MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus thermophilus JL-18 plasmid pTTJL1802

Total Repeats: 3325

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017590	TGG	2	6	24565	24570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361750
502	NC_017590	CCA	2	6	24619	24624	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361750
503	NC_017590	ACAA	2	8	24675	24682	75 %	0 %	0 %	25 %	386361750
504	NC_017590	AG	3	6	24734	24739	50 %	0 %	50 %	0 %	386361750
505	NC_017590	TGG	2	6	24856	24861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361751
506	NC_017590	TGG	2	6	24886	24891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361751
507	NC_017590	GCC	2	6	24957	24962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361751
508	NC_017590	CTT	2	6	25013	25018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386361751
509	NC_017590	GCT	2	6	25037	25042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386361751
510	NC_017590	ACG	2	6	25075	25080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386361751
511	NC_017590	CCTTTC	2	12	25165	25176	0 %	50 %	0 %	50 %	386361751
512	NC_017590	CCA	2	6	25201	25206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361751
513	NC_017590	ACC	2	6	25306	25311	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361751
514	NC_017590	TGA	2	6	25333	25338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386361751
515	NC_017590	G	6	6	25359	25364	0 %	0 %	100 %	0 %	386361751
516	NC_017590	AGG	2	6	25408	25413	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361751
517	NC_017590	CTG	2	6	25425	25430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386361751
518	NC_017590	GC	3	6	25431	25436	0 %	0 %	50 %	50 %	386361751
519	NC_017590	GGT	3	9	25463	25471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361751
520	NC_017590	AGG	2	6	25555	25560	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361751
521	NC_017590	AGG	2	6	25591	25596	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361751
522	NC_017590	CTG	2	6	25608	25613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386361751
523	NC_017590	GCTG	2	8	25666	25673	0 %	25 %	50 %	25 %	386361751
524	NC_017590	TGG	2	6	25675	25680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361751
525	NC_017590	GGA	2	6	25703	25708	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361751
526	NC_017590	CAG	2	6	25719	25724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386361751
527	NC_017590	CGG	2	6	25806	25811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361751
528	NC_017590	AGG	2	6	25870	25875	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361751
529	NC_017590	GGT	2	6	25928	25933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361751
530	NC_017590	TCC	2	6	26005	26010	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361751
531	NC_017590	ACC	2	6	26013	26018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361751
532	NC_017590	AGG	2	6	26050	26055	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361751
533	NC_017590	CTT	2	6	26141	26146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386361751
534	NC_017590	TGGCCC	2	12	26185	26196	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386361751
535	NC_017590	TGG	2	6	26335	26340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361751
536	NC_017590	G	6	6	26345	26350	0 %	0 %	100 %	0 %	386361751
537	NC_017590	CCT	2	6	26399	26404	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361751
538	NC_017590	CTG	2	6	26424	26429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386361751
539	NC_017590	AGG	2	6	26681	26686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361752
540	NC_017590	CCT	2	6	26705	26710	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361752
541	NC_017590	AGGA	2	8	26758	26765	50 %	0 %	50 %	0 %	386361752
542	NC_017590	C	7	7	26802	26808	0 %	0 %	0 %	100 %	386361752
543	NC_017590	GCCC	2	8	26838	26845	0 %	0 %	25 %	75 %	386361752
544	NC_017590	GGC	2	6	26865	26870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361752
545	NC_017590	CCT	2	6	26888	26893	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361752
546	NC_017590	GCA	2	6	26897	26902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386361752
547	NC_017590	ACC	2	6	26903	26908	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361752
548	NC_017590	C	6	6	26965	26970	0 %	0 %	0 %	100 %	386361752
549	NC_017590	AGG	2	6	26979	26984	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361752
550	NC_017590	AGG	4	12	26998	27009	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361752
551	NC_017590	AGG	2	6	27046	27051	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361752
552	NC_017590	GGC	2	6	27153	27158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361752
553	NC_017590	GAAA	2	8	27181	27188	75 %	0 %	25 %	0 %	386361752
554	NC_017590	CAC	2	6	27433	27438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361753
555	NC_017590	GA	3	6	27444	27449	50 %	0 %	50 %	0 %	386361753
556	NC_017590	GGA	2	6	27466	27471	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361753
557	NC_017590	AGG	2	6	27495	27500	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361753
558	NC_017590	C	6	6	27526	27531	0 %	0 %	0 %	100 %	386361753
559	NC_017590	AGG	2	6	27540	27545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361753
560	NC_017590	C	6	6	27554	27559	0 %	0 %	0 %	100 %	386361753
561	NC_017590	CCA	2	6	27622	27627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361753
562	NC_017590	G	7	7	27636	27642	0 %	0 %	100 %	0 %	386361753
563	NC_017590	GGA	2	6	27652	27657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361753
