MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Tistrella mobilis KA081020-065 plasmid pTM2

Total Repeats: 16733

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017966	ATC	2	6	85	90	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389879424
2	NC_017966	CGGAT	2	10	114	123	20 %	20 %	40 %	20 %	389879424
3	NC_017966	CAT	2	6	157	162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389879424
4	NC_017966	GGT	2	6	195	200	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389879424
5	NC_017966	GTCG	2	8	228	235	0 %	25 %	50 %	25 %	389879424
6	NC_017966	GTG	3	9	244	252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389879424
7	NC_017966	GCG	2	6	269	274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389879424
8	NC_017966	CTT	2	6	279	284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389879424
9	NC_017966	TCT	2	6	299	304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389879424
10	NC_017966	GAA	2	6	342	347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389879424
11	NC_017966	CGG	2	6	365	370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389879424
12	NC_017966	CTG	2	6	391	396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389879424
13	NC_017966	GGC	2	6	397	402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389879424
14	NC_017966	G	6	6	409	414	0 %	0 %	100 %	0 %	389879424
15	NC_017966	GGC	2	6	528	533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389879424
16	NC_017966	CGA	2	6	555	560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389879424
17	NC_017966	CTG	2	6	619	624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389879424
18	NC_017966	GCCG	2	8	628	635	0 %	0 %	50 %	50 %	389879424
19	NC_017966	GCC	2	6	682	687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389879424
20	NC_017966	CGCGGC	2	12	748	759	0 %	0 %	50 %	50 %	389879424
21	NC_017966	ACCG	2	8	856	863	25 %	0 %	25 %	50 %	389879424
22	NC_017966	TGC	2	6	872	877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389879424
23	NC_017966	TGC	2	6	892	897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389879424
24	NC_017966	GCT	2	6	939	944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389879424
25	NC_017966	TGG	2	6	1031	1036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389879424
26	NC_017966	TGC	2	6	1157	1162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389879424
27	NC_017966	CGG	2	6	1234	1239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389879425
28	NC_017966	CAC	2	6	1252	1257	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389879425
29	NC_017966	ACC	2	6	1295	1300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389879425
30	NC_017966	CGA	2	6	1394	1399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389879425
31	NC_017966	CGG	2	6	1422	1427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389879425
32	NC_017966	GCG	2	6	1433	1438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389879425
33	NC_017966	GCGT	2	8	1476	1483	0 %	25 %	50 %	25 %	389879425
34	NC_017966	CGGTAT	2	12	1545	1556	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	389879425
35	NC_017966	GGC	2	6	1558	1563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389879425
36	NC_017966	CGGC	2	8	1623	1630	0 %	0 %	50 %	50 %	389879425
37	NC_017966	AGC	2	6	1646	1651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389879425
38	NC_017966	CGC	2	6	1653	1658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389879425
39	NC_017966	CG	4	8	1671	1678	0 %	0 %	50 %	50 %	389879425
40	NC_017966	CAG	2	6	1690	1695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389879425
41	NC_017966	CCGG	2	8	1696	1703	0 %	0 %	50 %	50 %	389879425
42	NC_017966	CAG	2	6	1747	1752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389879425
43	NC_017966	CGGC	2	8	1796	1803	0 %	0 %	50 %	50 %	389879425
44	NC_017966	CG	3	6	1818	1823	0 %	0 %	50 %	50 %	389879425
45	NC_017966	CGGC	2	8	1838	1845	0 %	0 %	50 %	50 %	389879425
46	NC_017966	GGC	2	6	1912	1917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389879425
47	NC_017966	GGC	3	9	1921	1929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389879425
48	NC_017966	GAT	2	6	1936	1941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389879425
49	NC_017966	CGG	2	6	1954	1959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389879425
50	NC_017966	CCCAGC	2	12	2012	2023	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	389879425
51	NC_017966	GTC	2	6	2074	2079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389879425
52	NC_017966	GCAT	2	8	2102	2109	25 %	25 %	25 %	25 %	389879425
53	NC_017966	CGG	2	6	2112	2117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389879425
54	NC_017966	AGC	2	6	2153	2158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389879425
55	NC_017966	CCG	2	6	2178	2183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389879425
56	NC_017966	CG	3	6	2228	2233	0 %	0 %	50 %	50 %	389879426
57	NC_017966	TCGC	2	8	2258	2265	0 %	25 %	25 %	50 %	389879426
58	NC_017966	GCA	3	9	2276	2284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389879426
59	NC_017966	GGC	2	6	2334	2339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389879426
60	NC_017966	CCA	2	6	2351	2356	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389879426
61	NC_017966	GGC	2	6	2363	2368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389879426
62	NC_017966	GCC	2	6	2375	2380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389879426
63	NC_017966	GTC	2	6	2450	2455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389879427
64	NC_017966	ATA	2	6	2462	2467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389879427
65	NC_017966	GCGA	2	8	2469	2476	25 %	0 %	50 %	25 %	389879427
66	NC_017966	GATC	2	8	2485	2492	25 %	25 %	25 %	25 %	389879427
67	NC_017966	GCC	2	6	2504	2509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389879427
68	NC_017966	CCGG	2	8	2522	2529	0 %	0 %	50 %	50 %	389879427
69	NC_017966	TGA	2	6	2545	2550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389879427
70	NC_017966	AGC	2	6	2589	2594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389879427
71	NC_017966	CGCA	2	8	2615	2622	25 %	0 %	25 %	50 %	389879427
72	NC_017966	GCT	2	6	2623	2628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389879427
