MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus thermophilus JL-18 chromosome

Total Repeats: 49109

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3502	NC_017587	TGG	2	6	140711	140716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386359613
3503	NC_017587	CTT	2	6	140743	140748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386359613
3504	NC_017587	CTT	2	6	140755	140760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386359613
3505	NC_017587	TGG	2	6	140972	140977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386359614
3506	NC_017587	GGT	2	6	141039	141044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386359614
3507	NC_017587	CTC	3	9	141067	141075	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359614
3508	NC_017587	TCA	2	6	141092	141097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386359614
3509	NC_017587	GCGGG	2	10	141183	141192	0 %	0 %	80 %	20 %	386359614
3510	NC_017587	TCC	2	6	141266	141271	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359614
3511	NC_017587	GAG	2	6	141280	141285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386359614
3512	NC_017587	GGC	3	9	141300	141308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386359614
3513	NC_017587	ACCCC	2	10	141326	141335	20 %	0 %	0 %	80 %	386359614
3514	NC_017587	TGGG	2	8	141352	141359	0 %	25 %	75 %	0 %	386359614
3515	NC_017587	GGA	2	6	141360	141365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386359614
3516	NC_017587	AGG	2	6	141395	141400	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386359614
3517	NC_017587	CCT	2	6	141494	141499	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359614
3518	NC_017587	GGA	2	6	141531	141536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386359614
3519	NC_017587	GTG	2	6	141550	141555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386359614
3520	NC_017587	CTC	2	6	141632	141637	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359615
3521	NC_017587	GGT	2	6	141667	141672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386359615
3522	NC_017587	GGCCC	2	10	141691	141700	0 %	0 %	40 %	60 %	386359615
3523	NC_017587	AGG	2	6	141813	141818	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386359615
3524	NC_017587	TGA	2	6	141867	141872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386359615
3525	NC_017587	GGA	2	6	141949	141954	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386359615
3526	NC_017587	AG	3	6	141958	141963	50 %	0 %	50 %	0 %	386359615
3527	NC_017587	GGC	2	6	142040	142045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386359615
3528	NC_017587	CGC	2	6	142057	142062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386359615
3529	NC_017587	TGG	2	6	142101	142106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386359615
3530	NC_017587	CGC	2	6	142159	142164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386359615
3531	NC_017587	GCC	2	6	142203	142208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386359615
3532	NC_017587	CGGG	2	8	142232	142239	0 %	0 %	75 %	25 %	386359615
3533	NC_017587	AAG	2	6	142274	142279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386359615
3534	NC_017587	GGA	3	9	142333	142341	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386359615
3535	NC_017587	C	7	7	142447	142453	0 %	0 %	0 %	100 %	386359615
3536	NC_017587	TCC	2	6	142595	142600	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359616
3537	NC_017587	CCT	2	6	142605	142610	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359616
3538	NC_017587	CTC	3	9	142615	142623	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359616
3539	NC_017587	CCT	2	6	142638	142643	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359616
3540	NC_017587	G	6	6	142668	142673	0 %	0 %	100 %	0 %	386359616
3541	NC_017587	TCC	2	6	142688	142693	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359616
3542	NC_017587	CCT	3	9	142761	142769	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359616
3543	NC_017587	GGGGT	2	10	142834	142843	0 %	20 %	80 %	0 %	386359616
3544	NC_017587	TCT	2	6	142850	142855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386359616
3545	NC_017587	CCT	2	6	142878	142883	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359616
3546	NC_017587	TCC	2	6	142886	142891	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359616
3547	NC_017587	GCG	2	6	143004	143009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386359617
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3550	NC_017587	AGGG	2	8	143182	143189	25 %	0 %	75 %	0 %	386359617
3551	NC_017587	ACCT	2	8	143269	143276	25 %	25 %	0 %	50 %	386359617
3552	NC_017587	G	6	6	143293	143298	0 %	0 %	100 %	0 %	386359617
3553	NC_017587	G	7	7	143337	143343	0 %	0 %	100 %	0 %	386359617
3554	NC_017587	GAG	2	6	143347	143352	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386359617
3555	NC_017587	AAG	2	6	143389	143394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386359617
3556	NC_017587	GGGGC	2	10	143416	143425	0 %	0 %	80 %	20 %	386359617
3557	NC_017587	CAA	2	6	143442	143447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386359617
3558	NC_017587	CTC	2	6	143452	143457	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359617
3559	NC_017587	GCG	2	6	143473	143478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386359617
3560	NC_017587	TCA	2	6	143537	143542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386359617
3561	NC_017587	CCT	2	6	143546	143551	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359617
3562	NC_017587	CTC	2	6	143695	143700	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359617
3563	NC_017587	TAT	2	6	144013	144018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386359618
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3565	NC_017587	TCC	2	6	144086	144091	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359618
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3574	NC_017587	ACC	2	6	144386	144391	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386359618
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3580	NC_017587	GCTG	2	8	144543	144550	0 %	25 %	50 %	25 %	386359618
3581	NC_017587	CTCC	2	8	144847	144854	0 %	25 %	0 %	75 %	386359618
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3596	NC_017587	CCCT	2	8	145362	145369	0 %	25 %	0 %	75 %	386359618
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3605	NC_017587	TCC	2	6	145683	145688	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359619
3606	NC_017587	CTT	2	6	145718	145723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386359619
3607	NC_017587	CGAG	2	8	145755	145762	25 %	0 %	50 %	25 %	386359619
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3610	NC_017587	C	6	6	145841	145846	0 %	0 %	0 %	100 %	386359619
3611	NC_017587	TCC	3	9	145896	145904	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359619
3612	NC_017587	G	7	7	145913	145919	0 %	0 %	100 %	0 %	386359619
3613	NC_017587	CCT	2	6	145939	145944	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359619
3614	NC_017587	AGG	2	6	145965	145970	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386359619
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3619	NC_017587	CT	4	8	146217	146224	0 %	50 %	0 %	50 %	386359619
3620	NC_017587	TGA	2	6	146254	146259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386359619
3621	NC_017587	C	6	6	146299	146304	0 %	0 %	0 %	100 %	386359619
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3991	NC_017587	GCG	2	6	160718	160723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386359637
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