MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Thermoanaerobacterium saccharolyticum JW/SL-YS485 plasmid pMU3262

Total Repeats: 2651

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017998	TTAC	2	8	119	126	25 %	50 %	0 %	25 %	390935778
2	NC_017998	CAA	2	6	156	161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390935778
3	NC_017998	CCTC	2	8	162	169	0 %	25 %	0 %	75 %	390935778
4	NC_017998	TCT	2	6	223	228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390935778
5	NC_017998	T	7	7	231	237	0 %	100 %	0 %	0 %	390935778
6	NC_017998	CTTTT	2	10	242	251	0 %	80 %	0 %	20 %	390935778
7	NC_017998	TCTT	2	8	252	259	0 %	75 %	0 %	25 %	390935778
8	NC_017998	TA	4	8	266	273	50 %	50 %	0 %	0 %	390935778
9	NC_017998	ATC	2	6	333	338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390935779
10	NC_017998	CTG	2	6	374	379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390935779
11	NC_017998	ATT	2	6	441	446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390935779
12	NC_017998	T	8	8	445	452	0 %	100 %	0 %	0 %	390935779
13	NC_017998	ACA	2	6	511	516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390935779
14	NC_017998	ATT	2	6	598	603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390935779
15	NC_017998	TGA	2	6	672	677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390935779
16	NC_017998	TCC	2	6	828	833	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390935779
17	NC_017998	ATT	2	6	852	857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390935779
18	NC_017998	AT	4	8	900	907	50 %	50 %	0 %	0 %	390935779
19	NC_017998	AT	3	6	932	937	50 %	50 %	0 %	0 %	390935779
20	NC_017998	TTA	2	6	971	976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390935779
21	NC_017998	TTA	2	6	982	987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390935779
22	NC_017998	CTA	2	6	994	999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390935779
23	NC_017998	TAG	2	6	1016	1021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390935779
24	NC_017998	AT	3	6	1056	1061	50 %	50 %	0 %	0 %	390935779
25	NC_017998	TC	3	6	1101	1106	0 %	50 %	0 %	50 %	390935779
26	NC_017998	TA	3	6	1155	1160	50 %	50 %	0 %	0 %	390935779
27	NC_017998	ACC	2	6	1161	1166	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390935779
28	NC_017998	AAC	2	6	1212	1217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390935779
29	NC_017998	TCT	2	6	1240	1245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390935779
30	NC_017998	AAAT	2	8	1532	1539	75 %	25 %	0 %	0 %	390935780
31	NC_017998	CGTT	2	8	1555	1562	0 %	50 %	25 %	25 %	390935780
32	NC_017998	T	6	6	1603	1608	0 %	100 %	0 %	0 %	390935780
33	NC_017998	TTAA	2	8	1687	1694	50 %	50 %	0 %	0 %	390935780
34	NC_017998	A	6	6	1776	1781	100 %	0 %	0 %	0 %	390935780
35	NC_017998	AAG	2	6	1879	1884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390935780
36	NC_017998	GCA	2	6	1906	1911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390935780
37	NC_017998	CTT	2	6	1919	1924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390935780
38	NC_017998	AGT	2	6	1929	1934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390935780
39	NC_017998	AGTA	2	8	1995	2002	50 %	25 %	25 %	0 %	390935780
40	NC_017998	AAG	2	6	2057	2062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390935780
41	NC_017998	AG	3	6	2112	2117	50 %	0 %	50 %	0 %	390935780
42	NC_017998	ATTC	2	8	2126	2133	25 %	50 %	0 %	25 %	390935780
43	NC_017998	TCA	2	6	2144	2149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390935780
44	NC_017998	GCA	2	6	2188	2193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390935780
45	NC_017998	TCT	2	6	2224	2229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390935780
