MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Tistrella mobilis KA081020-065 plasmid pTM3

Total Repeats: 27227

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017958	CGG	2	6	31	36	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389874237
2	NC_017958	CGG	2	6	226	231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389874237
3	NC_017958	AAC	2	6	233	238	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389874237
4	NC_017958	GGC	2	6	327	332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389874237
5	NC_017958	CGG	2	6	333	338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389874237
6	NC_017958	GCC	3	9	344	352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389874237
7	NC_017958	TCC	2	6	375	380	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389874237
8	NC_017958	TCG	2	6	422	427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389874237
9	NC_017958	TGGT	2	8	490	497	0 %	50 %	50 %	0 %	389874237
10	NC_017958	CCCA	2	8	505	512	25 %	0 %	0 %	75 %	389874237
11	NC_017958	GCCGC	2	10	570	579	0 %	0 %	40 %	60 %	389874237
12	NC_017958	ACA	2	6	590	595	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389874237
13	NC_017958	CGG	2	6	602	607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389874237
14	NC_017958	CGG	2	6	634	639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389874237
15	NC_017958	CGC	2	6	681	686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389874237
16	NC_017958	CCGCG	2	10	699	708	0 %	0 %	40 %	60 %	389874237
17	NC_017958	GAA	2	6	732	737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389874237
18	NC_017958	GCCGC	2	10	830	839	0 %	0 %	40 %	60 %	389874237
19	NC_017958	GGA	2	6	894	899	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389874237
20	NC_017958	GATGCC	2	12	915	926	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	389874237
21	NC_017958	CGTGC	2	10	1008	1017	0 %	20 %	40 %	40 %	389874237
22	NC_017958	GTG	2	6	1069	1074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389874237
23	NC_017958	CGCC	2	8	1092	1099	0 %	0 %	25 %	75 %	389874237
24	NC_017958	GCA	2	6	1140	1145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389874237
25	NC_017958	GC	3	6	1190	1195	0 %	0 %	50 %	50 %	389874237
26	NC_017958	GCA	2	6	1230	1235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389874237
27	NC_017958	TGC	2	6	1241	1246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389874237
28	NC_017958	GCC	2	6	1285	1290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389874237
29	NC_017958	TGG	2	6	1319	1324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389874237
30	NC_017958	GC	3	6	1356	1361	0 %	0 %	50 %	50 %	389874237
31	NC_017958	GCA	2	6	1392	1397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389874237
32	NC_017958	CCG	2	6	1447	1452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389874237
33	NC_017958	ACG	2	6	1472	1477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389874237
34	NC_017958	GCA	2	6	1525	1530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389874238
35	NC_017958	GCCA	2	8	1550	1557	25 %	0 %	25 %	50 %	389874238
36	NC_017958	CTG	2	6	1568	1573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389874238
37	NC_017958	CTG	2	6	1622	1627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389874238
38	NC_017958	CCG	2	6	1638	1643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389874238
39	NC_017958	CCA	2	6	1762	1767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389874238
40	NC_017958	CGT	2	6	1795	1800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389874238
41	NC_017958	CTT	2	6	1888	1893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389874238
42	NC_017958	CCA	2	6	1896	1901	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389874238
43	NC_017958	GGC	2	6	2027	2032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389874238
44	NC_017958	GC	3	6	2031	2036	0 %	0 %	50 %	50 %	389874238
45	NC_017958	CAC	2	6	2086	2091	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389874238
46	NC_017958	ACC	2	6	2141	2146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389874238
47	NC_017958	GCT	2	6	2149	2154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389874238
48	NC_017958	CACC	2	8	2164	2171	25 %	0 %	0 %	75 %	389874238
49	NC_017958	GGC	2	6	2205	2210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389874238
50	NC_017958	CCG	2	6	2223	2228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389874238
51	NC_017958	CAA	2	6	2230	2235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389874238
52	NC_017958	AGG	2	6	2259	2264	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389874238
53	NC_017958	CCA	2	6	2265	2270	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389874238
54	NC_017958	ACC	2	6	2276	2281	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389874238
55	NC_017958	CGA	2	6	2529	2534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389874239
56	NC_017958	CGG	2	6	2682	2687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389874239
