MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus thermophilus JL-18 chromosome

Total Repeats: 49109

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16002	NC_017587	C	6	6	630710	630715	0 %	0 %	0 %	100 %	386360159
16003	NC_017587	CCT	2	6	630755	630760	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386360159
16004	NC_017587	GAG	2	6	630849	630854	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360159
16005	NC_017587	CGG	2	6	630932	630937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386360159
16006	NC_017587	AGG	3	9	630946	630954	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360159
16007	NC_017587	GAGGGC	2	12	630966	630977	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	386360159
16008	NC_017587	AGG	2	6	631045	631050	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360159
16009	NC_017587	CCT	2	6	631076	631081	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386360159
16010	NC_017587	TCCTC	2	10	631091	631100	0 %	40 %	0 %	60 %	386360159
16011	NC_017587	G	6	6	631112	631117	0 %	0 %	100 %	0 %	386360159
16012	NC_017587	GCC	2	6	631160	631165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386360159
16013	NC_017587	CCA	2	6	631166	631171	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386360159
16014	NC_017587	GCC	2	6	631243	631248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386360159
16015	NC_017587	GAG	2	6	631323	631328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360159
16016	NC_017587	GAA	2	6	631332	631337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386360159
16017	NC_017587	GGT	2	6	631338	631343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386360159
16018	NC_017587	GCCC	2	8	631347	631354	0 %	0 %	25 %	75 %	386360159
16019	NC_017587	CCG	2	6	631426	631431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386360159
16020	NC_017587	CCT	3	9	631471	631479	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386360160
16021	NC_017587	ATC	3	9	631530	631538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386360160
16022	NC_017587	GCC	2	6	631671	631676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386360160
16023	NC_017587	AGG	2	6	631746	631751	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360160
16024	NC_017587	GCC	2	6	631818	631823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386360160
16025	NC_017587	TGG	2	6	631846	631851	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386360160
16026	NC_017587	AGG	2	6	631854	631859	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360160
16027	NC_017587	GCG	2	6	631878	631883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386360160
16028	NC_017587	ATC	2	6	631965	631970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386360160
16029	NC_017587	GAG	2	6	631979	631984	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360160
16030	NC_017587	AGA	3	9	631987	631995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386360160
16031	NC_017587	G	6	6	632063	632068	0 %	0 %	100 %	0 %	386360160
16032	NC_017587	GGT	2	6	632116	632121	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386360160
16033	NC_017587	GTT	2	6	632126	632131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386360160
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16035	NC_017587	C	6	6	632185	632190	0 %	0 %	0 %	100 %	386360160
16036	NC_017587	GAG	2	6	632216	632221	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360160
16037	NC_017587	GTG	2	6	632235	632240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386360160
16038	NC_017587	GGA	2	6	632299	632304	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360160
16039	NC_017587	G	6	6	632317	632322	0 %	0 %	100 %	0 %	386360160
16040	NC_017587	GAA	2	6	632357	632362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386360160
16041	NC_017587	GGC	2	6	632363	632368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386360160
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16043	NC_017587	GGC	2	6	632426	632431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386360160
16044	NC_017587	GAG	3	9	632498	632506	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360160
16045	NC_017587	ACC	2	6	632523	632528	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386360160
16046	NC_017587	CG	3	6	632536	632541	0 %	0 %	50 %	50 %	386360160
16047	NC_017587	GAG	2	6	632642	632647	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360160
16048	NC_017587	GGC	2	6	632690	632695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386360160
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16050	NC_017587	AGGA	2	8	632745	632752	50 %	0 %	50 %	0 %	386360160
16051	NC_017587	AGG	2	6	632822	632827	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360161
16052	NC_017587	AGG	2	6	632843	632848	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360161
16053	NC_017587	GATGAG	2	12	632854	632865	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	386360161
16054	NC_017587	CCA	2	6	632871	632876	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386360161
16055	NC_017587	CGG	2	6	632904	632909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386360161
16056	NC_017587	AGGT	2	8	632921	632928	25 %	25 %	50 %	0 %	386360161
16057	NC_017587	GAA	2	6	632932	632937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386360161
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16059	NC_017587	GGA	2	6	633033	633038	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360161
16060	NC_017587	GTG	2	6	633059	633064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386360161
16061	NC_017587	GCC	2	6	633106	633111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386360161
16062	NC_017587	GAT	2	6	633130	633135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386360161
16063	NC_017587	AGGT	2	8	633224	633231	25 %	25 %	50 %	0 %	386360161
16064	NC_017587	TGCGCA	2	12	633339	633350	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386360161
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16091	NC_017587	CTC	2	6	634464	634469	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386360162
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16103	NC_017587	TGG	2	6	634916	634921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386360162
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16107	NC_017587	TGG	2	6	635172	635177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386360163
16108	NC_017587	GTC	2	6	635192	635197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386360163
16109	NC_017587	GGA	2	6	635218	635223	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360163
16110	NC_017587	AGTG	2	8	635224	635231	25 %	25 %	50 %	0 %	386360163
16111	NC_017587	TCCT	2	8	635268	635275	0 %	50 %	0 %	50 %	386360163
16112	NC_017587	CCTC	2	8	635290	635297	0 %	25 %	0 %	75 %	386360163
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16356	NC_017587	GCA	3	9	645532	645540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386360171
16357	NC_017587	G	7	7	645556	645562	0 %	0 %	100 %	0 %	386360171
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