MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus thermophilus JL-18 plasmid pTTJL1801

Total Repeats: 6043

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_017588	GGT	2	6	164230	164235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361598
3502	NC_017588	G	6	6	164254	164259	0 %	0 %	100 %	0 %	386361598
3503	NC_017588	GGC	2	6	164272	164277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361598
3504	NC_017588	GTGGGG	2	12	164321	164332	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	386361598
3505	NC_017588	TCC	2	6	164346	164351	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361598
3506	NC_017588	TGG	2	6	164358	164363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361598
3507	NC_017588	GCCC	2	8	164386	164393	0 %	0 %	25 %	75 %	386361598
3508	NC_017588	TGG	3	9	164505	164513	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361598
3509	NC_017588	CGG	2	6	164541	164546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361598
3510	NC_017588	G	7	7	164549	164555	0 %	0 %	100 %	0 %	386361598
3511	NC_017588	AGGG	2	8	164576	164583	25 %	0 %	75 %	0 %	386361598
3512	NC_017588	GGA	2	6	164656	164661	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361599
3513	NC_017588	CGG	2	6	164677	164682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361599
3514	NC_017588	ACC	2	6	164709	164714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361599
3515	NC_017588	GAA	2	6	164788	164793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386361599
3516	NC_017588	CCGAGG	2	12	164862	164873	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386361599
3517	NC_017588	AGG	2	6	164898	164903	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361599
3518	NC_017588	CTT	2	6	164941	164946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386361599
3519	NC_017588	CTCC	2	8	164947	164954	0 %	25 %	0 %	75 %	386361599
3520	NC_017588	C	6	6	164997	165002	0 %	0 %	0 %	100 %	386361599
3521	NC_017588	CGG	2	6	165036	165041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361599
3522	NC_017588	CCT	2	6	165055	165060	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361599
3523	NC_017588	GAG	2	6	165107	165112	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361599
3524	NC_017588	AGG	2	6	165144	165149	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361599
3525	NC_017588	GAG	2	6	165155	165160	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361599
3526	NC_017588	CTT	2	6	165223	165228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386361599
3527	NC_017588	CGA	2	6	165232	165237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386361599
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3529	NC_017588	TCA	2	6	165270	165275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386361599
3530	NC_017588	CTC	2	6	165308	165313	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361599
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3532	NC_017588	G	6	6	165396	165401	0 %	0 %	100 %	0 %	386361599
3533	NC_017588	GAG	2	6	165446	165451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361599
3534	NC_017588	CGCC	2	8	165454	165461	0 %	0 %	25 %	75 %	386361599
3535	NC_017588	C	6	6	165528	165533	0 %	0 %	0 %	100 %	386361599
3536	NC_017588	G	6	6	165547	165552	0 %	0 %	100 %	0 %	386361599
3537	NC_017588	G	7	7	165557	165563	0 %	0 %	100 %	0 %	386361599
3538	NC_017588	TCC	2	6	165576	165581	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361599
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3540	NC_017588	GTG	2	6	165620	165625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361599
3541	NC_017588	TCCAGG	2	12	165699	165710	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386361599
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3544	NC_017588	AGG	2	6	165786	165791	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361599
3545	NC_017588	CTC	2	6	165838	165843	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361600
3546	NC_017588	AGG	3	9	165896	165904	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361600
3547	NC_017588	GGAG	2	8	165905	165912	25 %	0 %	75 %	0 %	386361600
3548	NC_017588	TCC	2	6	165941	165946	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361600
3549	NC_017588	CTC	2	6	165961	165966	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361600
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3554	NC_017588	CCT	2	6	166092	166097	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361600
3555	NC_017588	CCT	2	6	166116	166121	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361600
3556	NC_017588	CCA	2	6	166170	166175	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361600
3557	NC_017588	CCT	2	6	166191	166196	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361600
3558	NC_017588	GAG	2	6	166216	166221	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361600
3559	NC_017588	CGC	2	6	166227	166232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361600
3560	NC_017588	GGC	2	6	166398	166403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361600
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3571	NC_017588	GGA	2	6	166742	166747	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361601
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3574	NC_017588	GGT	2	6	166784	166789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361601
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3589	NC_017588	G	7	7	167533	167539	0 %	0 %	100 %	0 %	386361602
3590	NC_017588	GGA	2	6	167565	167570	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361602
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3593	NC_017588	TCA	2	6	167663	167668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386361602
3594	NC_017588	CCT	2	6	167679	167684	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361602
3595	NC_017588	CGC	2	6	167718	167723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361602
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3601	NC_017588	CAC	2	6	167925	167930	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361602
3602	NC_017588	GGT	2	6	167931	167936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361602
3603	NC_017588	GAG	2	6	168057	168062	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361602
3604	NC_017588	ACCCTC	2	12	168113	168124	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	386361603
3605	NC_017588	TCC	2	6	168159	168164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361603
3606	NC_017588	CGC	2	6	168181	168186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361603
3607	NC_017588	GAG	2	6	168227	168232	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361603
3608	NC_017588	CTC	3	9	168245	168253	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361603
3609	NC_017588	ACG	2	6	168270	168275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386361603
3610	NC_017588	TCC	2	6	168306	168311	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361603
3611	NC_017588	C	6	6	168321	168326	0 %	0 %	0 %	100 %	386361603
3612	NC_017588	CCG	2	6	168351	168356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361603
3613	NC_017588	TGG	3	9	168360	168368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361603
3614	NC_017588	CTC	2	6	168395	168400	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361603
3615	NC_017588	GGGCG	2	10	168412	168421	0 %	0 %	80 %	20 %	386361603
3616	NC_017588	G	6	6	168454	168459	0 %	0 %	100 %	0 %	386361603
3617	NC_017588	CAC	2	6	168472	168477	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361603
3618	NC_017588	GGAC	2	8	168480	168487	25 %	0 %	50 %	25 %	386361603
3619	NC_017588	CGCCCC	2	12	168496	168507	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	386361603
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3623	NC_017588	C	6	6	168751	168756	0 %	0 %	0 %	100 %	386361603
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3991	NC_017588	GAG	2	6	184210	184215	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361619
3992	NC_017588	GCC	2	6	184260	184265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361619
3993	NC_017588	TCC	3	9	184289	184297	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361619
3994	NC_017588	AGG	2	6	184298	184303	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361619
3995	NC_017588	CCCAGG	2	12	184328	184339	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386361619
3996	NC_017588	GCC	2	6	184726	184731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361620
3997	NC_017588	TCC	2	6	184732	184737	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361620
3998	NC_017588	GGGGA	2	10	184753	184762	20 %	0 %	80 %	0 %	386361620
3999	NC_017588	AGG	3	9	184792	184800	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361620
4000	NC_017588	CGGA	2	8	184827	184834	25 %	0 %	50 %	25 %	386361620

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