MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermogladius cellulolyticus 1633 chromosome

Total Repeats: 26351

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017954	ACG	2	6	108	113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389860325
2	NC_017954	CTC	2	6	132	137	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389860325
3	NC_017954	GTA	2	6	149	154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389860325
4	NC_017954	CAC	3	9	209	217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389860325
5	NC_017954	TCC	2	6	219	224	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389860325
6	NC_017954	TCT	2	6	284	289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389860326
7	NC_017954	AGT	2	6	327	332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389860326
8	NC_017954	GTC	2	6	351	356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389860326
9	NC_017954	TC	3	6	355	360	0 %	50 %	0 %	50 %	389860326
10	NC_017954	GTG	2	6	434	439	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389860326
11	NC_017954	TAT	2	6	459	464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389860326
12	NC_017954	CTGG	2	8	497	504	0 %	25 %	50 %	25 %	389860326
13	NC_017954	TAG	2	6	552	557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389860326
14	NC_017954	ACT	2	6	703	708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389860326
15	NC_017954	ATC	2	6	727	732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389860326
16	NC_017954	GAA	2	6	855	860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389860326
17	NC_017954	TTC	2	6	880	885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389860326
18	NC_017954	TTC	2	6	919	924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389860326
19	NC_017954	CTT	2	6	932	937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389860326
20	NC_017954	CAC	2	6	1035	1040	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389860326
21	NC_017954	CGT	2	6	1049	1054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389860326
22	NC_017954	CTTCCT	2	12	1056	1067	0 %	50 %	0 %	50 %	389860326
23	NC_017954	CGA	2	6	1118	1123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389860326
24	NC_017954	GTGA	2	8	1194	1201	25 %	25 %	50 %	0 %	389860326
25	NC_017954	CGT	2	6	1268	1273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389860326
26	NC_017954	ACC	2	6	1296	1301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389860326
27	NC_017954	GTT	2	6	1326	1331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389860326
28	NC_017954	CTA	2	6	1412	1417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389860326
29	NC_017954	AAT	2	6	1464	1469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389860326
30	NC_017954	CTTC	2	8	1639	1646	0 %	50 %	0 %	50 %	389860326
31	NC_017954	CT	3	6	1701	1706	0 %	50 %	0 %	50 %	389860326
32	NC_017954	TCT	2	6	1742	1747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389860326
33	NC_017954	TC	3	6	1753	1758	0 %	50 %	0 %	50 %	389860326
34	NC_017954	CT	3	6	1816	1821	0 %	50 %	0 %	50 %	389860326
35	NC_017954	CGT	2	6	1826	1831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389860326
36	NC_017954	TGA	2	6	1862	1867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389860326
37	NC_017954	CTC	2	6	1923	1928	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389860326
38	NC_017954	GAT	2	6	1950	1955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389860326
39	NC_017954	TCT	2	6	1967	1972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389860326
40	NC_017954	CT	3	6	2020	2025	0 %	50 %	0 %	50 %	389860326
41	NC_017954	AAG	2	6	2312	2317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389860327
42	NC_017954	CCT	2	6	2341	2346	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389860327
43	NC_017954	CGAC	2	8	2467	2474	25 %	0 %	25 %	50 %	389860327
44	NC_017954	TAG	2	6	2579	2584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389860327
45	NC_017954	TCG	2	6	2628	2633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389860327
46	NC_017954	TGG	2	6	2651	2656	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389860327
47	NC_017954	CAG	2	6	2737	2742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389860327
48	NC_017954	AGA	2	6	3022	3027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389860328
49	NC_017954	TCC	3	9	3094	3102	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389860328
50	NC_017954	GA	4	8	3120	3127	50 %	0 %	50 %	0 %	389860328
51	NC_017954	CTA	2	6	3172	3177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389860328
52	NC_017954	AGT	2	6	3245	3250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389860328
53	NC_017954	CG	3	6	3268	3273	0 %	0 %	50 %	50 %	389860328
54	NC_017954	A	6	6	3311	3316	100 %	0 %	0 %	0 %	389860328
55	NC_017954	CGT	2	6	3323	3328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389860328
56	NC_017954	TCG	2	6	3373	3378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389860328
57	NC_017954	GTT	2	6	3425	3430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389860328
58	NC_017954	CTT	2	6	3471	3476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389860328
59	NC_017954	CTA	2	6	3486	3491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389860328
