MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus sp. CL1 chromosome

Total Repeats: 36405

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_018015	TCT	2	6	298120	298125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960504
5502	NC_018015	GCC	2	6	298158	298163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960504
5503	NC_018015	ATA	2	6	298173	298178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390960504
5504	NC_018015	ACC	2	6	298183	298188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960504
5505	NC_018015	CCA	2	6	298285	298290	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960504
5506	NC_018015	TCC	2	6	298423	298428	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960504
5507	NC_018015	TGAAG	2	10	298516	298525	40 %	20 %	40 %	0 %	390960505
5508	NC_018015	GGA	2	6	298617	298622	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960505
5509	NC_018015	GAG	2	6	298637	298642	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960505
5510	NC_018015	GGC	2	6	298652	298657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960505
5511	NC_018015	AGA	2	6	298689	298694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960505
5512	NC_018015	CACGC	2	10	298715	298724	20 %	0 %	20 %	60 %	390960505
5513	NC_018015	CAT	2	6	298759	298764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960505
5514	NC_018015	CTC	2	6	298817	298822	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960505
5515	NC_018015	TTG	2	6	298827	298832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390960505
5516	NC_018015	GAAG	2	8	298837	298844	50 %	0 %	50 %	0 %	390960505
5517	NC_018015	TCA	2	6	298911	298916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960505
5518	NC_018015	ATT	2	6	298991	298996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390960505
5519	NC_018015	AG	3	6	298997	299002	50 %	0 %	50 %	0 %	390960505
5520	NC_018015	TTC	2	6	299027	299032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960505
5521	NC_018015	GGA	2	6	299056	299061	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960505
5522	NC_018015	ATC	2	6	299162	299167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960505
5523	NC_018015	GTGGA	2	10	299201	299210	20 %	20 %	60 %	0 %	390960505
5524	NC_018015	GAG	2	6	299267	299272	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960505
5525	NC_018015	GAG	2	6	299339	299344	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960505
5526	NC_018015	TGG	2	6	299358	299363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960505
5527	NC_018015	TGG	2	6	299476	299481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960506
5528	NC_018015	CTC	2	6	299508	299513	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960506
5529	NC_018015	CTT	2	6	299594	299599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960506
5530	NC_018015	CAT	2	6	299651	299656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960506
5531	NC_018015	CGGG	2	8	299692	299699	0 %	0 %	75 %	25 %	390960506
5532	NC_018015	CACT	2	8	299847	299854	25 %	25 %	0 %	50 %	390960506
5533	NC_018015	CTC	2	6	299889	299894	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960506
5534	NC_018015	CTC	2	6	300037	300042	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960507
5535	NC_018015	TGG	2	6	300060	300065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960507
5536	NC_018015	GTC	2	6	300196	300201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960507
5537	NC_018015	GCC	2	6	300263	300268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960507
5538	NC_018015	TTC	2	6	300278	300283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960507
5539	NC_018015	CCGTCG	2	12	300284	300295	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	390960507
5540	NC_018015	TGC	2	6	300296	300301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960507
5541	NC_018015	GAC	2	6	300373	300378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960507
5542	NC_018015	TCT	2	6	300489	300494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960507
5543	NC_018015	ACC	2	6	300500	300505	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960507
5544	NC_018015	GCT	2	6	300510	300515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960507
5545	NC_018015	TCA	2	6	300560	300565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960507
5546	NC_018015	ACTC	2	8	300600	300607	25 %	25 %	0 %	50 %	390960507
5547	NC_018015	CGA	2	6	300636	300641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960507
5548	NC_018015	GCTC	2	8	300666	300673	0 %	25 %	25 %	50 %	390960507
5549	NC_018015	AGG	3	9	300731	300739	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960507
5550	NC_018015	CGA	2	6	300753	300758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960507
5551	NC_018015	CCTCA	2	10	300763	300772	20 %	20 %	0 %	60 %	390960507
5552	NC_018015	CTC	2	6	300775	300780	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960507
5553	NC_018015	TCT	2	6	300846	300851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960507
5554	NC_018015	CAT	2	6	300862	300867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960507
