MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus sp. CL1 chromosome

Total Repeats: 36405

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_018015	GCC	2	6	325400	325405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960532
6002	NC_018015	AGG	2	6	325440	325445	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960532
6003	NC_018015	GCC	2	6	325528	325533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960532
6004	NC_018015	GGCCAG	2	12	325552	325563	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	390960532
6005	NC_018015	CGG	2	6	325570	325575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960532
6006	NC_018015	GC	3	6	325589	325594	0 %	0 %	50 %	50 %	390960532
6007	NC_018015	TGG	2	6	325596	325601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960532
6008	NC_018015	G	6	6	325600	325605	0 %	0 %	100 %	0 %	390960532
6009	NC_018015	A	6	6	325673	325678	100 %	0 %	0 %	0 %	390960532
6010	NC_018015	TCC	2	6	325686	325691	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960532
6011	NC_018015	ACC	2	6	325787	325792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960533
6012	NC_018015	CCT	2	6	325815	325820	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960533
6013	NC_018015	CCA	2	6	325828	325833	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960533
6014	NC_018015	CTT	2	6	325891	325896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960533
6015	NC_018015	C	6	6	325951	325956	0 %	0 %	0 %	100 %	390960534
6016	NC_018015	TGT	2	6	326003	326008	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390960534
6017	NC_018015	CGG	2	6	326039	326044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960534
6018	NC_018015	AGG	2	6	326272	326277	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960534
6019	NC_018015	T	6	6	326286	326291	0 %	100 %	0 %	0 %	390960534
6020	NC_018015	CGTAG	2	10	326363	326372	20 %	20 %	40 %	20 %	390960534
6021	NC_018015	GAA	3	9	326391	326399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960534
6022	NC_018015	CCT	2	6	326427	326432	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960534
6023	NC_018015	GGA	2	6	326516	326521	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960534
6024	NC_018015	CTT	2	6	326600	326605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960535
6025	NC_018015	CAG	2	6	326609	326614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960535
6026	NC_018015	CCT	2	6	326689	326694	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960535
6027	NC_018015	GGA	2	6	326806	326811	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960535
6028	NC_018015	GTA	3	9	326894	326902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960535
6029	NC_018015	CT	3	6	326938	326943	0 %	50 %	0 %	50 %	390960535
6030	NC_018015	GAA	2	6	326978	326983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960535
6031	NC_018015	AGA	2	6	327001	327006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960535
6032	NC_018015	AGG	2	6	327028	327033	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960535
6033	NC_018015	T	6	6	327035	327040	0 %	100 %	0 %	0 %	390960535
6034	NC_018015	CTC	2	6	327041	327046	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960535
6035	NC_018015	TGTCCT	2	12	327139	327150	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	390960535
6036	NC_018015	AAG	2	6	327192	327197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960535
6037	NC_018015	CGA	2	6	327322	327327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960535
6038	NC_018015	CTCA	2	8	327400	327407	25 %	25 %	0 %	50 %	390960536
6039	NC_018015	TCT	2	6	327442	327447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960536
6040	NC_018015	GAG	2	6	327461	327466	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960536
6041	NC_018015	ATC	2	6	327489	327494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960536
6042	NC_018015	ACG	2	6	327606	327611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960536
6043	NC_018015	AGG	2	6	327646	327651	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960536
6044	NC_018015	CAA	2	6	327658	327663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390960536
6045	NC_018015	CTT	2	6	327677	327682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960536
6046	NC_018015	CGA	2	6	327700	327705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960536
6047	NC_018015	GAG	2	6	327740	327745	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960536
6048	NC_018015	CGA	2	6	327781	327786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960536
6049	NC_018015	CGA	2	6	327835	327840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960536
6050	NC_018015	TTG	2	6	327873	327878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390960536
6051	NC_018015	GTT	2	6	327938	327943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390960536
6052	NC_018015	TCA	2	6	327982	327987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960536
6053	NC_018015	AGA	2	6	328000	328005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960536
6054	NC_018015	TAT	2	6	328010	328015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390960536
6055	NC_018015	TCC	2	6	328029	328034	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960536
6056	NC_018015	CCTTGG	2	12	328039	328050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960536
6057	NC_018015	CGC	2	6	328057	328062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960536
6058	NC_018015	CGA	2	6	328063	328068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960536
6059	NC_018015	TTA	2	6	328069	328074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390960536
6060	NC_018015	TGG	2	6	328075	328080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960536
6061	NC_018015	CGA	2	6	328090	328095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960536
6062	NC_018015	GGTAT	2	10	328101	328110	20 %	40 %	40 %	0 %	390960536
6063	NC_018015	ACC	2	6	328121	328126	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960536
6064	NC_018015	GAC	2	6	328157	328162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960536
6065	NC_018015	TCC	2	6	328173	328178	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960536
6066	NC_018015	TCT	2	6	328243	328248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960536
6067	NC_018015	GC	3	6	328260	328265	0 %	0 %	50 %	50 %	390960536
6068	NC_018015	CCT	2	6	328316	328321	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960536
6069	NC_018015	GTC	2	6	328352	328357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960536
6070	NC_018015	ACA	2	6	328377	328382	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390960536
6071	NC_018015	GCC	2	6	328398	328403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960536
6072	NC_018015	CGA	2	6	328447	328452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960536
6073	NC_018015	GC	3	6	328491	328496	0 %	0 %	50 %	50 %	390960536
6074	NC_018015	CTT	2	6	328501	328506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960536
6075	NC_018015	GCC	2	6	328544	328549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960536
