MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermoanaerobacterium saccharolyticum JW/SL-YS485 chromosome

Total Repeats: 54815

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017992	ATT	2	6	115	120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390933133
2	NC_017992	TATAA	2	10	137	146	60 %	40 %	0 %	0 %	390933133
3	NC_017992	A	6	6	159	164	100 %	0 %	0 %	0 %	390933133
4	NC_017992	GAA	2	6	191	196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390933133
5	NC_017992	ATG	2	6	296	301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390933133
6	NC_017992	A	6	6	318	323	100 %	0 %	0 %	0 %	390933133
7	NC_017992	AT	3	6	329	334	50 %	50 %	0 %	0 %	390933133
8	NC_017992	TGC	2	6	345	350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390933133
9	NC_017992	TGA	2	6	366	371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390933133
10	NC_017992	ATC	2	6	507	512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933133
11	NC_017992	AG	3	6	665	670	50 %	0 %	50 %	0 %	390933133
12	NC_017992	AAAC	2	8	723	730	75 %	0 %	0 %	25 %	390933133
13	NC_017992	ATTTA	2	10	773	782	40 %	60 %	0 %	0 %	390933133
14	NC_017992	ATT	2	6	884	889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390933134
15	NC_017992	T	6	6	906	911	0 %	100 %	0 %	0 %	390933134
16	NC_017992	TC	3	6	933	938	0 %	50 %	0 %	50 %	390933134
17	NC_017992	TGC	2	6	978	983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390933134
18	NC_017992	CTT	2	6	1003	1008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390933134
19	NC_017992	AGC	2	6	1029	1034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390933134
20	NC_017992	T	6	6	1053	1058	0 %	100 %	0 %	0 %	390933134
21	NC_017992	TTC	2	6	1074	1079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390933134
22	NC_017992	CAG	2	6	1181	1186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390933134
23	NC_017992	GCA	2	6	1222	1227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390933134
24	NC_017992	CCG	2	6	1270	1275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390933134
25	NC_017992	CCA	2	6	1288	1293	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390933134
26	NC_017992	CTA	2	6	1301	1306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933134
27	NC_017992	TCTT	2	8	1310	1317	0 %	75 %	0 %	25 %	390933134
28	NC_017992	AT	3	6	1377	1382	50 %	50 %	0 %	0 %	390933134
29	NC_017992	TCA	3	9	1390	1398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933134
30	NC_017992	TGG	2	6	1407	1412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390933134
31	NC_017992	TTA	2	6	1424	1429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390933134
32	NC_017992	CT	3	6	1508	1513	0 %	50 %	0 %	50 %	390933134
33	NC_017992	TG	3	6	1619	1624	0 %	50 %	50 %	0 %	390933134
34	NC_017992	CAT	2	6	1680	1685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933134
35	NC_017992	TTC	2	6	1707	1712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390933134
36	NC_017992	T	7	7	1734	1740	0 %	100 %	0 %	0 %	390933134
37	NC_017992	ATACC	2	10	1925	1934	40 %	20 %	0 %	40 %	390933134
38	NC_017992	TGT	2	6	1935	1940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390933134
39	NC_017992	T	6	6	1978	1983	0 %	100 %	0 %	0 %	390933134
40	NC_017992	ACA	2	6	2388	2393	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390933135
41	NC_017992	CAC	2	6	2410	2415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390933135
42	NC_017992	GCA	2	6	2511	2516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390933135
43	NC_017992	TTC	2	6	2594	2599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390933135
44	NC_017992	TCT	2	6	2637	2642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390933135
45	NC_017992	CCT	2	6	2785	2790	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390933135
46	NC_017992	T	6	6	2862	2867	0 %	100 %	0 %	0 %	390933135
47	NC_017992	GTC	2	6	2868	2873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390933135
48	NC_017992	TC	3	6	2877	2882	0 %	50 %	0 %	50 %	390933135
49	NC_017992	T	6	6	2900	2905	0 %	100 %	0 %	0 %	390933136
50	NC_017992	CCAA	2	8	2931	2938	50 %	0 %	0 %	50 %	390933136
51	NC_017992	CAA	2	6	3032	3037	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390933136
52	NC_017992	TTG	2	6	3121	3126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390933136
53	NC_017992	CCA	2	6	3154	3159	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390933136
54	NC_017992	CTAT	2	8	3163	3170	25 %	50 %	0 %	25 %	390933136
55	NC_017992	TGA	2	6	3282	3287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390933136
56	NC_017992	AAAAG	2	10	3302	3311	80 %	0 %	20 %	0 %	390933136
57	NC_017992	T	6	6	3384	3389	0 %	100 %	0 %	0 %	390933136
58	NC_017992	T	7	7	4204	4210	0 %	100 %	0 %	0 %	390933137
59	NC_017992	AAT	2	6	4247	4252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390933137
60	NC_017992	T	6	6	4255	4260	0 %	100 %	0 %	0 %	390933137