60	NC_017954	TAC	2	6	3492	3497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389860328
61	NC_017954	CGTT	2	8	3526	3533	0 %	50 %	25 %	25 %	389860328
62	NC_017954	CTC	2	6	3630	3635	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389860328
63	NC_017954	GGCA	2	8	3734	3741	25 %	0 %	50 %	25 %	389860328
64	NC_017954	CAG	2	6	3773	3778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389860328
65	NC_017954	TAC	2	6	3780	3785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389860328
66	NC_017954	ACT	2	6	3937	3942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389860329
67	NC_017954	AAG	2	6	3959	3964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389860329
68	NC_017954	AGT	2	6	3971	3976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389860329
69	NC_017954	CAA	2	6	3985	3990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389860329
70	NC_017954	AGG	2	6	4082	4087	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389860329
71	NC_017954	GAG	2	6	4160	4165	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389860330
72	NC_017954	GTT	2	6	4183	4188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389860330
73	NC_017954	GA	3	6	4199	4204	50 %	0 %	50 %	0 %	389860330
74	NC_017954	CCAG	2	8	4312	4319	25 %	0 %	25 %	50 %	389860330
75	NC_017954	GAC	2	6	4349	4354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389860330
76	NC_017954	GAA	2	6	4372	4377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389860330
77	NC_017954	GCC	2	6	4379	4384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389860330
78	NC_017954	CT	3	6	4393	4398	0 %	50 %	0 %	50 %	389860330
79	NC_017954	ACC	3	9	4726	4734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389860331
80	NC_017954	TCA	2	6	4769	4774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389860331
81	NC_017954	CT	3	6	4798	4803	0 %	50 %	0 %	50 %	389860331
82	NC_017954	TGG	2	6	4853	4858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389860331
83	NC_017954	GTA	3	9	4893	4901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389860331
84	NC_017954	CGG	2	6	4929	4934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389860331
85	NC_017954	AGT	2	6	4958	4963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389860331
86	NC_017954	TC	3	6	4966	4971	0 %	50 %	0 %	50 %	389860331
87	NC_017954	AGG	2	6	4997	5002	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389860331
88	NC_017954	TC	3	6	5021	5026	0 %	50 %	0 %	50 %	389860331
89	NC_017954	TGG	2	6	5073	5078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389860331
90	NC_017954	C	6	6	5129	5134	0 %	0 %	0 %	100 %	389860331
91	NC_017954	CGA	2	6	5282	5287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389860331
92	NC_017954	TCC	2	6	5290	5295	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389860331
93	NC_017954	ACT	2	6	5416	5421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389860331
94	NC_017954	GAA	2	6	5476	5481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389860331
95	NC_017954	GCG	2	6	5482	5487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389860331
96	NC_017954	CT	3	6	5543	5548	0 %	50 %	0 %	50 %	389860331
97	NC_017954	CCT	2	6	5591	5596	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389860331
98	NC_017954	CGC	2	6	5607	5612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389860331
99	NC_017954	AGT	2	6	5618	5623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389860331
100	NC_017954	GTT	2	6	5649	5654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389860331
101	NC_017954	GCCG	2	8	5679	5686	0 %	0 %	50 %	50 %	389860331
102	NC_017954	GCTC	2	8	5726	5733	0 %	25 %	25 %	50 %	389860331
103	NC_017954	AG	3	6	5739	5744	50 %	0 %	50 %	0 %	389860331
104	NC_017954	CTC	2	6	5754	5759	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389860331
105	NC_017954	TCT	2	6	5790	5795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389860331
106	NC_017954	GTG	2	6	5904	5909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389860331
107	NC_017954	CTG	2	6	5924	5929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389860331
108	NC_017954	AGA	3	9	5931	5939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389860331
109	NC_017954	CTT	2	6	5981	5986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389860331
110	NC_017954	CTC	2	6	6060	6065	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389860331
111	NC_017954	GAG	2	6	6086	6091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389860331
112	NC_017954	CTC	2	6	6131	6136	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389860331
113	NC_017954	AGA	2	6	6154	6159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389860332
114	NC_017954	CT	3	6	6218	6223	0 %	50 %	0 %	50 %	389860332
115	NC_017954	CCT	2	6	6229	6234	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389860332
116	NC_017954	TCC	2	6	6239	6244	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389860332
117	NC_017954	GTA	2	6	6256	6261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389860332
118	NC_017954	ACCTT	2	10	6323	6332	20 %	40 %	0 %	40 %	389860332
119	NC_017954	CAT	2	6	6337	6342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389860332
120	NC_017954	T	6	6	6364	6369	0 %	100 %	0 %	0 %	389860332
121	NC_017954	CCT	2	6	6414	6419	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389860332
