MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus thermophilus JL-18 plasmid pTTJL1801

Total Repeats: 6043

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_017588	CGG	2	6	123508	123513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361558
2502	NC_017588	TGA	2	6	123629	123634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386361559
2503	NC_017588	CCT	2	6	123641	123646	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361559
2504	NC_017588	GGC	2	6	123663	123668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361559
2505	NC_017588	CCCG	3	12	123691	123702	0 %	0 %	25 %	75 %	386361559
2506	NC_017588	GAG	2	6	123783	123788	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361559
2507	NC_017588	CCAGGG	2	12	123818	123829	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386361559
2508	NC_017588	GGC	2	6	123894	123899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361559
2509	NC_017588	C	7	7	123924	123930	0 %	0 %	0 %	100 %	386361559
2510	NC_017588	GCT	2	6	123966	123971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386361559
2511	NC_017588	TCC	2	6	124093	124098	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361559
2512	NC_017588	GCCTCG	2	12	124150	124161	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386361559
2513	NC_017588	CATCCC	2	12	124187	124198	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	386361559
2514	NC_017588	GGC	2	6	124206	124211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361559
2515	NC_017588	GCG	2	6	124228	124233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361559
2516	NC_017588	GCC	2	6	124246	124251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361559
2517	NC_017588	GCC	2	6	124267	124272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361559
2518	NC_017588	TGA	2	6	124277	124282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386361559
2519	NC_017588	CAC	2	6	124284	124289	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361559
2520	NC_017588	GCC	2	6	124301	124306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361559
2521	NC_017588	AGT	2	6	124354	124359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386361560
2522	NC_017588	AAG	2	6	124386	124391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386361560
2523	NC_017588	GAA	2	6	124421	124426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386361560
2524	NC_017588	GCCC	2	8	124442	124449	0 %	0 %	25 %	75 %	386361560
2525	NC_017588	GCT	2	6	124463	124468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386361560
2526	NC_017588	CTC	2	6	124552	124557	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361560
2527	NC_017588	AGG	2	6	124564	124569	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361560
2528	NC_017588	CCCT	2	8	124649	124656	0 %	25 %	0 %	75 %	386361560
2529	NC_017588	GGA	2	6	124669	124674	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361560
2530	NC_017588	AGT	2	6	124681	124686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386361560
2531	NC_017588	C	6	6	124713	124718	0 %	0 %	0 %	100 %	386361560
2532	NC_017588	GGGC	2	8	124730	124737	0 %	0 %	75 %	25 %	386361560
2533	NC_017588	GCGTGG	2	12	124753	124764	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	386361560
2534	NC_017588	AGG	2	6	124914	124919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361560
2535	NC_017588	CTC	2	6	125006	125011	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361560
2536	NC_017588	GAA	2	6	125072	125077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386361560
2537	NC_017588	CCACCC	2	12	125185	125196	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	386361560
2538	NC_017588	TCC	2	6	125256	125261	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361560
2539	NC_017588	CCT	2	6	125323	125328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361560
2540	NC_017588	GCG	2	6	125342	125347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361560
2541	NC_017588	CCT	2	6	125371	125376	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361560
2542	NC_017588	ACC	2	6	125382	125387	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361560
2543	NC_017588	CCA	2	6	125401	125406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361560
2544	NC_017588	ACC	2	6	125409	125414	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361560
2545	NC_017588	CCT	2	6	125491	125496	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361560
2546	NC_017588	GGGCCA	2	12	125503	125514	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386361560
2547	NC_017588	ACCA	2	8	125538	125545	50 %	0 %	0 %	50 %	386361560
2548	NC_017588	CCCTTC	2	12	125550	125561	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361560
2549	NC_017588	TGGCC	2	10	125640	125649	0 %	20 %	40 %	40 %	386361561
2550	NC_017588	CAC	2	6	125656	125661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361561
2551	NC_017588	CTT	2	6	125667	125672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386361561
2552	NC_017588	CCA	2	6	125817	125822	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361561
2553	NC_017588	CTG	2	6	125869	125874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386361561
2554	NC_017588	TCC	2	6	126008	126013	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361561
2555	NC_017588	AGGG	2	8	126081	126088	25 %	0 %	75 %	0 %	386361561
2556	NC_017588	CGC	2	6	126128	126133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361561
2557	NC_017588	AG	3	6	126147	126152	50 %	0 %	50 %	0 %	386361561
2558	NC_017588	AAG	2	6	126157	126162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386361561
2559	NC_017588	GGT	2	6	126163	126168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361561
2560	NC_017588	GCCC	2	8	126172	126179	0 %	0 %	25 %	75 %	386361561
2561	NC_017588	AAG	2	6	126190	126195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386361561
2562	NC_017588	CCA	2	6	126198	126203	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361561
2563	NC_017588	GGC	2	6	126270	126275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361561
2564	NC_017588	ACC	2	6	126292	126297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361562
2565	NC_017588	C	7	7	126296	126302	0 %	0 %	0 %	100 %	386361562
