MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thiocystis violascens DSM 198 chromosome

Total Repeats: 97816

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_018012	CAC	2	6	97252	97257	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390948542
2003	NC_018012	AGAA	2	8	97346	97353	75 %	0 %	25 %	0 %	390948542
2004	NC_018012	ATC	2	6	97361	97366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390948542
2005	NC_018012	AACG	2	8	97561	97568	50 %	0 %	25 %	25 %	390948543
2006	NC_018012	GAA	2	6	97638	97643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390948543
2007	NC_018012	GCC	2	6	97746	97751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390948543
2008	NC_018012	GC	3	6	97786	97791	0 %	0 %	50 %	50 %	390948543
2009	NC_018012	GGA	2	6	97865	97870	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390948543
2010	NC_018012	GC	3	6	97884	97889	0 %	0 %	50 %	50 %	390948543
2011	NC_018012	CGC	2	6	97901	97906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390948543
2012	NC_018012	GCC	2	6	97926	97931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390948543
2013	NC_018012	GGC	2	6	97955	97960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390948543
2014	NC_018012	CGGTA	2	10	98174	98183	20 %	20 %	40 %	20 %	390948544
2015	NC_018012	CTGG	2	8	98184	98191	0 %	25 %	50 %	25 %	390948544
2016	NC_018012	CAG	2	6	98210	98215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390948544
2017	NC_018012	CCG	2	6	98217	98222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390948544
2018	NC_018012	GAC	2	6	98234	98239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390948544
2019	NC_018012	GCC	4	12	98279	98290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390948544
2020	NC_018012	CCG	2	6	98409	98414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390948544
2021	NC_018012	ACTG	2	8	98650	98657	25 %	25 %	25 %	25 %	390948544
2022	NC_018012	CAG	2	6	98705	98710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390948544
2023	NC_018012	GCC	2	6	98756	98761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390948544
2024	NC_018012	GCC	3	9	98781	98789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390948544
2025	NC_018012	AGC	2	6	98802	98807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390948544
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2030	NC_018012	CGA	3	9	99017	99025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390948545
2031	NC_018012	GCG	2	6	99171	99176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390948545
2032	NC_018012	CGG	2	6	99180	99185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390948545
2033	NC_018012	CCG	2	6	99197	99202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390948545
2034	NC_018012	CG	3	6	99270	99275	0 %	0 %	50 %	50 %	390948545
2035	NC_018012	TC	3	6	99288	99293	0 %	50 %	0 %	50 %	390948545
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2043	NC_018012	CG	3	6	99753	99758	0 %	0 %	50 %	50 %	390948546
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2045	NC_018012	CACGGT	2	12	99802	99813	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	390948546
2046	NC_018012	GC	3	6	99820	99825	0 %	0 %	50 %	50 %	390948546
2047	NC_018012	CCG	2	6	99838	99843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390948546
2048	NC_018012	GCC	2	6	99853	99858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390948546
2049	NC_018012	CCG	2	6	99887	99892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390948546
2050	NC_018012	CGAC	2	8	99953	99960	25 %	0 %	25 %	50 %	390948546
2051	NC_018012	CG	3	6	99969	99974	0 %	0 %	50 %	50 %	390948546
2052	NC_018012	CCGTTT	2	12	100083	100094	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	390948546
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2055	NC_018012	GCAT	2	8	100145	100152	25 %	25 %	25 %	25 %	390948546
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2059	NC_018012	ACG	2	6	100409	100414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390948546
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2123	NC_018012	GC	3	6	103927	103932	0 %	0 %	50 %	50 %	390948549
2124	NC_018012	GCT	2	6	103940	103945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390948549
2125	NC_018012	ATCGG	2	10	103960	103969	20 %	20 %	40 %	20 %	390948549
2126	NC_018012	CCT	2	6	103999	104004	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390948549
2127	NC_018012	CTG	2	6	104055	104060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390948549
2128	NC_018012	CGG	2	6	104077	104082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390948549
2129	NC_018012	GCC	2	6	104088	104093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390948549
2130	NC_018012	CATCGG	2	12	104123	104134	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	390948549
2131	NC_018012	CCG	2	6	104202	104207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390948549
2132	NC_018012	CATG	2	8	104225	104232	25 %	25 %	25 %	25 %	390948549
2133	NC_018012	CGC	2	6	104258	104263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390948549
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2136	NC_018012	GC	3	6	104388	104393	0 %	0 %	50 %	50 %	390948550
2137	NC_018012	CGAG	2	8	104481	104488	25 %	0 %	50 %	25 %	390948550
2138	NC_018012	GTC	2	6	104491	104496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390948550
