MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus thermophilus JL-18 chromosome

Total Repeats: 49109

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_017587	AGC	2	6	321884	321889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386359811
8002	NC_017587	GGA	2	6	321891	321896	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386359811
8003	NC_017587	GAA	2	6	321942	321947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386359811
8004	NC_017587	AGG	2	6	322063	322068	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386359811
8005	NC_017587	AAG	2	6	322079	322084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386359811
8006	NC_017587	GTG	2	6	322097	322102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386359812
8007	NC_017587	AGA	2	6	322119	322124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386359812
8008	NC_017587	TGG	2	6	322137	322142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386359812
8009	NC_017587	AAG	2	6	322190	322195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386359812
8010	NC_017587	GAG	2	6	322214	322219	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386359812
8011	NC_017587	GTG	2	6	322238	322243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386359812
8012	NC_017587	CAAGCG	2	12	322270	322281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386359812
8013	NC_017587	TGG	2	6	322299	322304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386359812
8014	NC_017587	TGG	2	6	322323	322328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386359812
8015	NC_017587	CCG	2	6	322342	322347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386359812
8016	NC_017587	ACCT	2	8	322402	322409	25 %	25 %	0 %	50 %	386359813
8017	NC_017587	ACA	2	6	322421	322426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386359813
8018	NC_017587	AGG	2	6	322517	322522	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386359813
8019	NC_017587	G	6	6	322532	322537	0 %	0 %	100 %	0 %	386359813
8020	NC_017587	AAGG	2	8	322543	322550	50 %	0 %	50 %	0 %	386359813
8021	NC_017587	GTG	3	9	322567	322575	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386359813
8022	NC_017587	AAG	2	6	322582	322587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386359813
8023	NC_017587	GAC	2	6	322624	322629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386359813
8024	NC_017587	CGC	2	6	322632	322637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386359813
8025	NC_017587	ATC	2	6	322642	322647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386359813
8026	NC_017587	AAC	2	6	322648	322653	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386359813
8027	NC_017587	GAA	2	6	322775	322780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386359814
8028	NC_017587	AGG	2	6	322837	322842	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386359814
8029	NC_017587	AAG	2	6	322851	322856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386359814
8030	NC_017587	GAA	2	6	322889	322894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386359814
8031	NC_017587	GGC	2	6	322926	322931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386359814
8032	NC_017587	AGG	2	6	322942	322947	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386359814
8033	NC_017587	C	6	6	322948	322953	0 %	0 %	0 %	100 %	386359814
8034	NC_017587	GAA	2	6	323012	323017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386359814
8035	NC_017587	AAG	2	6	323034	323039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386359814
8036	NC_017587	GCG	2	6	323059	323064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386359814
8037	NC_017587	GGA	2	6	323078	323083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386359814
8038	NC_017587	TAC	2	6	323121	323126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386359815
8039	NC_017587	GAG	2	6	323127	323132	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386359815
8040	NC_017587	CCG	2	6	323150	323155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386359815
8041	NC_017587	GGT	2	6	323198	323203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386359815
8042	NC_017587	AGG	2	6	323230	323235	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386359815
8043	NC_017587	GGC	2	6	323255	323260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386359815
8044	NC_017587	TCA	2	6	323275	323280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386359815
8045	NC_017587	AAG	2	6	323310	323315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386359815
8046	NC_017587	GCG	2	6	323372	323377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386359815
8047	NC_017587	AGC	2	6	323500	323505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386359815
8048	NC_017587	TGG	2	6	323533	323538	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386359815
8049	NC_017587	GGT	2	6	323564	323569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386359815
8050	NC_017587	ACC	2	6	323571	323576	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386359815
8051	NC_017587	CGA	2	6	323585	323590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386359815
8052	NC_017587	TGCG	2	8	323716	323723	0 %	25 %	50 %	25 %	386359816
8053	NC_017587	CTT	2	6	323751	323756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386359816
8054	NC_017587	CTGC	2	8	323772	323779	0 %	25 %	25 %	50 %	386359816
8055	NC_017587	AGG	2	6	323996	324001	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386359817
