586
7104	NC_018015	GAA	2	6	383837	383842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960586
7105	NC_018015	GTC	2	6	384048	384053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960587
7106	NC_018015	TCA	2	6	384091	384096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960587
7107	NC_018015	CAT	2	6	384128	384133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960587
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7109	NC_018015	CGC	2	6	384176	384181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960587
7110	NC_018015	CTCG	2	8	384218	384225	0 %	25 %	25 %	50 %	390960587
7111	NC_018015	CTC	2	6	384263	384268	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960587
7112	NC_018015	TTC	2	6	384352	384357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960587
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7117	NC_018015	GAA	2	6	384849	384854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960588
7118	NC_018015	TGT	2	6	385004	385009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390960588
7119	NC_018015	GAG	2	6	385014	385019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960588
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7121	NC_018015	TGA	2	6	385082	385087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960588
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7483	NC_018015	CAA	2	6	407420	407425	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390960609
7484	NC_018015	CCT	2	6	407447	407452	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960609
7485	NC_018015	GAA	2	6	407644	407649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960609
7486	NC_018015	GTCA	2	8	407655	407662	25 %	25 %	25 %	25 %	390960609
7487	NC_018015	CTC	2	6	407664	407669	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960609
7488	NC_018015	CT	3	6	407694	407699	0 %	50 %	0 %	50 %	390960609
7489	NC_018015	CAG	2	6	407726	407731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960609
7490	NC_018015	TGGTC	2	10	407819	407828	0 %	40 %	40 %	20 %	390960609
7491	NC_018015	ACC	2	6	407856	407861	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960609
7492	NC_018015	GAAG	2	8	407873	407880	50 %	0 %	50 %	0 %	390960609
7493	NC_018015	CGT	2	6	407906	407911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960609
7494	NC_018015	GAG	2	6	407919	407924	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960609
7495	NC_018015	GGA	2	6	407947	407952	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960609
7496	NC_018015	AGGACG	2	12	408070	408081	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	390960609
7497	NC_018015	TCA	2	6	408130	408135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960609
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7499	NC_018015	TCA	2	6	408214	408219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960609
7500	NC_018015	CAT	2	6	408227	408232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960609

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