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2140	NC_018012	CG	3	6	104636	104641	0 %	0 %	50 %	50 %	390948550
2141	NC_018012	CCCGG	2	10	104702	104711	0 %	0 %	40 %	60 %	390948550
2142	NC_018012	TCG	2	6	104717	104722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390948550
2143	NC_018012	GTC	2	6	104734	104739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390948550
2144	NC_018012	CAA	2	6	104797	104802	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390948550
2145	NC_018012	CTG	2	6	104803	104808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390948550
2146	NC_018012	TCG	2	6	104852	104857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390948550
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2148	NC_018012	CG	3	6	104929	104934	0 %	0 %	50 %	50 %	390948550
2149	NC_018012	GTT	2	6	104976	104981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390948550
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2151	NC_018012	CGG	2	6	105017	105022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390948550
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2153	NC_018012	CGC	2	6	105183	105188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390948550
2154	NC_018012	CGA	2	6	105388	105393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390948551
2155	NC_018012	TCA	2	6	105558	105563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390948551
2156	NC_018012	GCGAT	2	10	105657	105666	20 %	20 %	40 %	20 %	390948551
2157	NC_018012	GAT	2	6	105837	105842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390948552
2158	NC_018012	GC	3	6	105859	105864	0 %	0 %	50 %	50 %	390948552
2159	NC_018012	CG	3	6	105899	105904	0 %	0 %	50 %	50 %	390948552
2160	NC_018012	GA	3	6	105926	105931	50 %	0 %	50 %	0 %	390948552
2161	NC_018012	CCT	2	6	106008	106013	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390948552
2162	NC_018012	GTC	2	6	106316	106321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390948553
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2179	NC_018012	AGG	2	6	107208	107213	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390948553
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2202	NC_018012	GAG	2	6	108486	108491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390948554
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2219	NC_018012	ATC	2	6	109308	109313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390948555
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2228	NC_018012	TCG	2	6	109963	109968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390948556
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2230	NC_018012	CGA	2	6	110096	110101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390948556
2231	NC_018012	TCG	2	6	110188	110193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390948556
2232	NC_018012	CAC	2	6	110207	110212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390948556
2233	NC_018012	CCA	2	6	110233	110238	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390948556
2234	NC_018012	GC	4	8	110239	110246	0 %	0 %	50 %	50 %	390948556
2235	NC_018012	GCT	2	6	110252	110257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390948556
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2237	NC_018012	CAT	2	6	110289	110294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390948556
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2240	NC_018012	CGG	2	6	110378	110383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390948556
2241	NC_018012	CGGT	2	8	110428	110435	0 %	25 %	50 %	25 %	390948556
2242	NC_018012	TCG	2	6	110446	110451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390948556
2243	NC_018012	GC	3	6	110464	110469	0 %	0 %	50 %	50 %	390948556
2244	NC_018012	GCT	2	6	110522	110527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390948556
2245	NC_018012	TGC	2	6	110581	110586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390948556
2246	NC_018012	GCA	2	6	110624	110629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390948556
2247	NC_018012	GGT	2	6	110699	110704	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390948556
2248	NC_018012	CCA	2	6	110753	110758	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390948556
2249	NC_018012	CGG	2	6	110776	110781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390948556
2250	NC_018012	ATC	3	9	110821	110829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390948556
2251	NC_018012	CTT	2	6	110846	110851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390948556
2252	NC_018012	GAG	2	6	110889	110894	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390948556
2253	NC_018012	AGC	2	6	110905	110910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390948556
2254	NC_018012	GAG	2	6	110928	110933	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390948556
2255	NC_018012	GC	3	6	111025	111030	0 %	0 %	50 %	50 %	390948556
2256	NC_018012	TTCG	2	8	111086	111093	0 %	50 %	25 %	25 %	390948556
2257	NC_018012	CGA	2	6	111140	111145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390948556
2258	NC_018012	CGG	2	6	111166	111171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390948556
2259	NC_018012	CG	4	8	111187	111194	0 %	0 %	50 %	50 %	390948556
2260	NC_018012	CTG	2	6	111195	111200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390948556
2261	NC_018012	GCG	2	6	111218	111223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390948556
