MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus thermophilus JL-18 chromosome

Total Repeats: 49109

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12502	NC_017587	ACCTTC	2	12	495021	495032	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	386360008
12503	NC_017587	TGG	2	6	495049	495054	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386360008
12504	NC_017587	CGA	2	6	495077	495082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386360008
12505	NC_017587	GAG	4	12	495093	495104	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360008
12506	NC_017587	ACC	2	6	495136	495141	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386360008
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12508	NC_017587	GTG	3	9	495324	495332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386360008
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12510	NC_017587	CAT	2	6	495562	495567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386360009
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12512	NC_017587	TTC	2	6	495626	495631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386360009
12513	NC_017587	CGC	2	6	495685	495690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386360009
12514	NC_017587	CAC	2	6	495706	495711	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386360009
12515	NC_017587	GCCC	2	8	495715	495722	0 %	0 %	25 %	75 %	386360009
12516	NC_017587	GCC	2	6	495734	495739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386360009
12517	NC_017587	ATC	2	6	495863	495868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386360009
12518	NC_017587	GAA	2	6	495890	495895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386360009
12519	NC_017587	AGG	2	6	495931	495936	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360009
12520	NC_017587	CGT	2	6	495964	495969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386360010
12521	NC_017587	GAAG	2	8	496008	496015	50 %	0 %	50 %	0 %	386360010
12522	NC_017587	CTC	2	6	496024	496029	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386360010
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12525	NC_017587	GGCC	2	8	496234	496241	0 %	0 %	50 %	50 %	386360010
12526	NC_017587	TCT	2	6	496253	496258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386360010
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12528	NC_017587	CAGC	2	8	496284	496291	25 %	0 %	25 %	50 %	386360010
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12532	NC_017587	GAG	2	6	496474	496479	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360010
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12543	NC_017587	TGG	2	6	496867	496872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386360011
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12552	NC_017587	GGA	2	6	497252	497257	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360012
12553	NC_017587	CCTA	2	8	497269	497276	25 %	25 %	0 %	50 %	386360012
12554	NC_017587	GGA	2	6	497342	497347	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360013
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12561	NC_017587	C	7	7	497663	497669	0 %	0 %	0 %	100 %	386360013
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12590	NC_017587	CCCGG	2	10	499043	499052	0 %	0 %	40 %	60 %	386360016
12591	NC_017587	TGG	3	9	499080	499088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386360016
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12599	NC_017587	T	6	6	499384	499389	0 %	100 %	0 %	0 %	386360017
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12620	NC_017587	CCT	2	6	499980	499985	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386360017
12621	NC_017587	ACC	2	6	500003	500008	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386360017
12622	NC_017587	GGGCG	2	10	500010	500019	0 %	0 %	80 %	20 %	386360017
12623	NC_017587	GGGC	2	8	500021	500028	0 %	0 %	75 %	25 %	386360017
12624	NC_017587	GCG	2	6	500040	500045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386360017
12625	NC_017587	GGCCTT	2	12	500100	500111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386360017
12626	NC_017587	TGG	2	6	500129	500134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386360017
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12629	NC_017587	GGA	2	6	500226	500231	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360017
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12632	NC_017587	CTT	2	6	500329	500334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386360018
12633	NC_017587	CAG	3	9	500363	500371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386360018
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12641	NC_017587	GGC	2	6	500596	500601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386360018
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12649	NC_017587	GAA	2	6	500881	500886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386360018
12650	NC_017587	CCT	2	6	500887	500892	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386360018
12651	NC_017587	GAG	2	6	500909	500914	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360018
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12657	NC_017587	GCCCT	2	10	501158	501167	0 %	20 %	20 %	60 %	386360019
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12727	NC_017587	G	6	6	503210	503215	0 %	0 %	100 %	0 %	386360021
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12738	NC_017587	GGA	2	6	503746	503751	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360022
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12981	NC_017587	GGC	2	6	514663	514668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386360028
12982	NC_017587	CCT	2	6	514688	514693	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386360028
12983	NC_017587	GTG	3	9	514746	514754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386360028
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