MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thiocystis violascens DSM 198 chromosome

Total Repeats: 97816

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11002	NC_018012	CTG	2	6	564737	564742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390948964
11003	NC_018012	GTCGCG	2	12	564809	564820	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	390948964
11004	NC_018012	GGA	2	6	564874	564879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390948964
11005	NC_018012	CGG	2	6	564917	564922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390948964
11006	NC_018012	CG	3	6	564923	564928	0 %	0 %	50 %	50 %	390948964
11007	NC_018012	CGC	2	6	564939	564944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390948964
11008	NC_018012	TCG	2	6	564951	564956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390948964
11009	NC_018012	GAT	2	6	565054	565059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390948964
11010	NC_018012	CTG	2	6	565091	565096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390948964
11011	NC_018012	TGC	2	6	565146	565151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390948964
11012	NC_018012	CGCGG	2	10	565192	565201	0 %	0 %	60 %	40 %	390948964
11013	NC_018012	GCT	2	6	565210	565215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390948964
11014	NC_018012	GC	4	8	565241	565248	0 %	0 %	50 %	50 %	390948964
11015	NC_018012	GCC	2	6	565276	565281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390948964
11016	NC_018012	GCT	2	6	565417	565422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390948964
11017	NC_018012	GGC	2	6	565430	565435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390948964
11018	NC_018012	CCCG	2	8	565445	565452	0 %	0 %	25 %	75 %	390948964
11019	NC_018012	CTG	2	6	565454	565459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390948964
11020	NC_018012	GCCGC	2	10	565463	565472	0 %	0 %	40 %	60 %	390948964
11021	NC_018012	GC	3	6	565471	565476	0 %	0 %	50 %	50 %	390948964
11022	NC_018012	ACG	2	6	565553	565558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390948964
11023	NC_018012	ATCC	2	8	565587	565594	25 %	25 %	0 %	50 %	390948964
11024	NC_018012	TC	5	10	565602	565611	0 %	50 %	0 %	50 %	390948964
11025	NC_018012	TTGCC	2	10	565617	565626	0 %	40 %	20 %	40 %	390948964
11026	NC_018012	CGA	2	6	565663	565668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390948964
11027	NC_018012	GGA	2	6	565672	565677	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390948964
11028	NC_018012	TCC	2	6	565760	565765	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390948964
11029	NC_018012	T	6	6	565772	565777	0 %	100 %	0 %	0 %	390948964
11030	NC_018012	AGGA	2	8	565800	565807	50 %	0 %	50 %	0 %	390948964
11031	NC_018012	GCC	2	6	566008	566013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390948965
11032	NC_018012	CCG	2	6	566025	566030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390948965
11033	NC_018012	TGG	2	6	566058	566063	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390948965
11034	NC_018012	ACG	2	6	566138	566143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390948965
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11037	NC_018012	TCC	2	6	566576	566581	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390948966
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11040	NC_018012	TCG	2	6	566867	566872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390948966
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11042	NC_018012	GC	3	6	566886	566891	0 %	0 %	50 %	50 %	390948966
11043	NC_018012	GCG	2	6	566908	566913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390948966
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11047	NC_018012	ATCG	2	8	567085	567092	25 %	25 %	25 %	25 %	390948966
11048	NC_018012	CGA	2	6	567105	567110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390948966
11049	NC_018012	GTC	2	6	567112	567117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390948966
11050	NC_018012	TCG	2	6	567131	567136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390948966
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11052	NC_018012	TCCA	2	8	567366	567373	25 %	25 %	0 %	50 %	390948967
11053	NC_018012	CG	3	6	567388	567393	0 %	0 %	50 %	50 %	390948967
11054	NC_018012	CGC	2	6	567400	567405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390948967
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11061	NC_018012	CGG	2	6	567913	567918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390948967
11062	NC_018012	GA	3	6	567927	567932	50 %	0 %	50 %	0 %	390948967
11063	NC_018012	GAG	2	6	567941	567946	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390948967
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11072	NC_018012	CGA	2	6	569591	569596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390948969
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11075	NC_018012	CAA	2	6	569723	569728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390948969
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11091	NC_018012	GAT	2	6	570876	570881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390948970
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11093	NC_018012	GTG	2	6	570937	570942	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390948970
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11101	NC_018012	GC	3	6	571135	571140	0 %	0 %	50 %	50 %	390948970
11102	NC_018012	TCCG	2	8	571157	571164	0 %	25 %	25 %	50 %	390948970
11103	NC_018012	CGA	2	6	571197	571202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390948970
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11109	NC_018012	CG	4	8	571428	571435	0 %	0 %	50 %	50 %	390948970
11110	NC_018012	CTT	2	6	571482	571487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390948970