57	NC_017958	CGG	2	6	2727	2732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389874239
58	NC_017958	GTC	2	6	2737	2742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389874239
59	NC_017958	GCC	2	6	2757	2762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389874239
60	NC_017958	CGC	2	6	2934	2939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389874239
61	NC_017958	TCG	2	6	3083	3088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389874239
62	NC_017958	CCCA	2	8	3098	3105	25 %	0 %	0 %	75 %	389874239
63	NC_017958	CGG	2	6	3155	3160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389874239
64	NC_017958	CCT	2	6	3177	3182	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389874239
65	NC_017958	GCC	2	6	3217	3222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389874239
66	NC_017958	CAG	2	6	3280	3285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389874239
67	NC_017958	GCG	2	6	3311	3316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389874239
68	NC_017958	CG	3	6	3370	3375	0 %	0 %	50 %	50 %	389874239
69	NC_017958	GC	3	6	3396	3401	0 %	0 %	50 %	50 %	389874239
70	NC_017958	CG	3	6	3477	3482	0 %	0 %	50 %	50 %	389874239
71	NC_017958	CGAG	2	8	3528	3535	25 %	0 %	50 %	25 %	389874239
72	NC_017958	CTG	2	6	3558	3563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389874239
73	NC_017958	GAA	2	6	4353	4358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389874240
74	NC_017958	CGG	2	6	4367	4372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389874240
75	NC_017958	AAG	2	6	4396	4401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389874240
76	NC_017958	CTG	2	6	4546	4551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389874240
77	NC_017958	TCGG	2	8	4568	4575	0 %	25 %	50 %	25 %	389874240
78	NC_017958	GCA	2	6	4593	4598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389874240
79	NC_017958	CTGG	2	8	4698	4705	0 %	25 %	50 %	25 %	389874240
80	NC_017958	AGG	2	6	4714	4719	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389874240
81	NC_017958	GAA	2	6	4725	4730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389874240
82	NC_017958	GCGA	2	8	4733	4740	25 %	0 %	50 %	25 %	389874240
83	NC_017958	TGC	2	6	6448	6453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389874241
84	NC_017958	CCG	2	6	6484	6489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389874241
85	NC_017958	CAC	2	6	6512	6517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389874241
86	NC_017958	CGA	2	6	6580	6585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389874241
87	NC_017958	CAT	2	6	6593	6598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389874241
88	NC_017958	CGA	2	6	6605	6610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389874241
89	NC_017958	CTT	2	6	6613	6618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389874241
90	NC_017958	AGC	2	6	6651	6656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389874241
91	NC_017958	GTTC	2	8	6724	6731	0 %	50 %	25 %	25 %	389874241
92	NC_017958	CTTG	2	8	6739	6746	0 %	50 %	25 %	25 %	389874241
93	NC_017958	AAG	2	6	6752	6757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389874241
94	NC_017958	CCG	2	6	6832	6837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389874241
95	NC_017958	GA	3	6	6906	6911	50 %	0 %	50 %	0 %	389874241
96	NC_017958	CG	3	6	6935	6940	0 %	0 %	50 %	50 %	389874241
97	NC_017958	CGG	2	6	7071	7076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389874241
98	NC_017958	GCC	2	6	7092	7097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389874241
99	NC_017958	GCGGTC	2	12	7124	7135	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	389874241
100	NC_017958	CG	3	6	7175	7180	0 %	0 %	50 %	50 %	389874241
101	NC_017958	G	6	6	7187	7192	0 %	0 %	100 %	0 %	389874241
102	NC_017958	GCC	2	6	7215	7220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389874241
103	NC_017958	CTC	2	6	7235	7240	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389874241
104	NC_017958	GAC	2	6	7247	7252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389874241
105	NC_017958	CCG	2	6	7515	7520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389874242
106	NC_017958	AGC	2	6	7533	7538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389874242
107	NC_017958	GCGA	2	8	7547	7554	25 %	0 %	50 %	25 %	389874242
108	NC_017958	TCG	2	6	7591	7596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389874242
109	NC_017958	GC	3	6	7626	7631	0 %	0 %	50 %	50 %	389874242
110	NC_017958	TGA	2	6	8019	8024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389874243
111	NC_017958	TGCC	2	8	8040	8047	0 %	25 %	25 %	50 %	389874243
112	NC_017958	AGC	2	6	8053	8058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389874243
113	NC_017958	ACCGAT	2	12	8076	8087	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	389874243
114	NC_017958	GCA	2	6	8090	8095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389874243
