MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermoanaerobacterium saccharolyticum JW/SL-YS485 chromosome

Total Repeats: 54815

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017992	ATA	2	6	25867	25872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390933160
502	NC_017992	T	6	6	25913	25918	0 %	100 %	0 %	0 %	390933160
503	NC_017992	ACA	2	6	25972	25977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390933160
504	NC_017992	GGC	2	6	25999	26004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390933160
505	NC_017992	TAT	2	6	26007	26012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390933160
506	NC_017992	A	6	6	26028	26033	100 %	0 %	0 %	0 %	390933160
507	NC_017992	TCT	2	6	26059	26064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390933160
508	NC_017992	AGCC	2	8	26090	26097	25 %	0 %	25 %	50 %	390933160
509	NC_017992	GCA	2	6	26107	26112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390933160
510	NC_017992	T	6	6	26296	26301	0 %	100 %	0 %	0 %	390933160
511	NC_017992	ACC	2	6	26367	26372	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390933160
512	NC_017992	TCA	2	6	26393	26398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933160
513	NC_017992	TTA	2	6	26474	26479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390933160
514	NC_017992	CCA	2	6	26504	26509	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390933160
515	NC_017992	TCA	2	6	26521	26526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933160
516	NC_017992	GATT	2	8	26528	26535	25 %	50 %	25 %	0 %	390933160
517	NC_017992	CAT	2	6	26546	26551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933160
518	NC_017992	TCG	2	6	26560	26565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390933160
519	NC_017992	GCA	2	6	26570	26575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390933160
520	NC_017992	GTC	2	6	26586	26591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390933160
521	NC_017992	TC	3	6	26593	26598	0 %	50 %	0 %	50 %	390933160
522	NC_017992	CTT	2	6	26770	26775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390933160
523	NC_017992	ATG	2	6	26788	26793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390933160
524	NC_017992	AACC	2	8	26856	26863	50 %	0 %	0 %	50 %	390933160
525	NC_017992	TCC	2	6	26901	26906	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390933160
526	NC_017992	TC	3	6	26991	26996	0 %	50 %	0 %	50 %	390933160
527	NC_017992	GCA	2	6	27055	27060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390933160
528	NC_017992	GCA	2	6	27107	27112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390933160
529	NC_017992	ATCT	2	8	27222	27229	25 %	50 %	0 %	25 %	390933160
530	NC_017992	CCA	2	6	27266	27271	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390933160
531	NC_017992	T	6	6	27287	27292	0 %	100 %	0 %	0 %	390933160
532	NC_017992	CTC	2	6	27350	27355	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390933161
533	NC_017992	AT	3	6	27362	27367	50 %	50 %	0 %	0 %	390933161
534	NC_017992	TCC	2	6	27441	27446	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390933161
535	NC_017992	GCT	2	6	27489	27494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390933161
536	NC_017992	CAA	2	6	27628	27633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390933161
537	NC_017992	ACG	2	6	27643	27648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390933161
538	NC_017992	TC	3	6	27688	27693	0 %	50 %	0 %	50 %	390933161
539	NC_017992	TA	3	6	27727	27732	50 %	50 %	0 %	0 %	390933161
540	NC_017992	ACT	2	6	27750	27755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933161
541	NC_017992	TGC	2	6	27764	27769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390933161
542	NC_017992	ATATCT	2	12	27888	27899	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	390933161
543	NC_017992	CTT	2	6	27904	27909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390933161
544	NC_017992	T	6	6	27915	27920	0 %	100 %	0 %	0 %	390933161
545	NC_017992	ATG	2	6	27921	27926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390933161
546	NC_017992	T	6	6	28079	28084	0 %	100 %	0 %	0 %	390933161
547	NC_017992	CAT	2	6	28219	28224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933161
548	NC_017992	ACA	2	6	28227	28232	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390933161
549	NC_017992	T	6	6	28375	28380	0 %	100 %	0 %	0 %	390933161
550	NC_017992	ACA	2	6	28395	28400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390933161
551	NC_017992	TGTT	2	8	28406	28413	0 %	75 %	25 %	0 %	390933161
552	NC_017992	TC	3	6	28419	28424	0 %	50 %	0 %	50 %	390933161
553	NC_017992	CGA	2	6	28435	28440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390933161
554	NC_017992	T	6	6	28460	28465	0 %	100 %	0 %	0 %	390933161
555	NC_017992	CAT	2	6	28612	28617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933162
556	NC_017992	TCA	2	6	28618	28623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933162
557	NC_017992	TGTATG	2	12	28629	28640	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	390933162
558	NC_017992	AGA	2	6	28752	28757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390933162
559	NC_017992	GT	3	6	28811	28816	0 %	50 %	50 %	0 %	390933162
560	NC_017992	TTC	2	6	28868	28873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390933162
561	NC_017992	TGAC	2	8	28918	28925	25 %	25 %	25 %	25 %	390933162
