MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus thermophilus JL-18 chromosome

Total Repeats: 49109

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13002	NC_017587	CTCC	2	8	515492	515499	0 %	25 %	0 %	75 %	386360030
13003	NC_017587	GAT	2	6	515546	515551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386360030
13004	NC_017587	GGC	2	6	515567	515572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386360030
13005	NC_017587	GGC	2	6	515581	515586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386360030
13006	NC_017587	GGC	2	6	515648	515653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386360030
13007	NC_017587	CAC	2	6	515687	515692	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386360030
13008	NC_017587	GGC	2	6	515693	515698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386360030
13009	NC_017587	CTT	2	6	515728	515733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386360030
13010	NC_017587	TGT	2	6	515752	515757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386360030
13011	NC_017587	GCC	2	6	515759	515764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386360030
13012	NC_017587	GAT	2	6	515768	515773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386360030
13013	NC_017587	T	6	6	515780	515785	0 %	100 %	0 %	0 %	386360030
13014	NC_017587	GAG	2	6	515840	515845	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360030
13015	NC_017587	TTC	2	6	515873	515878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386360030
13016	NC_017587	G	6	6	515943	515948	0 %	0 %	100 %	0 %	386360030
13017	NC_017587	CTTC	2	8	515955	515962	0 %	50 %	0 %	50 %	386360030
13018	NC_017587	CCA	2	6	515968	515973	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386360030
13019	NC_017587	CTT	2	6	516014	516019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386360030
13020	NC_017587	G	6	6	516136	516141	0 %	0 %	100 %	0 %	386360030
13021	NC_017587	GTT	2	6	516200	516205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386360030
13022	NC_017587	GAG	2	6	516296	516301	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360030
13023	NC_017587	GAA	2	6	516362	516367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386360030
13024	NC_017587	GGA	2	6	516436	516441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360030
13025	NC_017587	GTG	2	6	516492	516497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386360030
13026	NC_017587	GGA	2	6	516511	516516	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360030
13027	NC_017587	TCGGGG	2	12	516528	516539	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	386360030
13028	NC_017587	CGG	2	6	516550	516555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386360030
13029	NC_017587	G	7	7	516554	516560	0 %	0 %	100 %	0 %	386360030
13030	NC_017587	GAG	2	6	516566	516571	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360030
13031	NC_017587	AGG	2	6	516648	516653	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360030
13032	NC_017587	GAAGG	2	10	516662	516671	40 %	0 %	60 %	0 %	386360030
13033	NC_017587	ACC	3	9	516690	516698	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386360030
13034	NC_017587	CCT	2	6	516712	516717	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386360030
13035	NC_017587	GAG	2	6	516740	516745	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360030
13036	NC_017587	TGG	2	6	516789	516794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386360030
13037	NC_017587	GAG	2	6	516848	516853	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360030
13038	NC_017587	CGA	3	9	516868	516876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386360030
13039	NC_017587	G	6	6	516880	516885	0 %	0 %	100 %	0 %	386360030
13040	NC_017587	ATG	2	6	516897	516902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386360030
13041	NC_017587	GCG	2	6	516953	516958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386360030
13042	NC_017587	GCG	2	6	517028	517033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386360030
13043	NC_017587	TCC	2	6	517041	517046	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386360030
13044	NC_017587	CGG	2	6	517085	517090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386360030
13045	NC_017587	GCCA	2	8	517110	517117	25 %	0 %	25 %	50 %	386360030
13046	NC_017587	CTC	2	6	517250	517255	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386360031
13047	NC_017587	CGGGG	2	10	517310	517319	0 %	0 %	80 %	20 %	386360031
13048	NC_017587	TGG	3	9	517320	517328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386360031
13049	NC_017587	CGA	2	6	517330	517335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386360031
13050	NC_017587	GAGG	2	8	517430	517437	25 %	0 %	75 %	0 %	386360031
13051	NC_017587	GGC	2	6	517498	517503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386360031
13052	NC_017587	TCC	2	6	517518	517523	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386360031
13053	NC_017587	GC	3	6	517528	517533	0 %	0 %	50 %	50 %	386360031
13054	NC_017587	GTG	2	6	517583	517588	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386360031
13055	NC_017587	TGG	2	6	517590	517595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386360031
13056	NC_017587	ACG	2	6	517596	517601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386360031
13057	NC_017587	GGC	2	6	517627	517632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386360031
13058	NC_017587	TCC	2	6	517644	517649	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386360031
13059	NC_017587	AGG	2	6	517650	517655	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360031
13060	NC_017587	GTG	3	9	517667	517675	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386360031