46	NC_017998	TTA	2	6	2252	2257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390935780
47	NC_017998	TTTA	2	8	2262	2269	25 %	75 %	0 %	0 %	390935780
48	NC_017998	CAA	2	6	2294	2299	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390935780
49	NC_017998	T	7	7	2422	2428	0 %	100 %	0 %	0 %	390935780
50	NC_017998	ATT	2	6	2454	2459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390935780
51	NC_017998	AAT	2	6	2546	2551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390935780
52	NC_017998	GCC	2	6	2595	2600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390935780
53	NC_017998	TA	3	6	2606	2611	50 %	50 %	0 %	0 %	390935780
54	NC_017998	ACC	2	6	2616	2621	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390935780
55	NC_017998	T	6	6	2633	2638	0 %	100 %	0 %	0 %	390935780
56	NC_017998	ATA	2	6	2653	2658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390935780
57	NC_017998	T	6	6	2711	2716	0 %	100 %	0 %	0 %	390935781
58	NC_017998	TAC	2	6	2768	2773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390935781
59	NC_017998	TCC	2	6	2787	2792	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390935781
60	NC_017998	AAGT	2	8	2868	2875	50 %	25 %	25 %	0 %	390935781
61	NC_017998	CTTA	2	8	2925	2932	25 %	50 %	0 %	25 %	390935781
62	NC_017998	ATTT	2	8	3068	3075	25 %	75 %	0 %	0 %	390935782
63	NC_017998	ATT	2	6	3083	3088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390935782
64	NC_017998	T	6	6	3122	3127	0 %	100 %	0 %	0 %	390935782
65	NC_017998	TA	3	6	3196	3201	50 %	50 %	0 %	0 %	390935782
66	NC_017998	TCT	2	6	3247	3252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390935782
67	NC_017998	CAT	2	6	3279	3284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390935782
68	NC_017998	TAA	2	6	3336	3341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390935782
69	NC_017998	T	6	6	3348	3353	0 %	100 %	0 %	0 %	390935782
70	NC_017998	A	6	6	3374	3379	100 %	0 %	0 %	0 %	390935782
71	NC_017998	CATA	2	8	3390	3397	50 %	25 %	0 %	25 %	390935782
72	NC_017998	T	6	6	3398	3403	0 %	100 %	0 %	0 %	390935782
73	NC_017998	CTT	2	6	3408	3413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390935782
74	NC_017998	TCT	2	6	3419	3424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390935782
75	NC_017998	GAA	2	6	3425	3430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390935782
76	NC_017998	A	6	6	3470	3475	100 %	0 %	0 %	0 %	390935782
77	NC_017998	TAA	2	6	3664	3669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390935783
78	NC_017998	T	9	9	3699	3707	0 %	100 %	0 %	0 %	390935783
79	NC_017998	TTA	3	9	3716	3724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390935783
80	NC_017998	TTA	2	6	3776	3781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390935783
81	NC_017998	AT	4	8	3792	3799	50 %	50 %	0 %	0 %	390935783
82	NC_017998	ATC	2	6	3823	3828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390935783
83	NC_017998	T	8	8	3839	3846	0 %	100 %	0 %	0 %	390935783
84	NC_017998	TTC	3	9	3871	3879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390935783
85	NC_017998	ATT	2	6	3883	3888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390935783
86	NC_017998	T	8	8	3896	3903	0 %	100 %	0 %	0 %	390935783
87	NC_017998	TCT	2	6	3908	3913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390935783
88	NC_017998	CTT	2	6	3936	3941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390935783
89	NC_017998	T	6	6	3958	3963	0 %	100 %	0 %	0 %	390935783
90	NC_017998	AT	3	6	3976	3981	50 %	50 %	0 %	0 %	390935783
91	NC_017998	A	6	6	4009	4014	100 %	0 %	0 %	0 %	390935783
92	NC_017998	T	7	7	4072	4078	0 %	100 %	0 %	0 %	390935783
93	NC_017998	AAT	2	6	4114	4119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390935783
