MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus sp. CL1 chromosome

Total Repeats: 36405

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_018015	GAG	2	6	242823	242828	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960445
4502	NC_018015	TCC	2	6	242847	242852	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960445
4503	NC_018015	TTC	2	6	242889	242894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960445
4504	NC_018015	TCCACC	2	12	242968	242979	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	390960445
4505	NC_018015	CTC	2	6	243087	243092	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960445
4506	NC_018015	AGG	2	6	243118	243123	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960445
4507	NC_018015	AGGTG	2	10	243252	243261	20 %	20 %	60 %	0 %	390960446
4508	NC_018015	CAT	2	6	243283	243288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960446
4509	NC_018015	GAA	2	6	243322	243327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960446
4510	NC_018015	GAA	2	6	243394	243399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960446
4511	NC_018015	CGA	2	6	243502	243507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960446
4512	NC_018015	CCTACA	2	12	243585	243596	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	390960446
4513	NC_018015	AGGG	2	8	243650	243657	25 %	0 %	75 %	0 %	390960446
4514	NC_018015	CCT	2	6	243667	243672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960446
4515	NC_018015	TA	3	6	243686	243691	50 %	50 %	0 %	0 %	390960446
4516	NC_018015	AGCG	2	8	243781	243788	25 %	0 %	50 %	25 %	390960446
4517	NC_018015	GCG	2	6	243795	243800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960446
4518	NC_018015	GAA	2	6	243829	243834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960446
4519	NC_018015	ACCT	2	8	243860	243867	25 %	25 %	0 %	50 %	390960446
4520	NC_018015	AAT	2	6	243868	243873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390960446
4521	NC_018015	ACG	2	6	243885	243890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960446
4522	NC_018015	GAG	2	6	243893	243898	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960446
4523	NC_018015	CG	3	6	243913	243918	0 %	0 %	50 %	50 %	390960446
4524	NC_018015	GTG	2	6	243923	243928	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960446
4525	NC_018015	GAC	2	6	243941	243946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960446
4526	NC_018015	AC	3	6	243945	243950	50 %	0 %	0 %	50 %	390960446
4527	NC_018015	CTT	2	6	243967	243972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960446
4528	NC_018015	GCC	2	6	243997	244002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960446
4529	NC_018015	GAA	2	6	244046	244051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960446
4530	NC_018015	GAC	2	6	244175	244180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960446
4531	NC_018015	GTG	2	6	244252	244257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960446
4532	NC_018015	GGA	2	6	244266	244271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960447
4533	NC_018015	GA	3	6	244361	244366	50 %	0 %	50 %	0 %	390960447
4534	NC_018015	CGAAAA	2	12	244407	244418	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	390960447
4535	NC_018015	GAG	2	6	244420	244425	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960447
4536	NC_018015	GGCG	2	8	244461	244468	0 %	0 %	75 %	25 %	390960447
4537	NC_018015	TCC	2	6	244493	244498	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960447
4538	NC_018015	TGG	2	6	244514	244519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960447
4539	NC_018015	TGA	2	6	244604	244609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960447
4540	NC_018015	GAC	2	6	244645	244650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960447
4541	NC_018015	GAG	2	6	244681	244686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960447
4542	NC_018015	GAG	2	6	244756	244761	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960447
4543	NC_018015	CTCG	2	8	244791	244798	0 %	25 %	25 %	50 %	390960447
4544	NC_018015	GGA	2	6	244839	244844	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960447
4545	NC_018015	CGG	2	6	244868	244873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960447
4546	NC_018015	CT	3	6	244879	244884	0 %	50 %	0 %	50 %	390960447
4547	NC_018015	ATC	2	6	244939	244944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960447
4548	NC_018015	ATA	2	6	244954	244959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390960447
4549	NC_018015	CGG	2	6	245001	245006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960447
4550	NC_018015	GAAC	2	8	245013	245020	50 %	0 %	25 %	25 %	390960447
4551	NC_018015	GAA	2	6	245058	245063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960447
4552	NC_018015	AAG	2	6	245297	245302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960448
4553	NC_018015	CCA	2	6	245340	245345	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960448
4554	NC_018015	CTT	2	6	245392	245397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960448
4555	NC_018015	TCG	2	6	245430	245435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960448
4556	NC_018015	GCT	3	9	245447	245455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960448
4557	NC_018015	GAG	2	6	245513	245518	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960448
4558	NC_018015	CCCG	2	8	245563	245570	0 %	0 %	25 %	75 %	390960448
4559	NC_018015	CCA	2	6	245637	245642	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960448
4560	NC_018015	GAG	2	6	245648	245653	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960448
4561	NC_018015	ACT	2	6	245664	245669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960448
4562	NC_018015	CGG	2	6	245683	245688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960448
4563	NC_018015	ACG	2	6	245691	245696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960448
4564	NC_018015	CAC	3	9	245731	245739	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960448
4565	NC_018015	GACAAG	2	12	245747	245758	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	390960448
4566	NC_018015	CGA	2	6	245764	245769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960448
4567	NC_018015	GCC	2	6	245848	245853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960448
4568	NC_018015	CCT	2	6	245866	245871	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960448
4569	NC_018015	CTA	2	6	246094	246099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960448
4570	NC_018015	CCG	2	6	246129	246134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960448
4571	NC_018015	GTC	2	6	246200	246205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960448
4572	NC_018015	CAT	2	6	246223	246228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960448
4573	NC_018015	TCG	2	6	246360	246365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960448
4574	NC_018015	CGC	2	6	246385	246390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960448
4575	NC_018015	ACG	2	6	246444	246449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960448
4576	NC_018015	CAA	2	6	246511	246516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390960448
4577	NC_018015	CAACGG	2	12	246619	246630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960448
4578	NC_018015	CGT	2	6	246652	246657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960448