61	NC_017992	TGC	2	6	4283	4288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390933137
62	NC_017992	TAA	2	6	4303	4308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390933137
63	NC_017992	A	7	7	4351	4357	100 %	0 %	0 %	0 %	390933137
64	NC_017992	TCA	2	6	4384	4389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933137
65	NC_017992	AAT	2	6	4422	4427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390933137
66	NC_017992	T	7	7	4529	4535	0 %	100 %	0 %	0 %	390933137
67	NC_017992	AAC	2	6	4638	4643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390933137
68	NC_017992	AAC	2	6	4725	4730	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390933137
69	NC_017992	ATG	2	6	4783	4788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390933137
70	NC_017992	TTG	2	6	4822	4827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390933137
71	NC_017992	ACA	2	6	4846	4851	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390933137
72	NC_017992	TCA	2	6	4969	4974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933137
73	NC_017992	TCC	2	6	4991	4996	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390933137
74	NC_017992	GGA	2	6	5025	5030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390933137
75	NC_017992	AAG	2	6	5124	5129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390933137
76	NC_017992	TAA	2	6	5134	5139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390933137
77	NC_017992	CGG	3	9	5237	5245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390933137
78	NC_017992	GAAA	2	8	5316	5323	75 %	0 %	25 %	0 %	390933137
79	NC_017992	ATG	2	6	5446	5451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390933137
80	NC_017992	ATA	2	6	5565	5570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390933137
81	NC_017992	AGA	2	6	5726	5731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390933137
82	NC_017992	ACA	2	6	5755	5760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390933137
83	NC_017992	AGC	2	6	5792	5797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390933137
84	NC_017992	ATCT	2	8	5806	5813	25 %	50 %	0 %	25 %	390933137
85	NC_017992	GCC	2	6	6039	6044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390933137
86	NC_017992	TAG	2	6	6070	6075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390933137
87	NC_017992	GAT	2	6	6189	6194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390933137
88	NC_017992	ATC	2	6	6212	6217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933137
89	NC_017992	AAG	2	6	6331	6336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390933137
90	NC_017992	AGA	2	6	6371	6376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390933137
91	NC_017992	ATA	2	6	6396	6401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390933137
92	NC_017992	TA	3	6	6400	6405	50 %	50 %	0 %	0 %	390933137
93	NC_017992	AC	3	6	6412	6417	50 %	0 %	0 %	50 %	390933137
94	NC_017992	ACA	2	6	6439	6444	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390933137
95	NC_017992	TA	3	6	6450	6455	50 %	50 %	0 %	0 %	390933137
96	NC_017992	AAT	2	6	6471	6476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390933137
97	NC_017992	AAT	2	6	6521	6526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390933137
98	NC_017992	TCA	2	6	6619	6624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933138
99	NC_017992	A	6	6	6649	6654	100 %	0 %	0 %	0 %	390933138
100	NC_017992	CAT	2	6	6693	6698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933138
101	NC_017992	CTTT	2	8	6706	6713	0 %	75 %	0 %	25 %	390933138
102	NC_017992	TCA	2	6	6773	6778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933138
103	NC_017992	TTG	2	6	6800	6805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390933138
104	NC_017992	TC	3	6	6815	6820	0 %	50 %	0 %	50 %	390933138
105	NC_017992	T	6	6	6836	6841	0 %	100 %	0 %	0 %	390933138
106	NC_017992	CTATT	2	10	6854	6863	20 %	60 %	0 %	20 %	390933138
107	NC_017992	GCT	2	6	6879	6884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390933138
108	NC_017992	TTG	3	9	6895	6903	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390933138
109	NC_017992	CT	3	6	6921	6926	0 %	50 %	0 %	50 %	390933138
110	NC_017992	TC	3	6	6930	6935	0 %	50 %	0 %	50 %	390933138
111	NC_017992	T	7	7	6997	7003	0 %	100 %	0 %	0 %	390933138
112	NC_017992	ATTT	2	8	7043	7050	25 %	75 %	0 %	0 %	390933138
113	NC_017992	TGG	3	9	7167	7175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390933138
114	NC_017992	ATA	2	6	7207	7212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390933138
115	NC_017992	ACG	2	6	7231	7236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390933138
116	NC_017992	GATT	2	8	7251	7258	25 %	50 %	25 %	0 %	390933138
117	NC_017992	GAC	2	6	7366	7371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390933139
118	NC_017992	A	6	6	7536	7541	100 %	0 %	0 %	0 %	390933139
