MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus thermophilus JL-18 chromosome

Total Repeats: 49109

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18502	NC_017587	GAG	2	6	723994	723999	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360243
18503	NC_017587	GCC	2	6	724006	724011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386360243
18504	NC_017587	AGA	2	6	724056	724061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386360243
18505	NC_017587	CGG	2	6	724065	724070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386360243
18506	NC_017587	CCA	2	6	724131	724136	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386360243
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18508	NC_017587	AGG	2	6	724196	724201	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360243
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18510	NC_017587	CGG	2	6	724236	724241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386360243
18511	NC_017587	CCA	2	6	724329	724334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386360243
18512	NC_017587	CCCGCA	2	12	724338	724349	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	386360243
18513	NC_017587	CCG	2	6	724377	724382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386360243
18514	NC_017587	GAG	2	6	724387	724392	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360243
18515	NC_017587	GCC	2	6	724416	724421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386360243
18516	NC_017587	GCCCAG	2	12	724435	724446	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386360243
18517	NC_017587	GGC	2	6	724489	724494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386360243
18518	NC_017587	GGC	2	6	724498	724503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386360243
18519	NC_017587	C	6	6	724539	724544	0 %	0 %	0 %	100 %	386360243
18520	NC_017587	CCT	2	6	724599	724604	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386360243
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18522	NC_017587	GAG	2	6	724645	724650	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360243
18523	NC_017587	CTG	2	6	724657	724662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386360243
18524	NC_017587	GCC	2	6	724714	724719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386360243
18525	NC_017587	GGTCC	2	10	724729	724738	0 %	20 %	40 %	40 %	386360243
18526	NC_017587	CGG	2	6	724742	724747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386360243
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18531	NC_017587	GGGC	2	8	724917	724924	0 %	0 %	75 %	25 %	386360243
18532	NC_017587	G	7	7	724925	724931	0 %	0 %	100 %	0 %	386360243
18533	NC_017587	GGC	2	6	724998	725003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386360243
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18540	NC_017587	GAG	2	6	725239	725244	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360243
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18543	NC_017587	GAG	2	6	725350	725355	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360243
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18555	NC_017587	CTG	2	6	725608	725613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386360243
18556	NC_017587	GC	3	6	725635	725640	0 %	0 %	50 %	50 %	386360243
18557	NC_017587	AGG	2	6	725802	725807	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360244
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18561	NC_017587	CCCCA	2	10	725981	725990	20 %	0 %	0 %	80 %	386360244
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18601	NC_017587	GCA	2	6	727240	727245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386360244
18602	NC_017587	CAGC	2	8	727252	727259	25 %	0 %	25 %	50 %	386360244
18603	NC_017587	GCG	2	6	727278	727283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386360244
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18981	NC_017587	CCA	2	6	741703	741708	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386360263
18982	NC_017587	CCG	2	6	741748	741753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386360263
18983	NC_017587	GCC	2	6	741756	741761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386360263
18984	NC_017587	GCT	2	6	741833	741838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386360263
18985	NC_017587	AGC	2	6	741892	741897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386360263
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18987	NC_017587	CCAC	2	8	741967	741974	25 %	0 %	0 %	75 %	386360263
18988	NC_017587	CAC	2	6	741986	741991	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386360263
18989	NC_017587	C	6	6	742003	742008	0 %	0 %	0 %	100 %	386360263
18990	NC_017587	CCT	2	6	742150	742155	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386360263
18991	NC_017587	CTC	2	6	742169	742174	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386360263
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18993	NC_017587	CTC	2	6	742184	742189	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386360263
18994	NC_017587	CGT	3	9	742285	742293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386360263
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18999	NC_017587	TCG	2	6	742401	742406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386360263
19000	NC_017587	TCCATG	2	12	742470	742481	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386360263

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