MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thiocystis violascens DSM 198 chromosome

Total Repeats: 97816

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_018012	CGT	2	6	156319	156324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390948590
3002	NC_018012	ATCG	2	8	156370	156377	25 %	25 %	25 %	25 %	390948590
3003	NC_018012	T	6	6	156639	156644	0 %	100 %	0 %	0 %	390948591
3004	NC_018012	ATC	2	6	156868	156873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390948591
3005	NC_018012	CGG	2	6	156900	156905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390948591
3006	NC_018012	GAA	2	6	156924	156929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390948591
3007	NC_018012	GAT	2	6	157033	157038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390948591
3008	NC_018012	CCA	2	6	157114	157119	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390948591
3009	NC_018012	TG	3	6	157129	157134	0 %	50 %	50 %	0 %	390948591
3010	NC_018012	CTGAT	2	10	157169	157178	20 %	40 %	20 %	20 %	390948591
3011	NC_018012	GTT	2	6	157264	157269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390948591
3012	NC_018012	GTG	2	6	157317	157322	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390948591
3013	NC_018012	ATC	2	6	157330	157335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390948591
3014	NC_018012	GA	3	6	157642	157647	50 %	0 %	50 %	0 %	390948592
3015	NC_018012	TAT	2	6	157652	157657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390948592
3016	NC_018012	ATG	2	6	157659	157664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390948592
3017	NC_018012	T	6	6	157702	157707	0 %	100 %	0 %	0 %	390948592
3018	NC_018012	GAAA	2	8	157710	157717	75 %	0 %	25 %	0 %	390948592
3019	NC_018012	ACA	2	6	157951	157956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390948592
3020	NC_018012	T	6	6	158004	158009	0 %	100 %	0 %	0 %	390948592
3021	NC_018012	TCG	2	6	158029	158034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390948592
3022	NC_018012	TTGA	2	8	158103	158110	25 %	50 %	25 %	0 %	390948592
3023	NC_018012	CG	3	6	158149	158154	0 %	0 %	50 %	50 %	390948592
3024	NC_018012	AAG	2	6	158178	158183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390948592
3025	NC_018012	TCGA	2	8	158187	158194	25 %	25 %	25 %	25 %	390948592
3026	NC_018012	TTC	2	6	158302	158307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390948592
3027	NC_018012	TGG	2	6	158315	158320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390948592
3028	NC_018012	CGA	2	6	158414	158419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390948593
3029	NC_018012	TGGC	2	8	158586	158593	0 %	25 %	50 %	25 %	390948593
3030	NC_018012	ATGA	2	8	158653	158660	50 %	25 %	25 %	0 %	390948593
3031	NC_018012	AGTCA	2	10	158701	158710	40 %	20 %	20 %	20 %	390948593
3032	NC_018012	AAC	2	6	158713	158718	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390948593
3033	NC_018012	CGC	2	6	158737	158742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390948593
3034	NC_018012	GGA	2	6	158745	158750	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390948593
3035	NC_018012	GAA	2	6	158776	158781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390948593
3036	NC_018012	CAT	2	6	158790	158795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390948593
3037	NC_018012	GAG	2	6	158806	158811	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390948593
3038	NC_018012	TGC	2	6	158835	158840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390948593
3039	NC_018012	A	6	6	158855	158860	100 %	0 %	0 %	0 %	390948593
3040	NC_018012	ATGAAC	2	12	158864	158875	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	390948593
3041	NC_018012	AGG	2	6	158975	158980	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390948593
3042	NC_018012	CTTT	2	8	159054	159061	0 %	75 %	0 %	25 %	390948593
3043	NC_018012	GGCT	2	8	159149	159156	0 %	25 %	50 %	25 %	390948594
3044	NC_018012	GGC	2	6	159157	159162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390948594
3045	NC_018012	CTGGCG	2	12	159170	159181	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	390948594
3046	NC_018012	GCT	3	9	159196	159204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390948594
3047	NC_018012	GCG	2	6	159223	159228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390948594
3048	NC_018012	CG	4	8	159227	159234	0 %	0 %	50 %	50 %	390948594
3049	NC_018012	GC	4	8	159240	159247	0 %	0 %	50 %	50 %	390948594
3050	NC_018012	GCC	2	6	159351	159356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390948594
3051	NC_018012	TCT	2	6	159399	159404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390948594
3052	NC_018012	GAACA	2	10	159674	159683	60 %	0 %	20 %	20 %	390948595
3053	NC_018012	GGC	2	6	159690	159695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390948595
3054	NC_018012	CCTG	2	8	159794	159801	0 %	25 %	25 %	50 %	390948595
3055	NC_018012	GTCT	2	8	159884	159891	0 %	50 %	25 %	25 %	390948595
3056	NC_018012	CTG	2	6	159919	159924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390948595
3057	NC_018012	CGTCTT	2	12	159969	159980	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	390948595
3058	NC_018012	CTG	2	6	160009	160014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390948595
3059	NC_018012	CGA	2	6	160017	160022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390948595
