MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus thermophilus JL-18 plasmid pTTJL1802

Total Repeats: 3325

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017590	AGGG	2	8	48153	48160	25 %	0 %	75 %	0 %	386361778
1002	NC_017590	CCA	2	6	48162	48167	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361778
1003	NC_017590	AGGCCC	2	12	48174	48185	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386361778
1004	NC_017590	AGG	2	6	48225	48230	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361778
1005	NC_017590	CTA	2	6	48274	48279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386361778
1006	NC_017590	TCA	2	6	48288	48293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386361778
1007	NC_017590	CAA	2	6	48301	48306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386361778
1008	NC_017590	TCC	2	6	48361	48366	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361778
1009	NC_017590	TTC	2	6	48417	48422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386361778
1010	NC_017590	TCC	2	6	48437	48442	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361778
1011	NC_017590	C	6	6	48441	48446	0 %	0 %	0 %	100 %	386361778
1012	NC_017590	CGG	2	6	48468	48473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361778
1013	NC_017590	ACT	2	6	48702	48707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386361778
1014	NC_017590	CTC	2	6	48740	48745	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361778
1015	NC_017590	C	6	6	48762	48767	0 %	0 %	0 %	100 %	386361778
1016	NC_017590	CCT	2	6	48772	48777	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361778
1017	NC_017590	CCT	2	6	48850	48855	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361778
1018	NC_017590	CGGGG	2	10	48856	48865	0 %	0 %	80 %	20 %	386361778
1019	NC_017590	G	6	6	48862	48867	0 %	0 %	100 %	0 %	386361778
1020	NC_017590	GTG	2	6	48869	48874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361778
1021	NC_017590	CGGG	2	8	48968	48975	0 %	0 %	75 %	25 %	386361778
1022	NC_017590	TGG	2	6	49098	49103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361778
1023	NC_017590	GGT	2	6	49171	49176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361778
1024	NC_017590	AGG	2	6	49284	49289	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361778
1025	NC_017590	GAG	2	6	49310	49315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361778
1026	NC_017590	C	6	6	49330	49335	0 %	0 %	0 %	100 %	386361778
1027	NC_017590	TCC	2	6	49337	49342	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361778
1028	NC_017590	CTT	2	6	49375	49380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386361778
1029	NC_017590	TGG	2	6	49494	49499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361778
1030	NC_017590	C	6	6	49546	49551	0 %	0 %	0 %	100 %	386361778
1031	NC_017590	C	6	6	49610	49615	0 %	0 %	0 %	100 %	386361778
1032	NC_017590	CTC	2	6	49766	49771	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361778
1033	NC_017590	CAA	2	6	49875	49880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386361779
1034	NC_017590	AGT	2	6	49918	49923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386361779
1035	NC_017590	CCCT	2	8	49948	49955	0 %	25 %	0 %	75 %	386361779
1036	NC_017590	TCC	2	6	49958	49963	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361779
1037	NC_017590	G	6	6	49964	49969	0 %	0 %	100 %	0 %	386361779
1038	NC_017590	CAC	2	6	49998	50003	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361779
1039	NC_017590	GAC	2	6	50026	50031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386361779
1040	NC_017590	CCT	2	6	50045	50050	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361779
1041	NC_017590	G	6	6	50051	50056	0 %	0 %	100 %	0 %	386361779
1042	NC_017590	AGG	2	6	50084	50089	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361779
1043	NC_017590	TGG	3	9	50093	50101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361779
1044	NC_017590	G	6	6	50158	50163	0 %	0 %	100 %	0 %	386361779
1045	NC_017590	GCCC	2	8	50204	50211	0 %	0 %	25 %	75 %	386361779
1046	NC_017590	ACGG	2	8	50245	50252	25 %	0 %	50 %	25 %	386361779
1047	NC_017590	AGG	2	6	50285	50290	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361779
1048	NC_017590	GAAG	2	8	50295	50302	50 %	0 %	50 %	0 %	386361779
1049	NC_017590	CCT	2	6	50304	50309	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361779
1050	NC_017590	GGT	2	6	50313	50318	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361779
1051	NC_017590	G	6	6	50325	50330	0 %	0 %	100 %	0 %	386361779
1052	NC_017590	CTGGCT	2	12	50436	50447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386361779
1053	NC_017590	CAA	2	6	50469	50474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386361779
1054	NC_017590	GTG	2	6	50509	50514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361779
1055	NC_017590	GAG	2	6	50523	50528	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361779
1056	NC_017590	AGG	3	9	50531	50539	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361779
1057	NC_017590	CGGA	2	8	50582	50589	25 %	0 %	50 %	25 %	386361780
1058	NC_017590	GGA	2	6	50614	50619	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361780
1059	NC_017590	GTG	2	6	50627	50632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361780
1060	NC_017590	TAC	2	6	50654	50659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386361780
1061	NC_017590	GGC	2	6	50685	50690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361780
1062	NC_017590	GGC	2	6	50710	50715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361780
1063	NC_017590	GAG	2	6	50735	50740	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361780
1064	NC_017590	GCG	2	6	50807	50812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361781