13061	NC_017587	GGT	2	6	517729	517734	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386360031
13062	NC_017587	CGC	2	6	517759	517764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386360031
13063	NC_017587	CTA	2	6	517774	517779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386360031
13064	NC_017587	CGA	2	6	517801	517806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386360031
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13066	NC_017587	GCCC	2	8	517876	517883	0 %	0 %	25 %	75 %	386360032
13067	NC_017587	G	6	6	517892	517897	0 %	0 %	100 %	0 %	386360032
13068	NC_017587	GGA	2	6	517929	517934	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360032
13069	NC_017587	C	6	6	517940	517945	0 %	0 %	0 %	100 %	386360032
13070	NC_017587	TCC	2	6	517952	517957	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386360032
13071	NC_017587	CCT	2	6	517968	517973	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386360032
13072	NC_017587	G	6	6	517978	517983	0 %	0 %	100 %	0 %	386360032
13073	NC_017587	CCACC	2	10	518001	518010	20 %	0 %	0 %	80 %	386360032
13074	NC_017587	GAG	2	6	518062	518067	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360032
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13078	NC_017587	GAG	2	6	518140	518145	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360032
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13088	NC_017587	GGA	3	9	518527	518535	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360033
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13091	NC_017587	GGC	2	6	518600	518605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386360033
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13093	NC_017587	GAGAA	2	10	518640	518649	60 %	0 %	40 %	0 %	386360033
13094	NC_017587	GAG	2	6	518690	518695	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360033
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13121	NC_017587	GAG	2	6	519531	519536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360034
13122	NC_017587	TGA	2	6	519566	519571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386360034
13123	NC_017587	GGC	2	6	519588	519593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386360034
13124	NC_017587	GAG	2	6	519648	519653	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360034
13125	NC_017587	GGC	2	6	519696	519701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386360034
13126	NC_017587	CCT	2	6	519746	519751	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386360034
13127	NC_017587	GCCTCC	2	12	519760	519771	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	386360034
13128	NC_017587	GTG	2	6	519796	519801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386360034
13129	NC_017587	TGG	3	9	519962	519970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386360034
13130	NC_017587	CCTCCC	2	12	520007	520018	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	386360034
13131	NC_017587	TCC	2	6	520036	520041	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386360034
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13134	NC_017587	CCT	2	6	520314	520319	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386360035
13135	NC_017587	TTC	2	6	520424	520429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386360035
13136	NC_017587	CCCG	2	8	520452	520459	0 %	0 %	25 %	75 %	386360035
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13139	NC_017587	GGC	2	6	520512	520517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386360035
13140	NC_017587	CGG	2	6	520593	520598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386360035
13141	NC_017587	CTG	2	6	520672	520677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386360035
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13151	NC_017587	AGGGTG	2	12	521105	521116	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	386360035
13152	NC_017587	CTG	2	6	521185	521190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386360035
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13154	NC_017587	GGCG	2	8	521379	521386	0 %	0 %	75 %	25 %	386360036
13155	NC_017587	CTT	2	6	521530	521535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386360036
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13158	NC_017587	CATCTC	2	12	521644	521655	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	386360036
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13233	NC_017587	AAG	2	6	524602	524607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386360040
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13237	NC_017587	TCA	2	6	524807	524812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386360040
13238	NC_017587	CTT	2	6	524871	524876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386360040
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13353	NC_017587	GAG	2	6	529189	529194	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360045
13354	NC_017587	GGA	2	6	529215	529220	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360045
13355	NC_017587	GCGATG	2	12	529244	529255	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386360045
13356	NC_017587	GTG	2	6	529340	529345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386360045
13357	NC_017587	ACC	2	6	529346	529351	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386360045
13358	NC_017587	AGGGC	2	10	529404	529413	20 %	0 %	60 %	20 %	386360045
13359	NC_017587	GAT	2	6	529414	529419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386360045
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13361	NC_017587	CGC	2	6	529441	529446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386360045
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