5555	NC_018015	GAAGT	2	10	300923	300932	40 %	20 %	40 %	0 %	390960507
5556	NC_018015	CCG	2	6	300938	300943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960507
5557	NC_018015	GTA	2	6	300952	300957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960507
5558	NC_018015	TCGGAA	2	12	300960	300971	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	390960507
5559	NC_018015	GAG	2	6	300976	300981	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960507
5560	NC_018015	TCC	2	6	300989	300994	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960507
5561	NC_018015	TCC	2	6	301079	301084	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960507
5562	NC_018015	ACA	2	6	301238	301243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390960507
5563	NC_018015	TGG	2	6	301356	301361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960508
5564	NC_018015	TCC	2	6	301362	301367	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960508
5565	NC_018015	AG	3	6	301480	301485	50 %	0 %	50 %	0 %	390960508
5566	NC_018015	GAA	2	6	301537	301542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960508
5567	NC_018015	GAG	2	6	301625	301630	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960508
5568	NC_018015	AG	3	6	301676	301681	50 %	0 %	50 %	0 %	390960508
5569	NC_018015	CA	3	6	301778	301783	50 %	0 %	0 %	50 %	390960508
5570	NC_018015	GCT	2	6	301789	301794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960508
5571	NC_018015	GAGG	2	8	301816	301823	25 %	0 %	75 %	0 %	390960508
5572	NC_018015	TCG	2	6	301845	301850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960508
5573	NC_018015	ACA	2	6	301854	301859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390960508
5574	NC_018015	GAT	2	6	301888	301893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960508
5575	NC_018015	GCT	2	6	301900	301905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960508
5576	NC_018015	GCC	2	6	301976	301981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960508
5577	NC_018015	CCTC	2	8	302008	302015	0 %	25 %	0 %	75 %	390960508
5578	NC_018015	G	6	6	302061	302066	0 %	0 %	100 %	0 %	390960508
5579	NC_018015	CGT	2	6	302086	302091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960508
5580	NC_018015	CGA	2	6	302097	302102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960508
5581	NC_018015	ATA	2	6	302165	302170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390960508
5582	NC_018015	AGCG	2	8	302198	302205	25 %	0 %	50 %	25 %	390960508
5583	NC_018015	AAC	2	6	302237	302242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390960508
5584	NC_018015	GGT	2	6	302257	302262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960508
5585	NC_018015	AGG	2	6	302361	302366	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960508
5586	NC_018015	CTC	2	6	302462	302467	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960508
5587	NC_018015	AAGG	2	8	302468	302475	50 %	0 %	50 %	0 %	390960508
5588	NC_018015	AAT	2	6	302500	302505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390960508
5589	NC_018015	GCG	2	6	302514	302519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960508
5590	NC_018015	GAC	2	6	302606	302611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960508
5591	NC_018015	GCT	2	6	302617	302622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960508
5592	NC_018015	TAC	2	6	302663	302668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960508
5593	NC_018015	TAC	2	6	302675	302680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960508
5594	NC_018015	GA	3	6	302685	302690	50 %	0 %	50 %	0 %	390960508
5595	NC_018015	GCC	2	6	302727	302732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960508
5596	NC_018015	T	6	6	302777	302782	0 %	100 %	0 %	0 %	390960509
5597	NC_018015	GCGG	2	8	302856	302863	0 %	0 %	75 %	25 %	390960509
5598	NC_018015	T	7	7	302866	302872	0 %	100 %	0 %	0 %	390960509
5599	NC_018015	TAA	2	6	303003	303008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390960509
5600	NC_018015	CT	3	6	303013	303018	0 %	50 %	0 %	50 %	390960509
5601	NC_018015	CCA	2	6	303151	303156	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960509
5602	NC_018015	TAG	2	6	303159	303164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960509
5603	NC_018015	GGT	3	9	303247	303255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960509
5604	NC_018015	GAC	2	6	303305	303310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960509
5605	NC_018015	GAA	2	6	303314	303319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960509
5606	NC_018015	GTCC	2	8	303335	303342	0 %	25 %	25 %	50 %	390960509
5607	NC_018015	CCGTC	2	10	303463	303472	0 %	20 %	20 %	60 %	390960509
5608	NC_018015	AAC	2	6	304004	304009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390960510
5609	NC_018015	CTC	2	6	304097	304102	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960510
5610	NC_018015	CCG	2	6	304201	304206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960510
5611	NC_018015	TTG	2	6	304212	304217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390960510
