MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus thermophilus JL-18 plasmid pTTJL1802

Total Repeats: 3325

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017590	GGAG	2	8	133	140	25 %	0 %	75 %	0 %	386361712
2	NC_017590	CAC	2	6	177	182	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361712
3	NC_017590	GGCG	2	8	185	192	0 %	0 %	75 %	25 %	386361712
4	NC_017590	GCC	2	6	202	207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361712
5	NC_017590	TCC	2	6	286	291	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361712
6	NC_017590	CTC	3	9	312	320	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361712
7	NC_017590	GGA	2	6	341	346	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361712
8	NC_017590	GGCCC	2	10	372	381	0 %	0 %	40 %	60 %	386361712
9	NC_017590	AGG	2	6	516	521	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361713
10	NC_017590	AGG	2	6	531	536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361713
11	NC_017590	G	6	6	624	629	0 %	0 %	100 %	0 %	386361713
12	NC_017590	GGT	2	6	682	687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361713
13	NC_017590	CAG	2	6	797	802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386361714
14	NC_017590	GAGG	2	8	808	815	25 %	0 %	75 %	0 %	386361714
15	NC_017590	GCC	2	6	825	830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361714
16	NC_017590	TCT	2	6	831	836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386361714
17	NC_017590	TGG	2	6	843	848	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361714
18	NC_017590	GGGA	2	8	877	884	25 %	0 %	75 %	0 %	386361714
19	NC_017590	GAG	2	6	934	939	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361714
20	NC_017590	CCT	2	6	940	945	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361714
21	NC_017590	CTT	2	6	961	966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386361714
22	NC_017590	C	6	6	967	972	0 %	0 %	0 %	100 %	386361714
23	NC_017590	GAG	2	6	1016	1021	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361714
24	NC_017590	GCC	2	6	1026	1031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361714
25	NC_017590	CAG	2	6	1279	1284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386361715
26	NC_017590	CGG	2	6	1308	1313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361715
27	NC_017590	ACT	2	6	1338	1343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386361715
28	NC_017590	AGG	2	6	1359	1364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361715
29	NC_017590	CCT	2	6	1381	1386	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361715
30	NC_017590	AGG	2	6	1413	1418	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361715
31	NC_017590	CTCCC	2	10	1472	1481	0 %	20 %	0 %	80 %	386361715
32	NC_017590	TGG	2	6	1509	1514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361715
33	NC_017590	G	6	6	1554	1559	0 %	0 %	100 %	0 %	386361715
34	NC_017590	GGA	2	6	1645	1650	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361715
35	NC_017590	GGT	2	6	1681	1686	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361715
36	NC_017590	GGA	2	6	1687	1692	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361715
37	NC_017590	GCGGAG	2	12	1706	1717	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	386361715
38	NC_017590	GAC	2	6	1733	1738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386361715
39	NC_017590	ACC	2	6	1739	1744	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361715
40	NC_017590	GGA	2	6	1762	1767	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361715
41	NC_017590	GAG	3	9	1796	1804	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361715
42	NC_017590	GGA	2	6	1828	1833	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361715
43	NC_017590	CGG	2	6	1856	1861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361715
44	NC_017590	AGG	2	6	1875	1880	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361715
45	NC_017590	GGA	2	6	1915	1920	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361715
46	NC_017590	GAG	2	6	1931	1936	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361715
47	NC_017590	AGG	2	6	1953	1958	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361715
48	NC_017590	GGC	2	6	1984	1989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361715
49	NC_017590	GGCTCA	2	12	2129	2140	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386361716
50	NC_017590	GGC	2	6	2141	2146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361716
51	NC_017590	GGA	2	6	2153	2158	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361716
52	NC_017590	CGG	2	6	2175	2180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361716
53	NC_017590	AGG	2	6	2188	2193	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361716
54	NC_017590	TGA	2	6	2212	2217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386361716
55	NC_017590	GGC	2	6	2222	2227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361716
56	NC_017590	AGG	2	6	2230	2235	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361716
57	NC_017590	GCCC	2	8	2264	2271	0 %	0 %	25 %	75 %	386361716
58	NC_017590	TGGCCC	2	12	2293	2304	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386361716
59	NC_017590	AGG	2	6	2323	2328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361716
60	NC_017590	CGGCA	2	10	2352	2361	20 %	0 %	40 %	40 %	386361716
61	NC_017590	AGG	2	6	2374	2379	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361716
62	NC_017590	GAGG	2	8	2450	2457	25 %	0 %	75 %	0 %	386361716
63	NC_017590	GGA	2	6	2489	2494	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361716
64	NC_017590	CGC	2	6	2495	2500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361716
65	NC_017590	GTGG	2	8	2504	2511	0 %	25 %	75 %	0 %	386361716
66	NC_017590	GAG	2	6	2538	2543	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361716
67	NC_017590	GAG	2	6	2559	2564	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361716
68	NC_017590	CAGGCT	2	12	2630	2641	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386361716