122	NC_017954	TCG	2	6	6503	6508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389860332
123	NC_017954	TCC	2	6	6572	6577	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389860332
124	NC_017954	GCT	2	6	6585	6590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389860332
125	NC_017954	ATC	2	6	6599	6604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389860332
126	NC_017954	CTA	2	6	6683	6688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389860332
127	NC_017954	CAG	2	6	6690	6695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389860332
128	NC_017954	TACCT	2	10	6703	6712	20 %	40 %	0 %	40 %	389860332
129	NC_017954	CTT	2	6	6714	6719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389860332
130	NC_017954	CTT	2	6	6835	6840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389860332
131	NC_017954	AGACG	2	10	6877	6886	40 %	0 %	40 %	20 %	389860332
132	NC_017954	CTT	2	6	6897	6902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389860332
133	NC_017954	GCG	2	6	7001	7006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389860332
134	NC_017954	CGT	2	6	7038	7043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389860332
135	NC_017954	TTC	2	6	7084	7089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389860332
136	NC_017954	ACT	2	6	7142	7147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389860333
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138	NC_017954	CTC	2	6	7158	7163	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389860333
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140	NC_017954	CTT	2	6	7193	7198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389860333
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142	NC_017954	CCT	2	6	7262	7267	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389860333
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253	NC_017954	CGT	3	9	14266	14274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389860342
254	NC_017954	CTT	2	6	14296	14301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389860342
255	NC_017954	GTC	2	6	14339	14344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389860342
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257	NC_017954	GCGG	2	8	14564	14571	0 %	0 %	75 %	25 %	389860342
258	NC_017954	GCGA	2	8	14588	14595	25 %	0 %	50 %	25 %	389860342
259	NC_017954	A	6	6	14635	14640	100 %	0 %	0 %	0 %	389860342
260	NC_017954	ATT	2	6	14660	14665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389860342
261	NC_017954	C	6	6	14672	14677	0 %	0 %	0 %	100 %	389860342
262	NC_017954	GA	3	6	14686	14691	50 %	0 %	50 %	0 %	389860342
263	NC_017954	GCCCGA	2	12	14701	14712	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	389860342
264	NC_017954	CCT	2	6	14748	14753	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389860342
265	NC_017954	ACC	3	9	14784	14792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389860342
266	NC_017954	AG	4	8	14833	14840	50 %	0 %	50 %	0 %	389860342
267	NC_017954	GCGT	2	8	14856	14863	0 %	25 %	50 %	25 %	389860342
268	NC_017954	AAC	2	6	14872	14877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389860342
269	NC_017954	AACC	2	8	14894	14901	50 %	0 %	0 %	50 %	389860342
270	NC_017954	GAG	3	9	14920	14928	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389860342
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281	NC_017954	TAC	2	6	15496	15501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389860343
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284	NC_017954	AAG	2	6	15758	15763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389860344
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286	NC_017954	GAG	2	6	15935	15940	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389860344
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290	NC_017954	A	6	6	16162	16167	100 %	0 %	0 %	0 %	389860344
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295	NC_017954	GAG	2	6	16325	16330	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389860344
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300	NC_017954	GAG	2	6	16423	16428	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389860344
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303	NC_017954	AGA	2	6	16743	16748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389860344
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321	NC_017954	TA	3	6	17660	17665	50 %	50 %	0 %	0 %	389860345
322	NC_017954	CT	3	6	17697	17702	0 %	50 %	0 %	50 %	389860345
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393	NC_017954	TGT	2	6	21067	21072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389860347
394	NC_017954	CT	4	8	21287	21294	0 %	50 %	0 %	50 %	389860347
395	NC_017954	CTC	2	6	21348	21353	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389860347
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398	NC_017954	TCT	2	6	21657	21662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389860347
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400	NC_017954	TAC	2	6	21837	21842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389860348
401	NC_017954	CT	3	6	21887	21892	0 %	50 %	0 %	50 %	389860348
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