MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermoanaerobacterium saccharolyticum JW/SL-YS485 chromosome

Total Repeats: 54815

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_017992	TCC	2	6	79347	79352	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390933209
1502	NC_017992	A	6	6	79408	79413	100 %	0 %	0 %	0 %	390933209
1503	NC_017992	GGA	2	6	79617	79622	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390933209
1504	NC_017992	AGA	2	6	79689	79694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390933209
1505	NC_017992	A	7	7	79728	79734	100 %	0 %	0 %	0 %	390933209
1506	NC_017992	T	7	7	79752	79758	0 %	100 %	0 %	0 %	390933209
1507	NC_017992	AC	3	6	79843	79848	50 %	0 %	0 %	50 %	390933209
1508	NC_017992	AT	3	6	79929	79934	50 %	50 %	0 %	0 %	390933209
1509	NC_017992	A	6	6	79977	79982	100 %	0 %	0 %	0 %	390933209
1510	NC_017992	ACC	2	6	79988	79993	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390933209
1511	NC_017992	GAT	2	6	80001	80006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390933209
1512	NC_017992	CTT	2	6	80138	80143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390933210
1513	NC_017992	GACA	2	8	80161	80168	50 %	0 %	25 %	25 %	390933210
1514	NC_017992	GAA	3	9	80231	80239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390933210
1515	NC_017992	A	6	6	80277	80282	100 %	0 %	0 %	0 %	390933210
1516	NC_017992	AGT	2	6	80293	80298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390933210
1517	NC_017992	CAA	2	6	80330	80335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390933210
1518	NC_017992	ACAAT	2	10	80371	80380	60 %	20 %	0 %	20 %	390933210
1519	NC_017992	GTAGAA	2	12	80426	80437	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	390933210
1520	NC_017992	ACAA	2	8	80535	80542	75 %	0 %	0 %	25 %	390933210
1521	NC_017992	TGG	2	6	80583	80588	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390933210
1522	NC_017992	AAT	2	6	80599	80604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390933210
1523	NC_017992	GTA	2	6	80620	80625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390933211
1524	NC_017992	A	6	6	80625	80630	100 %	0 %	0 %	0 %	390933211
1525	NC_017992	CCA	2	6	80635	80640	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390933211
1526	NC_017992	TTC	2	6	80656	80661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390933211
1527	NC_017992	TC	3	6	80692	80697	0 %	50 %	0 %	50 %	390933211
1528	NC_017992	AAG	2	6	80741	80746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390933211
1529	NC_017992	TAC	3	9	80769	80777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933211
1530	NC_017992	CTC	2	6	80797	80802	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390933211
1531	NC_017992	TTCT	2	8	80824	80831	0 %	75 %	0 %	25 %	390933211
1532	NC_017992	A	6	6	80832	80837	100 %	0 %	0 %	0 %	390933211
1533	NC_017992	AAT	2	6	80871	80876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390933211
1534	NC_017992	ATG	2	6	80930	80935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390933211
1535	NC_017992	CCTA	2	8	81019	81026	25 %	25 %	0 %	50 %	390933211
1536	NC_017992	GAA	2	6	81028	81033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390933211
1537	NC_017992	TAA	2	6	81044	81049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390933211
1538	NC_017992	TGA	2	6	81054	81059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390933211
1539	NC_017992	AAT	2	6	81112	81117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390933211
1540	NC_017992	A	6	6	81136	81141	100 %	0 %	0 %	0 %	390933211
1541	NC_017992	ATA	3	9	81166	81174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390933211
1542	NC_017992	ACG	2	6	81224	81229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390933211
1543	NC_017992	AGC	2	6	81336	81341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390933211
1544	NC_017992	ACG	2	6	81385	81390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390933211
1545	NC_017992	CAT	2	6	81402	81407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933211
1546	NC_017992	TA	3	6	81432	81437	50 %	50 %	0 %	0 %	390933211
1547	NC_017992	A	6	6	81458	81463	100 %	0 %	0 %	0 %	390933211
1548	NC_017992	AAG	2	6	81483	81488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390933211
1549	NC_017992	TA	3	6	81553	81558	50 %	50 %	0 %	0 %	390933211
1550	NC_017992	A	7	7	81571	81577	100 %	0 %	0 %	0 %	390933211
1551	NC_017992	AGA	2	6	81618	81623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390933211
1552	NC_017992	A	6	6	81623	81628	100 %	0 %	0 %	0 %	390933211
1553	NC_017992	GGA	2	6	81661	81666	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390933211
1554	NC_017992	TA	3	6	81673	81678	50 %	50 %	0 %	0 %	390933211
1555	NC_017992	GATAA	2	10	81703	81712	60 %	20 %	20 %	0 %	390933211
1556	NC_017992	A	7	7	81745	81751	100 %	0 %	0 %	0 %	390933211
1557	NC_017992	A	7	7	81758	81764	100 %	0 %	0 %	0 %	390933211
1558	NC_017992	T	7	7	81779	81785	0 %	100 %	0 %	0 %	390933212
1559	NC_017992	GAA	2	6	81815	81820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390933212
1560	NC_017992	ACT	2	6	81890	81895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933212
1561	NC_017992	ATT	3	9	81908	81916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390933212
