MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus sp. CL1 chromosome

Total Repeats: 36405

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_018015	CTT	2	6	269657	269662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960471
5002	NC_018015	TCG	2	6	269670	269675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960471
5003	NC_018015	CCG	2	6	269730	269735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960471
5004	NC_018015	CGCGA	2	10	269825	269834	20 %	0 %	40 %	40 %	390960471
5005	NC_018015	CCT	3	9	269851	269859	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960471
5006	NC_018015	TA	3	6	269877	269882	50 %	50 %	0 %	0 %	390960471
5007	NC_018015	GCC	2	6	269910	269915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960471
5008	NC_018015	ATC	2	6	269919	269924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960471
5009	NC_018015	GTC	2	6	269942	269947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960471
5010	NC_018015	CCT	3	9	270040	270048	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960471
5011	NC_018015	T	6	6	270095	270100	0 %	100 %	0 %	0 %	390960471
5012	NC_018015	GACC	2	8	270136	270143	25 %	0 %	25 %	50 %	390960471
5013	NC_018015	GAA	2	6	270170	270175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960471
5014	NC_018015	CGC	2	6	270211	270216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960471
5015	NC_018015	GAC	2	6	270224	270229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960471
5016	NC_018015	CTT	2	6	270317	270322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960471
5017	NC_018015	GAC	2	6	270389	270394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960471
5018	NC_018015	AGC	2	6	270453	270458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960471
5019	NC_018015	GAC	2	6	270561	270566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960472
5020	NC_018015	CCT	2	6	270578	270583	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960472
5021	NC_018015	TCG	2	6	270647	270652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960472
5022	NC_018015	AGT	2	6	270734	270739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960472
5023	NC_018015	TCC	2	6	270754	270759	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960472
5024	NC_018015	CAG	2	6	270801	270806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960472
5025	NC_018015	CGG	2	6	270852	270857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960472
5026	NC_018015	TGGGGT	2	12	270864	270875	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960472
5027	NC_018015	GGT	2	6	270888	270893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960472
5028	NC_018015	CGG	2	6	270939	270944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960472
5029	NC_018015	GCT	2	6	270984	270989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960472
5030	NC_018015	GCC	2	6	271039	271044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960472
5031	NC_018015	GGA	2	6	271050	271055	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960472
5032	NC_018015	ACC	2	6	271135	271140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960472
5033	NC_018015	CAG	2	6	271146	271151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960472
5034	NC_018015	TCG	2	6	271285	271290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960472
5035	NC_018015	TCG	2	6	271348	271353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960472
5036	NC_018015	GTG	2	6	271432	271437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960472
5037	NC_018015	CCG	2	6	271450	271455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960472
5038	NC_018015	TTC	2	6	271560	271565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960472
5039	NC_018015	TCC	2	6	271601	271606	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960472
5040	NC_018015	TAT	2	6	271608	271613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390960472
5041	NC_018015	GCG	2	6	271795	271800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960472
5042	NC_018015	CCG	2	6	271889	271894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960472
5043	NC_018015	TGGAA	2	10	271951	271960	40 %	20 %	40 %	0 %	390960472
5044	NC_018015	TTA	2	6	271961	271966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390960472
5045	NC_018015	GTC	2	6	271992	271997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960472
5046	NC_018015	GCG	2	6	272003	272008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960472
5047	NC_018015	AAC	2	6	272049	272054	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390960472
5048	NC_018015	CTGC	2	8	272122	272129	0 %	25 %	25 %	50 %	390960473
5049	NC_018015	ACC	2	6	272132	272137	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960473
5050	NC_018015	AGA	2	6	272214	272219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960473
5051	NC_018015	GTT	2	6	272230	272235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390960473
5052	NC_018015	TCC	2	6	272303	272308	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960473
5053	NC_018015	TAT	2	6	272380	272385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390960473