1065	NC_017590	CAT	2	6	50820	50825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386361781
1066	NC_017590	GCTT	2	8	50863	50870	0 %	50 %	25 %	25 %	386361781
1067	NC_017590	GGA	2	6	50892	50897	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361781
1068	NC_017590	GAG	2	6	50902	50907	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361781
1069	NC_017590	CCT	2	6	50949	50954	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361781
1070	NC_017590	TCGCCC	2	12	51006	51017	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	386361782
1071	NC_017590	TCC	3	9	51018	51026	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361782
1072	NC_017590	AGG	2	6	51105	51110	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361782
1073	NC_017590	TGG	2	6	51111	51116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361782
1074	NC_017590	CCT	2	6	51194	51199	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361782
1075	NC_017590	G	6	6	51210	51215	0 %	0 %	100 %	0 %	386361782
1076	NC_017590	GGT	2	6	51220	51225	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361782
1077	NC_017590	GGT	2	6	51252	51257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361782
1078	NC_017590	CGGA	2	8	51267	51274	25 %	0 %	50 %	25 %	386361782
1079	NC_017590	TTC	2	6	51278	51283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386361782
1080	NC_017590	GGC	2	6	51298	51303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361782
1081	NC_017590	GTG	3	9	51308	51316	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361782
1082	NC_017590	GGT	2	6	51328	51333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361782
1083	NC_017590	GCG	2	6	51409	51414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361783
1084	NC_017590	GGGT	2	8	51440	51447	0 %	25 %	75 %	0 %	386361783
1085	NC_017590	TGG	2	6	51479	51484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361783
1086	NC_017590	GGA	2	6	51505	51510	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361783
1087	NC_017590	GGA	2	6	51532	51537	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361783
1088	NC_017590	GGC	2	6	51556	51561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361783
1089	NC_017590	CGG	2	6	51569	51574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361783
1090	NC_017590	GAG	2	6	51596	51601	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361783
1091	NC_017590	CCT	2	6	51611	51616	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361783
1092	NC_017590	C	6	6	51655	51660	0 %	0 %	0 %	100 %	386361784
1093	NC_017590	AGG	3	9	51682	51690	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361784
1094	NC_017590	TCC	2	6	51718	51723	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361784
1095	NC_017590	CTC	2	6	51793	51798	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361784
1096	NC_017590	TGGAGG	2	12	51802	51813	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	386361784
1097	NC_017590	AGG	2	6	51817	51822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361784
1098	NC_017590	CCCG	2	8	51840	51847	0 %	0 %	25 %	75 %	386361784
1099	NC_017590	GTG	2	6	51873	51878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361784
1100	NC_017590	G	6	6	51888	51893	0 %	0 %	100 %	0 %	386361784
1101	NC_017590	GCG	2	6	51896	51901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361784
1102	NC_017590	TGG	3	9	51919	51927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361784
1103	NC_017590	TCC	2	6	51936	51941	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361784
1104	NC_017590	GGC	2	6	51998	52003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361784
1105	NC_017590	TCC	2	6	52009	52014	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361784
1106	NC_017590	G	6	6	52133	52138	0 %	0 %	100 %	0 %	386361784
1107	NC_017590	GAG	2	6	52161	52166	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361784
1108	NC_017590	GTG	3	9	52224	52232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361784
1109	NC_017590	GGT	2	6	52235	52240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361784
1110	NC_017590	TCC	2	6	52252	52257	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361784
1111	NC_017590	TCC	2	6	52282	52287	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361784
1112	NC_017590	GGC	3	9	52388	52396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361784
1113	NC_017590	TCC	2	6	52438	52443	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361784
1114	NC_017590	CCT	2	6	52451	52456	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361784
1115	NC_017590	GCG	2	6	52509	52514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361784
1116	NC_017590	GGT	2	6	52559	52564	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361784
1117	NC_017590	G	6	6	52636	52641	0 %	0 %	100 %	0 %	386361784
1118	NC_017590	TGG	3	9	52645	52653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361784
1119	NC_017590	CGG	3	9	52654	52662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361784
1120	NC_017590	CGGG	2	8	52670	52677	0 %	0 %	75 %	25 %	386361784
1121	NC_017590	ACT	2	6	52687	52692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386361784
1122	NC_017590	G	6	6	52708	52713	0 %	0 %	100 %	0 %	386361784
1123	NC_017590	CCT	2	6	52753	52758	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361784
1124	NC_017590	C	6	6	52774	52779	0 %	0 %	0 %	100 %	386361784
1125	NC_017590	G	7	7	52791	52797	0 %	0 %	100 %	0 %	386361784
1126	NC_017590	G	6	6	52829	52834	0 %	0 %	100 %	0 %	386361784
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1128	NC_017590	GGC	2	6	52862	52867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361784
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1498	NC_017590	C	6	6	68080	68085	0 %	0 %	0 %	100 %	386361803
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