MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus thermophilus JL-18 plasmid pTTJL1802

Total Repeats: 3325

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_017590	GCC	2	6	111832	111837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361835
2502	NC_017590	GC	3	6	111848	111853	0 %	0 %	50 %	50 %	386361835
2503	NC_017590	CTC	2	6	111890	111895	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361835
2504	NC_017590	AGG	2	6	111897	111902	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361835
2505	NC_017590	AGGGTG	2	12	111918	111929	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	386361835
2506	NC_017590	CCTCC	2	10	111980	111989	0 %	20 %	0 %	80 %	386361835
2507	NC_017590	GCC	2	6	112020	112025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361835
2508	NC_017590	C	6	6	112048	112053	0 %	0 %	0 %	100 %	386361835
2509	NC_017590	CCGA	2	8	112067	112074	25 %	0 %	25 %	50 %	386361835
2510	NC_017590	CCA	2	6	112144	112149	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361835
2511	NC_017590	GGA	2	6	112189	112194	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361835
2512	NC_017590	GAGGCG	2	12	112208	112219	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	386361835
2513	NC_017590	CAC	2	6	112286	112291	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361835
2514	NC_017590	GGC	2	6	112292	112297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361835
2515	NC_017590	G	7	7	112333	112339	0 %	0 %	100 %	0 %	386361835
2516	NC_017590	AGG	2	6	112343	112348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361835
2517	NC_017590	CGT	2	6	112349	112354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386361835
2518	NC_017590	GGA	2	6	112387	112392	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361836
2519	NC_017590	CCA	2	6	112405	112410	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361836
2520	NC_017590	GCCCC	2	10	112446	112455	0 %	0 %	20 %	80 %	386361836
2521	NC_017590	GAG	4	12	112493	112504	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361836
2522	NC_017590	GAG	2	6	112545	112550	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361836
2523	NC_017590	CGGG	2	8	112555	112562	0 %	0 %	75 %	25 %	386361836
2524	NC_017590	GGA	2	6	112573	112578	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361836
2525	NC_017590	GCC	2	6	112593	112598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361836
2526	NC_017590	GGA	2	6	112651	112656	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361836
2527	NC_017590	TGG	2	6	112719	112724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361836
2528	NC_017590	CCT	2	6	112771	112776	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361836
2529	NC_017590	CCTT	2	8	112806	112813	0 %	50 %	0 %	50 %	386361836
2530	NC_017590	AGA	2	6	112835	112840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386361836
2531	NC_017590	GAA	2	6	112842	112847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386361836
2532	NC_017590	GCG	2	6	112858	112863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361836
2533	NC_017590	CCT	2	6	112887	112892	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361836
2534	NC_017590	GA	3	6	112898	112903	50 %	0 %	50 %	0 %	386361836
2535	NC_017590	CCT	2	6	112957	112962	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361836
2536	NC_017590	CCG	2	6	112969	112974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361836
2537	NC_017590	TGAGGA	2	12	112983	112994	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	386361836
2538	NC_017590	T	7	7	112998	113004	0 %	100 %	0 %	0 %	386361836
2539	NC_017590	GA	3	6	113043	113048	50 %	0 %	50 %	0 %	386361836
2540	NC_017590	GCGCG	2	10	113107	113116	0 %	0 %	60 %	40 %	386361836
2541	NC_017590	CGGG	2	8	113140	113147	0 %	0 %	75 %	25 %	386361836
2542	NC_017590	CCA	2	6	113159	113164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361836
2543	NC_017590	CCA	2	6	113182	113187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361836
2544	NC_017590	GAG	2	6	113207	113212	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361836
2545	NC_017590	GAG	2	6	113243	113248	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361836
2546	NC_017590	TTG	2	6	113274	113279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386361836
2547	NC_017590	GCG	2	6	113291	113296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361836
2548	NC_017590	GGCGAG	2	12	113300	113311	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	386361836
2549	NC_017590	CTC	3	9	113765	113773	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361837
2550	NC_017590	GAA	2	6	113846	113851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386361837
2551	NC_017590	GGC	2	6	113852	113857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361837
2552	NC_017590	GCG	2	6	113961	113966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361837
2553	NC_017590	CCA	2	6	114004	114009	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361837
2554	NC_017590	TCC	2	6	114066	114071	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361837
2555	NC_017590	CTC	2	6	114074	114079	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361837
2556	NC_017590	GTC	2	6	114122	114127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386361837
2557	NC_017590	CCT	2	6	114136	114141	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361837
2558	NC_017590	CCA	2	6	114187	114192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361837
2559	NC_017590	TGG	2	6	114253	114258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361837
2560	NC_017590	CGC	2	6	114306	114311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361837
2561	NC_017590	GGA	2	6	114325	114330	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361837
2562	NC_017590	CCT	2	6	114943	114948	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361838
2563	NC_017590	GCAG	2	8	114958	114965	25 %	0 %	50 %	25 %	386361838
2564	NC_017590	CCT	2	6	114976	114981	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361838
2565	NC_017590	TCT	2	6	115177	115182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386361839
2566	NC_017590	GCA	2	6	115201	115206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386361839