115	NC_017958	CAG	2	6	8137	8142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389874243
116	NC_017958	CGA	2	6	8184	8189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389874243
117	NC_017958	ACG	2	6	8216	8221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389874243
118	NC_017958	CCA	2	6	8334	8339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389874243
119	NC_017958	CCCA	2	8	8345	8352	25 %	0 %	0 %	75 %	389874243
120	NC_017958	GATG	2	8	8391	8398	25 %	25 %	50 %	0 %	389874243
121	NC_017958	CGT	2	6	8412	8417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389874243
122	NC_017958	CGA	2	6	8517	8522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389874243
123	NC_017958	CA	4	8	8524	8531	50 %	0 %	0 %	50 %	389874243
124	NC_017958	GCG	2	6	8719	8724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389874243
125	NC_017958	TCG	2	6	8730	8735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389874243
126	NC_017958	TCG	2	6	8744	8749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389874243
127	NC_017958	CGC	3	9	8788	8796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389874243
128	NC_017958	GAG	2	6	8901	8906	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389874244
129	NC_017958	TGA	2	6	8959	8964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389874244
130	NC_017958	GCG	2	6	9060	9065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389874244
131	NC_017958	TGG	2	6	9106	9111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389874244
132	NC_017958	CGGC	2	8	9136	9143	0 %	0 %	50 %	50 %	389874244
133	NC_017958	GCG	2	6	9174	9179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389874244
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260	NC_017958	AGCC	2	8	16277	16284	25 %	0 %	25 %	50 %	389874249
261	NC_017958	GC	3	6	16322	16327	0 %	0 %	50 %	50 %	389874249
262	NC_017958	GC	3	6	16330	16335	0 %	0 %	50 %	50 %	389874249
263	NC_017958	CG	3	6	16338	16343	0 %	0 %	50 %	50 %	389874249
264	NC_017958	CGACAG	2	12	16462	16473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389874249
265	NC_017958	CCG	2	6	16495	16500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389874249
266	NC_017958	CG	3	6	16505	16510	0 %	0 %	50 %	50 %	389874249
267	NC_017958	CGTG	2	8	16549	16556	0 %	25 %	50 %	25 %	389874249
268	NC_017958	GAT	2	6	16583	16588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389874249
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270	NC_017958	GTG	2	6	17010	17015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389874250
271	NC_017958	CTGC	2	8	17022	17029	0 %	25 %	25 %	50 %	389874250
272	NC_017958	GCG	2	6	17040	17045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389874250
273	NC_017958	TCG	2	6	17059	17064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389874250
274	NC_017958	TGG	2	6	17121	17126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389874250
275	NC_017958	TGGCT	2	10	17161	17170	0 %	40 %	40 %	20 %	389874250
276	NC_017958	GCA	2	6	17434	17439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389874250
277	NC_017958	GTCT	2	8	17554	17561	0 %	50 %	25 %	25 %	389874250
278	NC_017958	AGA	2	6	17618	17623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389874250
279	NC_017958	GCA	2	6	17659	17664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389874250
280	NC_017958	GCG	2	6	17667	17672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389874250
281	NC_017958	TCT	2	6	17705	17710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389874250
282	NC_017958	AC	3	6	17726	17731	50 %	0 %	0 %	50 %	389874250
283	NC_017958	GA	3	6	17808	17813	50 %	0 %	50 %	0 %	389874250
284	NC_017958	CGGCA	2	10	17866	17875	20 %	0 %	40 %	40 %	389874250
285	NC_017958	CGG	2	6	17884	17889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389874250
286	NC_017958	TGG	2	6	17936	17941	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389874250
287	NC_017958	AGT	2	6	18007	18012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389874250
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289	NC_017958	TGG	2	6	19032	19037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389874251
290	NC_017958	AGC	2	6	19152	19157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389874251
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292	NC_017958	CTG	2	6	19228	19233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389874251
293	NC_017958	GCG	2	6	19239	19244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389874251
294	NC_017958	TCC	2	6	19262	19267	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389874251
295	NC_017958	CTG	2	6	19282	19287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389874251
296	NC_017958	GCA	2	6	19345	19350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389874252
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298	NC_017958	CG	4	8	19385	19392	0 %	0 %	50 %	50 %	389874252
299	NC_017958	CCG	2	6	19428	19433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389874252
