MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus thermophilus JL-18 plasmid pTTJL1801

Total Repeats: 6043

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017588	CCAGTA	2	12	39062	39073	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386361480
1002	NC_017588	AGG	2	6	39087	39092	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361480
1003	NC_017588	C	6	6	39113	39118	0 %	0 %	0 %	100 %	386361480
1004	NC_017588	GGA	2	6	39124	39129	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361480
1005	NC_017588	CGT	2	6	39133	39138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386361480
1006	NC_017588	TCC	2	6	39159	39164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361480
1007	NC_017588	GGGC	2	8	39182	39189	0 %	0 %	75 %	25 %	386361480
1008	NC_017588	AGG	2	6	39228	39233	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361480
1009	NC_017588	G	6	6	39232	39237	0 %	0 %	100 %	0 %	386361480
1010	NC_017588	CTC	2	6	39252	39257	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361480
1011	NC_017588	C	6	6	39280	39285	0 %	0 %	0 %	100 %	386361480
1012	NC_017588	CCT	2	6	39287	39292	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361480
1013	NC_017588	GCGAAG	2	12	39298	39309	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	386361480
1014	NC_017588	GAG	2	6	39318	39323	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361480
1015	NC_017588	TCCC	2	8	39352	39359	0 %	25 %	0 %	75 %	386361480
1016	NC_017588	CCA	2	6	39422	39427	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361480
1017	NC_017588	GGAAG	2	10	39428	39437	40 %	0 %	60 %	0 %	386361480
1018	NC_017588	CCA	2	6	39467	39472	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361480
1019	NC_017588	CAGGGG	2	12	39522	39533	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	386361480
1020	NC_017588	GGC	2	6	39534	39539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361480
1021	NC_017588	CTC	3	9	39546	39554	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361480
1022	NC_017588	GGAGG	2	10	39575	39584	20 %	0 %	80 %	0 %	386361480
1023	NC_017588	GCG	2	6	39606	39611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361480
1024	NC_017588	G	6	6	39644	39649	0 %	0 %	100 %	0 %	386361480
1025	NC_017588	GCC	3	9	39688	39696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361480
1026	NC_017588	TGG	2	6	39697	39702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361480
1027	NC_017588	G	6	6	39746	39751	0 %	0 %	100 %	0 %	386361480
1028	NC_017588	CCA	2	6	39761	39766	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361480
1029	NC_017588	G	6	6	39837	39842	0 %	0 %	100 %	0 %	386361480
1030	NC_017588	AAAGG	2	10	39849	39858	60 %	0 %	40 %	0 %	386361480
1031	NC_017588	GCCG	2	8	39904	39911	0 %	0 %	50 %	50 %	386361481
1032	NC_017588	GGT	2	6	39928	39933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361481
1033	NC_017588	AG	3	6	39937	39942	50 %	0 %	50 %	0 %	386361481
1034	NC_017588	GGA	2	6	39943	39948	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361481
1035	NC_017588	TCGGCC	2	12	39951	39962	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386361481
1036	NC_017588	GAA	2	6	39986	39991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386361481
1037	NC_017588	CCG	2	6	40028	40033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361481
1038	NC_017588	CCA	2	6	40042	40047	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361481
1039	NC_017588	GGGCG	2	10	40072	40081	0 %	0 %	80 %	20 %	386361481
1040	NC_017588	AGGA	2	8	40092	40099	50 %	0 %	50 %	0 %	386361481
1041	NC_017588	CTC	2	6	40130	40135	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361481
1042	NC_017588	CCT	2	6	40138	40143	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361481
1043	NC_017588	CTC	2	6	40154	40159	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361481
1044	NC_017588	GGA	2	6	40189	40194	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361481
1045	NC_017588	CCA	2	6	40195	40200	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361481
1046	NC_017588	GGC	2	6	40202	40207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361481
1047	NC_017588	CCA	2	6	40252	40257	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361481
1048	NC_017588	CTC	2	6	40263	40268	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361481
1049	NC_017588	CGG	2	6	40293	40298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361481
1050	NC_017588	CCA	2	6	40318	40323	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361481
1051	NC_017588	CCA	2	6	40348	40353	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361481
1052	NC_017588	CCT	2	6	40363	40368	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361481
1053	NC_017588	TCC	2	6	40416	40421	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361481
1054	NC_017588	G	7	7	40430	40436	0 %	0 %	100 %	0 %	386361481
1055	NC_017588	C	6	6	40586	40591	0 %	0 %	0 %	100 %	386361481
1056	NC_017588	GGA	2	6	40618	40623	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361481
1057	NC_017588	GCG	2	6	40677	40682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361481
1058	NC_017588	GAG	2	6	40712	40717	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361481