3060	NC_018012	CTT	2	6	160122	160127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390948595
3061	NC_018012	CCGA	2	8	160147	160154	25 %	0 %	25 %	50 %	390948595
3062	NC_018012	GCT	2	6	160248	160253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390948595
3063	NC_018012	GCG	2	6	160256	160261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390948595
3064	NC_018012	GGTC	2	8	160419	160426	0 %	25 %	50 %	25 %	390948595
3065	NC_018012	TC	3	6	160425	160430	0 %	50 %	0 %	50 %	390948595
3066	NC_018012	CGC	2	6	160458	160463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390948595
3067	NC_018012	GCT	2	6	160476	160481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390948595
3068	NC_018012	CTG	2	6	160498	160503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390948595
3069	NC_018012	GTCT	2	8	160568	160575	0 %	50 %	25 %	25 %	390948595
3070	NC_018012	GCGCA	2	10	160576	160585	20 %	0 %	40 %	40 %	390948595
3071	NC_018012	CGA	2	6	160590	160595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390948595
3072	NC_018012	ATC	2	6	160597	160602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390948595
3073	NC_018012	GCAT	2	8	160647	160654	25 %	25 %	25 %	25 %	390948596
3074	NC_018012	CCGT	2	8	160686	160693	0 %	25 %	25 %	50 %	390948596
3075	NC_018012	CGGC	2	8	160733	160740	0 %	0 %	50 %	50 %	390948596
3076	NC_018012	GCT	2	6	160752	160757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390948596
3077	NC_018012	CAA	2	6	160794	160799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390948596
3078	NC_018012	TCC	2	6	160820	160825	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390948596
3079	NC_018012	ATCC	2	8	160952	160959	25 %	25 %	0 %	50 %	390948596
3080	NC_018012	CCT	2	6	160977	160982	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390948596
3081	NC_018012	CGC	2	6	160991	160996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390948596
3082	NC_018012	ACC	2	6	161065	161070	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390948596
3083	NC_018012	GCC	2	6	161095	161100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390948596
3084	NC_018012	ACG	2	6	161128	161133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390948596
3085	NC_018012	GAT	2	6	161142	161147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390948596
3086	NC_018012	GTCTG	2	10	161168	161177	0 %	40 %	40 %	20 %	390948596
3087	NC_018012	GCG	2	6	161268	161273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390948596
3088	NC_018012	GCCG	2	8	161508	161515	0 %	0 %	50 %	50 %	390948596
3089	NC_018012	CGA	2	6	161517	161522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390948596
3090	NC_018012	CGCGG	2	10	161563	161572	0 %	0 %	60 %	40 %	390948596
3091	NC_018012	GCC	2	6	161625	161630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390948597
3092	NC_018012	TGG	2	6	161655	161660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390948597
3093	NC_018012	GGC	2	6	161663	161668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390948597
3094	NC_018012	CGG	2	6	161681	161686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390948597
3095	NC_018012	TCC	2	6	161689	161694	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390948597
3096	NC_018012	TCT	2	6	161734	161739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390948597
3097	NC_018012	CGG	2	6	161740	161745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390948597
3098	NC_018012	GGC	2	6	161753	161758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390948597
3099	NC_018012	CTT	2	6	161819	161824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390948597
3100	NC_018012	CGT	2	6	161831	161836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390948597
3101	NC_018012	CGA	2	6	161857	161862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390948597
3102	NC_018012	CCG	2	6	161864	161869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390948597
3103	NC_018012	CTG	3	9	161877	161885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390948597
3104	NC_018012	CGC	2	6	161891	161896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390948597
3105	NC_018012	GGC	2	6	161906	161911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390948597
3106	NC_018012	TGC	2	6	161947	161952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390948597
3107	NC_018012	TCG	2	6	161977	161982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390948597
3108	NC_018012	CTG	2	6	162033	162038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390948597
3109	NC_018012	TGC	3	9	162079	162087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390948597
3110	NC_018012	CTT	2	6	162095	162100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390948597
3111	NC_018012	GAT	2	6	162161	162166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390948597
3112	NC_018012	GCA	2	6	162172	162177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390948597
3113	NC_018012	GGT	2	6	162213	162218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390948597
3114	NC_018012	GCGG	2	8	162224	162231	0 %	0 %	75 %	25 %	390948597
3115	NC_018012	GGTGC	2	10	162270	162279	0 %	20 %	60 %	20 %	390948597
3116	NC_018012	TCT	2	6	162313	162318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390948597
3117	NC_018012	GAA	2	6	162428	162433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390948597
3118	NC_018012	GATCC	2	10	162435	162444	20 %	20 %	20 %	40 %	390948597