4579	NC_018015	AAGGAG	2	12	246680	246691	50 %	0 %	50 %	0 %	390960448
4580	NC_018015	GTT	2	6	246698	246703	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390960448
4581	NC_018015	CGT	2	6	246748	246753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960448
4582	NC_018015	CCG	2	6	246771	246776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960448
4583	NC_018015	AGA	2	6	246777	246782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960448
4584	NC_018015	GGA	2	6	246838	246843	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960448
4585	NC_018015	TCG	2	6	246864	246869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960448
4586	NC_018015	CGGTC	2	10	246871	246880	0 %	20 %	40 %	40 %	390960448
4587	NC_018015	TCG	2	6	246903	246908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960448
4588	NC_018015	AAC	2	6	246911	246916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390960448
4589	NC_018015	ACA	2	6	246936	246941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390960448
4590	NC_018015	GGC	2	6	246977	246982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960448
4591	NC_018015	ACG	2	6	246984	246989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960448
4592	NC_018015	TCG	2	6	246996	247001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960448
4593	NC_018015	CCA	2	6	247008	247013	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960448
4594	NC_018015	GCC	2	6	247031	247036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960448
4595	NC_018015	AGA	2	6	247125	247130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960449
4596	NC_018015	TCA	2	6	247159	247164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960449
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4598	NC_018015	CTCC	2	8	247332	247339	0 %	25 %	0 %	75 %	390960449
4599	NC_018015	GAG	2	6	247415	247420	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960449
4600	NC_018015	TCA	2	6	247462	247467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960449
4601	NC_018015	ACT	3	9	247567	247575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960449
4602	NC_018015	GAG	2	6	247710	247715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960449
4603	NC_018015	GGAG	2	8	247745	247752	25 %	0 %	75 %	0 %	390960449
4604	NC_018015	C	6	6	247774	247779	0 %	0 %	0 %	100 %	390960449
4605	NC_018015	ACC	2	6	247806	247811	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960449
4606	NC_018015	ATA	2	6	247851	247856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390960449
4607	NC_018015	GGAA	2	8	247871	247878	50 %	0 %	50 %	0 %	390960449
4608	NC_018015	TCC	2	6	247937	247942	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960450
4609	NC_018015	TCT	2	6	248007	248012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960450
4610	NC_018015	GAA	2	6	248034	248039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960450
4611	NC_018015	CGGAAT	2	12	248068	248079	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	390960450
4612	NC_018015	CGA	2	6	248157	248162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960450
4613	NC_018015	CG	3	6	248218	248223	0 %	0 %	50 %	50 %	390960450
4614	NC_018015	ACG	2	6	248252	248257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960450
4615	NC_018015	GAC	3	9	248377	248385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960450
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4617	NC_018015	TCG	2	6	248420	248425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960450
4618	NC_018015	CTT	2	6	248464	248469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960450
4619	NC_018015	GTT	2	6	248602	248607	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390960450
4620	NC_018015	CCA	2	6	248649	248654	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960450
4621	NC_018015	CTC	2	6	248704	248709	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960450
4622	NC_018015	GGAACG	2	12	248819	248830	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	390960450
4623	NC_018015	TCT	2	6	248933	248938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960450
4624	NC_018015	CGA	2	6	249039	249044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960450
4625	NC_018015	CCTGAA	2	12	249124	249135	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	390960450
4626	NC_018015	ACG	2	6	249197	249202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960450
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4639	NC_018015	GCT	2	6	249963	249968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960451
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4642	NC_018015	ACG	2	6	250127	250132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960451
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4645	NC_018015	GACT	2	8	250282	250289	25 %	25 %	25 %	25 %	390960451
4646	NC_018015	TCC	2	6	250316	250321	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960452
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4649	NC_018015	TGA	2	6	250415	250420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960452
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4653	NC_018015	AGT	2	6	250632	250637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960452
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4658	NC_018015	GAC	2	6	250951	250956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960452
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4729	NC_018015	GC	3	6	255238	255243	0 %	0 %	50 %	50 %	390960457
4730	NC_018015	AGGA	2	8	255319	255326	50 %	0 %	50 %	0 %	390960457
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4979	NC_018015	CATAG	2	10	267922	267931	40 %	20 %	20 %	20 %	390960468
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4983	NC_018015	GAG	2	6	268084	268089	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960468
4984	NC_018015	TCG	2	6	268202	268207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960468
4985	NC_018015	CCT	2	6	268308	268313	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960468
4986	NC_018015	GAA	2	6	268381	268386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960468
4987	NC_018015	TCA	2	6	268388	268393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960468
4988	NC_018015	ACA	2	6	268503	268508	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390960469
4989	NC_018015	GTA	2	6	268598	268603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960469
4990	NC_018015	TCCT	2	8	268701	268708	0 %	50 %	0 %	50 %	390960469
4991	NC_018015	GTCT	2	8	268802	268809	0 %	50 %	25 %	25 %	390960469
4992	NC_018015	ATC	2	6	268866	268871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960469
4993	NC_018015	TCG	2	6	269020	269025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960470
4994	NC_018015	GTCGTA	2	12	269034	269045	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	390960470
4995	NC_018015	CCTC	2	8	269054	269061	0 %	25 %	0 %	75 %	390960470
4996	NC_018015	CT	3	6	269113	269118	0 %	50 %	0 %	50 %	390960470
4997	NC_018015	TCG	2	6	269137	269142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960470
4998	NC_018015	CTC	2	6	269166	269171	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960470
4999	NC_018015	CTC	2	6	269262	269267	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960470
5000	NC_018015	CTC	2	6	269462	269467	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960471

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