562	NC_017992	AC	3	6	28924	28929	50 %	0 %	0 %	50 %	390933162
563	NC_017992	TTA	2	6	29011	29016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390933162
564	NC_017992	TTCA	2	8	29159	29166	25 %	50 %	0 %	25 %	390933162
565	NC_017992	TAT	2	6	29236	29241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390933162
566	NC_017992	ATA	2	6	29285	29290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390933162
567	NC_017992	ATCAC	2	10	29313	29322	40 %	20 %	0 %	40 %	390933162
568	NC_017992	TCA	2	6	29379	29384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933162
569	NC_017992	ATT	2	6	29479	29484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390933163
570	NC_017992	TCC	2	6	29493	29498	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390933163
571	NC_017992	TTC	2	6	29524	29529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390933163
572	NC_017992	TAA	2	6	29555	29560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390933163
573	NC_017992	GAT	2	6	29579	29584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390933163
574	NC_017992	CTT	2	6	29636	29641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390933163
575	NC_017992	CTT	2	6	29645	29650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390933163
576	NC_017992	CCA	2	6	29722	29727	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390933163
577	NC_017992	GAT	2	6	29728	29733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390933163
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579	NC_017992	AT	3	6	29936	29941	50 %	50 %	0 %	0 %	390933163
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581	NC_017992	T	6	6	30160	30165	0 %	100 %	0 %	0 %	390933164
582	NC_017992	TCG	2	6	30173	30178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390933164
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584	NC_017992	AAT	2	6	30270	30275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390933164
585	NC_017992	TCA	2	6	30335	30340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933164
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588	NC_017992	ATT	2	6	30413	30418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390933164
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590	NC_017992	GAT	2	6	30446	30451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390933164
591	NC_017992	AGC	2	6	30685	30690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390933164
592	NC_017992	GCAG	2	8	30713	30720	25 %	0 %	50 %	25 %	390933164
593	NC_017992	CAT	2	6	30727	30732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933164
594	NC_017992	CAAAC	2	10	30843	30852	60 %	0 %	0 %	40 %	390933164
595	NC_017992	TAA	2	6	30861	30866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390933164
596	NC_017992	ATG	2	6	30868	30873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390933164
597	NC_017992	TTA	2	6	30939	30944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390933164
598	NC_017992	GGC	2	6	30980	30985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390933164
599	NC_017992	CATA	2	8	30986	30993	50 %	25 %	0 %	25 %	390933164
600	NC_017992	GCA	2	6	30998	31003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390933164
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602	NC_017992	TTTA	2	8	31165	31172	25 %	75 %	0 %	0 %	390933164
603	NC_017992	CGC	2	6	31236	31241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390933164
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606	NC_017992	GCCA	2	8	31727	31734	25 %	0 %	25 %	50 %	390933165
607	NC_017992	T	6	6	31768	31773	0 %	100 %	0 %	0 %	390933165
608	NC_017992	CTT	2	6	31780	31785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390933165
609	NC_017992	ATCA	2	8	31835	31842	50 %	25 %	0 %	25 %	390933165
610	NC_017992	T	6	6	31845	31850	0 %	100 %	0 %	0 %	390933165
611	NC_017992	ATC	2	6	31989	31994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933165
612	NC_017992	GTC	2	6	31997	32002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390933165
613	NC_017992	CAT	2	6	32158	32163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933165
614	NC_017992	TC	3	6	32275	32280	0 %	50 %	0 %	50 %	390933165
615	NC_017992	A	6	6	32345	32350	100 %	0 %	0 %	0 %	390933165
616	NC_017992	TTA	2	6	32359	32364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390933165
617	NC_017992	TGC	2	6	32378	32383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390933165
618	NC_017992	TCCT	2	8	32452	32459	0 %	50 %	0 %	50 %	390933165
619	NC_017992	ATG	2	6	32505	32510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390933165
620	NC_017992	ACT	2	6	32685	32690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933166
621	NC_017992	CTC	2	6	32720	32725	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390933166
622	NC_017992	ATT	2	6	32741	32746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390933166
623	NC_017992	AGA	2	6	32810	32815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390933166
624	NC_017992	CTC	2	6	32825	32830	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390933166
625	NC_017992	GCA	2	6	32901	32906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390933166
626	NC_017992	CTTT	2	8	32962	32969	0 %	75 %	0 %	25 %	390933166
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628	NC_017992	TGC	2	6	33008	33013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390933166
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