564	NC_017590	CCCCCG	2	12	27688	27699	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	386361753
565	NC_017590	GAG	3	9	27713	27721	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361753
566	NC_017590	GAG	2	6	27734	27739	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361753
567	NC_017590	GCCCAG	2	12	27755	27766	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386361753
568	NC_017590	C	6	6	27776	27781	0 %	0 %	0 %	100 %	386361753
569	NC_017590	GAG	2	6	27782	27787	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361753
570	NC_017590	G	6	6	27798	27803	0 %	0 %	100 %	0 %	386361753
571	NC_017590	C	6	6	27840	27845	0 %	0 %	0 %	100 %	386361753
572	NC_017590	GCCC	2	8	27854	27861	0 %	0 %	25 %	75 %	386361753
573	NC_017590	GAAGA	2	10	27899	27908	60 %	0 %	40 %	0 %	386361753
574	NC_017590	C	6	6	27924	27929	0 %	0 %	0 %	100 %	386361753
575	NC_017590	CAGGG	2	10	27938	27947	20 %	0 %	60 %	20 %	386361753
576	NC_017590	GAG	2	6	27971	27976	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361753
577	NC_017590	GAG	2	6	28033	28038	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361753
578	NC_017590	AGG	3	9	28053	28061	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361753
579	NC_017590	G	6	6	28141	28146	0 %	0 %	100 %	0 %	386361753
580	NC_017590	CCT	2	6	28204	28209	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361753
581	NC_017590	AGC	2	6	28262	28267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386361753
582	NC_017590	AGGAAG	2	12	28272	28283	50 %	0 %	50 %	0 %	386361753
583	NC_017590	GGC	2	6	28295	28300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361753
584	NC_017590	GAA	2	6	28309	28314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386361753
585	NC_017590	GAG	2	6	28343	28348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361753
586	NC_017590	GAG	2	6	28373	28378	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361753
587	NC_017590	GGA	2	6	28417	28422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361753
588	NC_017590	CCA	3	9	28519	28527	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361753
589	NC_017590	GAAG	2	8	28549	28556	50 %	0 %	50 %	0 %	386361753
590	NC_017590	GAG	2	6	28559	28564	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361753
591	NC_017590	GAA	2	6	28565	28570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386361753
592	NC_017590	AAG	2	6	28684	28689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386361754
593	NC_017590	GAA	2	6	28776	28781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386361754
594	NC_017590	GCC	2	6	28793	28798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361754
595	NC_017590	TGG	2	6	28939	28944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361754
596	NC_017590	CCATGT	2	12	28967	28978	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386361754
597	NC_017590	GAT	2	6	29021	29026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386361754
598	NC_017590	CATA	2	8	29069	29076	50 %	25 %	0 %	25 %	386361754
599	NC_017590	GTT	2	6	29079	29084	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386361754
600	NC_017590	TTC	2	6	29125	29130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386361754
601	NC_017590	C	6	6	29209	29214	0 %	0 %	0 %	100 %	386361754
602	NC_017590	T	6	6	29281	29286	0 %	100 %	0 %	0 %	386361754
603	NC_017590	GAT	2	6	29376	29381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386361754
604	NC_017590	CCT	2	6	29413	29418	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361754
605	NC_017590	AGA	2	6	29432	29437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386361754
606	NC_017590	CCTT	2	8	29440	29447	0 %	50 %	0 %	50 %	386361754
607	NC_017590	AT	3	6	29464	29469	50 %	50 %	0 %	0 %	386361754
608	NC_017590	CTT	2	6	29654	29659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386361754
609	NC_017590	CCT	2	6	29746	29751	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361754
610	NC_017590	CTTG	2	8	29762	29769	0 %	50 %	25 %	25 %	386361754
611	NC_017590	TAG	2	6	29786	29791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386361754
612	NC_017590	CT	3	6	29877	29882	0 %	50 %	0 %	50 %	386361754
613	NC_017590	CTT	2	6	29963	29968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386361754
614	NC_017590	TCC	2	6	29974	29979	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361754
615	NC_017590	TGC	2	6	30031	30036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386361754
616	NC_017590	CCCGGG	2	12	30375	30386	0 %	0 %	50 %	50 %	386361755
617	NC_017590	AGG	2	6	30425	30430	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361755
618	NC_017590	TCC	2	6	30449	30454	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361755
619	NC_017590	GAG	2	6	30469	30474	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361755
620	NC_017590	CCT	2	6	30483	30488	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361755
621	NC_017590	TCC	2	6	30524	30529	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361755
622	NC_017590	GAG	2	6	30574	30579	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361755
623	NC_017590	AAGGGC	2	12	30592	30603	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	386361755
624	NC_017590	TC	3	6	30614	30619	0 %	50 %	0 %	50 %	386361755
625	NC_017590	GAGG	2	8	30653	30660	25 %	0 %	75 %	0 %	386361755
626	NC_017590	GGA	2	6	30720	30725	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361755
627	NC_017590	AGG	3	9	30806	30814	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361755
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