2262	NC_018012	CGA	2	6	111465	111470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390948557
2263	NC_018012	GGT	2	6	111486	111491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390948557
2264	NC_018012	ACCAG	2	10	111515	111524	40 %	0 %	20 %	40 %	390948557
2265	NC_018012	TGGC	2	8	111549	111556	0 %	25 %	50 %	25 %	390948557
2266	NC_018012	GCCA	2	8	111569	111576	25 %	0 %	25 %	50 %	390948557
2267	NC_018012	CG	3	6	111597	111602	0 %	0 %	50 %	50 %	390948557
2268	NC_018012	AAT	2	6	111646	111651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390948557
2269	NC_018012	T	6	6	111651	111656	0 %	100 %	0 %	0 %	390948557
2270	NC_018012	GCC	3	9	111727	111735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390948557
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2272	NC_018012	GCGAG	2	10	112001	112010	20 %	0 %	60 %	20 %	390948557
2273	NC_018012	GC	3	6	112097	112102	0 %	0 %	50 %	50 %	390948557
2274	NC_018012	GGCT	2	8	112192	112199	0 %	25 %	50 %	25 %	390948557
2275	NC_018012	GC	3	6	112207	112212	0 %	0 %	50 %	50 %	390948557
2276	NC_018012	GAA	2	6	112222	112227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390948557
2277	NC_018012	GCG	2	6	112263	112268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390948557
2278	NC_018012	CAT	2	6	112311	112316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390948557
2279	NC_018012	GCT	2	6	112329	112334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390948557
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2281	NC_018012	TGC	2	6	112388	112393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390948557
2282	NC_018012	GC	3	6	112415	112420	0 %	0 %	50 %	50 %	390948557
2283	NC_018012	AGG	2	6	112478	112483	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390948557
2284	NC_018012	GCTG	2	8	112487	112494	0 %	25 %	50 %	25 %	390948557
2285	NC_018012	GGT	2	6	112506	112511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390948557
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2292	NC_018012	CGG	2	6	112923	112928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390948557
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2301	NC_018012	GCT	2	6	113376	113381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390948557
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2311	NC_018012	GGCTGG	2	12	113864	113875	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	390948557
2312	NC_018012	GCC	4	12	114061	114072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390948557
2313	NC_018012	CTG	2	6	114127	114132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390948557
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2315	NC_018012	GGCGCC	2	12	114247	114258	0 %	0 %	50 %	50 %	390948557
2316	NC_018012	CGA	2	6	114267	114272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390948557
2317	NC_018012	GAT	2	6	114306	114311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390948557
2318	NC_018012	CG	3	6	114315	114320	0 %	0 %	50 %	50 %	390948557
2319	NC_018012	TCA	2	6	114473	114478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390948557
2320	NC_018012	TCG	2	6	114542	114547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390948557
2321	NC_018012	CGA	2	6	114549	114554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390948557
2322	NC_018012	GAT	2	6	114624	114629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390948557
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2324	NC_018012	TCA	2	6	114686	114691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390948557
2325	NC_018012	GCTCG	2	10	114702	114711	0 %	20 %	40 %	40 %	390948557
2326	NC_018012	CGC	2	6	114735	114740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390948557
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2328	NC_018012	GCG	2	6	114764	114769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390948557
2329	NC_018012	CG	3	6	114768	114773	0 %	0 %	50 %	50 %	390948557
2330	NC_018012	GCC	2	6	114843	114848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390948557
2331	NC_018012	GCG	2	6	114883	114888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390948557
2332	NC_018012	GCG	2	6	114892	114897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390948557
2333	NC_018012	CTG	2	6	114976	114981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390948557
2334	NC_018012	GCGCC	2	10	114999	115008	0 %	0 %	40 %	60 %	390948557
2335	NC_018012	TCG	2	6	115079	115084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390948557
2336	NC_018012	TCG	2	6	115130	115135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390948557
2337	NC_018012	CATCTG	2	12	115138	115149	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	390948557
2338	NC_018012	CG	3	6	115167	115172	0 %	0 %	50 %	50 %	390948557
2339	NC_018012	GCGT	2	8	115175	115182	0 %	25 %	50 %	25 %	390948557
2340	NC_018012	CCG	2	6	115226	115231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390948557
2341	NC_018012	CGC	2	6	115233	115238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390948557
2342	NC_018012	TCA	2	6	115268	115273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390948557
2343	NC_018012	GC	3	6	115278	115283	0 %	0 %	50 %	50 %	390948557
2344	NC_018012	CGG	2	6	115284	115289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390948557