1059	NC_017588	CTC	2	6	40736	40741	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361481
1060	NC_017588	CATG	2	8	42558	42565	25 %	25 %	25 %	25 %	386361482
1061	NC_017588	CCT	2	6	42589	42594	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361482
1062	NC_017588	CGCC	2	8	42643	42650	0 %	0 %	25 %	75 %	386361482
1063	NC_017588	GAGC	2	8	42661	42668	25 %	0 %	50 %	25 %	386361482
1064	NC_017588	CTT	2	6	42695	42700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386361482
1065	NC_017588	GGCCCT	2	12	42781	42792	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386361482
1066	NC_017588	CGC	2	6	42796	42801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361482
1067	NC_017588	ACC	2	6	42816	42821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361482
1068	NC_017588	TCC	2	6	42897	42902	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361482
1069	NC_017588	GC	3	6	42923	42928	0 %	0 %	50 %	50 %	386361482
1070	NC_017588	TGG	2	6	42954	42959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361482
1071	NC_017588	CCT	2	6	42967	42972	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361482
1072	NC_017588	GCG	2	6	42976	42981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361482
1073	NC_017588	GGC	2	6	43023	43028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361482
1074	NC_017588	ACC	2	6	43107	43112	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361482
1075	NC_017588	CGCC	2	8	43150	43157	0 %	0 %	25 %	75 %	386361482
1076	NC_017588	C	6	6	43180	43185	0 %	0 %	0 %	100 %	386361482
1077	NC_017588	G	6	6	43221	43226	0 %	0 %	100 %	0 %	386361482
1078	NC_017588	GAG	2	6	43241	43246	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361482
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1080	NC_017588	GAG	3	9	43325	43333	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361482
1081	NC_017588	CGCC	2	8	43354	43361	0 %	0 %	25 %	75 %	386361482
1082	NC_017588	GCC	2	6	43367	43372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361482
1083	NC_017588	CCTGG	2	10	43402	43411	0 %	20 %	40 %	40 %	386361482
1084	NC_017588	C	6	6	43447	43452	0 %	0 %	0 %	100 %	386361482
1085	NC_017588	GGA	2	6	43474	43479	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361482
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1088	NC_017588	GAG	2	6	43558	43563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361483
1089	NC_017588	GCC	2	6	43564	43569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361483
1090	NC_017588	CTC	2	6	43609	43614	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361483
1091	NC_017588	CGG	2	6	43631	43636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361483
1092	NC_017588	TCC	2	6	43652	43657	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361483
1093	NC_017588	GGAG	2	8	43658	43665	25 %	0 %	75 %	0 %	386361483
1094	NC_017588	GAG	2	6	43711	43716	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361483
1095	NC_017588	GCC	2	6	43735	43740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361483
1096	NC_017588	GAG	2	6	43795	43800	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361483
1097	NC_017588	GGGC	2	8	43820	43827	0 %	0 %	75 %	25 %	386361483
1098	NC_017588	GAG	2	6	43887	43892	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361483
1099	NC_017588	GCGG	2	8	43920	43927	0 %	0 %	75 %	25 %	386361483
1100	NC_017588	CGC	3	9	43938	43946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361483
1101	NC_017588	CAC	2	6	43957	43962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361483
1102	NC_017588	GAG	2	6	43981	43986	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361483
1103	NC_017588	GGA	2	6	44016	44021	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361483
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1106	NC_017588	C	6	6	44089	44094	0 %	0 %	0 %	100 %	386361483
1107	NC_017588	TCC	2	6	44129	44134	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361483
1108	NC_017588	CCT	2	6	44150	44155	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361483
1109	NC_017588	CCCTT	2	10	44178	44187	0 %	40 %	0 %	60 %	386361483
1110	NC_017588	G	6	6	44213	44218	0 %	0 %	100 %	0 %	386361483
1111	NC_017588	GGA	2	6	44226	44231	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361483
1112	NC_017588	GGA	2	6	44294	44299	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361483
1113	NC_017588	AGG	2	6	44348	44353	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361483
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1116	NC_017588	TGG	2	6	44399	44404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361483
1117	NC_017588	CATGGG	2	12	44412	44423	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386361483
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1122	NC_017588	GCC	2	6	44570	44575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361483
1123	NC_017588	GCC	2	6	44599	44604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361483
1124	NC_017588	CTC	2	6	44605	44610	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361483
1125	NC_017588	GCC	2	6	44641	44646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361483
1126	NC_017588	C	6	6	44645	44650	0 %	0 %	0 %	100 %	386361483
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