MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus sp. CL1 chromosome

Total Repeats: 36405

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_018015	CGC	2	6	353555	353560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960559
6502	NC_018015	TACGAG	2	12	353578	353589	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	390960559
6503	NC_018015	AAC	2	6	353767	353772	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390960559
6504	NC_018015	CTC	2	6	353788	353793	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960559
6505	NC_018015	TGG	2	6	353820	353825	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960559
6506	NC_018015	TCG	3	9	353858	353866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960559
6507	NC_018015	CGG	2	6	353898	353903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960559
6508	NC_018015	AGCA	2	8	353937	353944	50 %	0 %	25 %	25 %	390960559
6509	NC_018015	GAA	2	6	353988	353993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960559
6510	NC_018015	GTG	2	6	354006	354011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960559
6511	NC_018015	CGA	2	6	354075	354080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960559
6512	NC_018015	GCGG	2	8	354133	354140	0 %	0 %	75 %	25 %	390960559
6513	NC_018015	CTC	2	6	354166	354171	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960559
6514	NC_018015	GAG	2	6	354198	354203	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960559
6515	NC_018015	CTC	2	6	354211	354216	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960559
6516	NC_018015	CTC	2	6	354223	354228	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960559
6517	NC_018015	TTC	2	6	354241	354246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960560
6518	NC_018015	TCCCT	2	10	354283	354292	0 %	40 %	0 %	60 %	390960560
6519	NC_018015	CAC	2	6	354306	354311	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960560
6520	NC_018015	GCA	2	6	354324	354329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960560
6521	NC_018015	TC	3	6	354350	354355	0 %	50 %	0 %	50 %	390960560
6522	NC_018015	CAAC	2	8	354403	354410	50 %	0 %	0 %	50 %	390960560
6523	NC_018015	TGT	2	6	354431	354436	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390960560
6524	NC_018015	CCG	2	6	354454	354459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960560
6525	NC_018015	CTT	2	6	354506	354511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960560
6526	NC_018015	TCC	2	6	354553	354558	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960560
6527	NC_018015	CGT	2	6	354600	354605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960560
6528	NC_018015	CTCCTT	2	12	354633	354644	0 %	50 %	0 %	50 %	390960560
6529	NC_018015	CTC	2	6	354681	354686	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960560
6530	NC_018015	CTT	2	6	354699	354704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960560
6531	NC_018015	TCC	2	6	354724	354729	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960560
6532	NC_018015	TCT	2	6	354731	354736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960560
6533	NC_018015	TTC	2	6	354781	354786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960560
6534	NC_018015	G	6	6	354815	354820	0 %	0 %	100 %	0 %	390960560
6535	NC_018015	TCT	3	9	354830	354838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960560
6536	NC_018015	CTG	2	6	354856	354861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960560
6537	NC_018015	GC	3	6	354883	354888	0 %	0 %	50 %	50 %	390960560
6538	NC_018015	TTCCAA	2	12	354899	354910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960560
6539	NC_018015	GCC	2	6	354934	354939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960560
6540	NC_018015	TCT	4	12	354965	354976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960560
6541	NC_018015	CCT	2	6	355010	355015	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960560
6542	NC_018015	TCG	2	6	355036	355041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960560
6543	NC_018015	CAGC	2	8	355068	355075	25 %	0 %	25 %	50 %	390960560
6544	NC_018015	CCT	2	6	355076	355081	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960560
6545	NC_018015	GAT	2	6	355112	355117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960560
6546	NC_018015	TAT	2	6	355128	355133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390960560
6547	NC_018015	CTTC	2	8	355280	355287	0 %	50 %	0 %	50 %	390960560
6548	NC_018015	GAG	2	6	355411	355416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960560
6549	NC_018015	GCTC	2	8	355438	355445	0 %	25 %	25 %	50 %	390960560
6550	NC_018015	TCT	2	6	355472	355477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960560
6551	NC_018015	CTG	2	6	355554	355559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960560
6552	NC_018015	GGCC	2	8	355584	355591	0 %	0 %	50 %	50 %	390960560
6553	NC_018015	CTT	2	6	355593	355598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960560
6554	NC_018015	CCT	2	6	355601	355606	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960560
6555	NC_018015	CCT	3	9	355622	355630	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960560
6556	NC_018015	TTC	2	6	355678	355683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960560