5612	NC_018015	CCT	2	6	304291	304296	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960510
5613	NC_018015	CGA	2	6	304342	304347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960510
5614	NC_018015	CCCTG	2	10	304357	304366	0 %	20 %	20 %	60 %	390960510
5615	NC_018015	TCC	2	6	304383	304388	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960510
5616	NC_018015	GTC	2	6	304454	304459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960510
5617	NC_018015	C	6	6	304491	304496	0 %	0 %	0 %	100 %	390960510
5618	NC_018015	CAT	2	6	304514	304519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960510
5619	NC_018015	ACC	2	6	304647	304652	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960510
5620	NC_018015	TCC	2	6	304670	304675	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960510
5621	NC_018015	ACG	3	9	304695	304703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960510
5622	NC_018015	CGA	2	6	304747	304752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960510
5623	NC_018015	GTC	2	6	304770	304775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960510
5624	NC_018015	GGT	2	6	304784	304789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960510
5625	NC_018015	TGA	2	6	304798	304803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960510
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5627	NC_018015	GAG	2	6	304841	304846	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960510
5628	NC_018015	GTA	2	6	304850	304855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960510
5629	NC_018015	TGA	2	6	304867	304872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960510
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5632	NC_018015	GTA	2	6	304979	304984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960510
5633	NC_018015	AGG	2	6	304988	304993	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960510
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5652	NC_018015	CCT	2	6	306002	306007	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960512
5653	NC_018015	CTC	2	6	306030	306035	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960512
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5726	NC_018015	CGA	2	6	309974	309979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960516
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5729	NC_018015	GCGAT	2	10	310174	310183	20 %	20 %	40 %	20 %	390960516
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5731	NC_018015	GAG	3	9	310233	310241	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960516
5732	NC_018015	TG	4	8	310279	310286	0 %	50 %	50 %	0 %	390960516
5733	NC_018015	AAG	2	6	310290	310295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960516
5734	NC_018015	TCA	2	6	310312	310317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960516
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5737	NC_018015	TCG	2	6	310429	310434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960516
5738	NC_018015	CAGG	2	8	310443	310450	25 %	0 %	50 %	25 %	390960516
5739	NC_018015	TCG	2	6	310483	310488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960516
5740	NC_018015	CG	3	6	310636	310641	0 %	0 %	50 %	50 %	390960516
5741	NC_018015	GGT	2	6	310683	310688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960516
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5743	NC_018015	TCA	2	6	311106	311111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960517
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5984	NC_018015	TCC	2	6	324400	324405	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960531
5985	NC_018015	TCT	2	6	324445	324450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960531
5986	NC_018015	AG	3	6	324465	324470	50 %	0 %	50 %	0 %	390960531
5987	NC_018015	GGA	2	6	324751	324756	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960531
5988	NC_018015	GA	3	6	324755	324760	50 %	0 %	50 %	0 %	390960531
5989	NC_018015	CTC	2	6	324791	324796	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960531
5990	NC_018015	TCCCT	2	10	324853	324862	0 %	40 %	0 %	60 %	390960531
5991	NC_018015	GAA	2	6	324866	324871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960531
5992	NC_018015	CCA	2	6	324948	324953	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960532
5993	NC_018015	AGC	2	6	325115	325120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960532
5994	NC_018015	TCCC	2	8	325121	325128	0 %	25 %	0 %	75 %	390960532
5995	NC_018015	ACG	2	6	325208	325213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960532
5996	NC_018015	TC	3	6	325222	325227	0 %	50 %	0 %	50 %	390960532
5997	NC_018015	GAC	2	6	325246	325251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960532
5998	NC_018015	GCCTAT	2	12	325294	325305	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	390960532
5999	NC_018015	CT	3	6	325321	325326	0 %	50 %	0 %	50 %	390960532
6000	NC_018015	AGT	2	6	325383	325388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960532

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