73	NC_017966	CGC	2	6	2644	2649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389879427
74	NC_017966	CCA	2	6	2651	2656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389879427
75	NC_017966	TCG	2	6	2685	2690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389879427
76	NC_017966	GCAGG	2	10	2710	2719	20 %	0 %	60 %	20 %	389879427
77	NC_017966	GCG	2	6	2765	2770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389879427
78	NC_017966	GCCGAA	2	12	2798	2809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389879427
79	NC_017966	GCCG	2	8	2843	2850	0 %	0 %	50 %	50 %	389879427
80	NC_017966	GCC	2	6	2861	2866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389879427
81	NC_017966	GCC	3	9	2871	2879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389879427
82	NC_017966	CGGG	2	8	2884	2891	0 %	0 %	75 %	25 %	389879427
83	NC_017966	CGC	2	6	2903	2908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389879427
84	NC_017966	CGA	2	6	2917	2922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389879427
85	NC_017966	GCC	3	9	2931	2939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389879427
86	NC_017966	GCCG	2	8	2971	2978	0 %	0 %	50 %	50 %	389879427
87	NC_017966	CGGCC	2	10	2980	2989	0 %	0 %	40 %	60 %	389879427
88	NC_017966	GATCC	2	10	3004	3013	20 %	20 %	20 %	40 %	389879427
89	NC_017966	CGC	2	6	3014	3019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389879427
90	NC_017966	GCA	2	6	3151	3156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389879427
91	NC_017966	GCG	2	6	3165	3170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389879427
92	NC_017966	GCC	2	6	3222	3227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389879427
93	NC_017966	CGT	2	6	3286	3291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389879427
94	NC_017966	CGG	2	6	3292	3297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389879427
95	NC_017966	GCA	2	6	3310	3315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389879427
96	NC_017966	GGC	3	9	3326	3334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389879427
97	NC_017966	CTG	2	6	3359	3364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389879427
98	NC_017966	TCGTC	2	10	3388	3397	0 %	40 %	20 %	40 %	389879427
99	NC_017966	CAG	2	6	3446	3451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389879427
100	NC_017966	GGA	2	6	3541	3546	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389879427
101	NC_017966	GTC	2	6	3560	3565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389879427
102	NC_017966	GCC	3	9	3593	3601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389879427
103	NC_017966	CAG	2	6	3608	3613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389879427
104	NC_017966	G	6	6	3616	3621	0 %	0 %	100 %	0 %	389879427
105	NC_017966	GCG	2	6	3636	3641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389879427
106	NC_017966	GCG	2	6	3644	3649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389879427
107	NC_017966	CGG	2	6	3743	3748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389879428
108	NC_017966	GTG	2	6	3794	3799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389879428
109	NC_017966	GGC	2	6	3829	3834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389879428
110	NC_017966	GAT	2	6	3882	3887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389879428
111	NC_017966	AGG	2	6	3899	3904	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389879428
112	NC_017966	AG	3	6	3913	3918	50 %	0 %	50 %	0 %	389879428
113	NC_017966	ACG	2	6	3919	3924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389879428
114	NC_017966	CCCG	2	8	3937	3944	0 %	0 %	25 %	75 %	389879428
115	NC_017966	CGA	2	6	3983	3988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389879428
116	NC_017966	CCG	2	6	4156	4161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389879428
117	NC_017966	CGC	2	6	4175	4180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389879428
118	NC_017966	CAG	2	6	4272	4277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389879428
119	NC_017966	CAC	2	6	4284	4289	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389879428
120	NC_017966	GGC	2	6	4353	4358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389879428
121	NC_017966	CGC	4	12	4401	4412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389879428
122	NC_017966	CGG	2	6	4425	4430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389879428
123	NC_017966	CGC	3	9	4445	4453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389879428
124	NC_017966	CGC	2	6	4511	4516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389879428
125	NC_017966	TCA	2	6	4520	4525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389879428
126	NC_017966	GCC	2	6	4543	4548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389879428
127	NC_017966	GCC	2	6	4587	4592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389879428
128	NC_017966	CG	3	6	4596	4601	0 %	0 %	50 %	50 %	389879428
129	NC_017966	GTC	2	6	4608	4613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389879428
130	NC_017966	GCA	2	6	4727	4732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389879428
131	NC_017966	GGC	2	6	4734	4739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389879428
132	NC_017966	GCG	2	6	4786	4791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389879428
133	NC_017966	CGC	2	6	4805	4810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389879428
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254	NC_017966	ATC	2	6	9921	9926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389879434
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258	NC_017966	CGC	2	6	10000	10005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389879434
259	NC_017966	GCA	2	6	10015	10020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389879434
260	NC_017966	CCA	2	6	10025	10030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389879434
261	NC_017966	TGC	2	6	10084	10089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389879434
262	NC_017966	GCA	2	6	10105	10110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389879434
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264	NC_017966	CGCC	2	8	10300	10307	0 %	0 %	25 %	75 %	389879434
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