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11115	NC_018012	C	7	7	571842	571848	0 %	0 %	0 %	100 %	390948971
11116	NC_018012	GAT	2	6	571851	571856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390948971
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11236	NC_018012	TGTC	2	8	577683	577690	0 %	50 %	25 %	25 %	390948977
11237	NC_018012	AGCC	2	8	577763	577770	25 %	0 %	25 %	50 %	390948978
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11359	NC_018012	TGGC	2	8	583803	583810	0 %	25 %	50 %	25 %	390948983
11360	NC_018012	GCC	2	6	583830	583835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390948983
11361	NC_018012	AAC	2	6	583844	583849	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390948983
11362	NC_018012	GCA	2	6	583869	583874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390948983
11363	NC_018012	GATCTC	2	12	583894	583905	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	390948983
11364	NC_018012	CCT	2	6	583920	583925	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390948983
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11366	NC_018012	CCG	2	6	583962	583967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390948983
11367	NC_018012	GCT	2	6	583977	583982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390948983
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11371	NC_018012	TGAG	2	8	584401	584408	25 %	25 %	50 %	0 %	390948984
11372	NC_018012	GCC	2	6	584428	584433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390948984
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11377	NC_018012	CGA	2	6	584687	584692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390948984
11378	NC_018012	TCG	2	6	584716	584721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390948984
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11382	NC_018012	AGG	2	6	584875	584880	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390948984
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11387	NC_018012	CTG	2	6	585099	585104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390948984
11388	NC_018012	CGGA	2	8	585111	585118	25 %	0 %	50 %	25 %	390948984
11389	NC_018012	GCG	2	6	585120	585125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390948984
11390	NC_018012	CTG	2	6	585171	585176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390948984
11391	NC_018012	CCTGG	2	10	585194	585203	0 %	20 %	40 %	40 %	390948984
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11393	NC_018012	GA	3	6	585246	585251	50 %	0 %	50 %	0 %	390948984
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11405	NC_018012	GGT	2	6	585806	585811	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390948984
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11422	NC_018012	CGA	2	6	586526	586531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390948985
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11424	NC_018012	CGA	2	6	586605	586610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390948985
11425	NC_018012	TCA	2	6	586616	586621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390948985
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11432	NC_018012	ATC	2	6	586948	586953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390948985
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11465	NC_018012	CCAC	2	8	588755	588762	25 %	0 %	0 %	75 %	390948987
11466	NC_018012	GCT	2	6	588816	588821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390948987
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11471	NC_018012	CTG	2	6	588940	588945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390948987
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11473	NC_018012	GGC	2	6	588958	588963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390948987
11474	NC_018012	ATC	2	6	589003	589008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390948987
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11476	NC_018012	CGG	2	6	589032	589037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390948987
11477	NC_018012	CGG	2	6	589054	589059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390948987
11478	NC_018012	GCC	2	6	589074	589079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390948987
11479	NC_018012	GTG	2	6	589096	589101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390948987
11480	NC_018012	GCT	2	6	589107	589112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390948987
11481	NC_018012	TGT	2	6	589133	589138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390948987
11482	NC_018012	CTG	2	6	589177	589182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390948987
11483	NC_018012	CTG	2	6	589240	589245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390948987
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11486	NC_018012	CTG	2	6	589309	589314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390948987
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11491	NC_018012	CG	3	6	589531	589536	0 %	0 %	50 %	50 %	390948987
11492	NC_018012	CGC	2	6	589547	589552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390948987
11493	NC_018012	TCG	2	6	589565	589570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390948987
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11496	NC_018012	CGTC	2	8	589733	589740	0 %	25 %	25 %	50 %	390948987
11497	NC_018012	GAG	2	6	589765	589770	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390948987
11498	NC_018012	CGG	2	6	589802	589807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390948987
11499	NC_018012	GGA	2	6	589890	589895	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390948987
11500	NC_018012	CGC	2	6	589911	589916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390948987

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