2566	NC_017588	AGG	2	6	126345	126350	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361562
2567	NC_017588	CCA	2	6	126428	126433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361562
2568	NC_017588	TC	3	6	126474	126479	0 %	50 %	0 %	50 %	386361562
2569	NC_017588	AGG	3	9	126529	126537	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361562
2570	NC_017588	CCGG	2	8	126681	126688	0 %	0 %	50 %	50 %	386361562
2571	NC_017588	ACC	2	6	126763	126768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361562
2572	NC_017588	G	6	6	126789	126794	0 %	0 %	100 %	0 %	386361562
2573	NC_017588	CT	3	6	127086	127091	0 %	50 %	0 %	50 %	386361563
2574	NC_017588	AAG	2	6	127182	127187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386361563
2575	NC_017588	CGC	2	6	127345	127350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361563
2576	NC_017588	CTC	3	9	127351	127359	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361563
2577	NC_017588	AGG	3	9	127427	127435	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361563
2578	NC_017588	GCC	2	6	127517	127522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361563
2579	NC_017588	CCA	2	6	127629	127634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361563
2580	NC_017588	C	10	10	127653	127662	0 %	0 %	0 %	100 %	386361563
2581	NC_017588	GCCA	2	8	127673	127680	25 %	0 %	25 %	50 %	386361563
2582	NC_017588	A	6	6	127732	127737	100 %	0 %	0 %	0 %	386361563
2583	NC_017588	TCC	2	6	127771	127776	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361563
2584	NC_017588	AGA	2	6	127799	127804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386361563
2585	NC_017588	AGA	2	6	127816	127821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386361563
2586	NC_017588	A	6	6	127850	127855	100 %	0 %	0 %	0 %	386361563
2587	NC_017588	AAG	2	6	127867	127872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386361563
2588	NC_017588	CAAAG	2	10	127873	127882	60 %	0 %	20 %	20 %	386361563
2589	NC_017588	AAG	2	6	127891	127896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386361563
2590	NC_017588	CGC	2	6	127912	127917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361564
2591	NC_017588	AAG	2	6	128028	128033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386361564
2592	NC_017588	ACC	3	9	128080	128088	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361564
2593	NC_017588	ACC	3	9	128140	128148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361564
2594	NC_017588	GGC	2	6	128235	128240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361564
2595	NC_017588	CCACC	2	10	128303	128312	20 %	0 %	0 %	80 %	386361564
2596	NC_017588	TGC	2	6	128483	128488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386361564
2597	NC_017588	CCG	2	6	128502	128507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361564
2598	NC_017588	GAA	3	9	128513	128521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386361564
2599	NC_017588	C	6	6	128547	128552	0 %	0 %	0 %	100 %	386361564
2600	NC_017588	CCAG	2	8	128599	128606	25 %	0 %	25 %	50 %	386361564
2601	NC_017588	ACCC	2	8	128691	128698	25 %	0 %	0 %	75 %	386361564
2602	NC_017588	TCCC	2	8	128714	128721	0 %	25 %	0 %	75 %	386361564
2603	NC_017588	CAT	2	6	128760	128765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386361564
2604	NC_017588	C	6	6	128830	128835	0 %	0 %	0 %	100 %	386361565
2605	NC_017588	CTT	2	6	128984	128989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386361565
2606	NC_017588	AGG	2	6	129000	129005	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361565
2607	NC_017588	TCC	2	6	129090	129095	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361565
2608	NC_017588	GAGG	2	8	129179	129186	25 %	0 %	75 %	0 %	386361565
2609	NC_017588	GTT	2	6	129266	129271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386361565
2610	NC_017588	CCA	2	6	129496	129501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361565
2611	NC_017588	GAA	2	6	129530	129535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386361565
2612	NC_017588	ATG	2	6	129630	129635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386361565
2613	NC_017588	CCT	2	6	129648	129653	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361565
2614	NC_017588	TCG	2	6	129723	129728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386361565
2615	NC_017588	GCCAAG	2	12	129867	129878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386361565
2616	NC_017588	TCC	2	6	129907	129912	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361565
2617	NC_017588	ATG	2	6	129966	129971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386361566
2618	NC_017588	CTCG	2	8	129983	129990	0 %	25 %	25 %	50 %	386361566
2619	NC_017588	GAA	2	6	130052	130057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386361566
2620	NC_017588	C	6	6	130064	130069	0 %	0 %	0 %	100 %	386361566
2621	NC_017588	GCC	2	6	130104	130109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361566
2622	NC_017588	CTT	2	6	130166	130171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386361566
2623	NC_017588	GCC	2	6	130176	130181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361566
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2735	NC_017588	GGAG	2	8	134532	134539	25 %	0 %	75 %	0 %	386361570
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2992	NC_017588	CTA	2	6	146933	146938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386361581
2993	NC_017588	CCA	2	6	146945	146950	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361581
2994	NC_017588	GGGCC	2	10	146972	146981	0 %	0 %	60 %	40 %	386361581
2995	NC_017588	ACT	2	6	147010	147015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386361581
2996	NC_017588	GC	3	6	147074	147079	0 %	0 %	50 %	50 %	386361581
2997	NC_017588	T	6	6	147094	147099	0 %	100 %	0 %	0 %	386361581
2998	NC_017588	AGG	2	6	147101	147106	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361581
2999	NC_017588	GAA	2	6	147117	147122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386361582
3000	NC_017588	GCG	2	6	147123	147128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361582

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