2567	NC_017590	GGC	2	6	115229	115234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361839
2568	NC_017590	AGG	2	6	115281	115286	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361839
2569	NC_017590	GCC	2	6	115348	115353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361839
2570	NC_017590	CGC	2	6	115397	115402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361839
2571	NC_017590	GC	3	6	115401	115406	0 %	0 %	50 %	50 %	386361839
2572	NC_017590	CAG	2	6	115458	115463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386361839
2573	NC_017590	GTC	2	6	115496	115501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386361839
2574	NC_017590	GAG	2	6	115505	115510	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361839
2575	NC_017590	AGT	2	6	115561	115566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386361839
2576	NC_017590	CGGG	2	8	115679	115686	0 %	0 %	75 %	25 %	386361840
2577	NC_017590	CCA	2	6	115702	115707	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361840
2578	NC_017590	CCA	2	6	115741	115746	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361840
2579	NC_017590	CG	3	6	116557	116562	0 %	0 %	50 %	50 %	386361841
2580	NC_017590	TCC	2	6	116584	116589	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361841
2581	NC_017590	C	6	6	116609	116614	0 %	0 %	0 %	100 %	386361841
2582	NC_017590	CTC	2	6	116649	116654	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361841
2583	NC_017590	CG	3	6	116662	116667	0 %	0 %	50 %	50 %	386361841
2584	NC_017590	GGC	2	6	116721	116726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361841
2585	NC_017590	C	6	6	116754	116759	0 %	0 %	0 %	100 %	386361841
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2587	NC_017590	GCC	2	6	116928	116933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361842
2588	NC_017590	GGC	2	6	116954	116959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361842
2589	NC_017590	CCT	2	6	116962	116967	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361842
2590	NC_017590	C	7	7	117056	117062	0 %	0 %	0 %	100 %	386361842
2591	NC_017590	AGG	2	6	117075	117080	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361842
2592	NC_017590	C	6	6	117360	117365	0 %	0 %	0 %	100 %	386361843
2593	NC_017590	GCG	2	6	117399	117404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361843
2594	NC_017590	TGACC	2	10	117440	117449	20 %	20 %	20 %	40 %	386361843
2595	NC_017590	TGG	2	6	117514	117519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361843
2596	NC_017590	GCC	2	6	117541	117546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361843
2597	NC_017590	CCAC	2	8	117547	117554	25 %	0 %	0 %	75 %	386361843
2598	NC_017590	GGAGG	2	10	117569	117578	20 %	0 %	80 %	0 %	386361843
2599	NC_017590	GGT	2	6	117602	117607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361843
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2601	NC_017590	GGA	2	6	117644	117649	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361843
2602	NC_017590	GTG	2	6	117699	117704	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361843
2603	NC_017590	CCT	2	6	117728	117733	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361843
2604	NC_017590	GTG	4	12	117744	117755	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361843
2605	NC_017590	CGAGG	2	10	117772	117781	20 %	0 %	60 %	20 %	386361843
2606	NC_017590	GCC	2	6	117789	117794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361843
2607	NC_017590	TGG	2	6	117847	117852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361843
2608	NC_017590	GGAGGT	2	12	117902	117913	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	386361843
2609	NC_017590	TCC	2	6	117931	117936	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361843
2610	NC_017590	CTT	2	6	117969	117974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386361843
2611	NC_017590	TGG	3	9	118079	118087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361844
2612	NC_017590	GTG	2	6	118168	118173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361844
2613	NC_017590	GAG	2	6	118195	118200	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361844
2614	NC_017590	GGC	2	6	118241	118246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361844
2615	NC_017590	GGC	2	6	118260	118265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361844
2616	NC_017590	TCT	2	6	118271	118276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386361844
2617	NC_017590	TCC	2	6	118277	118282	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361844
2618	NC_017590	AGG	2	6	118283	118288	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361844
2619	NC_017590	CTGGAC	2	12	118312	118323	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386361844
2620	NC_017590	GTG	2	6	118333	118338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361844
2621	NC_017590	CTT	2	6	118347	118352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386361844
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2623	NC_017590	G	6	6	118525	118530	0 %	0 %	100 %	0 %	386361845
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2747	NC_017590	CGG	2	6	122087	122092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361850
2748	NC_017590	G	6	6	122122	122127	0 %	0 %	100 %	0 %	386361850
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2754	NC_017590	TGG	2	6	122360	122365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361851
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2992	NC_017590	CCA	2	6	131244	131249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361859
2993	NC_017590	GGC	2	6	131296	131301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361859
2994	NC_017590	GGCCT	2	10	131306	131315	0 %	20 %	40 %	40 %	386361859
2995	NC_017590	CGG	2	6	131337	131342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361859
2996	NC_017590	GGC	2	6	131357	131362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361859
2997	NC_017590	CTT	2	6	131388	131393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386361859
2998	NC_017590	TGG	2	6	131396	131401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361859
2999	NC_017590	GCCC	2	8	131403	131410	0 %	0 %	25 %	75 %	386361859
3000	NC_017590	G	8	8	131413	131420	0 %	0 %	100 %	0 %	386361859

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