69	NC_017590	GAG	2	6	2663	2668	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361716
70	NC_017590	TGG	2	6	2680	2685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361716
71	NC_017590	TGG	2	6	2743	2748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361716
72	NC_017590	GGT	2	6	2765	2770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361716
73	NC_017590	CCT	2	6	2849	2854	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361716
74	NC_017590	CCT	2	6	2875	2880	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361716
75	NC_017590	GCC	2	6	2899	2904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361716
76	NC_017590	CCT	2	6	2993	2998	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361716
77	NC_017590	AGG	2	6	3018	3023	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361716
78	NC_017590	GCAC	2	8	3276	3283	25 %	0 %	25 %	50 %	386361717
79	NC_017590	C	7	7	3322	3328	0 %	0 %	0 %	100 %	386361717
80	NC_017590	C	6	6	3357	3362	0 %	0 %	0 %	100 %	386361717
81	NC_017590	GCGT	2	8	3364	3371	0 %	25 %	50 %	25 %	386361717
82	NC_017590	CCG	2	6	3469	3474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361717
83	NC_017590	G	6	6	3555	3560	0 %	0 %	100 %	0 %	386361717
84	NC_017590	GGA	2	6	3609	3614	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361717
85	NC_017590	G	7	7	3748	3754	0 %	0 %	100 %	0 %	386361717
86	NC_017590	ACCCC	3	15	3830	3844	20 %	0 %	0 %	80 %	386361717
87	NC_017590	GCC	3	9	3919	3927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361717
88	NC_017590	AGGGG	2	10	3966	3975	20 %	0 %	80 %	0 %	386361717
89	NC_017590	TGCCCC	2	12	3987	3998	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	386361717
90	NC_017590	CCG	2	6	4050	4055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361717
91	NC_017590	TGG	2	6	4364	4369	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361718
92	NC_017590	TGG	2	6	4469	4474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361718
93	NC_017590	AGG	2	6	4475	4480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361718
94	NC_017590	GGTG	2	8	4481	4488	0 %	25 %	75 %	0 %	386361718
95	NC_017590	GGA	2	6	4494	4499	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361718
96	NC_017590	GGT	2	6	4554	4559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361718
97	NC_017590	GC	3	6	4585	4590	0 %	0 %	50 %	50 %	386361718
98	NC_017590	GGT	2	6	4596	4601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361718
99	NC_017590	TGG	2	6	4654	4659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361719
100	NC_017590	CTC	2	6	4692	4697	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361719
101	NC_017590	CCT	2	6	4700	4705	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361719
102	NC_017590	ACT	2	6	4717	4722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386361719
103	NC_017590	GCGG	2	8	4769	4776	0 %	0 %	75 %	25 %	386361719
104	NC_017590	AGG	2	6	4780	4785	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361719
105	NC_017590	AGG	2	6	4798	4803	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361719
106	NC_017590	AGG	2	6	4807	4812	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361719
107	NC_017590	GCT	2	6	4815	4820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386361719
108	NC_017590	AGG	2	6	4822	4827	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361719
109	NC_017590	CTT	2	6	4904	4909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386361720
110	NC_017590	CCT	2	6	4919	4924	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361720
111	NC_017590	GCC	2	6	5001	5006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361720
112	NC_017590	GGC	2	6	5081	5086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361720
113	NC_017590	GGC	2	6	5105	5110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361720
114	NC_017590	GGC	2	6	5123	5128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361720
115	NC_017590	GAT	2	6	5132	5137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386361720
116	NC_017590	CCG	2	6	5326	5331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361721
117	NC_017590	CGG	2	6	5351	5356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361721
118	NC_017590	G	6	6	5383	5388	0 %	0 %	100 %	0 %	386361721
119	NC_017590	GCCGAT	2	12	5420	5431	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386361721
120	NC_017590	GGC	2	6	5593	5598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361721
121	NC_017590	GCC	2	6	5616	5621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361721
122	NC_017590	GCC	2	6	5658	5663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361721
123	NC_017590	TCC	2	6	5702	5707	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361721
124	NC_017590	TGG	2	6	5713	5718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361721
125	NC_017590	CCG	2	6	5866	5871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361721
126	NC_017590	GAG	2	6	5898	5903	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361721
127	NC_017590	AGG	2	6	5907	5912	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361721
128	NC_017590	CAC	2	6	5981	5986	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361721
129	NC_017590	GCC	2	6	6023	6028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361721
130	NC_017590	CCG	2	6	6029	6034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361721
131	NC_017590	CCT	2	6	6062	6067	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361721
132	NC_017590	TTC	2	6	6078	6083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386361721
133	NC_017590	CCG	2	6	6145	6150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361721
134	NC_017590	TGGG	2	8	6165	6172	0 %	25 %	75 %	0 %	386361721
135	NC_017590	CT	3	6	6196	6201	0 %	50 %	0 %	50 %	386361721
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396	NC_017590	GCGAG	2	10	16340	16349	20 %	0 %	60 %	20 %	386361742
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