5054	NC_018015	CCG	2	6	272403	272408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960473
5055	NC_018015	TC	4	8	272453	272460	0 %	50 %	0 %	50 %	390960473
5056	NC_018015	GCTC	2	8	272464	272471	0 %	25 %	25 %	50 %	390960473
5057	NC_018015	TCG	2	6	272611	272616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960474
5058	NC_018015	CGT	2	6	272642	272647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960474
5059	NC_018015	GAG	2	6	272652	272657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960474
5060	NC_018015	AC	3	6	272750	272755	50 %	0 %	0 %	50 %	390960474
5061	NC_018015	ATA	2	6	272775	272780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390960474
5062	NC_018015	CGT	2	6	272810	272815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960474
5063	NC_018015	CCA	2	6	272824	272829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960474
5064	NC_018015	CGA	2	6	272831	272836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960474
5065	NC_018015	CAT	2	6	272843	272848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960474
5066	NC_018015	CGT	2	6	272894	272899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960474
5067	NC_018015	GGCGCC	2	12	272904	272915	0 %	0 %	50 %	50 %	390960474
5068	NC_018015	GTC	2	6	272976	272981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960474
5069	NC_018015	GAA	3	9	273014	273022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960474
5070	NC_018015	GAA	2	6	273068	273073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960474
5071	NC_018015	CAT	2	6	273122	273127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960475
5072	NC_018015	CCT	2	6	273161	273166	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960475
5073	NC_018015	AAT	3	9	273206	273214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390960475
5074	NC_018015	C	6	6	273252	273257	0 %	0 %	0 %	100 %	390960475
5075	NC_018015	GGA	2	6	273290	273295	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960475
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5077	NC_018015	GAG	2	6	273408	273413	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960475
5078	NC_018015	GACG	2	8	273431	273438	25 %	0 %	50 %	25 %	390960475
5079	NC_018015	AGGA	3	12	273476	273487	50 %	0 %	50 %	0 %	390960475
5080	NC_018015	GCT	2	6	273488	273493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960475
5081	NC_018015	GCC	2	6	273513	273518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960475
5082	NC_018015	GAG	2	6	273519	273524	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960475
5083	NC_018015	GA	3	6	273528	273533	50 %	0 %	50 %	0 %	390960475
5084	NC_018015	CGA	2	6	273662	273667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960475
5085	NC_018015	CTA	2	6	273689	273694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960475
5086	NC_018015	CGG	2	6	273731	273736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960475
5087	NC_018015	AGAGG	2	10	273737	273746	40 %	0 %	60 %	0 %	390960475
5088	NC_018015	TCC	2	6	273757	273762	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960475
5089	NC_018015	CTT	2	6	273788	273793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960475
5090	NC_018015	AGA	2	6	273856	273861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960475
5091	NC_018015	AAT	2	6	273981	273986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390960476
5092	NC_018015	AAG	2	6	274093	274098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960476
5093	NC_018015	ACA	2	6	274130	274135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390960476
5094	NC_018015	ATA	2	6	274183	274188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390960476
5095	NC_018015	GGA	2	6	274311	274316	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960476
5096	NC_018015	AGG	2	6	274334	274339	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960476
5097	NC_018015	GC	3	6	274361	274366	0 %	0 %	50 %	50 %	390960476
5098	NC_018015	TCA	2	6	274367	274372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960476
5099	NC_018015	AAC	2	6	274384	274389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390960476
5100	NC_018015	CAC	2	6	274501	274506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960476
5101	NC_018015	GAG	2	6	274516	274521	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960476
5102	NC_018015	AGG	2	6	274580	274585	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960476
5103	NC_018015	GAG	2	6	274606	274611	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960476
5104	NC_018015	ACC	2	6	274725	274730	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960477
5105	NC_018015	ACG	2	6	274758	274763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960477
5106	NC_018015	G	6	6	274917	274922	0 %	0 %	100 %	0 %	390960477
5107	NC_018015	ATA	2	6	274931	274936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390960477
5108	NC_018015	TCT	2	6	274983	274988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960477
5109	NC_018015	AAG	2	6	275055	275060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960477
