MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus thermophilus JL-18 chromosome

Total Repeats: 49109

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6502	NC_017587	CGC	2	6	261511	261516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386359741
6503	NC_017587	AGG	2	6	261629	261634	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386359741
6504	NC_017587	ACC	2	6	261635	261640	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386359741
6505	NC_017587	AGGGG	2	10	261760	261769	20 %	0 %	80 %	0 %	386359741
6506	NC_017587	CCGC	2	8	261833	261840	0 %	0 %	25 %	75 %	386359742
6507	NC_017587	CCA	2	6	261848	261853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386359742
6508	NC_017587	GGC	2	6	261886	261891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386359742
6509	NC_017587	GGC	2	6	261966	261971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386359742
6510	NC_017587	CCA	2	6	261992	261997	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386359742
6511	NC_017587	GGGGA	2	10	262030	262039	20 %	0 %	80 %	0 %	386359742
6512	NC_017587	GCC	2	6	262120	262125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386359742
6513	NC_017587	C	6	6	262152	262157	0 %	0 %	0 %	100 %	386359742
6514	NC_017587	GGT	2	6	262161	262166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386359742
6515	NC_017587	C	7	7	262173	262179	0 %	0 %	0 %	100 %	386359742
6516	NC_017587	CCT	2	6	262199	262204	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359742
6517	NC_017587	CGC	2	6	262232	262237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386359742
6518	NC_017587	CCTC	2	8	262414	262421	0 %	25 %	0 %	75 %	386359742
6519	NC_017587	CGT	2	6	262487	262492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386359742
6520	NC_017587	CCA	2	6	262517	262522	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386359742
6521	NC_017587	GGC	2	6	262602	262607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386359742
6522	NC_017587	CTT	2	6	262614	262619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386359742
6523	NC_017587	GGC	2	6	262650	262655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386359742
6524	NC_017587	G	6	6	262705	262710	0 %	0 %	100 %	0 %	386359742
6525	NC_017587	C	6	6	262739	262744	0 %	0 %	0 %	100 %	386359742
6526	NC_017587	CCA	2	6	262808	262813	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386359742
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6529	NC_017587	CGC	2	6	262943	262948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386359742
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6531	NC_017587	CTT	2	6	263548	263553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386359743
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6533	NC_017587	CTA	2	6	263581	263586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386359743
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6536	NC_017587	TGG	2	6	263691	263696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386359743
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6538	NC_017587	GTCA	2	8	263735	263742	25 %	25 %	25 %	25 %	386359743
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6540	NC_017587	GACC	2	8	263812	263819	25 %	0 %	25 %	50 %	386359743
6541	NC_017587	GGC	2	6	263830	263835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386359743
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6543	NC_017587	TGGGA	2	10	264021	264030	20 %	20 %	60 %	0 %	386359743
6544	NC_017587	GCG	2	6	264064	264069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386359743
6545	NC_017587	TCA	2	6	264081	264086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386359743
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6553	NC_017587	GCG	2	6	264430	264435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386359743
6554	NC_017587	CTT	2	6	264488	264493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386359743
6555	NC_017587	AGGC	2	8	264509	264516	25 %	0 %	50 %	25 %	386359743
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6558	NC_017587	TGG	2	6	264811	264816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386359744
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6561	NC_017587	GAG	2	6	264924	264929	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386359744
6562	NC_017587	GAG	2	6	264948	264953	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386359744
6563	NC_017587	GTG	2	6	264963	264968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386359744
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6573	NC_017587	C	6	6	265140	265145	0 %	0 %	0 %	100 %	386359744
6574	NC_017587	GAG	2	6	265155	265160	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386359744
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6589	NC_017587	GCCCTG	2	12	265683	265694	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386359744
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6592	NC_017587	G	6	6	265753	265758	0 %	0 %	100 %	0 %	386359744
6593	NC_017587	AGG	2	6	265777	265782	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386359744
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6595	NC_017587	GCCTAC	2	12	265848	265859	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386359744
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6603	NC_017587	TCC	3	9	266108	266116	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359745
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6605	NC_017587	GGA	2	6	266190	266195	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386359745
6606	NC_017587	CGGGC	2	10	266201	266210	0 %	0 %	60 %	40 %	386359745
6607	NC_017587	CCTCGC	2	12	266214	266225	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	386359745
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6610	NC_017587	GGGC	2	8	266320	266327	0 %	0 %	75 %	25 %	386359745
6611	NC_017587	CTC	2	6	266335	266340	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359745
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6615	NC_017587	TGGCCC	2	12	266525	266536	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386359745
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6990	NC_017587	TCC	2	6	283267	283272	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359765
6991	NC_017587	CCTGG	2	10	283296	283305	0 %	20 %	40 %	40 %	386359765
6992	NC_017587	GGGC	2	8	283316	283323	0 %	0 %	75 %	25 %	386359765
6993	NC_017587	GGGGC	3	15	283359	283373	0 %	0 %	80 %	20 %	386359765
6994	NC_017587	GAG	2	6	283383	283388	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386359765
6995	NC_017587	TCC	2	6	283422	283427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359765
6996	NC_017587	CAT	2	6	283452	283457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386359765
6997	NC_017587	GAG	2	6	283485	283490	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386359765
6998	NC_017587	CTTC	2	8	283502	283509	0 %	50 %	0 %	50 %	386359765
6999	NC_017587	AGG	2	6	283549	283554	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386359765
7000	NC_017587	TCC	2	6	283576	283581	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359765

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