300	NC_017958	CAA	2	6	19460	19465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389874252
301	NC_017958	ACC	2	6	19477	19482	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389874252
302	NC_017958	CGA	2	6	19496	19501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389874252
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320	NC_017958	GCA	2	6	20249	20254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389874253
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323	NC_017958	GCCG	2	8	20325	20332	0 %	0 %	50 %	50 %	389874254
324	NC_017958	CCA	2	6	20336	20341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389874254
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327	NC_017958	CTG	2	6	20479	20484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389874254
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329	NC_017958	TGC	2	6	20507	20512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389874254
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331	NC_017958	TCA	2	6	20579	20584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389874254
332	NC_017958	CCG	2	6	20660	20665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389874254
333	NC_017958	GCC	2	6	20704	20709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389874254
334	NC_017958	CAT	2	6	20799	20804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389874254
335	NC_017958	TCG	2	6	20825	20830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389874254
336	NC_017958	CTG	3	9	20833	20841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389874254
337	NC_017958	GCT	2	6	20874	20879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389874254
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341	NC_017958	GCC	2	6	20959	20964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389874254
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343	NC_017958	TGC	2	6	21026	21031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389874254
344	NC_017958	CAT	2	6	21054	21059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389874254
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346	NC_017958	TTC	2	6	21112	21117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389874254
347	NC_017958	GGCCT	2	10	21124	21133	0 %	20 %	40 %	40 %	389874254
348	NC_017958	GGCG	2	8	21150	21157	0 %	0 %	75 %	25 %	389874254
349	NC_017958	AGC	2	6	21158	21163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389874254
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352	NC_017958	GCG	2	6	21466	21471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389874255
353	NC_017958	GC	3	6	21547	21552	0 %	0 %	50 %	50 %	389874255
354	NC_017958	GC	3	6	21557	21562	0 %	0 %	50 %	50 %	389874255
355	NC_017958	TGC	2	6	21565	21570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389874255
356	NC_017958	TCA	2	6	21664	21669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389874255
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359	NC_017958	GCGCG	2	10	21752	21761	0 %	0 %	60 %	40 %	389874255
360	NC_017958	GTG	2	6	21786	21791	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389874255
361	NC_017958	CAC	2	6	21920	21925	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389874256
362	NC_017958	CTG	2	6	21929	21934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389874256
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367	NC_017958	TGC	2	6	22056	22061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389874256
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369	NC_017958	CCA	2	6	22223	22228	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389874257
370	NC_017958	GCA	2	6	22236	22241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389874257
371	NC_017958	CG	4	8	22254	22261	0 %	0 %	50 %	50 %	389874257
372	NC_017958	CCT	2	6	22307	22312	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389874257
373	NC_017958	CGG	2	6	22314	22319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389874257
374	NC_017958	TCG	2	6	22355	22360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389874257
375	NC_017958	CGC	2	6	22366	22371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389874257
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377	NC_017958	CG	3	6	22468	22473	0 %	0 %	50 %	50 %	389874257
378	NC_017958	GGCT	2	8	22474	22481	0 %	25 %	50 %	25 %	389874257
379	NC_017958	GCT	2	6	22485	22490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389874257
380	NC_017958	GGC	2	6	22491	22496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389874257
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382	NC_017958	CG	3	6	22670	22675	0 %	0 %	50 %	50 %	389874257
383	NC_017958	GGC	2	6	22692	22697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389874257
384	NC_017958	GCT	2	6	22698	22703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389874257
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