MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus sp. CCB_US3_UF1 chromosome

Total Repeats: 56109

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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47003	NC_017278	CCT	2	6	1879747	1879752	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440265
47004	NC_017278	AGA	2	6	1879756	1879761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384440265
47005	NC_017278	CCCT	2	8	1879808	1879815	0 %	25 %	0 %	75 %	384440265
47006	NC_017278	TC	3	6	1879883	1879888	0 %	50 %	0 %	50 %	384440265
47007	NC_017278	GCT	2	6	1879931	1879936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384440265
47008	NC_017278	AGT	2	6	1879984	1879989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384440265
47009	NC_017278	AGG	2	6	1880043	1880048	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440265
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47011	NC_017278	GTA	2	6	1880108	1880113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384440265
47012	NC_017278	AGC	2	6	1880192	1880197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384440265
47013	NC_017278	CGC	2	6	1880308	1880313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384440265
47014	NC_017278	GCC	2	6	1880354	1880359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384440265
47015	NC_017278	ACG	2	6	1880601	1880606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384440265
47016	NC_017278	TCC	2	6	1880675	1880680	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440265
47017	NC_017278	GGGTAA	2	12	1880686	1880697	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	384440265
47018	NC_017278	CCT	2	6	1880715	1880720	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440265
47019	NC_017278	ATC	2	6	1880735	1880740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384440265
47020	NC_017278	GC	3	6	1880837	1880842	0 %	0 %	50 %	50 %	384440265
47021	NC_017278	AGTA	2	8	1880857	1880864	50 %	25 %	25 %	0 %	384440265
47022	NC_017278	AGGGTG	2	12	1880892	1880903	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	384440265
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47024	NC_017278	TC	3	6	1880970	1880975	0 %	50 %	0 %	50 %	384440265
47025	NC_017278	GGA	2	6	1881095	1881100	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440265
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47027	NC_017278	GT	5	10	1881173	1881182	0 %	50 %	50 %	0 %	384440265
47028	NC_017278	CTC	3	9	1881442	1881450	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440266
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47031	NC_017278	TGG	2	6	1881635	1881640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384440266
47032	NC_017278	CT	3	6	1881689	1881694	0 %	50 %	0 %	50 %	384440266
47033	NC_017278	CTT	2	6	1881696	1881701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384440266
47034	NC_017278	GGT	2	6	1881729	1881734	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384440266
47035	NC_017278	CTCC	2	8	1881807	1881814	0 %	25 %	0 %	75 %	384440266
47036	NC_017278	CGGGTG	2	12	1881865	1881876	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	384440266
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47039	NC_017278	GCG	2	6	1881954	1881959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384440266
47040	NC_017278	GGGGA	2	10	1881974	1881983	20 %	0 %	80 %	0 %	384440266
47041	NC_017278	G	6	6	1882028	1882033	0 %	0 %	100 %	0 %	384440266
47042	NC_017278	TTTC	2	8	1882034	1882041	0 %	75 %	0 %	25 %	384440266
47043	NC_017278	CCGCTA	2	12	1882056	1882067	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384440266
47044	NC_017278	CTG	2	6	1882135	1882140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384440266
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47050	NC_017278	CT	3	6	1882315	1882320	0 %	50 %	0 %	50 %	384440266
47051	NC_017278	CGG	2	6	1882343	1882348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384440266
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47103	NC_017278	GAG	2	6	1890162	1890167	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440270
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