6557	NC_018015	TGA	2	6	355697	355702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960560
6558	NC_018015	TCTCCC	2	12	355733	355744	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960560
6559	NC_018015	GA	3	6	355789	355794	50 %	0 %	50 %	0 %	390960560
6560	NC_018015	GC	3	6	355813	355818	0 %	0 %	50 %	50 %	390960560
6561	NC_018015	GA	3	6	355843	355848	50 %	0 %	50 %	0 %	390960560
6562	NC_018015	GC	3	6	355878	355883	0 %	0 %	50 %	50 %	390960560
6563	NC_018015	TCG	2	6	355913	355918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960560
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6565	NC_018015	CTT	2	6	355950	355955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960560
6566	NC_018015	TGG	2	6	355988	355993	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960560
6567	NC_018015	CGC	2	6	356000	356005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960560
6568	NC_018015	TCG	2	6	356074	356079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960560
6569	NC_018015	GCCCTT	2	12	356127	356138	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	390960560
6570	NC_018015	CCG	2	6	356228	356233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960560
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6572	NC_018015	GTA	2	6	356271	356276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960560
6573	NC_018015	ATG	2	6	356362	356367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960560
6574	NC_018015	CGA	2	6	357080	357085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960561
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6576	NC_018015	CGG	2	6	357167	357172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960561
6577	NC_018015	TCG	2	6	357179	357184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960561
6578	NC_018015	GAG	2	6	357201	357206	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960561
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6580	NC_018015	TCC	2	6	357266	357271	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960561
6581	NC_018015	GTC	2	6	357372	357377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960561
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6584	NC_018015	TCC	2	6	357469	357474	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960561
6585	NC_018015	G	6	6	357510	357515	0 %	0 %	100 %	0 %	390960561
6586	NC_018015	CCCG	2	8	357530	357537	0 %	0 %	25 %	75 %	390960561
6587	NC_018015	GAA	2	6	357759	357764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960562
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6589	NC_018015	CAA	2	6	357827	357832	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390960562
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6592	NC_018015	AGG	2	6	357946	357951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960562
6593	NC_018015	CAA	2	6	357978	357983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390960562
6594	NC_018015	GCC	2	6	358072	358077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960562
6595	NC_018015	TCC	2	6	358118	358123	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960562
6596	NC_018015	AAG	2	6	358207	358212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960562
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6599	NC_018015	GTC	2	6	358258	358263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960562
6600	NC_018015	GAG	2	6	358264	358269	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960562
6601	NC_018015	AT	3	6	358333	358338	50 %	50 %	0 %	0 %	390960562
6602	NC_018015	CAG	2	6	358466	358471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960562
6603	NC_018015	ATG	2	6	358504	358509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960562
6604	NC_018015	CTT	2	6	358521	358526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960562
6605	NC_018015	CCGCT	2	10	358595	358604	0 %	20 %	20 %	60 %	390960562
6606	NC_018015	CAT	2	6	358617	358622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960562
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6608	NC_018015	ACC	3	9	358829	358837	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960562
6609	NC_018015	GAG	2	6	358858	358863	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960562
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6617	NC_018015	CAG	2	6	359389	359394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960564
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6620	NC_018015	ATC	2	6	359441	359446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960564
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6984	NC_018015	CAG	2	6	377531	377536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960583
6985	NC_018015	GC	3	6	377556	377561	0 %	0 %	50 %	50 %	390960583
6986	NC_018015	GTA	2	6	377665	377670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960583
6987	NC_018015	ACCTCG	2	12	377714	377725	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	390960583
6988	NC_018015	TG	4	8	377898	377905	0 %	50 %	50 %	0 %	390960583
6989	NC_018015	TCA	2	6	377940	377945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960583
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6991	NC_018015	GTA	2	6	377971	377976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960583
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