2345	NC_018012	CCG	3	9	115307	115315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390948557
2346	NC_018012	TGG	2	6	115339	115344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390948557
2347	NC_018012	CGG	2	6	115349	115354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390948557
2348	NC_018012	TCA	2	6	115421	115426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390948557
2349	NC_018012	ATC	2	6	115450	115455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390948557
2350	NC_018012	CTG	2	6	115492	115497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390948557
2351	NC_018012	CGG	2	6	115512	115517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390948557
2352	NC_018012	TGA	2	6	118107	118112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390948558
2353	NC_018012	GGT	2	6	118158	118163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390948558
2354	NC_018012	GAT	2	6	118191	118196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390948558
2355	NC_018012	CTG	2	6	118234	118239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390948558
2356	NC_018012	GAA	2	6	118293	118298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390948558
2357	NC_018012	GGC	2	6	118356	118361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390948558
2358	NC_018012	GTT	2	6	118380	118385	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390948558
2359	NC_018012	GCT	2	6	118422	118427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390948558
2360	NC_018012	TGG	2	6	118430	118435	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390948558
2361	NC_018012	GGGT	2	8	118442	118449	0 %	25 %	75 %	0 %	390948558
2362	NC_018012	CG	3	6	118453	118458	0 %	0 %	50 %	50 %	390948558
2363	NC_018012	TGGCG	2	10	118466	118475	0 %	20 %	60 %	20 %	390948558
2364	NC_018012	GGC	2	6	118488	118493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390948558
2365	NC_018012	CAG	2	6	118513	118518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390948558
2366	NC_018012	GTG	2	6	118519	118524	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390948558
2367	NC_018012	CCTGG	2	10	118536	118545	0 %	20 %	40 %	40 %	390948558
2368	NC_018012	GC	3	6	118558	118563	0 %	0 %	50 %	50 %	390948558
2369	NC_018012	TGC	2	6	118565	118570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390948558
2370	NC_018012	CGG	2	6	118574	118579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390948558
2371	NC_018012	CGG	2	6	118595	118600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390948558
2372	NC_018012	GAC	3	9	118689	118697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390948558
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2374	NC_018012	GAC	2	6	118855	118860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390948558
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2380	NC_018012	A	7	7	119042	119048	100 %	0 %	0 %	0 %	390948558
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2384	NC_018012	CG	3	6	121953	121958	0 %	0 %	50 %	50 %	390948559
2385	NC_018012	CGG	3	9	121991	121999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390948559
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2388	NC_018012	TCG	3	9	122055	122063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390948559
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2391	NC_018012	GTC	2	6	122126	122131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390948559
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2394	NC_018012	CCAG	2	8	122281	122288	25 %	0 %	25 %	50 %	390948559
2395	NC_018012	GGC	2	6	122305	122310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390948559
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2403	NC_018012	CG	3	6	122635	122640	0 %	0 %	50 %	50 %	390948559
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2406	NC_018012	GTC	2	6	122703	122708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390948559
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2415	NC_018012	TCG	2	6	123230	123235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390948560
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2453	NC_018012	CGA	2	6	126704	126709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390948563
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2469	NC_018012	TCAACC	2	12	127521	127532	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	390948564
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2475	NC_018012	AC	3	6	128602	128607	50 %	0 %	0 %	50 %	390948566
2476	NC_018012	GCC	2	6	128625	128630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390948566
2477	NC_018012	TCAG	2	8	128651	128658	25 %	25 %	25 %	25 %	390948566
2478	NC_018012	GAAA	2	8	128687	128694	75 %	0 %	25 %	0 %	390948566
2479	NC_018012	GGT	2	6	128755	128760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390948566
2480	NC_018012	TCA	2	6	129309	129314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390948567
2481	NC_018012	CGG	2	6	129412	129417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390948567
2482	NC_018012	CGA	2	6	129436	129441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390948567
2483	NC_018012	G	6	6	129480	129485	0 %	0 %	100 %	0 %	390948567
2484	NC_018012	GGGC	2	8	129513	129520	0 %	0 %	75 %	25 %	390948567
2485	NC_018012	GGGT	2	8	129591	129598	0 %	25 %	75 %	0 %	390948567
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