119	NC_017992	AAAG	2	8	7586	7593	75 %	0 %	25 %	0 %	390933139
120	NC_017992	CAT	2	6	7608	7613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933139
121	NC_017992	A	7	7	7665	7671	100 %	0 %	0 %	0 %	390933139
122	NC_017992	AT	3	6	7678	7683	50 %	50 %	0 %	0 %	390933139
123	NC_017992	CTG	2	6	7712	7717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390933139
124	NC_017992	ATA	2	6	7759	7764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390933139
125	NC_017992	CATA	2	8	7824	7831	50 %	25 %	0 %	25 %	390933139
126	NC_017992	AGC	2	6	7848	7853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390933139
127	NC_017992	A	6	6	7857	7862	100 %	0 %	0 %	0 %	390933139
128	NC_017992	T	6	6	7888	7893	0 %	100 %	0 %	0 %	390933140
129	NC_017992	AT	3	6	8068	8073	50 %	50 %	0 %	0 %	390933140
130	NC_017992	AAC	2	6	8102	8107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390933140
131	NC_017992	CAC	2	6	8132	8137	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390933140
132	NC_017992	TGT	2	6	8158	8163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390933140
133	NC_017992	ACA	2	6	8176	8181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390933140
134	NC_017992	TAT	2	6	8183	8188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390933140
135	NC_017992	CCT	2	6	8194	8199	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390933140
136	NC_017992	CTG	2	6	8202	8207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390933140
137	NC_017992	AATC	2	8	8233	8240	50 %	25 %	0 %	25 %	390933140
138	NC_017992	CTT	2	6	8251	8256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390933140
139	NC_017992	T	6	6	8259	8264	0 %	100 %	0 %	0 %	390933140
140	NC_017992	TCG	2	6	8283	8288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390933140
141	NC_017992	TGTC	2	8	8314	8321	0 %	50 %	25 %	25 %	390933140
142	NC_017992	ACC	2	6	8336	8341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390933140
143	NC_017992	TGAC	2	8	8363	8370	25 %	25 %	25 %	25 %	390933140
144	NC_017992	TAT	2	6	8375	8380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390933140
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148	NC_017992	AT	3	6	8575	8580	50 %	50 %	0 %	0 %	390933140
149	NC_017992	CTT	2	6	8584	8589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390933140
150	NC_017992	TCA	2	6	8691	8696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933140
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152	NC_017992	T	6	6	8790	8795	0 %	100 %	0 %	0 %	390933140
153	NC_017992	ATCT	2	8	8879	8886	25 %	50 %	0 %	25 %	390933140
154	NC_017992	CAGT	2	8	8932	8939	25 %	25 %	25 %	25 %	390933140
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158	NC_017992	GTA	2	6	9030	9035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390933140
159	NC_017992	TGT	2	6	9064	9069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390933140
160	NC_017992	TCA	2	6	9109	9114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933140
161	NC_017992	CTT	2	6	9159	9164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390933140
162	NC_017992	A	6	6	9198	9203	100 %	0 %	0 %	0 %	390933140
163	NC_017992	CTT	2	6	9214	9219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390933140
164	NC_017992	T	7	7	9258	9264	0 %	100 %	0 %	0 %	390933140
165	NC_017992	CTT	2	6	9338	9343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390933140
166	NC_017992	A	6	6	9457	9462	100 %	0 %	0 %	0 %	390933141
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171	NC_017992	AT	3	6	10000	10005	50 %	50 %	0 %	0 %	390933141
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176	NC_017992	A	6	6	10344	10349	100 %	0 %	0 %	0 %	390933141
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252	NC_017992	TCT	2	6	13521	13526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390933144
253	NC_017992	AT	3	6	13561	13566	50 %	50 %	0 %	0 %	390933144
254	NC_017992	T	6	6	13644	13649	0 %	100 %	0 %	0 %	390933144
255	NC_017992	CTTTG	2	10	13665	13674	0 %	60 %	20 %	20 %	390933144
256	NC_017992	TCA	2	6	13677	13682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933144
257	NC_017992	ACA	2	6	13686	13691	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390933144
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260	NC_017992	T	7	7	13928	13934	0 %	100 %	0 %	0 %	390933145
261	NC_017992	ATT	2	6	13980	13985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390933145
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266	NC_017992	CCG	2	6	14372	14377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390933146
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499	NC_017992	TAT	2	6	25746	25751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390933160
500	NC_017992	CCA	2	6	25756	25761	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390933160

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