5110	NC_018015	GAG	2	6	275126	275131	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960477
5111	NC_018015	TTC	2	6	275199	275204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960477
5112	NC_018015	GAG	2	6	275291	275296	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960477
5113	NC_018015	ACCG	2	8	275350	275357	25 %	0 %	25 %	50 %	390960477
5114	NC_018015	TGAAGA	2	12	275400	275411	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	390960477
5115	NC_018015	CTC	3	9	275545	275553	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960478
5116	NC_018015	TTCC	2	8	275584	275591	0 %	50 %	0 %	50 %	390960478
5117	NC_018015	GAC	2	6	275592	275597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960478
5118	NC_018015	TATG	2	8	275601	275608	25 %	50 %	25 %	0 %	390960478
5119	NC_018015	CCTT	2	8	275627	275634	0 %	50 %	0 %	50 %	390960478
5120	NC_018015	TCT	2	6	275636	275641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960478
5121	NC_018015	GTC	2	6	275661	275666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960478
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5123	NC_018015	CCTGG	2	10	275799	275808	0 %	20 %	40 %	40 %	390960478
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5230	NC_018015	TA	3	6	281343	281348	50 %	50 %	0 %	0 %	390960485
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5243	NC_018015	CTT	2	6	282619	282624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960486
5244	NC_018015	TATT	2	8	282628	282635	25 %	75 %	0 %	0 %	390960486
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5261	NC_018015	A	6	6	283349	283354	100 %	0 %	0 %	0 %	390960487
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5271	NC_018015	AT	3	6	283727	283732	50 %	50 %	0 %	0 %	390960488
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5361	NC_018015	TGT	2	6	290364	290369	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390960495
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5365	NC_018015	TCC	2	6	290687	290692	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960495
5366	NC_018015	GGC	2	6	290722	290727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960495
5367	NC_018015	GTG	2	6	290774	290779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960495
5368	NC_018015	TGG	2	6	290784	290789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960495
5369	NC_018015	TGAAC	2	10	290793	290802	40 %	20 %	20 %	20 %	390960495
5370	NC_018015	TTG	2	6	290819	290824	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390960495
5371	NC_018015	TGG	2	6	290871	290876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960495
5372	NC_018015	CGC	2	6	290893	290898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960495
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5384	NC_018015	CCT	2	6	292126	292131	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960497
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5393	NC_018015	GGC	2	6	292443	292448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960497
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5477	NC_018015	AACC	2	8	296937	296944	50 %	0 %	0 %	50 %	390960503
5478	NC_018015	ACT	3	9	297026	297034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960503
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5481	NC_018015	ACGA	2	8	297226	297233	50 %	0 %	25 %	25 %	390960503
5482	NC_018015	GGA	2	6	297264	297269	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960503
5483	NC_018015	G	6	6	297318	297323	0 %	0 %	100 %	0 %	390960503
5484	NC_018015	GGA	2	6	297369	297374	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960503
5485	NC_018015	TGA	2	6	297646	297651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960504
5486	NC_018015	CTC	2	6	297654	297659	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960504
5487	NC_018015	TCA	2	6	297733	297738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960504
5488	NC_018015	CGG	2	6	297755	297760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960504
5489	NC_018015	CGG	2	6	297875	297880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960504
5490	NC_018015	GGT	2	6	297899	297904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960504
5491	NC_018015	CTC	3	9	297918	297926	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960504
5492	NC_018015	TGG	2	6	297934	297939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960504
5493	NC_018015	CTGG	2	8	297956	297963	0 %	25 %	50 %	25 %	390960504
5494	NC_018015	C	6	6	297967	297972	0 %	0 %	0 %	100 %	390960504
5495	NC_018015	CGG	2	6	297974	297979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960504
5496	NC_018015	ACTC	2	8	297994	298001	25 %	25 %	0 %	50 %	390960504
5497	NC_018015	ATG	2	6	298029	298034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960504
5498	NC_018015	CCA	2	6	298063	298068	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960504
5499	NC_018015	TCC	2	6	298077	298082	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960504
5500	NC_018015	GTG	2	6	298107	298112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960504

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