94	NC_017998	ATT	2	6	4126	4131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390935783
95	NC_017998	TA	3	6	4134	4139	50 %	50 %	0 %	0 %	390935783
96	NC_017998	AAT	2	6	4153	4158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390935783
97	NC_017998	TC	3	6	4168	4173	0 %	50 %	0 %	50 %	390935783
98	NC_017998	AGTT	2	8	4195	4202	25 %	50 %	25 %	0 %	390935783
99	NC_017998	TA	3	6	4246	4251	50 %	50 %	0 %	0 %	390935783
100	NC_017998	AATT	2	8	4303	4310	50 %	50 %	0 %	0 %	390935783
101	NC_017998	CTT	2	6	4344	4349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390935783
102	NC_017998	AAAT	2	8	4354	4361	75 %	25 %	0 %	0 %	390935783
103	NC_017998	AATT	2	8	4519	4526	50 %	50 %	0 %	0 %	390935783
104	NC_017998	TTTA	2	8	4774	4781	25 %	75 %	0 %	0 %	390935784
105	NC_017998	TGA	2	6	4803	4808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390935784
106	NC_017998	ACT	2	6	4892	4897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390935784
107	NC_017998	AT	3	6	4923	4928	50 %	50 %	0 %	0 %	390935784
108	NC_017998	CAG	2	6	4957	4962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390935784
109	NC_017998	TGCC	2	8	5008	5015	0 %	25 %	25 %	50 %	390935784
110	NC_017998	TGA	2	6	5042	5047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390935784
111	NC_017998	TA	4	8	5048	5055	50 %	50 %	0 %	0 %	390935784
112	NC_017998	TAA	2	6	5084	5089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390935784
113	NC_017998	AT	3	6	5167	5172	50 %	50 %	0 %	0 %	390935784
114	NC_017998	AAT	2	6	5206	5211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390935784
115	NC_017998	CAC	2	6	5215	5220	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390935784
116	NC_017998	TCA	2	6	5265	5270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390935784
117	NC_017998	ACC	2	6	5275	5280	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390935784
118	NC_017998	TA	3	6	5298	5303	50 %	50 %	0 %	0 %	390935784
119	NC_017998	CAC	2	6	5305	5310	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390935784
120	NC_017998	AGC	2	6	5348	5353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390935784
121	NC_017998	CAG	2	6	5386	5391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390935784
122	NC_017998	GAA	2	6	5431	5436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390935784
123	NC_017998	AAGT	2	8	5497	5504	50 %	25 %	25 %	0 %	390935784
124	NC_017998	CCA	2	6	5597	5602	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390935784
125	NC_017998	CTT	2	6	5626	5631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390935784
126	NC_017998	TA	3	6	5634	5639	50 %	50 %	0 %	0 %	390935784
127	NC_017998	TA	3	6	5642	5647	50 %	50 %	0 %	0 %	390935784
128	NC_017998	AT	3	6	5680	5685	50 %	50 %	0 %	0 %	390935784
129	NC_017998	TAT	2	6	5689	5694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390935784
130	NC_017998	ATT	2	6	5708	5713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390935784
131	NC_017998	ATC	2	6	5730	5735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390935784
132	NC_017998	T	7	7	5770	5776	0 %	100 %	0 %	0 %	390935784
133	NC_017998	TG	3	6	5846	5851	0 %	50 %	50 %	0 %	390935784
134	NC_017998	TTA	2	6	5883	5888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390935784
135	NC_017998	GT	3	6	5896	5901	0 %	50 %	50 %	0 %	390935784
136	NC_017998	AT	3	6	5932	5937	50 %	50 %	0 %	0 %	390935784
137	NC_017998	GTT	2	6	6000	6005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390935784
138	NC_017998	T	6	6	6069	6074	0 %	100 %	0 %	0 %	390935784
139	NC_017998	TGTTAT	2	12	6085	6096	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	390935784
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