6076	NC_018015	ATC	2	6	328617	328622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960536
6077	NC_018015	CTC	2	6	328823	328828	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960537
6078	NC_018015	CAA	2	6	328834	328839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390960537
6079	NC_018015	CGA	2	6	328846	328851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960537
6080	NC_018015	ATA	2	6	328919	328924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390960537
6081	NC_018015	TC	3	6	328973	328978	0 %	50 %	0 %	50 %	390960537
6082	NC_018015	CGT	2	6	329074	329079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960537
6083	NC_018015	TGA	2	6	329094	329099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960537
6084	NC_018015	CTG	2	6	329156	329161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960537
6085	NC_018015	AGG	2	6	329168	329173	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960537
6086	NC_018015	AAG	2	6	329243	329248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960537
6087	NC_018015	TGA	2	6	329257	329262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960537
6088	NC_018015	AGA	2	6	329341	329346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960537
6089	NC_018015	AAG	2	6	329444	329449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960537
6090	NC_018015	TCG	2	6	329454	329459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960537
6091	NC_018015	GA	3	6	329484	329489	50 %	0 %	50 %	0 %	390960537
6092	NC_018015	GGA	3	9	329506	329514	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960538
6093	NC_018015	ATA	2	6	329525	329530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390960538
6094	NC_018015	GAA	2	6	329641	329646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960538
6095	NC_018015	GCTGA	2	10	329657	329666	20 %	20 %	40 %	20 %	390960538
6096	NC_018015	GAG	2	6	329675	329680	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960538
6097	NC_018015	CTCC	2	8	329713	329720	0 %	25 %	0 %	75 %	390960538
6098	NC_018015	GGA	2	6	329722	329727	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960538
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6100	NC_018015	ATA	2	6	329768	329773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390960538
6101	NC_018015	GGAG	2	8	329800	329807	25 %	0 %	75 %	0 %	390960538
6102	NC_018015	GAA	2	6	329814	329819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960538
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6105	NC_018015	GAAGGA	2	12	329982	329993	50 %	0 %	50 %	0 %	390960539
6106	NC_018015	CTT	2	6	330090	330095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960540
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6108	NC_018015	GAA	2	6	330210	330215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960540
6109	NC_018015	TCG	3	9	330220	330228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960540
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6111	NC_018015	TAT	2	6	330342	330347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390960540
6112	NC_018015	CTTGGC	2	12	330348	330359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960540
6113	NC_018015	TGA	2	6	330377	330382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960540
6114	NC_018015	CGT	2	6	330413	330418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960540
6115	NC_018015	AGG	2	6	330424	330429	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960540
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6117	NC_018015	GAG	2	6	330558	330563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960540
6118	NC_018015	CTC	2	6	330564	330569	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960540
6119	NC_018015	CTT	3	9	330576	330584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960540
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6121	NC_018015	CTC	2	6	330618	330623	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960540
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6364	NC_018015	GAG	2	6	343499	343504	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960550
6365	NC_018015	CGT	2	6	343534	343539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960550
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6367	NC_018015	TGG	2	6	343605	343610	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960550
6368	NC_018015	CTC	2	6	343676	343681	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960550
6369	NC_018015	GAG	2	6	343709	343714	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960550
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6394	NC_018015	CCG	2	6	344905	344910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960551
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6463	NC_018015	CGT	2	6	351111	351116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960555
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6470	NC_018015	GAA	2	6	351726	351731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960556
6471	NC_018015	CGG	2	6	351770	351775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960556
6472	NC_018015	GCT	2	6	351884	351889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960556
6473	NC_018015	CTC	2	6	351969	351974	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960556
6474	NC_018015	TGA	2	6	351977	351982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960556
6475	NC_018015	CTT	2	6	351984	351989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960556
6476	NC_018015	CACCT	2	10	352207	352216	20 %	20 %	0 %	60 %	390960557
6477	NC_018015	AGC	2	6	352243	352248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960557
6478	NC_018015	TTC	2	6	352260	352265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960557
6479	NC_018015	GAGG	2	8	352326	352333	25 %	0 %	75 %	0 %	390960557
6480	NC_018015	TAC	2	6	352360	352365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960557
6481	NC_018015	CATAGC	2	12	352368	352379	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	390960557
6482	NC_018015	GCG	2	6	352439	352444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960557
6483	NC_018015	GCTC	2	8	352496	352503	0 %	25 %	25 %	50 %	390960557
6484	NC_018015	GAT	2	6	352509	352514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960557
6485	NC_018015	TTC	2	6	352553	352558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960557
6486	NC_018015	TGA	2	6	352595	352600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960557
6487	NC_018015	TCG	2	6	352673	352678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960557
6488	NC_018015	TAA	3	9	352772	352780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390960557
6489	NC_018015	GAA	2	6	352804	352809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960557
6490	NC_018015	CGG	2	6	352827	352832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960557
6491	NC_018015	GGT	2	6	352892	352897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960558
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