1562	NC_017992	A	6	6	81942	81947	100 %	0 %	0 %	0 %	390933213
1563	NC_017992	GCC	2	6	81964	81969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390933213
1564	NC_017992	AACT	2	8	82003	82010	50 %	25 %	0 %	25 %	390933213
1565	NC_017992	ATG	2	6	82026	82031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390933213
1566	NC_017992	TGG	2	6	82059	82064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390933213
1567	NC_017992	CTA	2	6	82188	82193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933213
1568	NC_017992	CTT	2	6	82197	82202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390933213
1569	NC_017992	ATT	2	6	82208	82213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390933213
1570	NC_017992	AAG	2	6	82219	82224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390933213
1571	NC_017992	TA	3	6	82288	82293	50 %	50 %	0 %	0 %	390933213
1572	NC_017992	AAT	2	6	82357	82362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390933213
1573	NC_017992	T	7	7	82390	82396	0 %	100 %	0 %	0 %	390933213
1574	NC_017992	TAT	2	6	82471	82476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390933213
1575	NC_017992	TCA	2	6	82484	82489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933213
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1577	NC_017992	A	6	6	82528	82533	100 %	0 %	0 %	0 %	390933213
1578	NC_017992	ATG	2	6	82560	82565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390933213
1579	NC_017992	GCCA	2	8	82600	82607	25 %	0 %	25 %	50 %	390933213
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1581	NC_017992	CT	3	6	82685	82690	0 %	50 %	0 %	50 %	390933213
1582	NC_017992	GAAT	2	8	82746	82753	50 %	25 %	25 %	0 %	390933213
1583	NC_017992	TTATC	2	10	82782	82791	20 %	60 %	0 %	20 %	390933213
1584	NC_017992	TCT	2	6	82826	82831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390933213
1585	NC_017992	A	6	6	82832	82837	100 %	0 %	0 %	0 %	390933213
1586	NC_017992	ATA	2	6	82857	82862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390933213
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1588	NC_017992	ATG	2	6	82901	82906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390933213
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1591	NC_017992	CCAAC	2	10	83018	83027	40 %	0 %	0 %	60 %	390933213
1592	NC_017992	AAAAT	2	10	83042	83051	80 %	20 %	0 %	0 %	390933213
1593	NC_017992	TC	3	6	83110	83115	0 %	50 %	0 %	50 %	390933213
1594	NC_017992	ATGT	2	8	83139	83146	25 %	50 %	25 %	0 %	390933213
1595	NC_017992	TA	3	6	83173	83178	50 %	50 %	0 %	0 %	390933213
1596	NC_017992	TTA	2	6	83213	83218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390933213
1597	NC_017992	ATTATC	2	12	83227	83238	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	390933213
1598	NC_017992	A	6	6	83253	83258	100 %	0 %	0 %	0 %	390933213
1599	NC_017992	TCC	2	6	83276	83281	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390933213
1600	NC_017992	AAC	2	6	83320	83325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390933213
1601	NC_017992	CCA	2	6	83391	83396	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390933213
1602	NC_017992	CTA	2	6	83478	83483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933213
1603	NC_017992	T	6	6	83532	83537	0 %	100 %	0 %	0 %	390933213
1604	NC_017992	AGTA	2	8	83547	83554	50 %	25 %	25 %	0 %	390933213
1605	NC_017992	CGA	2	6	83580	83585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390933213
1606	NC_017992	CCTT	2	8	83609	83616	0 %	50 %	0 %	50 %	390933213
1607	NC_017992	T	7	7	83615	83621	0 %	100 %	0 %	0 %	390933213
1608	NC_017992	AGC	2	6	83716	83721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390933213
1609	NC_017992	ATC	2	6	83726	83731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933213
1610	NC_017992	CAC	2	6	83789	83794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390933214
1611	NC_017992	T	6	6	83799	83804	0 %	100 %	0 %	0 %	390933214
1612	NC_017992	T	7	7	83810	83816	0 %	100 %	0 %	0 %	390933214
1613	NC_017992	CAAAT	2	10	83825	83834	60 %	20 %	0 %	20 %	390933214
1614	NC_017992	TAT	3	9	83846	83854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390933214
1615	NC_017992	CT	3	6	83875	83880	0 %	50 %	0 %	50 %	390933214
1616	NC_017992	TCA	2	6	83940	83945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933214
1617	NC_017992	CA	3	6	83989	83994	50 %	0 %	0 %	50 %	390933214
1618	NC_017992	TCA	2	6	83998	84003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933214
1619	NC_017992	TGC	2	6	84180	84185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390933215
1620	NC_017992	AT	3	6	84239	84244	50 %	50 %	0 %	0 %	390933215
1621	NC_017992	CAT	2	6	84277	84282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933215
1622	NC_017992	TCC	2	6	84334	84339	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390933215
1623	NC_017992	GAT	2	6	84345	84350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390933215
1624	NC_017992	TG	3	6	84401	84406	0 %	50 %	50 %	0 %	390933215
1625	NC_017992	GCA	2	6	84470	84475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390933215
1626	NC_017992	CTC	2	6	84481	84486	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390933215
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