8056	NC_017587	CG	3	6	324018	324023	0 %	0 %	50 %	50 %	386359817
8057	NC_017587	TCA	2	6	324032	324037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386359817
8058	NC_017587	GTGGAC	2	12	324052	324063	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386359817
8059	NC_017587	CCA	2	6	324141	324146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386359817
8060	NC_017587	CGG	2	6	324151	324156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386359817
8061	NC_017587	GCG	2	6	324171	324176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386359817
8062	NC_017587	ACCG	2	8	324259	324266	25 %	0 %	25 %	50 %	386359817
8063	NC_017587	TGGGCG	2	12	324281	324292	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	386359817
8064	NC_017587	GTG	2	6	324312	324317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386359817
8065	NC_017587	CGGG	2	8	324380	324387	0 %	0 %	75 %	25 %	386359818
8066	NC_017587	TCAAGG	2	12	324388	324399	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386359818
8067	NC_017587	GTG	3	9	324444	324452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386359818
8068	NC_017587	GAG	2	6	324453	324458	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386359818
8069	NC_017587	CGA	2	6	324485	324490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386359818
8070	NC_017587	GCC	2	6	324493	324498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386359818
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8072	NC_017587	GGGC	2	8	324615	324622	0 %	0 %	75 %	25 %	386359818
8073	NC_017587	GTG	3	9	324654	324662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386359818
8074	NC_017587	CGGGTC	2	12	324705	324716	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386359818
8075	NC_017587	GCC	2	6	324750	324755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386359818
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8077	NC_017587	AAG	2	6	324852	324857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386359818
8078	NC_017587	GAC	2	6	324992	324997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386359819
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8080	NC_017587	GGGCC	2	10	325078	325087	0 %	0 %	60 %	40 %	386359819
8081	NC_017587	GGC	2	6	325193	325198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386359819
8082	NC_017587	GAAGA	2	10	325241	325250	60 %	0 %	40 %	0 %	386359820
8083	NC_017587	TGATCC	2	12	325251	325262	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386359820
8084	NC_017587	GGCG	3	12	325282	325293	0 %	0 %	75 %	25 %	386359820
8085	NC_017587	CCGCTT	2	12	325294	325305	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	386359820
8086	NC_017587	TGG	4	12	325314	325325	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386359820
8087	NC_017587	TAC	2	6	325400	325405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386359820
8088	NC_017587	CGC	2	6	325409	325414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386359820
8089	NC_017587	TGG	2	6	325419	325424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386359820
8090	NC_017587	CGG	2	6	325500	325505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386359820
8091	NC_017587	TGAC	2	8	325566	325573	25 %	25 %	25 %	25 %	386359820
8092	NC_017587	CCA	2	6	325623	325628	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386359820
8093	NC_017587	GGC	2	6	325751	325756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386359821
8094	NC_017587	GGC	2	6	325777	325782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386359821
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8096	NC_017587	GGT	2	6	325862	325867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386359821
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8099	NC_017587	GGGT	2	8	325923	325930	0 %	25 %	75 %	0 %	386359822
8100	NC_017587	CGG	2	6	325996	326001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386359822
8101	NC_017587	CGC	2	6	326015	326020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386359822
8102	NC_017587	GGC	2	6	326027	326032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386359822
8103	NC_017587	GGTGA	2	10	326147	326156	20 %	20 %	60 %	0 %	386359822
8104	NC_017587	CGGG	2	8	326174	326181	0 %	0 %	75 %	25 %	386359822
8105	NC_017587	GAA	2	6	326188	326193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386359822
8106	NC_017587	GGT	2	6	326242	326247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386359822
8107	NC_017587	CGGG	2	8	326292	326299	0 %	0 %	75 %	25 %	386359822
8108	NC_017587	TCC	2	6	326307	326312	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359822
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8110	NC_017587	CGC	2	6	326399	326404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386359823
8111	NC_017587	CAT	2	6	326495	326500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386359823
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8113	NC_017587	CAT	3	9	326576	326584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386359823
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8118	NC_017587	CAT	2	6	326651	326656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386359823
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8491	NC_017587	CGC	2	6	341255	341260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386359843
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