MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thiocystis violascens DSM 198 chromosome

Total Repeats: 97816

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_018012	CGG	2	6	47186	47191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390948500
1002	NC_018012	GCC	2	6	47193	47198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390948500
1003	NC_018012	GCG	2	6	47217	47222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390948500
1004	NC_018012	AGC	2	6	47224	47229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390948500
1005	NC_018012	CGG	3	9	47240	47248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390948500
1006	NC_018012	TGG	2	6	47324	47329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390948500
1007	NC_018012	GCG	2	6	47343	47348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390948500
1008	NC_018012	GAG	2	6	47386	47391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390948500
1009	NC_018012	CGA	2	6	47402	47407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390948500
1010	NC_018012	GCG	3	9	47428	47436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390948500
1011	NC_018012	CGCC	2	8	47443	47450	0 %	0 %	25 %	75 %	390948500
1012	NC_018012	GAT	2	6	47465	47470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390948500
1013	NC_018012	CTT	2	6	47510	47515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390948500
1014	NC_018012	GCG	2	6	47521	47526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390948500
1015	NC_018012	ACG	2	6	47605	47610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390948500
1016	NC_018012	TCC	2	6	47647	47652	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390948500
1017	NC_018012	CG	3	6	47694	47699	0 %	0 %	50 %	50 %	390948500
1018	NC_018012	CAG	2	6	47700	47705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390948500
1019	NC_018012	CGGT	2	8	47758	47765	0 %	25 %	50 %	25 %	390948500
1020	NC_018012	CGG	2	6	47768	47773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390948500
1021	NC_018012	GGCGC	2	10	47778	47787	0 %	0 %	60 %	40 %	390948500
1022	NC_018012	GGC	2	6	47789	47794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390948500
1023	NC_018012	GCA	2	6	47810	47815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390948500
1024	NC_018012	CGCGGG	2	12	47849	47860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390948500
1025	NC_018012	GGC	2	6	47874	47879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390948500
1026	NC_018012	CGT	2	6	47954	47959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390948500
1027	NC_018012	GGC	2	6	47964	47969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390948500
1028	NC_018012	CTT	2	6	48014	48019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390948500
1029	NC_018012	CTCC	2	8	48047	48054	0 %	25 %	0 %	75 %	390948500
1030	NC_018012	GCC	2	6	48174	48179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390948500
1031	NC_018012	CGG	2	6	48536	48541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390948501
1032	NC_018012	CG	3	6	48547	48552	0 %	0 %	50 %	50 %	390948501
1033	NC_018012	CGT	2	6	48567	48572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390948501
1034	NC_018012	GC	3	6	48619	48624	0 %	0 %	50 %	50 %	390948501
1035	NC_018012	TCG	2	6	48640	48645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390948501
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1038	NC_018012	CGTCG	2	10	48884	48893	0 %	20 %	40 %	40 %	390948501
1039	NC_018012	CGG	3	9	48899	48907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390948501
1040	NC_018012	TCAA	2	8	48952	48959	50 %	25 %	0 %	25 %	390948501
1041	NC_018012	GGC	2	6	49116	49121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390948501
1042	NC_018012	CGT	2	6	49163	49168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390948501
1043	NC_018012	CCG	2	6	49269	49274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390948501
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1045	NC_018012	GTC	2	6	49362	49367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390948501
1046	NC_018012	CGG	2	6	49379	49384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390948501
1047	NC_018012	ACC	2	6	49492	49497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390948501
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1049	NC_018012	GCC	2	6	49564	49569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390948501
1050	NC_018012	AGC	2	6	49585	49590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390948501
1051	NC_018012	GTC	2	6	49620	49625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390948501
1052	NC_018012	AGAT	2	8	49648	49655	50 %	25 %	25 %	0 %	390948501
1053	NC_018012	CGA	2	6	49676	49681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390948501
1054	NC_018012	GGT	2	6	49725	49730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390948501
1055	NC_018012	ACC	2	6	49884	49889	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390948501
1056	NC_018012	CCG	2	6	49937	49942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390948501
1057	NC_018012	GC	3	6	49957	49962	0 %	0 %	50 %	50 %	390948501
1058	NC_018012	GC	3	6	49981	49986	0 %	0 %	50 %	50 %	390948501
1059	NC_018012	TCA	2	6	49990	49995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390948501
1060	NC_018012	CCA	2	6	50058	50063	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390948501
1061	NC_018012	CCA	2	6	50090	50095	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390948501
1062	NC_018012	GCC	2	6	50149	50154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390948501
1063	NC_018012	GCA	2	6	50264	50269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390948501
1064	NC_018012	CG	3	6	50300	50305	0 %	0 %	50 %	50 %	390948501
1065	NC_018012	GGC	2	6	50310	50315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390948501
1066	NC_018012	TGCCT	2	10	50358	50367	0 %	40 %	20 %	40 %	390948501
1067	NC_018012	CAG	2	6	50379	50384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390948501
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1071	NC_018012	TCGA	2	8	50470	50477	25 %	25 %	25 %	25 %	390948501
1072	NC_018012	GCGG	2	8	50550	50557	0 %	0 %	75 %	25 %	390948501
1073	NC_018012	CAGC	2	8	50592	50599	25 %	0 %	25 %	50 %	390948501
1074	NC_018012	GAC	2	6	50692	50697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390948501
1075	NC_018012	CCAG	2	8	50732	50739	25 %	0 %	25 %	50 %	390948501
1076	NC_018012	TTCGC	2	10	51121	51130	0 %	40 %	20 %	40 %	390948502