3119	NC_018012	CGG	2	6	162470	162475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390948597
3120	NC_018012	CTGC	2	8	162498	162505	0 %	25 %	25 %	50 %	390948597
3121	NC_018012	GGCC	2	8	162509	162516	0 %	0 %	50 %	50 %	390948597
3122	NC_018012	TCG	2	6	162557	162562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390948597
3123	NC_018012	CTG	2	6	162684	162689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390948597
3124	NC_018012	GAC	2	6	162729	162734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390948597
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3126	NC_018012	ATC	2	6	162811	162816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390948597
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3226	NC_018012	CTCC	2	8	168117	168124	0 %	25 %	0 %	75 %	390948602
3227	NC_018012	GAA	2	6	168180	168185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390948602
3228	NC_018012	GCGAT	2	10	168235	168244	20 %	20 %	40 %	20 %	390948602
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3232	NC_018012	TGC	2	6	168583	168588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390948602
3233	NC_018012	ATG	2	6	168595	168600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390948602
3234	NC_018012	CGA	2	6	168951	168956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390948603
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3236	NC_018012	CTC	2	6	169046	169051	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390948603
3237	NC_018012	TGGC	2	8	169123	169130	0 %	25 %	50 %	25 %	390948603
3238	NC_018012	ATGA	2	8	169190	169197	50 %	25 %	25 %	0 %	390948603
3239	NC_018012	TCAG	2	8	169236	169243	25 %	25 %	25 %	25 %	390948603
3240	NC_018012	AAC	2	6	169250	169255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390948603
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3242	NC_018012	GGA	2	6	169282	169287	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390948603
3243	NC_018012	GAA	2	6	169313	169318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390948603
3244	NC_018012	CAT	2	6	169327	169332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390948603
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3246	NC_018012	CGC	2	6	169372	169377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390948603
3247	NC_018012	GATGAA	2	12	169400	169411	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	390948603
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3352	NC_018012	C	6	6	177616	177621	0 %	0 %	0 %	100 %	390948611
3353	NC_018012	GGC	2	6	177623	177628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390948611
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3355	NC_018012	T	7	7	177736	177742	0 %	100 %	0 %	0 %	390948611
3356	NC_018012	CTGG	2	8	178072	178079	0 %	25 %	50 %	25 %	390948612
3357	NC_018012	CGC	2	6	178111	178116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390948612
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3359	NC_018012	GCT	2	6	178236	178241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390948612
3360	NC_018012	CGC	2	6	178260	178265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390948612
3361	NC_018012	CAG	2	6	178272	178277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390948612
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3364	NC_018012	ACG	2	6	179338	179343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390948613
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3367	NC_018012	GCC	2	6	179434	179439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390948613
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3473	NC_018012	CCGAT	2	10	185506	185515	20 %	20 %	20 %	40 %	390948619
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3483	NC_018012	GCCCC	2	10	185945	185954	0 %	0 %	20 %	80 %	390948619
3484	NC_018012	CCGC	2	8	185966	185973	0 %	0 %	25 %	75 %	390948619
3485	NC_018012	GCC	2	6	185978	185983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390948619
3486	NC_018012	GCGCCC	2	12	185984	185995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390948619
3487	NC_018012	TCG	2	6	185998	186003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390948619
3488	NC_018012	CAGATC	2	12	186038	186049	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	390948619
3489	NC_018012	TCA	2	6	186205	186210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390948619
3490	NC_018012	GC	4	8	186295	186302	0 %	0 %	50 %	50 %	390948619
3491	NC_018012	GCC	2	6	186319	186324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390948619
3492	NC_018012	TCGC	2	8	186438	186445	0 %	25 %	25 %	50 %	390948619
3493	NC_018012	A	7	7	186492	186498	100 %	0 %	0 %	0 %	390948619
3494	NC_018012	CGACCT	2	12	186858	186869	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	390948620
3495	NC_018012	CAC	2	6	186952	186957	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390948620
3496	NC_018012	CAG	2	6	186982	186987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390948620
3497	NC_018012	CGC	2	6	186988	186993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390948620
3498	NC_018012	TTG	2	6	186995	187000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390948620
3499	NC_018012	TCGCTG	2	12	187085	187096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390948620
3500	NC_018012	GC	3	6	187135	187140	0 %	0 %	50 %	50 %	390948620

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