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1080	NC_018012	CCTGA	2	10	51302	51311	20 %	20 %	20 %	40 %	390948502
1081	NC_018012	CGC	2	6	51351	51356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390948502
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1086	NC_018012	CGG	2	6	51574	51579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390948502
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1089	NC_018012	GCC	3	9	51685	51693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390948502
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1092	NC_018012	CGG	2	6	51780	51785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390948502
1093	NC_018012	ATT	2	6	51817	51822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390948502
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1096	NC_018012	CGC	2	6	51976	51981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390948502
1097	NC_018012	TTC	2	6	52031	52036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390948502
1098	NC_018012	GGC	2	6	52037	52042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390948502
1099	NC_018012	GC	3	6	52064	52069	0 %	0 %	50 %	50 %	390948502
1100	NC_018012	TC	3	6	52102	52107	0 %	50 %	0 %	50 %	390948502
1101	NC_018012	CTG	2	6	52136	52141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390948502
1102	NC_018012	TTCTC	2	10	52164	52173	0 %	60 %	0 %	40 %	390948502
1103	NC_018012	GATC	2	8	52174	52181	25 %	25 %	25 %	25 %	390948502
1104	NC_018012	CTGG	2	8	52225	52232	0 %	25 %	50 %	25 %	390948502
1105	NC_018012	GC	4	8	52243	52250	0 %	0 %	50 %	50 %	390948502
1106	NC_018012	GGT	2	6	52333	52338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390948502
1107	NC_018012	GCG	2	6	52357	52362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390948502
1108	NC_018012	CTT	2	6	52435	52440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390948502
1109	NC_018012	GCT	2	6	52474	52479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390948502
1110	NC_018012	GTC	2	6	52481	52486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390948502
1111	NC_018012	GGTC	2	8	52507	52514	0 %	25 %	50 %	25 %	390948502
1112	NC_018012	GCC	3	9	52619	52627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390948502
1113	NC_018012	GAGCC	2	10	52676	52685	20 %	0 %	40 %	40 %	390948502
1114	NC_018012	TGG	2	6	52800	52805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390948502
1115	NC_018012	GGGC	2	8	52824	52831	0 %	0 %	75 %	25 %	390948502
1116	NC_018012	ATCTG	2	10	52848	52857	20 %	40 %	20 %	20 %	390948502
1117	NC_018012	CTT	2	6	52861	52866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390948502
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1119	NC_018012	TTCC	2	8	52912	52919	0 %	50 %	0 %	50 %	390948502
1120	NC_018012	TTC	2	6	52973	52978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390948502
1121	NC_018012	ACA	2	6	52992	52997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390948502
1122	NC_018012	GCC	3	9	53039	53047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390948502
1123	NC_018012	CTCG	2	8	53098	53105	0 %	25 %	25 %	50 %	390948502
1124	NC_018012	CGG	2	6	53131	53136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390948502
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1126	NC_018012	GATCCT	2	12	53185	53196	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	390948502
1127	NC_018012	CGA	2	6	53197	53202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390948502
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1129	NC_018012	CCATTG	2	12	53280	53291	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	390948502
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1240	NC_018012	GCG	2	6	59237	59242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390948508
1241	NC_018012	TCG	2	6	59330	59335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390948508
1242	NC_018012	GAAG	2	8	59346	59353	50 %	0 %	50 %	0 %	390948508
1243	NC_018012	GGC	2	6	59364	59369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390948508
1244	NC_018012	TCA	2	6	59456	59461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390948508
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1247	NC_018012	GAT	2	6	59691	59696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390948509
1248	NC_018012	GTCG	2	8	59790	59797	0 %	25 %	50 %	25 %	390948509
1249	NC_018012	CAGCG	2	10	59806	59815	20 %	0 %	40 %	40 %	390948509
1250	NC_018012	CG	3	6	59814	59819	0 %	0 %	50 %	50 %	390948509
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1362	NC_018012	GA	3	6	66771	66776	50 %	0 %	50 %	0 %	390948513
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1370	NC_018012	TCGATC	2	12	67206	67217	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	390948513
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1373	NC_018012	CGG	2	6	67296	67301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390948513
1374	NC_018012	TC	3	6	67400	67405	0 %	50 %	0 %	50 %	390948514
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1376	NC_018012	GC	3	6	67811	67816	0 %	0 %	50 %	50 %	390948515
1377	NC_018012	TGC	2	6	67826	67831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390948515
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1381	NC_018012	TCG	2	6	68075	68080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390948516
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1483	NC_018012	ACC	2	6	73368	73373	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390948519
1484	NC_018012	GC	3	6	73428	73433	0 %	0 %	50 %	50 %	390948519
1485	NC_018012	GGATC	2	10	73439	73448	20 %	20 %	40 %	20 %	390948519
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1487	NC_018012	GAC	2	6	73677	73682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390948519
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1489	NC_018012	GC	3	6	73772	73777	0 %	0 %	50 %	50 %	390948519
1490	NC_018012	GGA	2	6	73778	73783	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390948519
1491	NC_018012	CG	3	6	73787	73792	0 %	0 %	50 %	50 %	390948519
1492	NC_018012	TCC	2	6	73843	73848	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390948519
1493	NC_018012	GCCTTC	2	12	73851	73862	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	390948519
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1495	NC_018012	GCC	2	6	73918	73923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390948519
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1500	NC_018012	CG	3	6	74129	74134	0 %	0 %	50 %	50 %	390948519

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